MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus rhamnosus ATCC 8530 chromosome

Total Repeats: 7528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017491	TTTA	2	8	605	612	25 %	75 %	0 %	0 %	385833939
2	NC_017491	TCCA	2	8	737	744	25 %	25 %	0 %	50 %	385833939
3	NC_017491	GCCT	2	8	909	916	0 %	25 %	25 %	50 %	385833939
4	NC_017491	ATAG	2	8	3058	3065	50 %	25 %	25 %	0 %	385833941
5	NC_017491	GCAA	2	8	3150	3157	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017491	TTTA	2	8	3208	3215	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017491	TAAT	2	8	3613	3620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017491	TGAT	2	8	3756	3763	25 %	50 %	25 %	0 %	385833942
9	NC_017491	TTTG	2	8	4242	4249	0 %	75 %	25 %	0 %	385833943
10	NC_017491	AAGA	2	8	5060	5067	75 %	0 %	25 %	0 %	385833944
11	NC_017491	AAGA	2	8	5081	5088	75 %	0 %	25 %	0 %	385833944
12	NC_017491	GCCA	2	8	6830	6837	25 %	0 %	25 %	50 %	385833944
13	NC_017491	ACGT	2	8	7184	7191	25 %	25 %	25 %	25 %	385833945
14	NC_017491	ATGA	2	8	7231	7238	50 %	25 %	25 %	0 %	385833945
15	NC_017491	GATT	2	8	7503	7510	25 %	50 %	25 %	0 %	385833945
16	NC_017491	TATT	2	8	8911	8918	25 %	75 %	0 %	0 %	385833945
17	NC_017491	GCAC	2	8	9068	9075	25 %	0 %	25 %	50 %	385833945
18	NC_017491	AAAT	2	8	10029	10036	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017491	GAAA	2	8	10291	10298	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017491	CGAA	2	8	10465	10472	50 %	0 %	25 %	25 %	385833947
21	NC_017491	GCCG	2	8	11760	11767	0 %	0 %	50 %	50 %	385833949
22	NC_017491	CTGG	2	8	11843	11850	0 %	25 %	50 %	25 %	385833949
23	NC_017491	TTCA	2	8	12505	12512	25 %	50 %	0 %	25 %	385833951
24	NC_017491	TTGG	2	8	12632	12639	0 %	50 %	50 %	0 %	385833951
25	NC_017491	AGCG	2	8	13297	13304	25 %	0 %	50 %	25 %	385833952
26	NC_017491	GGAC	2	8	13764	13771	25 %	0 %	50 %	25 %	385833954
27	NC_017491	TGAA	2	8	13815	13822	50 %	25 %	25 %	0 %	385833954
28	NC_017491	TTTG	2	8	14020	14027	0 %	75 %	25 %	0 %	385833954
29	NC_017491	TCAA	2	8	14040	14047	50 %	25 %	0 %	25 %	385833954
30	NC_017491	TCGG	2	8	14626	14633	0 %	25 %	50 %	25 %	385833955
31	NC_017491	CTGG	2	8	15664	15671	0 %	25 %	50 %	25 %	385833955
32	NC_017491	CAAT	2	8	16245	16252	50 %	25 %	0 %	25 %	385833956
33	NC_017491	TGTT	2	8	16292	16299	0 %	75 %	25 %	0 %	385833956
34	NC_017491	TTTA	2	8	16726	16733	25 %	75 %	0 %	0 %	385833956
35	NC_017491	CTAA	2	8	17213	17220	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017491	GTTT	2	8	17437	17444	0 %	75 %	25 %	0 %	385833958
37	NC_017491	AAGA	2	8	17681	17688	75 %	0 %	25 %	0 %	385833958
38	NC_017491	TTTA	2	8	17828	17835	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017491	ATTT	2	8	18468	18475	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017491	CAAC	2	8	18897	18904	50 %	0 %	0 %	50 %	385833961
41	NC_017491	ATAC	2	8	19257	19264	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017491	AGTG	2	8	19359	19366	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017491	ATTC	2	8	19390	19397	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017491	TACA	2	8	19548	19555	50 %	25 %	0 %	25 %	385833962
45	NC_017491	TAAA	2	8	20216	20223	75 %	25 %	0 %	0 %	385833962
46	NC_017491	GAAA	2	8	20437	20444	75 %	0 %	25 %	0 %	385833963
47	NC_017491	TTGA	2	8	20611	20618	25 %	50 %	25 %	0 %	385833963
48	NC_017491	GCTG	2	8	20827	20834	0 %	25 %	50 %	25 %	385833963
49	NC_017491	ATCA	2	8	21004	21011	50 %	25 %	0 %	25 %	385833963
50	NC_017491	TTTC	2	8	21207	21214	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017491	GGGC	2	8	21553	21560	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017491	TGCG	2	8	21595	21602	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017491	TTTG	2	8	21816	21823	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017491	TTGT	2	8	21913	21920	0 %	75 %	25 %	0 %	385833964
55	NC_017491	GTTG	2	8	22042	22049	0 %	50 %	50 %	0 %	385833964
56	NC_017491	GGCA	2	8	22466	22473	25 %	0 %	50 %	25 %	385833964
57	NC_017491	AGTT	2	8	22918	22925	25 %	50 %	25 %	0 %	385833964
58	NC_017491	GACG	2	8	23768	23775	25 %	0 %	50 %	25 %	385833965
59	NC_017491	TTAT	2	8	24256	24263	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017491	GGGT	2	8	24320	24327	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017491	TGCC	2	8	24614	24621	0 %	25 %	25 %	50 %	385833966
62	NC_017491	GTTG	2	8	24765	24772	0 %	50 %	50 %	0 %	385833966
63	NC_017491	CTTT	2	8	25241	25248	0 %	75 %	0 %	25 %	385833966
64	NC_017491	TTAA	3	12	25598	25609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017491	ACGA	2	8	26311	26318	50 %	0 %	25 %	25 %	385833968
66	NC_017491	TGAA	2	8	26916	26923	50 %	25 %	25 %	0 %	385833968
67	NC_017491	GGCA	2	8	27547	27554	25 %	0 %	50 %	25 %	385833968
68	NC_017491	CAGG	2	8	27762	27769	25 %	0 %	50 %	25 %	385833968
69	NC_017491	GATT	2	8	28023	28030	25 %	50 %	25 %	0 %	385833968
70	NC_017491	TGAC	2	8	28125	28132	25 %	25 %	25 %	25 %	385833968
71	NC_017491	AGCC	2	8	28740	28747	25 %	0 %	25 %	50 %	385833969
72	NC_017491	ATCC	2	8	28900	28907	25 %	25 %	0 %	50 %	385833969
73	NC_017491	GTCC	2	8	29588	29595	0 %	25 %	25 %	50 %	385833970
74	NC_017491	GAAA	2	8	29833	29840	75 %	0 %	25 %	0 %	385833971
75	NC_017491	TCAA	2	8	29937	29944	50 %	25 %	0 %	25 %	385833971
76	NC_017491	CCGG	2	8	30334	30341	0 %	0 %	50 %	50 %	385833971
77	NC_017491	CTTA	2	8	30749	30756	25 %	50 %	0 %	25 %	385833972
78	NC_017491	TTGC	2	8	31116	31123	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017491	CAAT	2	8	31642	31649	50 %	25 %	0 %	25 %	385833973
80	NC_017491	AACC	2	8	31750	31757	50 %	0 %	0 %	50 %	385833973
81	NC_017491	ATTT	2	8	32459	32466	25 %	75 %	0 %	0 %	385833974
82	NC_017491	GCGA	2	8	32485	32492	25 %	0 %	50 %	25 %	385833974
83	NC_017491	TTAT	2	8	32566	32573	25 %	75 %	0 %	0 %	385833974
84	NC_017491	CAAA	2	8	32879	32886	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017491	TTCA	2	8	33142	33149	25 %	50 %	0 %	25 %	385833975
86	NC_017491	GTAT	2	8	33973	33980	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017491	GATT	2	8	34764	34771	25 %	50 %	25 %	0 %	385833977
88	NC_017491	GCAG	2	8	34887	34894	25 %	0 %	50 %	25 %	385833977
89	NC_017491	CTGG	2	8	35193	35200	0 %	25 %	50 %	25 %	385833977
90	NC_017491	AGAA	2	8	35718	35725	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017491	TTAT	2	8	35979	35986	25 %	75 %	0 %	0 %	385833978
92	NC_017491	TTGG	2	8	36034	36041	0 %	50 %	50 %	0 %	385833978
93	NC_017491	GTTT	2	8	36618	36625	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017491	AAGT	2	8	37426	37433	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017491	CCGG	2	8	37460	37467	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017491	TGGG	2	8	37885	37892	0 %	25 %	75 %	0 %	385833980
97	NC_017491	AGAA	2	8	37984	37991	75 %	0 %	25 %	0 %	385833980
98	NC_017491	AAAT	2	8	38210	38217	75 %	25 %	0 %	0 %	385833980
99	NC_017491	ATGA	2	8	38379	38386	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017491	TCTA	2	8	38422	38429	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017491	CCTT	2	8	38695	38702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017491	TAGT	2	8	38717	38724	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017491	TATT	2	8	38793	38800	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017491	ATTT	2	8	39382	39389	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017491	AGCT	2	8	39914	39921	25 %	25 %	25 %	25 %	385833981
106	NC_017491	AGTC	2	8	39944	39951	25 %	25 %	25 %	25 %	385833981
107	NC_017491	AAAC	2	8	40429	40436	75 %	0 %	0 %	25 %	385833981
108	NC_017491	CGAC	2	8	40777	40784	25 %	0 %	25 %	50 %	385833981
109	NC_017491	ATGA	2	8	42064	42071	50 %	25 %	25 %	0 %	385833982
110	NC_017491	GATC	2	8	42613	42620	25 %	25 %	25 %	25 %	385833982
111	NC_017491	CTGT	2	8	42732	42739	0 %	50 %	25 %	25 %	385833982
112	NC_017491	CTGC	2	8	42989	42996	0 %	25 %	25 %	50 %	385833983
113	NC_017491	CTTT	2	8	43173	43180	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017491	CAAA	2	8	43236	43243	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017491	TGGA	2	8	43395	43402	25 %	25 %	50 %	0 %	385833984
116	NC_017491	GCCG	2	8	43777	43784	0 %	0 %	50 %	50 %	385833984
117	NC_017491	AAAG	2	8	44287	44294	75 %	0 %	25 %	0 %	385833984
118	NC_017491	GGCT	2	8	44797	44804	0 %	25 %	50 %	25 %	385833984
119	NC_017491	AAGT	2	8	45146	45153	50 %	25 %	25 %	0 %	385833984
120	NC_017491	TGCG	2	8	45261	45268	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017491	AAAG	2	8	45530	45537	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017491	AAAC	2	8	46112	46119	75 %	0 %	0 %	25 %	385833985
123	NC_017491	TATC	2	8	46620	46627	25 %	50 %	0 %	25 %	385833985
124	NC_017491	TTGG	2	8	46766	46773	0 %	50 %	50 %	0 %	385833985
125	NC_017491	AGTA	2	8	46936	46943	50 %	25 %	25 %	0 %	385833985
126	NC_017491	TCAA	2	8	47128	47135	50 %	25 %	0 %	25 %	385833985
127	NC_017491	CGGG	2	8	47498	47505	0 %	0 %	75 %	25 %	385833985
128	NC_017491	CAGT	3	12	47709	47720	25 %	25 %	25 %	25 %	385833985
129	NC_017491	GGCA	2	8	48872	48879	25 %	0 %	50 %	25 %	385833985
130	NC_017491	GGCA	2	8	49088	49095	25 %	0 %	50 %	25 %	385833985
131	NC_017491	ACCA	2	8	49270	49277	50 %	0 %	0 %	50 %	385833985
132	NC_017491	AGCA	2	8	49751	49758	50 %	0 %	25 %	25 %	385833985
133	NC_017491	TAAA	2	8	50126	50133	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017491	TTAC	2	8	50394	50401	25 %	50 %	0 %	25 %	385833986
135	NC_017491	TTAA	2	8	51010	51017	50 %	50 %	0 %	0 %	385833986
136	NC_017491	GGCT	2	8	51237	51244	0 %	25 %	50 %	25 %	385833987
137	NC_017491	TTGA	2	8	51433	51440	25 %	50 %	25 %	0 %	385833987
138	NC_017491	CGAT	2	8	51513	51520	25 %	25 %	25 %	25 %	385833987
139	NC_017491	CAGC	2	8	51651	51658	25 %	0 %	25 %	50 %	385833987
140	NC_017491	GCCA	2	8	51985	51992	25 %	0 %	25 %	50 %	385833987
141	NC_017491	CATT	2	8	52079	52086	25 %	50 %	0 %	25 %	385833987
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