MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus ATCC 8530 chromosome

Total Repeats: 55282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017491	TAAAGA	2	12	208597	208608	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385834138
4002	NC_017491	GAA	2	6	208655	208660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834138
4003	NC_017491	TAA	2	6	208732	208737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385834138
4004	NC_017491	AGC	2	6	208828	208833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834138
4005	NC_017491	GAAG	2	8	208867	208874	50 %	0 %	50 %	0 %	385834138
4006	NC_017491	AAG	2	6	208902	208907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834138
4007	NC_017491	GAC	2	6	208936	208941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834138
4008	NC_017491	GAC	2	6	208943	208948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834138
4009	NC_017491	GAA	2	6	208960	208965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834138
4010	NC_017491	AT	3	6	208975	208980	50 %	50 %	0 %	0 %	385834138
4011	NC_017491	TCC	2	6	209024	209029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385834138
4012	NC_017491	TC	3	6	209083	209088	0 %	50 %	0 %	50 %	385834138
4013	NC_017491	TCCT	2	8	209120	209127	0 %	50 %	0 %	50 %	385834138
4014	NC_017491	ATG	2	6	209184	209189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834138
4015	NC_017491	AAC	2	6	209222	209227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385834138
4016	NC_017491	AAG	2	6	209277	209282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834138
4017	NC_017491	CAGCC	2	10	209353	209362	20 %	0 %	20 %	60 %	385834138
4018	NC_017491	TTG	2	6	209376	209381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385834138
4019	NC_017491	AGT	2	6	209397	209402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834138
4020	NC_017491	TG	3	6	209474	209479	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_017491	TA	3	6	209518	209523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_017491	TAA	2	6	209529	209534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_017491	ATTA	2	8	209566	209573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_017491	ACA	2	6	209589	209594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_017491	CA	3	6	209593	209598	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4026	NC_017491	AAT	2	6	209609	209614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_017491	AAT	2	6	209626	209631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_017491	TAAA	2	8	209635	209642	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_017491	TAA	2	6	209674	209679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_017491	AAAT	2	8	209690	209697	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_017491	ATTT	2	8	209698	209705	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_017491	ACA	2	6	209768	209773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_017491	TG	3	6	209844	209849	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_017491	TGT	2	6	209859	209864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_017491	CAA	2	6	209875	209880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_017491	ATG	2	6	209958	209963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_017491	TATT	2	8	210073	210080	25 %	75 %	0 %	0 %	385834139
4038	NC_017491	ATG	2	6	210109	210114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834139
4039	NC_017491	T	7	7	210147	210153	0 %	100 %	0 %	0 %	385834139
4040	NC_017491	AT	3	6	210158	210163	50 %	50 %	0 %	0 %	385834139
4041	NC_017491	TTC	2	6	210185	210190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385834139
4042	NC_017491	GGT	2	6	210243	210248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385834139
4043	NC_017491	GCT	2	6	210255	210260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834139
4044	NC_017491	TTGC	2	8	210399	210406	0 %	50 %	25 %	25 %	385834139
4045	NC_017491	TGC	2	6	210421	210426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834139
4046	NC_017491	AAT	3	9	210441	210449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385834139
4047	NC_017491	G	6	6	210474	210479	0 %	0 %	100 %	0 %	385834139
4048	NC_017491	T	6	6	210484	210489	0 %	100 %	0 %	0 %	385834139
4049	NC_017491	GGAT	2	8	210516	210523	25 %	25 %	50 %	0 %	385834139
4050	NC_017491	GCTAT	2	10	210550	210559	20 %	40 %	20 %	20 %	385834139
4051	NC_017491	T	6	6	210559	210564	0 %	100 %	0 %	0 %	385834139
4052	NC_017491	ATG	2	6	210618	210623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834139
4053	NC_017491	ATT	2	6	210635	210640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385834139
4054	NC_017491	GTT	2	6	210824	210829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385834140
4055	NC_017491	TGA	2	6	210868	210873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834140
4056	NC_017491	GACGG	2	10	210917	210926	20 %	0 %	60 %	20 %	385834140
4057	NC_017491	GAT	2	6	211007	211012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834140
4058	NC_017491	TCT	2	6	211049	211054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385834140
4059	NC_017491	AT	3	6	211088	211093	50 %	50 %	0 %	0 %	385834140
4060	NC_017491	TTATT	2	10	211104	211113	20 %	80 %	0 %	0 %	385834140
4061	NC_017491	GCTAAT	2	12	211206	211217	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385834140
4062	NC_017491	TGA	2	6	211222	211227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834140
4063	NC_017491	ATT	2	6	211472	211477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385834140
4064	NC_017491	CAA	2	6	211638	211643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385834141
4065	NC_017491	TGA	2	6	211657	211662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834141
4066	NC_017491	CAGT	2	8	211700	211707	25 %	25 %	25 %	25 %	385834141
4067	NC_017491	TGG	2	6	211710	211715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385834141
4068	NC_017491	GAGG	2	8	211865	211872	25 %	0 %	75 %	0 %	385834141
4069	NC_017491	GCA	2	6	211934	211939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834141
4070	NC_017491	GGCT	2	8	211949	211956	0 %	25 %	50 %	25 %	385834141
4071	NC_017491	ATT	2	6	211962	211967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385834141
4072	NC_017491	TTA	2	6	211969	211974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385834141
4073	NC_017491	TTA	2	6	212142	212147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385834141
4074	NC_017491	TGA	3	9	212285	212293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834142
4075	NC_017491	TGA	2	6	212310	212315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834142
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4077	NC_017491	TC	3	6	212333	212338	0 %	50 %	0 %	50 %	385834142
4078	NC_017491	TTG	2	6	212354	212359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385834142
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4080	NC_017491	ATGA	2	8	212437	212444	50 %	25 %	25 %	0 %	385834142
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4083	NC_017491	ATGA	2	8	212512	212519	50 %	25 %	25 %	0 %	385834142
4084	NC_017491	TGA	3	9	212571	212579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834142
4085	NC_017491	TGA	2	6	212594	212599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834142
4086	NC_017491	GAT	2	6	212652	212657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834142
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4089	NC_017491	CAGAT	2	10	212840	212849	40 %	20 %	20 %	20 %	385834142
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4092	NC_017491	CGG	2	6	212936	212941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385834143
4093	NC_017491	TGA	2	6	212953	212958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834143
4094	NC_017491	TGTT	2	8	212974	212981	0 %	75 %	25 %	0 %	385834143
4095	NC_017491	GAAG	2	8	213201	213208	50 %	0 %	50 %	0 %	385834143
4096	NC_017491	AAC	2	6	213223	213228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385834143
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4099	NC_017491	GAC	2	6	213311	213316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834143
4100	NC_017491	TGA	2	6	213393	213398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_017491	GAC	2	6	213443	213448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834144
4102	NC_017491	CAC	2	6	213465	213470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385834144
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4105	NC_017491	GTG	2	6	213546	213551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385834144
4106	NC_017491	GGC	2	6	213601	213606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385834144
4107	NC_017491	GAA	2	6	213623	213628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834144
4108	NC_017491	TGA	2	6	213643	213648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834144
4109	NC_017491	GCC	2	6	213649	213654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385834144
4110	NC_017491	TAG	2	6	213657	213662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834144
4111	NC_017491	CAA	2	6	213704	213709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385834144
4112	NC_017491	AGG	2	6	213768	213773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385834144
4113	NC_017491	CG	3	6	213825	213830	0 %	0 %	50 %	50 %	385834144
4114	NC_017491	AT	3	6	213950	213955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_017491	CTTT	2	8	213977	213984	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4116	NC_017491	GCA	2	6	214064	214069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834145
4117	NC_017491	GTAT	2	8	214097	214104	25 %	50 %	25 %	0 %	385834145
4118	NC_017491	TGC	2	6	214229	214234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834145
4119	NC_017491	TGA	2	6	214349	214354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834145
4120	NC_017491	GAT	2	6	214503	214508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834145
4121	NC_017491	CGG	2	6	214550	214555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385834145
4122	NC_017491	GT	3	6	214567	214572	0 %	50 %	50 %	0 %	385834145
4123	NC_017491	CCG	2	6	214618	214623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385834145
4124	NC_017491	ATT	2	6	214681	214686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385834145
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4126	NC_017491	CAT	2	6	214764	214769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385834145
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4173	NC_017491	TTA	2	6	217211	217216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4233	NC_017491	AGC	2	6	220527	220532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834150
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4238	NC_017491	GACCC	2	10	220802	220811	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4239	NC_017491	A	6	6	220842	220847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4240	NC_017491	TGT	3	9	220921	220929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385834151
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4244	NC_017491	AAC	2	6	221294	221299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385834151
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4246	NC_017491	GGC	2	6	221394	221399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385834151
4247	NC_017491	GAT	2	6	221405	221410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834151
4248	NC_017491	ATG	2	6	221529	221534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834151
4249	NC_017491	CGG	2	6	221542	221547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385834151
4250	NC_017491	TAT	2	6	221565	221570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385834151
4251	NC_017491	GCC	2	6	221598	221603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385834151
4252	NC_017491	TCG	2	6	221623	221628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834151
4253	NC_017491	GAT	2	6	221780	221785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834152
4254	NC_017491	GGC	2	6	221830	221835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385834152
4255	NC_017491	ATT	2	6	221843	221848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385834152
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4263	NC_017491	GAT	2	6	222196	222201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4264	NC_017491	TTAC	2	8	222246	222253	25 %	50 %	0 %	25 %	385834153
4265	NC_017491	ACG	2	6	222292	222297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834153
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4268	NC_017491	TCC	2	6	222459	222464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4269	NC_017491	GAA	2	6	222580	222585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4270	NC_017491	TAA	2	6	222670	222675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4271	NC_017491	TTAA	2	8	222705	222712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4272	NC_017491	CCA	2	6	222758	222763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385834154
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4277	NC_017491	GAT	2	6	222920	222925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834154
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4282	NC_017491	ATC	2	6	223233	223238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4283	NC_017491	GTT	2	6	223244	223249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4284	NC_017491	AAGGT	2	10	223358	223367	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4285	NC_017491	ATA	2	6	223447	223452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385834155
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4292	NC_017491	TGAGG	2	10	223746	223755	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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4302	NC_017491	AAG	2	6	224218	224223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834156
4303	NC_017491	TGAG	2	8	224274	224281	25 %	25 %	50 %	0 %	385834157
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4320	NC_017491	TTG	2	6	225156	225161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385834160
4321	NC_017491	TGA	2	6	225223	225228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834160
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4330	NC_017491	A	6	6	225883	225888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4331	NC_017491	TGA	2	6	226036	226041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834161
4332	NC_017491	GAT	2	6	226088	226093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834161
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4343	NC_017491	TTA	3	9	226522	226530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4344	NC_017491	AAT	2	6	226545	226550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4345	NC_017491	AAAG	2	8	226596	226603	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4346	NC_017491	ATG	2	6	226614	226619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834162
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4357	NC_017491	CAT	2	6	227064	227069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385834163
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4363	NC_017491	GCA	2	6	227489	227494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4364	NC_017491	GCA	2	6	227528	227533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834164
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4366	NC_017491	CGG	2	6	227621	227626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385834164
4367	NC_017491	GGCT	2	8	227631	227638	0 %	25 %	50 %	25 %	385834164
4368	NC_017491	GATG	2	8	227731	227738	25 %	25 %	50 %	0 %	385834165
4369	NC_017491	GTC	2	6	227822	227827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834165
4370	NC_017491	GATG	2	8	227875	227882	25 %	25 %	50 %	0 %	385834165
4371	NC_017491	CTGA	2	8	227900	227907	25 %	25 %	25 %	25 %	385834165
4372	NC_017491	TG	3	6	228033	228038	0 %	50 %	50 %	0 %	385834165
4373	NC_017491	CATG	2	8	228094	228101	25 %	25 %	25 %	25 %	385834165
4374	NC_017491	GA	3	6	228289	228294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4375	NC_017491	ACA	2	6	228304	228309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385834166
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4384	NC_017491	CAT	2	6	228763	228768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4400	NC_017491	TAG	2	6	229565	229570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4459	NC_017491	A	6	6	232735	232740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4460	NC_017491	TGA	2	6	232742	232747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834172
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4467	NC_017491	CGCT	2	8	232902	232909	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4468	NC_017491	CT	3	6	232954	232959	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4469	NC_017491	TTTG	2	8	232972	232979	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4470	NC_017491	ATC	2	6	233198	233203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385834173
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4477	NC_017491	TGAT	2	8	233773	233780	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4478	NC_017491	AAG	2	6	233797	233802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4479	NC_017491	AAC	2	6	233823	233828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4480	NC_017491	AGT	2	6	233954	233959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834174
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4482	NC_017491	GAT	2	6	234018	234023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834174
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4484	NC_017491	TTC	2	6	234111	234116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385834174
4485	NC_017491	ACA	2	6	234119	234124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385834174
4486	NC_017491	GGTC	2	8	234140	234147	0 %	25 %	50 %	25 %	385834174
4487	NC_017491	CTG	2	6	234189	234194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834174
4488	NC_017491	T	7	7	234263	234269	0 %	100 %	0 %	0 %	385834174
4489	NC_017491	TTA	2	6	234293	234298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4490	NC_017491	AAG	2	6	234385	234390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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