MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus ATCC 8530 chromosome

Total Repeats: 55282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017491	T	7	7	181603	181609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_017491	ACA	2	6	181635	181640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_017491	TA	3	6	181654	181659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_017491	T	7	7	181700	181706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_017491	CAA	2	6	181757	181762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385834111
3506	NC_017491	ACA	2	6	181790	181795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385834111
3507	NC_017491	CAG	2	6	181911	181916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834111
3508	NC_017491	CAA	2	6	181934	181939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385834111
3509	NC_017491	AGC	2	6	182009	182014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834111
3510	NC_017491	CAACCG	2	12	182015	182026	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385834111
3511	NC_017491	CTG	2	6	182094	182099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834111
3512	NC_017491	CG	3	6	182114	182119	0 %	0 %	50 %	50 %	385834111
3513	NC_017491	TGAT	2	8	182145	182152	25 %	50 %	25 %	0 %	385834111
3514	NC_017491	GCC	2	6	182216	182221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385834111
3515	NC_017491	CG	3	6	182265	182270	0 %	0 %	50 %	50 %	385834111
3516	NC_017491	CAA	2	6	182284	182289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385834111
3517	NC_017491	TTA	2	6	182290	182295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385834111
3518	NC_017491	ATT	2	6	182336	182341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385834111
3519	NC_017491	GCAA	2	8	182399	182406	50 %	0 %	25 %	25 %	385834111
3520	NC_017491	TTCAT	2	10	182431	182440	20 %	60 %	0 %	20 %	385834111
3521	NC_017491	CTTT	2	8	182494	182501	0 %	75 %	0 %	25 %	385834111
3522	NC_017491	GAA	2	6	182504	182509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834111
3523	NC_017491	A	6	6	182717	182722	100 %	0 %	0 %	0 %	385834111
3524	NC_017491	A	7	7	182769	182775	100 %	0 %	0 %	0 %	385834111
3525	NC_017491	AAC	2	6	182807	182812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385834111
3526	NC_017491	TCGAC	2	10	182908	182917	20 %	20 %	20 %	40 %	385834111
3527	NC_017491	TGA	2	6	182934	182939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834111
3528	NC_017491	GAT	2	6	183047	183052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834111
3529	NC_017491	CAT	2	6	183078	183083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385834111
3530	NC_017491	GGC	2	6	183157	183162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385834111
3531	NC_017491	GGT	2	6	183175	183180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385834111
3532	NC_017491	CAC	2	6	183199	183204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385834111
3533	NC_017491	GTC	2	6	183227	183232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834111
3534	NC_017491	A	6	6	183242	183247	100 %	0 %	0 %	0 %	385834111
3535	NC_017491	GATTTT	2	12	183278	183289	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385834111
3536	NC_017491	ATT	2	6	183350	183355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385834111
3537	NC_017491	CGG	2	6	183369	183374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385834111
3538	NC_017491	AGTC	2	8	183381	183388	25 %	25 %	25 %	25 %	385834111
3539	NC_017491	AAC	3	9	183477	183485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385834111
3540	NC_017491	AGG	2	6	183510	183515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385834111
3541	NC_017491	CAGT	2	8	183544	183551	25 %	25 %	25 %	25 %	385834111
3542	NC_017491	GGT	2	6	183677	183682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_017491	TGA	2	6	183689	183694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834112
3544	NC_017491	CTG	2	6	183706	183711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834112
3545	NC_017491	CCA	2	6	183739	183744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385834112
3546	NC_017491	CTT	2	6	183789	183794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385834112
3547	NC_017491	ACC	3	9	183861	183869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385834112
3548	NC_017491	AGA	2	6	183876	183881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834112
3549	NC_017491	ATG	2	6	183901	183906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834112
3550	NC_017491	CTA	2	6	183934	183939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385834112
3551	NC_017491	TTG	2	6	183964	183969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385834112
3552	NC_017491	ACAA	2	8	183985	183992	75 %	0 %	0 %	25 %	385834112
3553	NC_017491	GAA	2	6	184000	184005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834112
3554	NC_017491	TTAAGT	2	12	184120	184131	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385834113
3555	NC_017491	CCGA	2	8	184194	184201	25 %	0 %	25 %	50 %	385834113
3556	NC_017491	TGG	2	6	184214	184219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385834113
3557	NC_017491	TCGA	2	8	184251	184258	25 %	25 %	25 %	25 %	385834113
3558	NC_017491	CA	3	6	184337	184342	50 %	0 %	0 %	50 %	385834113
3559	NC_017491	GCT	2	6	184602	184607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834113
3560	NC_017491	GAT	2	6	184644	184649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834113
3561	NC_017491	ACC	2	6	184803	184808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385834113
3562	NC_017491	TGA	2	6	184834	184839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_017491	GAA	2	6	184961	184966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834114
3564	NC_017491	A	6	6	184965	184970	100 %	0 %	0 %	0 %	385834114
3565	NC_017491	TGCC	2	8	185008	185015	0 %	25 %	25 %	50 %	385834114
3566	NC_017491	TGC	2	6	185045	185050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834114
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3569	NC_017491	TTCA	2	8	185601	185608	25 %	50 %	0 %	25 %	385834114
3570	NC_017491	CAAGC	2	10	185918	185927	40 %	0 %	20 %	40 %	385834114
3571	NC_017491	ATC	2	6	185982	185987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385834114
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3573	NC_017491	CTT	2	6	186031	186036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385834114
3574	NC_017491	GGC	2	6	186080	186085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_017491	AGA	2	6	186136	186141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834115
3576	NC_017491	GAT	2	6	186145	186150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834115
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3579	NC_017491	A	7	7	186373	186379	100 %	0 %	0 %	0 %	385834116
3580	NC_017491	AAG	2	6	186387	186392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834116
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3582	NC_017491	GAT	2	6	186534	186539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834116
3583	NC_017491	ATA	2	6	186589	186594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385834116
3584	NC_017491	CTG	2	6	186651	186656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834116
3585	NC_017491	TGA	2	6	186661	186666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834116
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3587	NC_017491	GCT	2	6	186827	186832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834116
3588	NC_017491	TGG	2	6	186847	186852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385834116
3589	NC_017491	CA	3	6	186854	186859	50 %	0 %	0 %	50 %	385834116
3590	NC_017491	AAC	2	6	186926	186931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385834116
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3593	NC_017491	ATT	2	6	187182	187187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385834116
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3595	NC_017491	GAT	2	6	187365	187370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834116
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3597	NC_017491	T	6	6	187410	187415	0 %	100 %	0 %	0 %	385834116
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3599	NC_017491	CGC	2	6	187505	187510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385834116
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3602	NC_017491	CCG	2	6	187728	187733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385834116
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3604	NC_017491	AAG	2	6	187792	187797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834116
3605	NC_017491	GTT	2	6	187824	187829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_017491	T	7	7	187828	187834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_017491	GAA	2	6	187840	187845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_017491	AAC	2	6	187902	187907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_017491	CTT	2	6	187923	187928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_017491	TTTA	2	8	187929	187936	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_017491	TAA	2	6	187956	187961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_017491	TTTC	2	8	188048	188055	0 %	75 %	0 %	25 %	385834117
3613	NC_017491	TGG	2	6	188097	188102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385834117
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3620	NC_017491	TTG	2	6	188398	188403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385834117
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