MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus ATCC 8530 chromosome

Total Repeats: 55282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017491	GTT	2	6	77602	77607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_017491	GGCT	3	12	77696	77707	0 %	25 %	50 %	25 %	385834009
1503	NC_017491	GTGGC	2	10	77730	77739	0 %	20 %	60 %	20 %	385834009
1504	NC_017491	GGT	2	6	77790	77795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385834009
1505	NC_017491	GTT	2	6	77806	77811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385834009
1506	NC_017491	GCT	2	6	77823	77828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834009
1507	NC_017491	CAA	2	6	77832	77837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385834009
1508	NC_017491	TAA	2	6	77904	77909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_017491	CAGT	2	8	77920	77927	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1510	NC_017491	TGAT	2	8	77942	77949	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_017491	GAA	2	6	78048	78053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_017491	A	6	6	78081	78086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_017491	A	6	6	78098	78103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_017491	GAC	2	6	78104	78109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_017491	GAT	2	6	78289	78294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834010
1516	NC_017491	CCG	2	6	78305	78310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385834010
1517	NC_017491	ATG	2	6	78377	78382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834010
1518	NC_017491	GGC	2	6	78448	78453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385834010
1519	NC_017491	TGA	2	6	78501	78506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834010
1520	NC_017491	CAA	2	6	78511	78516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385834010
1521	NC_017491	ATG	3	9	78572	78580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834010
1522	NC_017491	ACA	2	6	78582	78587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385834010
1523	NC_017491	GCCAA	2	10	78665	78674	40 %	0 %	20 %	40 %	385834010
1524	NC_017491	TGC	2	6	78785	78790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834010
1525	NC_017491	GTC	2	6	78813	78818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834011
1526	NC_017491	AAT	2	6	78830	78835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385834011
1527	NC_017491	TCG	2	6	78886	78891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834011
1528	NC_017491	AGTTC	2	10	78899	78908	20 %	40 %	20 %	20 %	385834011
1529	NC_017491	TTC	2	6	78973	78978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385834011
1530	NC_017491	TGT	2	6	78986	78991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385834011
1531	NC_017491	GAA	2	6	79020	79025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834011
1532	NC_017491	ATC	2	6	79032	79037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385834011
1533	NC_017491	CCGT	2	8	79072	79079	0 %	25 %	25 %	50 %	385834011
1534	NC_017491	CGT	2	6	79121	79126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834011
1535	NC_017491	AAACC	2	10	79127	79136	60 %	0 %	0 %	40 %	385834011
1536	NC_017491	CTTT	2	8	79256	79263	0 %	75 %	0 %	25 %	385834011
1537	NC_017491	CTT	2	6	79290	79295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385834011
1538	NC_017491	CTT	3	9	79298	79306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385834011
1539	NC_017491	T	6	6	79371	79376	0 %	100 %	0 %	0 %	385834011
1540	NC_017491	CAT	2	6	79484	79489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385834011
1541	NC_017491	ATC	2	6	79495	79500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385834011
1542	NC_017491	ACC	2	6	79510	79515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385834011
1543	NC_017491	GTT	2	6	79530	79535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385834011
1544	NC_017491	GTC	2	6	79543	79548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834011
1545	NC_017491	ACC	2	6	79677	79682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385834011
1546	NC_017491	AGC	2	6	79687	79692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834011
1547	NC_017491	AGT	2	6	79717	79722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834011
1548	NC_017491	CCT	2	6	79747	79752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385834012
1549	NC_017491	GC	3	6	79755	79760	0 %	0 %	50 %	50 %	385834012
1550	NC_017491	GGT	2	6	79777	79782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385834012
1551	NC_017491	CAA	2	6	79807	79812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385834012
1552	NC_017491	GAT	2	6	79847	79852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834012
1553	NC_017491	AGC	2	6	80045	80050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834012
1554	NC_017491	GCA	2	6	80107	80112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834012
1555	NC_017491	CGA	2	6	80131	80136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834012
1556	NC_017491	CAG	2	6	80258	80263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834012
1557	NC_017491	CAA	2	6	80281	80286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385834012
1558	NC_017491	CCT	2	6	80388	80393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385834013
1559	NC_017491	GTG	2	6	80426	80431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385834013
1560	NC_017491	GTC	2	6	80432	80437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834013
1561	NC_017491	CTGA	2	8	80448	80455	25 %	25 %	25 %	25 %	385834013
1562	NC_017491	GCA	2	6	80471	80476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834013
1563	NC_017491	ATC	2	6	80485	80490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385834013
1564	NC_017491	CAA	2	6	80526	80531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385834013
1565	NC_017491	T	6	6	80641	80646	0 %	100 %	0 %	0 %	385834013
1566	NC_017491	TGG	2	6	80685	80690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385834013
1567	NC_017491	CAG	2	6	80761	80766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834013
1568	NC_017491	TTC	2	6	80840	80845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385834013
1569	NC_017491	GTG	2	6	80864	80869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385834013
1570	NC_017491	CCGC	2	8	80874	80881	0 %	0 %	25 %	75 %	385834013
1571	NC_017491	CAA	2	6	80916	80921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385834013
1572	NC_017491	TTG	2	6	80924	80929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385834013
1573	NC_017491	AGT	2	6	80942	80947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834013
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1575	NC_017491	TGG	2	6	81000	81005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385834013
1576	NC_017491	AAC	2	6	81043	81048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385834013
1577	NC_017491	TAAT	2	8	81078	81085	50 %	50 %	0 %	0 %	385834013
1578	NC_017491	AGATC	2	10	81141	81150	40 %	20 %	20 %	20 %	385834013
1579	NC_017491	GCA	2	6	81158	81163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834013
1580	NC_017491	GC	3	6	81165	81170	0 %	0 %	50 %	50 %	385834013
1581	NC_017491	GTT	3	9	81186	81194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385834013
1582	NC_017491	CGA	2	6	81246	81251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834013
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1584	NC_017491	TAA	2	6	81301	81306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385834013
1585	NC_017491	TG	3	6	81342	81347	0 %	50 %	50 %	0 %	385834013
1586	NC_017491	CGC	2	6	81386	81391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385834013
1587	NC_017491	CCG	2	6	81443	81448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385834013
1588	NC_017491	ATC	2	6	81470	81475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385834013
1589	NC_017491	TTA	2	6	81533	81538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385834013
1590	NC_017491	GTT	2	6	81615	81620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_017491	TCC	2	6	81639	81644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1592	NC_017491	TTTG	2	8	81645	81652	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_017491	TAA	2	6	81663	81668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_017491	T	6	6	81685	81690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_017491	A	7	7	81750	81756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_017491	TTGA	2	8	81778	81785	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_017491	AAT	2	6	81810	81815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_017491	GGGA	2	8	81842	81849	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_017491	AAG	2	6	81881	81886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834014
1600	NC_017491	CGG	2	6	81897	81902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385834014
1601	NC_017491	GCG	2	6	81913	81918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385834014
1602	NC_017491	GATT	2	8	81920	81927	25 %	50 %	25 %	0 %	385834014
1603	NC_017491	TCAG	2	8	81929	81936	25 %	25 %	25 %	25 %	385834014
1604	NC_017491	TGG	2	6	81962	81967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385834014
1605	NC_017491	TGA	2	6	82061	82066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834014
1606	NC_017491	GTT	2	6	82090	82095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385834014
1607	NC_017491	CTGG	2	8	82119	82126	0 %	25 %	50 %	25 %	385834014
1608	NC_017491	GCA	2	6	82177	82182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834014
1609	NC_017491	GCT	2	6	82197	82202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834014
1610	NC_017491	GAC	2	6	82209	82214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834014
1611	NC_017491	TGGC	2	8	82259	82266	0 %	25 %	50 %	25 %	385834014
1612	NC_017491	A	6	6	82421	82426	100 %	0 %	0 %	0 %	385834014
1613	NC_017491	ACA	2	6	82433	82438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385834014
1614	NC_017491	CAG	2	6	82447	82452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834014
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1616	NC_017491	TGG	2	6	82559	82564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385834014
1617	NC_017491	GATT	2	8	82565	82572	25 %	50 %	25 %	0 %	385834014
1618	NC_017491	GGC	2	6	82699	82704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385834014
1619	NC_017491	TTG	2	6	82880	82885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385834014
1620	NC_017491	CAG	2	6	83023	83028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834014
1621	NC_017491	GTG	2	6	83054	83059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385834014
1622	NC_017491	CTTGGT	2	12	83064	83075	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385834014
1623	NC_017491	GAC	2	6	83083	83088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834014
1624	NC_017491	CGGA	2	8	83125	83132	25 %	0 %	50 %	25 %	385834014
1625	NC_017491	AAG	2	6	83170	83175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834014
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