MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 plasmid pQA518

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017495	AAAG	2	8	726	733	75 %	0 %	25 %	0 %	385836840
2	NC_017495	CTTT	2	8	743	750	0 %	75 %	0 %	25 %	385836840
3	NC_017495	AAGC	2	8	808	815	50 %	0 %	25 %	25 %	385836840
4	NC_017495	CGGA	2	8	1080	1087	25 %	0 %	50 %	25 %	385836840
5	NC_017495	GCGA	2	8	1140	1147	25 %	0 %	50 %	25 %	385836840
6	NC_017495	AAAG	2	8	1260	1267	75 %	0 %	25 %	0 %	385836840
7	NC_017495	ATGA	2	8	1459	1466	50 %	25 %	25 %	0 %	385836840
8	NC_017495	TACC	2	8	1645	1652	25 %	25 %	0 %	50 %	385836840
9	NC_017495	TGAG	2	8	1680	1687	25 %	25 %	50 %	0 %	385836840
10	NC_017495	TTGT	2	8	2486	2493	0 %	75 %	25 %	0 %	385836842
11	NC_017495	CTGA	2	8	2507	2514	25 %	25 %	25 %	25 %	385836842
12	NC_017495	ACCG	2	8	2793	2800	25 %	0 %	25 %	50 %	385836842
13	NC_017495	CATA	2	8	3425	3432	50 %	25 %	0 %	25 %	385836842
14	NC_017495	AGCA	2	8	4070	4077	50 %	0 %	25 %	25 %	385836843
15	NC_017495	CATA	2	8	4396	4403	50 %	25 %	0 %	25 %	385836843
16	NC_017495	CGCT	2	8	4429	4436	0 %	25 %	25 %	50 %	385836843
17	NC_017495	CACC	2	8	5078	5085	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
18	NC_017495	CACT	2	8	5122	5129	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017495	AGTA	2	8	5327	5334	50 %	25 %	25 %	0 %	385836844
20	NC_017495	TAAA	2	8	5462	5469	75 %	25 %	0 %	0 %	385836844
21	NC_017495	GAAA	2	8	5849	5856	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017495	CTTG	2	8	6961	6968	0 %	50 %	25 %	25 %	385836845
23	NC_017495	TTCT	2	8	7731	7738	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017495	TAAT	2	8	7802	7809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017495	TAAT	2	8	7916	7923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017495	TATG	2	8	8064	8071	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017495	TGAC	2	8	8928	8935	25 %	25 %	25 %	25 %	385836847
28	NC_017495	TAAA	2	8	9483	9490	75 %	25 %	0 %	0 %	385836847
29	NC_017495	TTAT	2	8	9577	9584	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017495	TTTA	2	8	10041	10048	25 %	75 %	0 %	0 %	385836848
31	NC_017495	ACGG	2	8	10130	10137	25 %	0 %	50 %	25 %	385836848
32	NC_017495	ATCA	2	8	10153	10160	50 %	25 %	0 %	25 %	385836848
33	NC_017495	GGAT	2	8	11132	11139	25 %	25 %	50 %	0 %	385836849
34	NC_017495	ACGA	2	8	12872	12879	50 %	0 %	25 %	25 %	385836850
35	NC_017495	AAGC	2	8	12983	12990	50 %	0 %	25 %	25 %	385836850
36	NC_017495	ATCT	2	8	13017	13024	25 %	50 %	0 %	25 %	385836850
37	NC_017495	AGCC	2	8	13201	13208	25 %	0 %	25 %	50 %	385836850
38	NC_017495	CGTT	2	8	13253	13260	0 %	50 %	25 %	25 %	385836850
39	NC_017495	ATTG	2	8	13314	13321	25 %	50 %	25 %	0 %	385836850
40	NC_017495	ATTC	2	8	13374	13381	25 %	50 %	0 %	25 %	385836850
41	NC_017495	AGCA	2	8	14277	14284	50 %	0 %	25 %	25 %	385836850
42	NC_017495	ATCA	2	8	14777	14784	50 %	25 %	0 %	25 %	385836851
43	NC_017495	CATC	2	8	15793	15800	25 %	25 %	0 %	50 %	385836851
44	NC_017495	TGCT	2	8	16214	16221	0 %	50 %	25 %	25 %	385836851
45	NC_017495	TCGG	2	8	16419	16426	0 %	25 %	50 %	25 %	385836851
46	NC_017495	GTTG	2	8	16467	16474	0 %	50 %	50 %	0 %	385836851
47	NC_017495	TTGC	2	8	16829	16836	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017495	ATTT	2	8	16930	16937	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017495	TTTA	2	8	17100	17107	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017495	TTTC	2	8	17145	17152	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017495	ATAA	2	8	17556	17563	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017495	TACA	2	8	17604	17611	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.