MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus rhamnosus ATCC 8530 chromosome

Total Repeats: 1773

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017491	TATAT	2	10	1650	1659	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017491	TAAAA	2	10	3254	3263	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017491	TAGGC	2	10	3465	3474	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017491	GCAAG	2	10	3999	4008	40 %	0 %	40 %	20 %	385833943
5	NC_017491	GATCG	2	10	4189	4198	20 %	20 %	40 %	20 %	385833943
6	NC_017491	GAAAA	2	10	7921	7930	80 %	0 %	20 %	0 %	385833945
7	NC_017491	AAAAT	2	10	10187	10196	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017491	ATTTG	2	10	14372	14381	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017491	CCGGT	2	10	16082	16091	0 %	20 %	40 %	40 %	385833956
10	NC_017491	AGCAG	2	10	18111	18120	40 %	0 %	40 %	20 %	385833960
11	NC_017491	TGGTG	2	10	22568	22577	0 %	40 %	60 %	0 %	385833964
12	NC_017491	AACTG	2	10	25227	25236	40 %	20 %	20 %	20 %	385833966
13	NC_017491	GATGC	2	10	25477	25486	20 %	20 %	40 %	20 %	385833966
14	NC_017491	GAATA	2	10	25948	25957	60 %	20 %	20 %	0 %	385833968
15	NC_017491	AAAAC	2	10	28799	28808	80 %	0 %	0 %	20 %	385833969
16	NC_017491	ATGAC	2	10	29481	29490	40 %	20 %	20 %	20 %	385833970
17	NC_017491	CTGAT	2	10	30246	30255	20 %	40 %	20 %	20 %	385833971
18	NC_017491	GATTT	2	10	36480	36489	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017491	TTAAT	2	10	36695	36704	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017491	TTTTC	2	10	37076	37085	0 %	80 %	0 %	20 %	385833979
21	NC_017491	AAGGA	2	10	37827	37836	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017491	TAGAT	2	10	41989	41998	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017491	GATCG	2	10	44153	44162	20 %	20 %	40 %	20 %	385833984
24	NC_017491	AAAGC	2	10	45589	45598	60 %	0 %	20 %	20 %	385833985
25	NC_017491	AGACA	2	10	48576	48585	60 %	0 %	20 %	20 %	385833985
26	NC_017491	AGCCA	2	10	48783	48792	40 %	0 %	20 %	40 %	385833985
27	NC_017491	ACAGT	2	10	49259	49268	40 %	20 %	20 %	20 %	385833985
28	NC_017491	CATCG	2	10	52576	52585	20 %	20 %	20 %	40 %	385833988
29	NC_017491	AGCCC	2	10	55605	55614	20 %	0 %	20 %	60 %	385833990
30	NC_017491	TTGGC	2	10	55688	55697	0 %	40 %	40 %	20 %	385833990
31	NC_017491	CCGAT	2	10	58915	58924	20 %	20 %	20 %	40 %	385833992
32	NC_017491	GGCGT	2	10	61392	61401	0 %	20 %	60 %	20 %	385833994
33	NC_017491	AAGTG	2	10	62769	62778	40 %	20 %	40 %	0 %	385833995
34	NC_017491	CATAG	2	10	68376	68385	40 %	20 %	20 %	20 %	385834000
35	NC_017491	CTGAG	2	10	71500	71509	20 %	20 %	40 %	20 %	385834003
36	NC_017491	TTGGA	2	10	71982	71991	20 %	40 %	40 %	0 %	385834003
37	NC_017491	AATGG	2	10	73757	73766	40 %	20 %	40 %	0 %	385834004
38	NC_017491	GATCC	2	10	76389	76398	20 %	20 %	20 %	40 %	385834007
39	NC_017491	GTGGC	2	10	77730	77739	0 %	20 %	60 %	20 %	385834009
40	NC_017491	GCCAA	2	10	78665	78674	40 %	0 %	20 %	40 %	385834010
41	NC_017491	AGTTC	2	10	78899	78908	20 %	40 %	20 %	20 %	385834011
42	NC_017491	AAACC	2	10	79127	79136	60 %	0 %	0 %	40 %	385834011
43	NC_017491	AGATC	2	10	81141	81150	40 %	20 %	20 %	20 %	385834013
44	NC_017491	CGTTT	2	10	84639	84648	0 %	60 %	20 %	20 %	385834016
45	NC_017491	TGGGA	2	10	88343	88352	20 %	20 %	60 %	0 %	385834020
46	NC_017491	GAAAA	2	10	89157	89166	80 %	0 %	20 %	0 %	385834022
47	NC_017491	GAATC	2	10	90412	90421	40 %	20 %	20 %	20 %	385834022
48	NC_017491	ATCGC	2	10	93734	93743	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_017491	GTTTT	2	10	100483	100492	0 %	80 %	20 %	0 %	385834033
50	NC_017491	CGAAG	2	10	101205	101214	40 %	0 %	40 %	20 %	385834033
51	NC_017491	CCCAT	2	10	101221	101230	20 %	20 %	0 %	60 %	385834033
52	NC_017491	AGTCG	2	10	101359	101368	20 %	20 %	40 %	20 %	385834033
53	NC_017491	ATCAT	2	10	103875	103884	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017491	GCTTG	2	10	105168	105177	0 %	40 %	40 %	20 %	385834036
55	NC_017491	GTTTC	2	10	106100	106109	0 %	60 %	20 %	20 %	385834037
56	NC_017491	CCATG	2	10	108594	108603	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_017491	AAAAC	2	10	109392	109401	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017491	TGGGC	2	10	113619	113628	0 %	20 %	60 %	20 %	385834046
59	NC_017491	AGGGC	2	10	113672	113681	20 %	0 %	60 %	20 %	385834046
60	NC_017491	GCTTT	2	10	114326	114335	0 %	60 %	20 %	20 %	385834046
61	NC_017491	TAACG	2	10	117610	117619	40 %	20 %	20 %	20 %	385834049
62	NC_017491	CCTTG	2	10	118118	118127	0 %	40 %	20 %	40 %	385834050
63	NC_017491	TCTTT	2	10	120500	120509	0 %	80 %	0 %	20 %	385834053
64	NC_017491	ATTGT	2	10	122066	122075	20 %	60 %	20 %	0 %	385834054
65	NC_017491	CAAAA	2	10	122805	122814	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017491	AACCA	2	10	125245	125254	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_017491	AGCTG	2	10	125965	125974	20 %	20 %	40 %	20 %	385834058
68	NC_017491	AAAAC	2	10	126919	126928	80 %	0 %	0 %	20 %	385834059
69	NC_017491	CGTGG	2	10	132452	132461	0 %	20 %	60 %	20 %	385834063
70	NC_017491	ACCGC	2	10	134820	134829	20 %	0 %	20 %	60 %	385834065
71	NC_017491	GCATC	2	10	136249	136258	20 %	20 %	20 %	40 %	385834066
72	NC_017491	AGGCT	2	10	136502	136511	20 %	20 %	40 %	20 %	385834066
73	NC_017491	GAATC	2	10	137075	137084	40 %	20 %	20 %	20 %	385834067
74	NC_017491	TGGCG	2	10	137270	137279	0 %	20 %	60 %	20 %	385834067
75	NC_017491	AATCA	2	10	138808	138817	60 %	20 %	0 %	20 %	385834068
76	NC_017491	TTTTC	2	10	139125	139134	0 %	80 %	0 %	20 %	385834068
77	NC_017491	GTTTG	2	10	139865	139874	0 %	60 %	40 %	0 %	385834069
78	NC_017491	GGTCA	2	10	140380	140389	20 %	20 %	40 %	20 %	385834070
79	NC_017491	CAGCT	2	10	140603	140612	20 %	20 %	20 %	40 %	385834070
80	NC_017491	CAGCA	2	10	143183	143192	40 %	0 %	20 %	40 %	385834071
81	NC_017491	GGGAT	2	10	144507	144516	20 %	20 %	60 %	0 %	385834072
82	NC_017491	CTCAA	2	10	146654	146663	40 %	20 %	0 %	40 %	385834073
83	NC_017491	GTGCC	2	10	148264	148273	0 %	20 %	40 %	40 %	385834075
84	NC_017491	TAATT	2	10	151848	151857	40 %	60 %	0 %	0 %	385834078
85	NC_017491	ATCGG	2	10	152837	152846	20 %	20 %	40 %	20 %	385834079
86	NC_017491	GTTCG	2	10	154366	154375	0 %	40 %	40 %	20 %	385834081
87	NC_017491	CGGTG	2	10	155325	155334	0 %	20 %	60 %	20 %	385834082
88	NC_017491	GCAAG	2	10	158638	158647	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017491	TGCTG	2	10	164872	164881	0 %	40 %	40 %	20 %	385834091
90	NC_017491	ACGCT	2	10	164909	164918	20 %	20 %	20 %	40 %	385834091
91	NC_017491	ATTGC	2	10	167131	167140	20 %	40 %	20 %	20 %	385834093
92	NC_017491	GCAAT	2	10	168947	168956	40 %	20 %	20 %	20 %	385834095
93	NC_017491	GCGTG	2	10	171937	171946	0 %	20 %	60 %	20 %	385834100
94	NC_017491	GAAGA	2	10	172169	172178	60 %	0 %	40 %	0 %	385834100
95	NC_017491	CAAAC	2	10	173384	173393	60 %	0 %	0 %	40 %	385834101
96	NC_017491	AATTT	2	10	174120	174129	40 %	60 %	0 %	0 %	385834101
97	NC_017491	GGCAA	3	15	175200	175214	40 %	0 %	40 %	20 %	385834102
98	NC_017491	AATCA	2	10	175994	176003	60 %	20 %	0 %	20 %	385834103
99	NC_017491	TTGGT	2	10	177645	177654	0 %	60 %	40 %	0 %	385834106
100	NC_017491	TCACT	2	10	180881	180890	20 %	40 %	0 %	40 %	385834110
101	NC_017491	AAGTC	2	10	181453	181462	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017491	TTCAT	2	10	182431	182440	20 %	60 %	0 %	20 %	385834111
103	NC_017491	TCGAC	2	10	182908	182917	20 %	20 %	20 %	40 %	385834111
104	NC_017491	CAAGC	2	10	185918	185927	40 %	0 %	20 %	40 %	385834114
105	NC_017491	TAAGC	2	10	189417	189426	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017491	CACAA	2	10	190860	190869	60 %	0 %	0 %	40 %	385834119
107	NC_017491	AATAA	2	10	191309	191318	80 %	20 %	0 %	0 %	385834120
108	NC_017491	GTGAT	2	10	192486	192495	20 %	40 %	40 %	0 %	385834120
109	NC_017491	TGGTC	2	10	193717	193726	0 %	40 %	40 %	20 %	385834122
110	NC_017491	TTCGG	2	10	195929	195938	0 %	40 %	40 %	20 %	385834123
111	NC_017491	GGCCG	2	10	196777	196786	0 %	0 %	60 %	40 %	385834124
112	NC_017491	ATGCG	2	10	198953	198962	20 %	20 %	40 %	20 %	385834126
113	NC_017491	GCCGA	2	10	199543	199552	20 %	0 %	40 %	40 %	385834127
114	NC_017491	CCGTT	2	10	199616	199625	0 %	40 %	20 %	40 %	385834127
115	NC_017491	TTGTT	2	10	203200	203209	0 %	80 %	20 %	0 %	385834133
116	NC_017491	AAATT	2	10	207557	207566	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017491	CAGCC	2	10	209353	209362	20 %	0 %	20 %	60 %	385834138
118	NC_017491	GCTAT	2	10	210550	210559	20 %	40 %	20 %	20 %	385834139
119	NC_017491	GACGG	2	10	210917	210926	20 %	0 %	60 %	20 %	385834140
120	NC_017491	TTATT	2	10	211104	211113	20 %	80 %	0 %	0 %	385834140
121	NC_017491	CAGAT	2	10	212840	212849	40 %	20 %	20 %	20 %	385834142
122	NC_017491	GAAGG	2	10	217225	217234	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017491	TCTTT	2	10	217355	217364	0 %	80 %	0 %	20 %	385834147
124	NC_017491	GACCC	2	10	220802	220811	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
125	NC_017491	CAAAG	2	10	223014	223023	60 %	0 %	20 %	20 %	385834154
126	NC_017491	AAGGT	2	10	223358	223367	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017491	TTCAT	2	10	223633	223642	20 %	60 %	0 %	20 %	385834155
128	NC_017491	TGAGG	2	10	223746	223755	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017491	TGATC	2	10	226354	226363	20 %	40 %	20 %	20 %	385834161
130	NC_017491	GTTGC	2	10	231153	231162	0 %	40 %	40 %	20 %	385834169
131	NC_017491	AGAGA	2	10	236353	236362	60 %	0 %	40 %	0 %	385834177
132	NC_017491	CGATT	2	10	236797	236806	20 %	40 %	20 %	20 %	385834178
133	NC_017491	AAAGC	2	10	244542	244551	60 %	0 %	20 %	20 %	385834187
134	NC_017491	TCCGG	2	10	244619	244628	0 %	20 %	40 %	40 %	385834187
135	NC_017491	CGAAC	2	10	244715	244724	40 %	0 %	20 %	40 %	385834187
136	NC_017491	GGTTT	2	10	245861	245870	0 %	60 %	40 %	0 %	385834188
137	NC_017491	ACGGT	2	10	248604	248613	20 %	20 %	40 %	20 %	385834192
138	NC_017491	ACCGT	2	10	251626	251635	20 %	20 %	20 %	40 %	385834195
139	NC_017491	GCATC	2	10	251741	251750	20 %	20 %	20 %	40 %	385834195
140	NC_017491	TATCA	2	10	252003	252012	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_017491	CGGTT	2	10	255943	255952	0 %	40 %	40 %	20 %	385834199
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143	NC_017491	AGTCA	2	10	260013	260022	40 %	20 %	20 %	20 %	385834202
144	NC_017491	GGTTA	2	10	265064	265073	20 %	40 %	40 %	0 %	385834208
145	NC_017491	AATCT	2	10	265448	265457	40 %	40 %	0 %	20 %	385834208
146	NC_017491	TTTGA	2	10	267203	267212	20 %	60 %	20 %	0 %	385834210
147	NC_017491	CCGGT	2	10	267600	267609	0 %	20 %	40 %	40 %	385834210
148	NC_017491	CATTT	2	10	275089	275098	20 %	60 %	0 %	20 %	385834217
149	NC_017491	AAAGA	2	10	277937	277946	80 %	0 %	20 %	0 %	385834219
150	NC_017491	GTGGA	2	10	278157	278166	20 %	20 %	60 %	0 %	385834219
151	NC_017491	GACCA	2	10	279287	279296	40 %	0 %	20 %	40 %	385834221
152	NC_017491	AGCTT	2	10	280188	280197	20 %	40 %	20 %	20 %	385834221
153	NC_017491	ATTTG	2	10	281590	281599	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017491	CGGCA	2	10	282827	282836	20 %	0 %	40 %	40 %	385834224
155	NC_017491	TGATG	2	10	283394	283403	20 %	40 %	40 %	0 %	385834225
156	NC_017491	GGGAT	2	10	283409	283418	20 %	20 %	60 %	0 %	385834225
157	NC_017491	CAAAA	2	10	285104	285113	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
158	NC_017491	AATGA	2	10	287195	287204	60 %	20 %	20 %	0 %	385834230
159	NC_017491	AGGTG	2	10	289429	289438	20 %	20 %	60 %	0 %	385834231
160	NC_017491	TGGGA	2	10	289683	289692	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017491	GTCTG	2	10	290712	290721	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
162	NC_017491	TCGTG	2	10	291046	291055	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
163	NC_017491	TCGCA	2	10	291707	291716	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
164	NC_017491	AAACG	2	10	292120	292129	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
165	NC_017491	GAGAT	2	10	294533	294542	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
166	NC_017491	AAGAT	2	10	294893	294902	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
167	NC_017491	ATTCG	2	10	296014	296023	20 %	40 %	20 %	20 %	385834233
168	NC_017491	GGAAT	2	10	296064	296073	40 %	20 %	40 %	0 %	385834233
169	NC_017491	GATGG	2	10	298107	298116	20 %	20 %	60 %	0 %	385834236
170	NC_017491	GAGGT	2	10	301123	301132	20 %	20 %	60 %	0 %	385834239
171	NC_017491	ACGCA	2	10	305037	305046	40 %	0 %	20 %	40 %	385834244
172	NC_017491	GGATG	2	10	306446	306455	20 %	20 %	60 %	0 %	385834245
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174	NC_017491	CAAAC	2	10	314404	314413	60 %	0 %	0 %	40 %	385834252
175	NC_017491	GCATT	2	10	314567	314576	20 %	40 %	20 %	20 %	385834252
176	NC_017491	CGGCA	2	10	317288	317297	20 %	0 %	40 %	40 %	385834255
177	NC_017491	CAAAA	2	10	317393	317402	80 %	0 %	0 %	20 %	385834255
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179	NC_017491	TTTCG	2	10	324084	324093	0 %	60 %	20 %	20 %	385834259
180	NC_017491	ATCAG	2	10	329251	329260	40 %	20 %	20 %	20 %	385834264
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187	NC_017491	GTTGG	2	10	334322	334331	0 %	40 %	60 %	0 %	385834268
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193	NC_017491	ACGGG	2	10	350842	350851	20 %	0 %	60 %	20 %	385834283
194	NC_017491	AACGA	2	10	354483	354492	60 %	0 %	20 %	20 %	385834288
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196	NC_017491	AGCGG	2	10	360935	360944	20 %	0 %	60 %	20 %	385834294
197	NC_017491	TGGTT	2	10	361465	361474	0 %	60 %	40 %	0 %	385834295
198	NC_017491	AGCGC	2	10	364115	364124	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
199	NC_017491	TGATT	2	10	366136	366145	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
200	NC_017491	GATCG	2	10	369228	369237	20 %	20 %	40 %	20 %	385834304
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203	NC_017491	ATGCT	2	10	371390	371399	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
204	NC_017491	TGCCT	2	10	372682	372691	0 %	40 %	20 %	40 %	385834308
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207	NC_017491	GCCTT	2	10	378941	378950	0 %	40 %	20 %	40 %	385834314
208	NC_017491	TTTAA	2	10	380345	380354	40 %	60 %	0 %	0 %	385834317
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210	NC_017491	GAGTC	2	10	383548	383557	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
211	NC_017491	GCGAT	2	10	386053	386062	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
212	NC_017491	AACTG	2	10	386260	386269	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
213	NC_017491	GCTGG	2	10	388576	388585	0 %	20 %	60 %	20 %	385834325
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215	NC_017491	AATTG	2	10	391185	391194	40 %	40 %	20 %	0 %	385834328
216	NC_017491	GCTTG	2	10	392402	392411	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
217	NC_017491	AAAAG	2	10	394488	394497	80 %	0 %	20 %	0 %	385834332
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219	NC_017491	ATACG	2	10	395893	395902	40 %	20 %	20 %	20 %	385834334
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234	NC_017491	AACAA	2	10	414280	414289	80 %	0 %	0 %	20 %	385834351
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236	NC_017491	AAAGA	2	10	416149	416158	80 %	0 %	20 %	0 %	385834352
237	NC_017491	CAGAG	2	10	417859	417868	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
238	NC_017491	TGGCG	2	10	419800	419809	0 %	20 %	60 %	20 %	385834355
239	NC_017491	CGTAT	2	10	422675	422684	20 %	40 %	20 %	20 %	385834358
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241	NC_017491	TTTTC	2	10	423273	423282	0 %	80 %	0 %	20 %	385834359
242	NC_017491	GTTTT	2	10	424668	424677	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
243	NC_017491	TCAAT	2	10	427555	427564	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
244	NC_017491	AATGA	2	10	428783	428792	60 %	20 %	20 %	0 %	385834361
245	NC_017491	CATTC	2	10	429627	429636	20 %	40 %	0 %	40 %	385834362
246	NC_017491	GTTCG	2	10	429808	429817	0 %	40 %	40 %	20 %	385834362
247	NC_017491	AGCAA	2	10	430644	430653	60 %	0 %	20 %	20 %	385834363
248	NC_017491	GAAAA	2	10	435075	435084	80 %	0 %	20 %	0 %	385834368
249	NC_017491	GTTGT	2	10	435510	435519	0 %	60 %	40 %	0 %	385834368
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251	NC_017491	GAAGA	2	10	440333	440342	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
252	NC_017491	ATGCG	2	10	440659	440668	20 %	20 %	40 %	20 %	385834374
253	NC_017491	GACTG	2	10	442534	442543	20 %	20 %	40 %	20 %	385834375
254	NC_017491	CAAAA	2	10	445635	445644	80 %	0 %	0 %	20 %	385834378
255	NC_017491	GTTTG	2	10	445739	445748	0 %	60 %	40 %	0 %	385834379
256	NC_017491	AGTTG	2	10	446000	446009	20 %	40 %	40 %	0 %	385834379
257	NC_017491	CAGCA	2	10	448261	448270	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
258	NC_017491	ATTTG	2	10	450021	450030	20 %	60 %	20 %	0 %	385834382
259	NC_017491	AGACG	2	10	451200	451209	40 %	0 %	40 %	20 %	385834383
260	NC_017491	TCTAA	2	10	451303	451312	40 %	40 %	0 %	20 %	385834383
261	NC_017491	CTGGC	2	10	452012	452021	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
262	NC_017491	AGGAG	2	10	452492	452501	40 %	0 %	60 %	0 %	385834384
263	NC_017491	ATTGC	2	10	454208	454217	20 %	40 %	20 %	20 %	385834386
264	NC_017491	CTTGC	2	10	456358	456367	0 %	40 %	20 %	40 %	385834389
265	NC_017491	ATTTG	2	10	457803	457812	20 %	60 %	20 %	0 %	385834390
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