MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus ATCC 8530 chromosome

Total Repeats: 55282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017491	GAA	2	6	290422	290427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_017491	TGT	2	6	290444	290449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_017491	CAG	2	6	290494	290499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_017491	AGCG	2	8	290549	290556	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5505	NC_017491	T	6	6	290564	290569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_017491	AGA	2	6	290635	290640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_017491	AT	3	6	290679	290684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_017491	GAA	2	6	290686	290691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_017491	GGC	2	6	290705	290710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_017491	GTCTG	2	10	290712	290721	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5511	NC_017491	GAA	2	6	290949	290954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_017491	GA	3	6	290987	290992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_017491	GGT	2	6	291023	291028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_017491	GTC	2	6	291037	291042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_017491	TCGTG	2	10	291046	291055	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5516	NC_017491	GGA	2	6	291149	291154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_017491	ATC	2	6	291173	291178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_017491	AC	3	6	291200	291205	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5519	NC_017491	ATGG	2	8	291214	291221	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_017491	CGC	2	6	291339	291344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5521	NC_017491	AC	3	6	291369	291374	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5522	NC_017491	GAGC	2	8	291433	291440	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5523	NC_017491	CCT	2	6	291513	291518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5524	NC_017491	CA	3	6	291556	291561	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5525	NC_017491	TTG	2	6	291642	291647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_017491	TAA	2	6	291694	291699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_017491	TCGCA	2	10	291707	291716	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5528	NC_017491	TAAG	2	8	291829	291836	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_017491	TTG	2	6	291909	291914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_017491	AGAA	2	8	291959	291966	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_017491	TAG	2	6	291980	291985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_017491	GCGA	2	8	291988	291995	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5533	NC_017491	GCTT	2	8	292020	292027	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5534	NC_017491	AAACG	2	10	292120	292129	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5535	NC_017491	CGG	2	6	292158	292163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_017491	GGA	2	6	292190	292195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_017491	CGGAGC	2	12	292400	292411	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_017491	GTAG	2	8	292439	292446	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_017491	GTG	2	6	292493	292498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_017491	AC	3	6	292501	292506	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5541	NC_017491	GGA	2	6	292508	292513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_017491	ATGT	2	8	292522	292529	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_017491	TC	3	6	292594	292599	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5544	NC_017491	GGA	2	6	292624	292629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_017491	AGC	2	6	292852	292857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_017491	ATA	2	6	292928	292933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_017491	TCC	2	6	293107	293112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5548	NC_017491	AGG	2	6	293215	293220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_017491	GCC	2	6	293286	293291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5550	NC_017491	GAG	2	6	293411	293416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_017491	GAGC	2	8	293430	293437	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5552	NC_017491	GAA	2	6	293481	293486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_017491	AAC	2	6	293527	293532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_017491	GAT	2	6	293569	293574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_017491	CGG	2	6	293660	293665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_017491	GA	3	6	293758	293763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_017491	TAGG	2	8	293876	293883	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_017491	TGG	2	6	293922	293927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_017491	TAC	2	6	293930	293935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_017491	CCT	2	6	294018	294023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5561	NC_017491	GGT	2	6	294154	294159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_017491	CGT	2	6	294349	294354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_017491	GAG	2	6	294398	294403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_017491	GCC	2	6	294457	294462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5565	NC_017491	C	6	6	294525	294530	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5566	NC_017491	GAGAT	2	10	294533	294542	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_017491	GAT	2	6	294577	294582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_017491	TGGAAG	2	12	294596	294607	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_017491	GC	4	8	294685	294692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5570	NC_017491	CAA	3	9	294730	294738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5571	NC_017491	GTG	2	6	294776	294781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_017491	AAG	2	6	294790	294795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_017491	CTT	2	6	294832	294837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5574	NC_017491	AGT	2	6	294847	294852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_017491	TGG	2	6	294853	294858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_017491	CTGC	2	8	294863	294870	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5577	NC_017491	AAGAT	2	10	294893	294902	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_017491	T	6	6	294921	294926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_017491	TAA	2	6	294933	294938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_017491	TGA	2	6	294955	294960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_017491	GAA	2	6	294968	294973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_017491	CAA	2	6	295043	295048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_017491	ACA	2	6	295060	295065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5584	NC_017491	TGT	3	9	295092	295100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_017491	GTG	2	6	295116	295121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_017491	TCCT	2	8	295212	295219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5587	NC_017491	TAT	2	6	295236	295241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385834232
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5589	NC_017491	AAG	2	6	295336	295341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834232
5590	NC_017491	TGA	2	6	295366	295371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834233
5591	NC_017491	TTA	2	6	295416	295421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385834233
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5594	NC_017491	T	6	6	295713	295718	0 %	100 %	0 %	0 %	385834233
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5598	NC_017491	TGT	2	6	295817	295822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385834233
5599	NC_017491	ATTCG	2	10	296014	296023	20 %	40 %	20 %	20 %	385834233
5600	NC_017491	GGAAT	2	10	296064	296073	40 %	20 %	40 %	0 %	385834233
5601	NC_017491	ATT	2	6	296112	296117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385834233
5602	NC_017491	AGG	2	6	296136	296141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_017491	TGGT	2	8	296254	296261	0 %	50 %	50 %	0 %	385834234
5604	NC_017491	ATG	2	6	296267	296272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834234
5605	NC_017491	GGTT	2	8	296273	296280	0 %	50 %	50 %	0 %	385834234
5606	NC_017491	GAT	2	6	296317	296322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834234
5607	NC_017491	T	8	8	296364	296371	0 %	100 %	0 %	0 %	385834234
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5609	NC_017491	GTGC	2	8	296456	296463	0 %	25 %	50 %	25 %	385834234
5610	NC_017491	GCC	2	6	296486	296491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385834234
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5613	NC_017491	ATT	2	6	296569	296574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385834234
5614	NC_017491	AGC	2	6	296660	296665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_017491	CCG	2	6	296684	296689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5616	NC_017491	GCT	2	6	296783	296788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_017491	T	7	7	296788	296794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_017491	T	6	6	296828	296833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_017491	TTAT	2	8	296860	296867	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_017491	TAA	2	6	296868	296873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_017491	AAG	2	6	297053	297058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385834235
5622	NC_017491	GTCA	2	8	297069	297076	25 %	25 %	25 %	25 %	385834235
5623	NC_017491	CAG	2	6	297086	297091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834235
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5626	NC_017491	T	7	7	297242	297248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_017491	GAT	2	6	297335	297340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834236
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5631	NC_017491	GCA	2	6	297513	297518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385834236
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5723	NC_017491	TTACTC	2	12	301597	301608	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385834240
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5729	NC_017491	A	7	7	301910	301916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5730	NC_017491	GGA	2	6	302003	302008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5731	NC_017491	TGG	2	6	302044	302049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385834241
5732	NC_017491	GGA	2	6	302111	302116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385834241
5733	NC_017491	ATC	2	6	302164	302169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385834241
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5736	NC_017491	TTG	2	6	302286	302291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385834241
5737	NC_017491	GGT	2	6	302364	302369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5740	NC_017491	TTG	2	6	302534	302539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385834242
5741	NC_017491	TCG	2	6	302616	302621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834242
5742	NC_017491	GCCATC	2	12	302705	302716	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385834242
5743	NC_017491	TTG	2	6	302766	302771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385834242
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5745	NC_017491	GCT	2	6	302974	302979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385834242
5746	NC_017491	CTT	2	6	303008	303013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385834242
5747	NC_017491	TTG	2	6	303018	303023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385834242
5748	NC_017491	TAT	2	6	303034	303039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385834242
5749	NC_017491	GTT	2	6	303147	303152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385834242
5750	NC_017491	ATG	2	6	303360	303365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385834242
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5997	NC_017491	TGG	2	6	316885	316890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385834254
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5999	NC_017491	TTG	2	6	317034	317039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385834255
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