MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN3

Total Repeats: 409

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017499	TG	3	6	1214	1219	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017499	TA	3	6	1998	2003	50 %	50 %	0 %	0 %	385839644
3	NC_017499	AG	3	6	3631	3636	50 %	0 %	50 %	0 %	385839645
4	NC_017499	AT	3	6	4093	4098	50 %	50 %	0 %	0 %	385839646
5	NC_017499	GA	3	6	4941	4946	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017499	TA	4	8	5317	5324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017499	AT	3	6	5331	5336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017499	AT	3	6	5370	5375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017499	TA	4	8	6708	6715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017499	TA	3	6	6730	6735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017499	TA	3	6	6769	6774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017499	GA	3	6	7876	7881	50 %	0 %	50 %	0 %	385839648
13	NC_017499	TA	3	6	8709	8714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017499	AT	3	6	8782	8787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017499	TA	4	8	8919	8926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017499	TA	3	6	9713	9718	50 %	50 %	0 %	0 %	385839649
17	NC_017499	AT	3	6	11540	11545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017499	TA	4	8	11549	11556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017499	TA	3	6	11569	11574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017499	AT	3	6	11597	11602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017499	AT	3	6	12430	12435	50 %	50 %	0 %	0 %	385839650
22	NC_017499	TA	3	6	14068	14073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017499	AT	3	6	14130	14135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017499	TA	3	6	14170	14175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017499	AT	3	6	15523	15528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017499	TA	3	6	16217	16222	50 %	50 %	0 %	0 %	385839653
27	NC_017499	AG	3	6	16472	16477	50 %	0 %	50 %	0 %	385839654
28	NC_017499	AT	3	6	17069	17074	50 %	50 %	0 %	0 %	385839654
29	NC_017499	TA	3	6	17285	17290	50 %	50 %	0 %	0 %	385839654
30	NC_017499	AG	3	6	17473	17478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017499	TA	3	6	17762	17767	50 %	50 %	0 %	0 %	385839655
32	NC_017499	AT	3	6	17874	17879	50 %	50 %	0 %	0 %	385839655
33	NC_017499	TA	3	6	18194	18199	50 %	50 %	0 %	0 %	385839655
34	NC_017499	AT	3	6	19145	19150	50 %	50 %	0 %	0 %	385839656
35	NC_017499	TA	3	6	19260	19265	50 %	50 %	0 %	0 %	385839656
36	NC_017499	AC	3	6	20179	20184	50 %	0 %	0 %	50 %	385839656
37	NC_017499	AT	3	6	20502	20507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017499	GA	3	6	21977	21982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017499	AT	3	6	22493	22498	50 %	50 %	0 %	0 %	385839658
40	NC_017499	GT	3	6	23430	23435	0 %	50 %	50 %	0 %	385839659
41	NC_017499	TA	3	6	23480	23485	50 %	50 %	0 %	0 %	385839659
42	NC_017499	TA	3	6	23951	23956	50 %	50 %	0 %	0 %	385839659
43	NC_017499	AT	3	6	24235	24240	50 %	50 %	0 %	0 %	385839659
44	NC_017499	TA	3	6	25757	25762	50 %	50 %	0 %	0 %	385839660
45	NC_017499	TA	3	6	27115	27120	50 %	50 %	0 %	0 %	385839661
46	NC_017499	CT	3	6	27185	27190	0 %	50 %	0 %	50 %	385839661
47	NC_017499	AT	3	6	27210	27215	50 %	50 %	0 %	0 %	385839661
48	NC_017499	TA	3	6	27253	27258	50 %	50 %	0 %	0 %	385839661
49	NC_017499	TA	3	6	27460	27465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017499	TA	3	6	28223	28228	50 %	50 %	0 %	0 %	385839663
51	NC_017499	AT	3	6	29869	29874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017499	AT	3	6	30646	30651	50 %	50 %	0 %	0 %	385839665
53	NC_017499	AT	3	6	30735	30740	50 %	50 %	0 %	0 %	385839665
54	NC_017499	AT	3	6	30801	30806	50 %	50 %	0 %	0 %	385839665
55	NC_017499	TA	4	8	31208	31215	50 %	50 %	0 %	0 %	385839665
56	NC_017499	TA	3	6	31257	31262	50 %	50 %	0 %	0 %	385839665
57	NC_017499	AT	3	6	31264	31269	50 %	50 %	0 %	0 %	385839665
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59	NC_017499	TA	3	6	33769	33774	50 %	50 %	0 %	0 %	385839667
60	NC_017499	TA	3	6	34285	34290	50 %	50 %	0 %	0 %	385839668
61	NC_017499	TA	3	6	34692	34697	50 %	50 %	0 %	0 %	385839669
62	NC_017499	GA	3	6	34793	34798	50 %	0 %	50 %	0 %	385839669
63	NC_017499	TA	3	6	34992	34997	50 %	50 %	0 %	0 %	385839669
64	NC_017499	AT	3	6	35318	35323	50 %	50 %	0 %	0 %	385839669
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67	NC_017499	AT	3	6	37582	37587	50 %	50 %	0 %	0 %	385839670
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69	NC_017499	GA	3	6	38869	38874	50 %	0 %	50 %	0 %	385839671
70	NC_017499	AT	3	6	38876	38881	50 %	50 %	0 %	0 %	385839671
71	NC_017499	TA	4	8	38959	38966	50 %	50 %	0 %	0 %	385839671
72	NC_017499	TA	3	6	39375	39380	50 %	50 %	0 %	0 %	385839671
73	NC_017499	AG	3	6	39575	39580	50 %	0 %	50 %	0 %	385839671
74	NC_017499	AT	3	6	39807	39812	50 %	50 %	0 %	0 %	385839671
75	NC_017499	AG	3	6	39851	39856	50 %	0 %	50 %	0 %	385839671
76	NC_017499	AG	3	6	39925	39930	50 %	0 %	50 %	0 %	385839671
77	NC_017499	AG	3	6	40013	40018	50 %	0 %	50 %	0 %	385839671
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79	NC_017499	GA	3	6	40512	40517	50 %	0 %	50 %	0 %	385839671
80	NC_017499	AT	3	6	40540	40545	50 %	50 %	0 %	0 %	385839671
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90	NC_017499	AT	3	6	43549	43554	50 %	50 %	0 %	0 %	385839672
91	NC_017499	AT	3	6	43854	43859	50 %	50 %	0 %	0 %	385839672
92	NC_017499	AT	3	6	43884	43889	50 %	50 %	0 %	0 %	385839672
93	NC_017499	AT	3	6	44035	44040	50 %	50 %	0 %	0 %	385839672
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104	NC_017499	AG	3	6	49149	49154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017499	GA	3	6	49291	49296	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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112	NC_017499	AT	3	6	54668	54673	50 %	50 %	0 %	0 %	385839680
113	NC_017499	AT	3	6	55243	55248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017499	AT	3	6	55664	55669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017499	AT	3	6	55942	55947	50 %	50 %	0 %	0 %	385839681
116	NC_017499	AT	3	6	56098	56103	50 %	50 %	0 %	0 %	385839681
117	NC_017499	TA	3	6	57003	57008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017499	TA	3	6	57748	57753	50 %	50 %	0 %	0 %	385839682
119	NC_017499	TA	3	6	60086	60091	50 %	50 %	0 %	0 %	385839684
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121	NC_017499	TA	3	6	60646	60651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017499	TA	3	6	61186	61191	50 %	50 %	0 %	0 %	385839685
123	NC_017499	AT	3	6	61772	61777	50 %	50 %	0 %	0 %	385839685
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127	NC_017499	AT	3	6	62863	62868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017499	TA	3	6	63634	63639	50 %	50 %	0 %	0 %	385839686
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130	NC_017499	AG	3	6	63858	63863	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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133	NC_017499	TA	3	6	66602	66607	50 %	50 %	0 %	0 %	385839688
134	NC_017499	TA	3	6	66826	66831	50 %	50 %	0 %	0 %	385839689
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.