MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 plasmid pQA549

Total Repeats: 1059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017493	GAGC	2	8	21580	21587	25 %	0 %	50 %	25 %	385836944
502	NC_017493	CAA	2	6	21602	21607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836944
503	NC_017493	AG	3	6	21620	21625	50 %	0 %	50 %	0 %	385836944
504	NC_017493	TCTCT	2	10	21629	21638	0 %	60 %	0 %	40 %	385836944
505	NC_017493	CAA	2	6	21644	21649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836944
506	NC_017493	TCC	2	6	21652	21657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_017493	TCA	2	6	21724	21729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836945
508	NC_017493	AGT	2	6	21744	21749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836945
509	NC_017493	TGC	2	6	21765	21770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836945
510	NC_017493	CTT	2	6	21779	21784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836945
511	NC_017493	CTT	3	9	21935	21943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836945
512	NC_017493	CAG	2	6	21959	21964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836945
513	NC_017493	TCACCA	2	12	21988	21999	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	385836945
514	NC_017493	TCA	2	6	22147	22152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836945
515	NC_017493	AAG	2	6	22168	22173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836945
516	NC_017493	TTG	2	6	22230	22235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836945
517	NC_017493	CAT	2	6	22259	22264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836945
518	NC_017493	T	6	6	22373	22378	0 %	100 %	0 %	0 %	385836945
519	NC_017493	AAG	3	9	22386	22394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836945
520	NC_017493	CTT	2	6	22400	22405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836945
521	NC_017493	TTG	2	6	22418	22423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836945
522	NC_017493	GAA	2	6	22456	22461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836945
523	NC_017493	TCA	2	6	22477	22482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836945
524	NC_017493	TTC	2	6	22500	22505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836945
525	NC_017493	CAC	2	6	22562	22567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385836945
526	NC_017493	TCTGT	2	10	22634	22643	0 %	60 %	20 %	20 %	385836945
527	NC_017493	TAA	2	6	22766	22771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836946
528	NC_017493	T	7	7	22783	22789	0 %	100 %	0 %	0 %	385836946
529	NC_017493	AAC	2	6	22847	22852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836946
530	NC_017493	TTC	2	6	22979	22984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836946
531	NC_017493	CTT	2	6	22999	23004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836946
532	NC_017493	ATT	2	6	23030	23035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836946
533	NC_017493	CGA	2	6	23060	23065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836946
534	NC_017493	GTG	2	6	23083	23088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385836946
535	NC_017493	ATA	2	6	23150	23155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836946
536	NC_017493	TAA	2	6	23212	23217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836946
537	NC_017493	CTT	2	6	23248	23253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836946
538	NC_017493	TTG	2	6	23263	23268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836946
539	NC_017493	ACC	2	6	23405	23410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385836946
540	NC_017493	CCA	2	6	23478	23483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385836946
541	NC_017493	CAC	2	6	23612	23617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385836947
542	NC_017493	CAAT	2	8	23699	23706	50 %	25 %	0 %	25 %	385836947
543	NC_017493	T	6	6	23706	23711	0 %	100 %	0 %	0 %	385836947
544	NC_017493	TCT	2	6	23716	23721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836947
545	NC_017493	ATG	2	6	23755	23760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836947
546	NC_017493	TCAT	2	8	23761	23768	25 %	50 %	0 %	25 %	385836947
547	NC_017493	AAG	2	6	23769	23774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836947
548	NC_017493	ACC	2	6	23775	23780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385836947
549	NC_017493	ATC	2	6	23785	23790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836947
550	NC_017493	CCA	2	6	23791	23796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385836947
551	NC_017493	TTC	2	6	23820	23825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836947
552	NC_017493	TTTA	2	8	23883	23890	25 %	75 %	0 %	0 %	385836947
553	NC_017493	ATAC	2	8	23923	23930	50 %	25 %	0 %	25 %	385836947
554	NC_017493	TAC	2	6	23952	23957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836947
555	NC_017493	T	6	6	23970	23975	0 %	100 %	0 %	0 %	385836947
556	NC_017493	ATAG	2	8	23979	23986	50 %	25 %	25 %	0 %	385836947
557	NC_017493	GTAC	2	8	23995	24002	25 %	25 %	25 %	25 %	385836947
558	NC_017493	T	6	6	24113	24118	0 %	100 %	0 %	0 %	385836947
559	NC_017493	TGA	2	6	24164	24169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836948
560	NC_017493	CAT	2	6	24177	24182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836948
561	NC_017493	TCA	2	6	24224	24229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836948
562	NC_017493	CGA	2	6	24231	24236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836948
563	NC_017493	CTG	2	6	24312	24317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836948
564	NC_017493	TTTA	2	8	24400	24407	25 %	75 %	0 %	0 %	385836948
565	NC_017493	CAA	2	6	24435	24440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836948
566	NC_017493	GTCC	2	8	24447	24454	0 %	25 %	25 %	50 %	385836948
567	NC_017493	CTT	2	6	24480	24485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836948
568	NC_017493	CAA	3	9	24540	24548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836948
569	NC_017493	CCT	2	6	24564	24569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_017493	GTAGAA	2	12	24592	24603	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017493	TCA	2	6	24635	24640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_017493	TA	3	6	24651	24656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017493	CAAA	2	8	24669	24676	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
574	NC_017493	T	6	6	24696	24701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017493	T	9	9	24703	24711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017493	T	7	7	24717	24723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017493	A	6	6	24724	24729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017493	ATT	2	6	24746	24751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017493	TCA	2	6	24919	24924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_017493	GTTT	2	8	24931	24938	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017493	TTGT	2	8	24949	24956	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017493	A	7	7	25011	25017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017493	GAAA	2	8	25027	25034	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017493	A	6	6	25050	25055	100 %	0 %	0 %	0 %	385836949
585	NC_017493	CGA	2	6	25056	25061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836949
586	NC_017493	A	6	6	25066	25071	100 %	0 %	0 %	0 %	385836949
587	NC_017493	ACCATA	2	12	25098	25109	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385836949
588	NC_017493	ATA	2	6	25116	25121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836949
589	NC_017493	TGG	2	6	25202	25207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385836949
590	NC_017493	GAA	2	6	25256	25261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836949
591	NC_017493	A	6	6	25279	25284	100 %	0 %	0 %	0 %	385836949
592	NC_017493	A	6	6	25296	25301	100 %	0 %	0 %	0 %	385836949
593	NC_017493	CTT	2	6	25470	25475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836949
594	NC_017493	AAGG	2	8	25611	25618	50 %	0 %	50 %	0 %	385836949
595	NC_017493	CAA	2	6	25626	25631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836949
596	NC_017493	TTA	2	6	25662	25667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836949
597	NC_017493	TCGA	2	8	25684	25691	25 %	25 %	25 %	25 %	385836949
598	NC_017493	CAT	2	6	25733	25738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836949
599	NC_017493	ACT	2	6	25788	25793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836949
600	NC_017493	ACT	2	6	25836	25841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_017493	AAT	2	6	25846	25851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017493	A	7	7	25859	25865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017493	T	7	7	25896	25902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017493	ATT	2	6	25941	25946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017493	A	6	6	25956	25961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017493	CTA	2	6	25991	25996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_017493	AGGG	2	8	26065	26072	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017493	AGT	2	6	26105	26110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017493	T	6	6	26216	26221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017493	A	7	7	26226	26232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017493	T	6	6	26335	26340	0 %	100 %	0 %	0 %	385836950
612	NC_017493	ATC	2	6	26395	26400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836950
613	NC_017493	TTC	2	6	26448	26453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836950
614	NC_017493	T	6	6	26509	26514	0 %	100 %	0 %	0 %	385836950
615	NC_017493	TAT	2	6	26600	26605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836950
616	NC_017493	AT	3	6	26624	26629	50 %	50 %	0 %	0 %	385836950
617	NC_017493	CTT	2	6	26804	26809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836950
618	NC_017493	CTT	2	6	26819	26824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836950
619	NC_017493	TAA	2	6	26906	26911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017493	ACG	2	6	27072	27077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_017493	CAA	2	6	27087	27092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_017493	CTCTA	2	10	27110	27119	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
623	NC_017493	GAA	2	6	27188	27193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017493	A	7	7	27205	27211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017493	AGTG	2	8	27240	27247	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017493	TTA	2	6	27330	27335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836951
627	NC_017493	CATC	2	8	27352	27359	25 %	25 %	0 %	50 %	385836951
628	NC_017493	TCA	2	6	27447	27452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836951
629	NC_017493	TCT	2	6	27453	27458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836951
630	NC_017493	CTA	2	6	27553	27558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836951
631	NC_017493	TCA	2	6	27583	27588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_017493	GCA	2	6	27692	27697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836952
633	NC_017493	AAT	2	6	27702	27707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836952
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