MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56B

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017487	AT	4	8	127	134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017487	TA	3	6	216	221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017487	TA	3	6	238	243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017487	TC	3	6	575	580	0 %	50 %	0 %	50 %	385831932
5	NC_017487	CA	3	6	824	829	50 %	0 %	0 %	50 %	385831932
6	NC_017487	GA	3	6	941	946	50 %	0 %	50 %	0 %	385831932
7	NC_017487	CT	3	6	1369	1374	0 %	50 %	0 %	50 %	385831932
8	NC_017487	CT	3	6	3285	3290	0 %	50 %	0 %	50 %	385831934
9	NC_017487	TA	3	6	4216	4221	50 %	50 %	0 %	0 %	385831934
10	NC_017487	TC	3	6	6145	6150	0 %	50 %	0 %	50 %	385831935
11	NC_017487	TC	3	6	6979	6984	0 %	50 %	0 %	50 %	385831936
12	NC_017487	TA	3	6	7219	7224	50 %	50 %	0 %	0 %	385831936
13	NC_017487	AT	3	6	7817	7822	50 %	50 %	0 %	0 %	385831936
14	NC_017487	AT	3	6	8278	8283	50 %	50 %	0 %	0 %	385831937
15	NC_017487	AT	3	6	9263	9268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017487	TA	3	6	9396	9401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017487	AT	3	6	9621	9626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017487	AT	3	6	9848	9853	50 %	50 %	0 %	0 %	385831938
19	NC_017487	TA	3	6	10088	10093	50 %	50 %	0 %	0 %	385831938
20	NC_017487	TA	3	6	10454	10459	50 %	50 %	0 %	0 %	385831939
21	NC_017487	TA	3	6	10712	10717	50 %	50 %	0 %	0 %	385831940
22	NC_017487	AT	3	6	11072	11077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017487	AG	3	6	13316	13321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017487	AT	3	6	13926	13931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017487	AG	3	6	14027	14032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017487	TC	3	6	14680	14685	0 %	50 %	0 %	50 %	385831942
27	NC_017487	AG	3	6	15916	15921	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017487	TA	3	6	16387	16392	50 %	50 %	0 %	0 %	385831943
29	NC_017487	TA	3	6	16536	16541	50 %	50 %	0 %	0 %	385831943
30	NC_017487	AG	3	6	17033	17038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017487	AT	3	6	17529	17534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017487	AT	3	6	17551	17556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017487	AC	3	6	17923	17928	50 %	0 %	0 %	50 %	385831944
34	NC_017487	AT	3	6	18153	18158	50 %	50 %	0 %	0 %	385831944
35	NC_017487	CT	3	6	18241	18246	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017487	TA	3	6	18341	18346	50 %	50 %	0 %	0 %	385831945
37	NC_017487	CT	3	6	18951	18956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017487	AT	3	6	20103	20108	50 %	50 %	0 %	0 %	385831946
39	NC_017487	AT	3	6	21878	21883	50 %	50 %	0 %	0 %	385831948
40	NC_017487	TA	3	6	22529	22534	50 %	50 %	0 %	0 %	385831948
41	NC_017487	CT	3	6	24047	24052	0 %	50 %	0 %	50 %	385831949
42	NC_017487	TG	3	6	24109	24114	0 %	50 %	50 %	0 %	385831949
43	NC_017487	GC	3	6	24331	24336	0 %	0 %	50 %	50 %	385831949
44	NC_017487	TA	3	6	24383	24388	50 %	50 %	0 %	0 %	385831949
45	NC_017487	AT	3	6	24589	24594	50 %	50 %	0 %	0 %	385831949
46	NC_017487	GA	3	6	25359	25364	50 %	0 %	50 %	0 %	385831949
47	NC_017487	AT	3	6	25531	25536	50 %	50 %	0 %	0 %	385831949
48	NC_017487	GA	4	8	26579	26586	50 %	0 %	50 %	0 %	385831949
49	NC_017487	AT	3	6	27943	27948	50 %	50 %	0 %	0 %	385831952
50	NC_017487	TA	3	6	28225	28230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017487	TA	3	6	28363	28368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017487	AT	3	6	28509	28514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017487	TA	3	6	28593	28598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017487	AT	3	6	28739	28744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017487	AG	3	6	28840	28845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017487	TG	3	6	29730	29735	0 %	50 %	50 %	0 %	385831954
57	NC_017487	AT	3	6	30664	30669	50 %	50 %	0 %	0 %	385831954
58	NC_017487	AT	3	6	30772	30777	50 %	50 %	0 %	0 %	385831954
59	NC_017487	AG	3	6	31242	31247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017487	GT	3	6	31966	31971	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017487	AC	3	6	32318	32323	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017487	GA	3	6	32716	32721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017487	AC	3	6	32880	32885	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017487	CT	3	6	33221	33226	0 %	50 %	0 %	50 %	385831956
65	NC_017487	GA	3	6	34086	34091	50 %	0 %	50 %	0 %	385831957
66	NC_017487	GA	3	6	34241	34246	50 %	0 %	50 %	0 %	385831957
67	NC_017487	AG	3	6	35314	35319	50 %	0 %	50 %	0 %	385831958
68	NC_017487	AT	3	6	35595	35600	50 %	50 %	0 %	0 %	385831959

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.