MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 chromosome

Total Repeats: 1963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017492	GTCTT	2	10	4976	4985	0 %	60 %	20 %	20 %	385836972
2	NC_017492	AAATG	2	10	12223	12232	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017492	ATGGT	2	10	13026	13035	20 %	40 %	40 %	0 %	385836978
4	NC_017492	GAAAA	2	10	14022	14031	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017492	ATTTT	2	10	15287	15296	20 %	80 %	0 %	0 %	385836980
6	NC_017492	TGCGA	2	10	16542	16551	20 %	20 %	40 %	20 %	385836980
7	NC_017492	TACTT	2	10	17187	17196	20 %	60 %	0 %	20 %	385836980
8	NC_017492	TGATT	2	10	19254	19263	20 %	60 %	20 %	0 %	385836984
9	NC_017492	TTTGG	2	10	22608	22617	0 %	60 %	40 %	0 %	385836987
10	NC_017492	TGGTA	2	10	24549	24558	20 %	40 %	40 %	0 %	385836988
11	NC_017492	CTTAA	2	10	25608	25617	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017492	AAGTC	2	10	25749	25758	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017492	TGGCT	2	10	26547	26556	0 %	40 %	40 %	20 %	385836989
14	NC_017492	ATTTT	2	10	26642	26651	20 %	80 %	0 %	0 %	385836989
15	NC_017492	AGAGA	2	10	27560	27569	60 %	0 %	40 %	0 %	385836990
16	NC_017492	CAAAA	2	10	27908	27917	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017492	TATAA	2	10	36755	36764	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017492	TAGAG	2	10	38075	38084	40 %	20 %	40 %	0 %	385837001
19	NC_017492	TAAGC	2	10	38821	38830	40 %	20 %	20 %	20 %	385837002
20	NC_017492	TTTAA	2	10	39159	39168	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017492	TGGAT	2	10	39384	39393	20 %	40 %	40 %	0 %	385837003
22	NC_017492	AAAAG	2	10	39850	39859	80 %	0 %	20 %	0 %	385837004
23	NC_017492	TCAAA	2	10	40018	40027	60 %	20 %	0 %	20 %	385837004
24	NC_017492	TAATC	2	10	41239	41248	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017492	GTGAG	2	10	41594	41603	20 %	20 %	60 %	0 %	385837005
26	NC_017492	AGTAA	2	10	42297	42306	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017492	TTTAT	2	10	42635	42644	20 %	80 %	0 %	0 %	385837006
28	NC_017492	AATTA	2	10	43009	43018	60 %	40 %	0 %	0 %	385837006
29	NC_017492	ATTAT	2	10	43282	43291	40 %	60 %	0 %	0 %	385837006
30	NC_017492	AATCA	2	10	45122	45131	60 %	20 %	0 %	20 %	385837008
31	NC_017492	TTTAA	2	10	45717	45726	40 %	60 %	0 %	0 %	385837008
32	NC_017492	GCTTG	2	10	48803	48812	0 %	40 %	40 %	20 %	385837011
33	NC_017492	TCCAT	2	10	49154	49163	20 %	40 %	0 %	40 %	385837011
34	NC_017492	TTGTA	2	10	52936	52945	20 %	60 %	20 %	0 %	385837016
35	NC_017492	GCTTC	2	10	53737	53746	0 %	40 %	20 %	40 %	385837017
36	NC_017492	AATTG	2	10	54118	54127	40 %	40 %	20 %	0 %	385837018
37	NC_017492	AAAAT	2	10	55800	55809	80 %	20 %	0 %	0 %	385837020
38	NC_017492	AGTTT	2	10	58007	58016	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017492	ATTAA	2	10	58782	58791	60 %	40 %	0 %	0 %	385837024
40	NC_017492	GTCTT	2	10	59053	59062	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017492	CAAAT	2	10	61486	61495	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017492	CAAGC	2	10	63667	63676	40 %	0 %	20 %	40 %	385837028
43	NC_017492	CCATT	2	10	65907	65916	20 %	40 %	0 %	40 %	385837030
44	NC_017492	TACTA	2	10	66780	66789	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017492	CAAGA	2	10	67131	67140	60 %	0 %	20 %	20 %	385837032
46	NC_017492	TCCAA	2	10	67286	67295	40 %	20 %	0 %	40 %	385837032
47	NC_017492	AATAT	2	10	68851	68860	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017492	TGAGT	2	10	70996	71005	20 %	40 %	40 %	0 %	385837035
49	NC_017492	TGAAA	2	10	71512	71521	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017492	AATTT	2	10	73937	73946	40 %	60 %	0 %	0 %	385837039
51	NC_017492	ACTGG	2	10	74768	74777	20 %	20 %	40 %	20 %	385837040
52	NC_017492	AATTT	2	10	76189	76198	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017492	AATTA	2	10	76236	76245	60 %	40 %	0 %	0 %	385837042
54	NC_017492	TATTT	2	10	77134	77143	20 %	80 %	0 %	0 %	385837042
55	NC_017492	CAAAC	2	10	77241	77250	60 %	0 %	0 %	40 %	385837042
56	NC_017492	TTTTC	2	10	78943	78952	0 %	80 %	0 %	20 %	385837044
57	NC_017492	ATGCT	2	10	79084	79093	20 %	40 %	20 %	20 %	385837044
58	NC_017492	CTTTT	2	10	79230	79239	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017492	CTATT	2	10	79240	79249	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017492	AAGAG	2	10	79573	79582	60 %	0 %	40 %	0 %	385837045
61	NC_017492	CTTTA	2	10	80149	80158	20 %	60 %	0 %	20 %	385837046
62	NC_017492	TCCGG	2	10	81263	81272	0 %	20 %	40 %	40 %	385837047
63	NC_017492	ATTAA	2	10	82462	82471	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017492	ATTGG	2	10	83486	83495	20 %	40 %	40 %	0 %	385837049
65	NC_017492	TTCGT	2	10	83522	83531	0 %	60 %	20 %	20 %	385837049
66	NC_017492	AAAGT	2	10	85068	85077	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017492	CAAAT	2	10	86695	86704	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017492	AAAAT	2	10	87187	87196	80 %	20 %	0 %	0 %	385837052
69	NC_017492	AGGTT	2	10	87855	87864	20 %	40 %	40 %	0 %	385837053
70	NC_017492	CTCAA	2	10	87944	87953	40 %	20 %	0 %	40 %	385837053
71	NC_017492	GAGTA	2	10	89269	89278	40 %	20 %	40 %	0 %	385837054
72	NC_017492	AGGAG	2	10	89319	89328	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017492	ACTGA	2	10	93501	93510	40 %	20 %	20 %	20 %	385837058
74	NC_017492	TTTGA	2	10	97920	97929	20 %	60 %	20 %	0 %	385837063
75	NC_017492	ATAAA	2	10	98055	98064	80 %	20 %	0 %	0 %	385837063
76	NC_017492	ATATG	2	10	100007	100016	40 %	40 %	20 %	0 %	385837065
77	NC_017492	TTAAA	2	10	105164	105173	60 %	40 %	0 %	0 %	385837071
78	NC_017492	ATTTT	2	10	105474	105483	20 %	80 %	0 %	0 %	385837072
79	NC_017492	TGCTT	2	10	107523	107532	0 %	60 %	20 %	20 %	385837073
80	NC_017492	TTCTG	2	10	108529	108538	0 %	60 %	20 %	20 %	385837075
81	NC_017492	AAATA	2	10	109840	109849	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017492	CTTTA	2	10	111003	111012	20 %	60 %	0 %	20 %	385837077
83	NC_017492	TTGTA	2	10	111177	111186	20 %	60 %	20 %	0 %	385837078
84	NC_017492	ATTTT	2	10	111816	111825	20 %	80 %	0 %	0 %	385837078
85	NC_017492	GCTTC	2	10	111978	111987	0 %	40 %	20 %	40 %	385837079
86	NC_017492	TATAT	2	10	113572	113581	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017492	TAGAG	2	10	115193	115202	40 %	20 %	40 %	0 %	385837083
88	NC_017492	TAAAT	2	10	115730	115739	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017492	TTTTA	2	10	116889	116898	20 %	80 %	0 %	0 %	385837086
90	NC_017492	GTAAA	2	10	118955	118964	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017492	TTATT	2	10	119949	119958	20 %	80 %	0 %	0 %	385837090
92	NC_017492	TCTTT	2	10	121135	121144	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017492	TTGCT	2	10	121436	121445	0 %	60 %	20 %	20 %	385837091
94	NC_017492	ACGAG	2	10	122767	122776	40 %	0 %	40 %	20 %	385837093
95	NC_017492	TGAGT	2	10	122810	122819	20 %	40 %	40 %	0 %	385837093
96	NC_017492	GCAGA	2	10	123425	123434	40 %	0 %	40 %	20 %	385837094
97	NC_017492	TTTTA	2	10	125979	125988	20 %	80 %	0 %	0 %	385837097
98	NC_017492	AAGCT	2	10	126152	126161	40 %	20 %	20 %	20 %	385837097
99	NC_017492	TGGAT	2	10	127147	127156	20 %	40 %	40 %	0 %	385837098
100	NC_017492	ATAAA	2	10	129536	129545	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017492	CAAGA	2	10	130533	130542	60 %	0 %	20 %	20 %	385837103
102	NC_017492	ATAGA	2	10	131404	131413	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017492	AAAGA	2	10	135023	135032	80 %	0 %	20 %	0 %	385837107
104	NC_017492	AGAGT	2	10	135433	135442	40 %	20 %	40 %	0 %	385837108
105	NC_017492	TGGTT	2	10	136106	136115	0 %	60 %	40 %	0 %	385837108
106	NC_017492	ATTTG	2	10	136441	136450	20 %	60 %	20 %	0 %	385837109
107	NC_017492	TATGA	2	10	138718	138727	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017492	TCGTA	2	10	139173	139182	20 %	40 %	20 %	20 %	385837112
109	NC_017492	TTATA	2	10	139938	139947	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017492	GATTT	2	10	143027	143036	20 %	60 %	20 %	0 %	385837115
111	NC_017492	TCAAA	2	10	145457	145466	60 %	20 %	0 %	20 %	385837118
112	NC_017492	TCGCA	2	10	149085	149094	20 %	20 %	20 %	40 %	385837122
113	NC_017492	TATTC	2	10	149918	149927	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017492	TTTTA	2	10	152092	152101	20 %	80 %	0 %	0 %	385837126
115	NC_017492	AATAA	2	10	153033	153042	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017492	CTCTA	2	10	153249	153258	20 %	40 %	0 %	40 %	385837127
117	NC_017492	ATTTG	2	10	156585	156594	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017492	GCTCC	2	10	156888	156897	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
119	NC_017492	TAAAA	2	10	156961	156970	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017492	TGGAT	2	10	157090	157099	20 %	40 %	40 %	0 %	385837130
121	NC_017492	GAAGG	2	10	157169	157178	40 %	0 %	60 %	0 %	385837130
122	NC_017492	AATTA	2	10	158071	158080	60 %	40 %	0 %	0 %	385837130
123	NC_017492	ATTTT	2	10	158977	158986	20 %	80 %	0 %	0 %	385837131
124	NC_017492	TTTTC	2	10	160281	160290	0 %	80 %	0 %	20 %	385837132
125	NC_017492	CCAAA	2	10	160826	160835	60 %	0 %	0 %	40 %	385837132
126	NC_017492	TGGCT	2	10	161790	161799	0 %	40 %	40 %	20 %	385837134
127	NC_017492	TCAAA	2	10	162368	162377	60 %	20 %	0 %	20 %	385837135
128	NC_017492	TTTTA	2	10	162641	162650	20 %	80 %	0 %	0 %	385837135
129	NC_017492	TTTTA	2	10	162971	162980	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017492	CAGGT	2	10	164843	164852	20 %	20 %	40 %	20 %	385837138
131	NC_017492	GTTTG	2	10	164904	164913	0 %	60 %	40 %	0 %	385837138
132	NC_017492	TTATT	2	10	166358	166367	20 %	80 %	0 %	0 %	385837140
133	NC_017492	TTTAC	2	10	166878	166887	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017492	TTGTT	2	10	167825	167834	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017492	TAAAA	2	10	168205	168214	80 %	20 %	0 %	0 %	385837143
136	NC_017492	TTTTC	2	10	172650	172659	0 %	80 %	0 %	20 %	385837150
137	NC_017492	TTAGG	2	10	172993	173002	20 %	40 %	40 %	0 %	385837150
138	NC_017492	TAACA	2	10	174048	174057	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017492	TTAAC	2	10	175911	175920	40 %	40 %	0 %	20 %	385837154
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