MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN3

Total Repeats: 3685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017499	ATT	2	6	110	115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017499	TAA	2	6	131	136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017499	TGT	2	6	221	226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839643
4	NC_017499	TTC	2	6	333	338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839643
5	NC_017499	AGA	2	6	421	426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839643
6	NC_017499	ATA	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839643
7	NC_017499	ACA	2	6	465	470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839643
8	NC_017499	CAA	3	9	504	512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839643
9	NC_017499	ATT	2	6	513	518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839643
10	NC_017499	GAA	2	6	645	650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839643
11	NC_017499	TGT	2	6	725	730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839643
12	NC_017499	ATT	2	6	956	961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839643
13	NC_017499	ACC	2	6	1050	1055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017499	CAC	2	6	1117	1122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017499	ATT	2	6	1181	1186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017499	CAT	2	6	1199	1204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017499	CAA	2	6	1306	1311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839644
18	NC_017499	TAA	2	6	1530	1535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839644
19	NC_017499	GTT	2	6	1538	1543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839644
20	NC_017499	AAC	2	6	1588	1593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839644
21	NC_017499	AAT	2	6	1715	1720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839644
22	NC_017499	ATT	3	9	1729	1737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839644
23	NC_017499	ATT	2	6	1841	1846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839644
24	NC_017499	TTA	2	6	1976	1981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839644
25	NC_017499	AAG	2	6	2016	2021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839644
26	NC_017499	GTT	2	6	2044	2049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839644
27	NC_017499	GAT	2	6	2210	2215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839644
28	NC_017499	TAT	2	6	2232	2237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839644
29	NC_017499	TAA	2	6	2324	2329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017499	AAT	2	6	2621	2626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017499	AAG	2	6	2727	2732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017499	GTA	2	6	2788	2793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017499	ATC	2	6	2839	2844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839645
34	NC_017499	GTT	2	6	2946	2951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839645
35	NC_017499	TAC	2	6	3018	3023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839645
36	NC_017499	TAA	2	6	3055	3060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839645
37	NC_017499	TGA	3	9	3086	3094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839645
38	NC_017499	AAT	2	6	3201	3206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839645
39	NC_017499	ATT	2	6	3304	3309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839645
40	NC_017499	TCA	2	6	3365	3370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839645
41	NC_017499	ATC	3	9	3412	3420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839645
42	NC_017499	ATG	2	6	3508	3513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839645
43	NC_017499	ATA	2	6	3753	3758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017499	TAA	2	6	3783	3788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017499	TAA	2	6	3870	3875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839646
46	NC_017499	TGT	2	6	4188	4193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839646
47	NC_017499	ATA	2	6	4270	4275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839646
48	NC_017499	GAA	2	6	4345	4350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839646
49	NC_017499	GAA	2	6	4384	4389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839646
50	NC_017499	ACC	2	6	4399	4404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385839646
51	NC_017499	TTG	2	6	4503	4508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839646
52	NC_017499	AAT	2	6	4593	4598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839646
53	NC_017499	CAT	2	6	4603	4608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839646
54	NC_017499	AAT	2	6	4654	4659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017499	CTA	2	6	4704	4709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017499	CTA	2	6	4719	4724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017499	TCT	2	6	4913	4918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017499	ATA	2	6	4932	4937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017499	TTC	2	6	4954	4959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017499	TGA	2	6	4966	4971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017499	ATT	2	6	5011	5016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017499	GTT	2	6	5025	5030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017499	AAT	2	6	5056	5061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017499	ATT	2	6	5068	5073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017499	ATT	3	9	5095	5103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017499	TCC	2	6	5129	5134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017499	TAA	2	6	5146	5151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017499	ACA	2	6	5181	5186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017499	AAG	2	6	5243	5248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017499	TTA	2	6	5304	5309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017499	TAA	2	6	5441	5446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017499	TAT	2	6	5509	5514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839647
73	NC_017499	ATC	2	6	5690	5695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839647
74	NC_017499	AGA	2	6	5717	5722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839647
75	NC_017499	TTC	2	6	5847	5852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839647
76	NC_017499	CCA	2	6	5907	5912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385839647
77	NC_017499	ATT	2	6	5958	5963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839647
78	NC_017499	TTC	2	6	5968	5973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839647
79	NC_017499	TTG	2	6	6034	6039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839647
80	NC_017499	AAG	2	6	6092	6097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839647
81	NC_017499	TGC	2	6	6125	6130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385839647
82	NC_017499	AGA	2	6	6134	6139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839647
83	NC_017499	TGA	2	6	6146	6151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839647
84	NC_017499	GAA	2	6	6300	6305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839647
85	NC_017499	TGG	2	6	6313	6318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385839647
86	NC_017499	TGA	2	6	6415	6420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017499	ATA	2	6	6489	6494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017499	AAG	2	6	6516	6521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017499	AAT	2	6	6719	6724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017499	ATA	2	6	6747	6752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017499	ACA	2	6	6761	6766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017499	TAA	2	6	6782	6787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017499	ATT	2	6	6793	6798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017499	TAA	2	6	6869	6874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017499	GGA	2	6	6978	6983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017499	CGC	2	6	7013	7018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_017499	GGT	2	6	7082	7087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017499	AAT	3	9	7220	7228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017499	AAG	2	6	7657	7662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839648
100	NC_017499	TAA	2	6	7673	7678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839648
101	NC_017499	CTA	2	6	7729	7734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839648
102	NC_017499	ATG	2	6	7738	7743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839648
103	NC_017499	GTT	2	6	8091	8096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839648
104	NC_017499	AAC	2	6	8275	8280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839648
105	NC_017499	ACC	2	6	8336	8341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385839648
106	NC_017499	ATG	2	6	8344	8349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017499	TTA	2	6	8384	8389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017499	ACT	2	6	8432	8437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017499	CGA	2	6	8445	8450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017499	AGT	2	6	8554	8559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017499	CAT	2	6	8588	8593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017499	ATA	2	6	8691	8696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017499	TAT	2	6	8742	8747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017499	TTA	2	6	8915	8920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017499	AGC	2	6	8949	8954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017499	CAC	2	6	9143	9148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385839649
117	NC_017499	GCT	2	6	9196	9201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385839649
118	NC_017499	TTG	2	6	9294	9299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839649
119	NC_017499	TCT	2	6	9379	9384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839649
120	NC_017499	AAT	2	6	9397	9402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839649
121	NC_017499	AGA	2	6	9456	9461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839649
122	NC_017499	TAA	2	6	9468	9473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839649
123	NC_017499	AGC	2	6	9540	9545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385839649
124	NC_017499	ATT	2	6	9699	9704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839649
125	NC_017499	TAA	2	6	9762	9767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839649
126	NC_017499	AAG	2	6	9785	9790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839649
127	NC_017499	AAT	2	6	9826	9831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839649
128	NC_017499	TCT	2	6	9877	9882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839649
129	NC_017499	ACA	2	6	9907	9912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839649
130	NC_017499	GCT	2	6	9952	9957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385839649
131	NC_017499	CTT	2	6	10061	10066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839649
132	NC_017499	GAA	2	6	10080	10085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839649
133	NC_017499	ACT	2	6	10099	10104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839649
134	NC_017499	GTT	2	6	10148	10153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839649
135	NC_017499	ATA	2	6	10168	10173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839649
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137	NC_017499	TAA	2	6	10314	10319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839649
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