MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56B

Total Repeats: 850

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017487	A	7	7	21106	21112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017487	AAAG	2	8	21123	21130	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017487	T	7	7	21135	21141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017487	ATT	2	6	21202	21207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831947
505	NC_017487	ATG	2	6	21214	21219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831947
506	NC_017487	A	6	6	21229	21234	100 %	0 %	0 %	0 %	385831947
507	NC_017487	A	6	6	21243	21248	100 %	0 %	0 %	0 %	385831947
508	NC_017487	CAA	2	6	21251	21256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831947
509	NC_017487	A	8	8	21316	21323	100 %	0 %	0 %	0 %	385831947
510	NC_017487	A	8	8	21331	21338	100 %	0 %	0 %	0 %	385831947
511	NC_017487	A	7	7	21340	21346	100 %	0 %	0 %	0 %	385831947
512	NC_017487	T	6	6	21357	21362	0 %	100 %	0 %	0 %	385831947
513	NC_017487	AAAAGA	2	12	21371	21382	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385831947
514	NC_017487	ATT	2	6	21407	21412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831947
515	NC_017487	CAA	2	6	21420	21425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831947
516	NC_017487	A	6	6	21444	21449	100 %	0 %	0 %	0 %	385831947
517	NC_017487	GAA	2	6	21456	21461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831947
518	NC_017487	AGA	3	9	21503	21511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831947
519	NC_017487	A	6	6	21537	21542	100 %	0 %	0 %	0 %	385831947
520	NC_017487	ATG	2	6	21559	21564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831947
521	NC_017487	ACAA	2	8	21601	21608	75 %	0 %	0 %	25 %	385831947
522	NC_017487	A	6	6	21622	21627	100 %	0 %	0 %	0 %	385831947
523	NC_017487	A	6	6	21711	21716	100 %	0 %	0 %	0 %	385831947
524	NC_017487	GAA	2	6	21744	21749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017487	ATTC	2	8	21794	21801	25 %	50 %	0 %	25 %	385831948
526	NC_017487	T	6	6	21829	21834	0 %	100 %	0 %	0 %	385831948
527	NC_017487	ATTT	2	8	21847	21854	25 %	75 %	0 %	0 %	385831948
528	NC_017487	AT	3	6	21878	21883	50 %	50 %	0 %	0 %	385831948
529	NC_017487	T	7	7	21883	21889	0 %	100 %	0 %	0 %	385831948
530	NC_017487	T	8	8	21921	21928	0 %	100 %	0 %	0 %	385831948
531	NC_017487	A	6	6	21933	21938	100 %	0 %	0 %	0 %	385831948
532	NC_017487	TTA	2	6	21948	21953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831948
533	NC_017487	ATTT	2	8	21968	21975	25 %	75 %	0 %	0 %	385831948
534	NC_017487	AGT	2	6	22019	22024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831948
535	NC_017487	ATT	2	6	22031	22036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831948
536	NC_017487	CTG	2	6	22063	22068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385831948
537	NC_017487	AAAC	2	8	22104	22111	75 %	0 %	0 %	25 %	385831948
538	NC_017487	TCTA	2	8	22128	22135	25 %	50 %	0 %	25 %	385831948
539	NC_017487	AAT	2	6	22140	22145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831948
540	NC_017487	T	7	7	22145	22151	0 %	100 %	0 %	0 %	385831948
541	NC_017487	TTA	2	6	22230	22235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831948
542	NC_017487	TTA	2	6	22254	22259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831948
543	NC_017487	T	8	8	22320	22327	0 %	100 %	0 %	0 %	385831948
544	NC_017487	TTC	2	6	22380	22385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385831948
545	NC_017487	T	6	6	22400	22405	0 %	100 %	0 %	0 %	385831948
546	NC_017487	TGG	2	6	22440	22445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385831948
547	NC_017487	TTAT	2	8	22498	22505	25 %	75 %	0 %	0 %	385831948
548	NC_017487	TTG	2	6	22522	22527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831948
549	NC_017487	TA	3	6	22529	22534	50 %	50 %	0 %	0 %	385831948
550	NC_017487	A	6	6	22555	22560	100 %	0 %	0 %	0 %	385831948
551	NC_017487	A	8	8	22562	22569	100 %	0 %	0 %	0 %	385831948
552	NC_017487	TAA	2	6	22612	22617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831948
553	NC_017487	ATC	2	6	22620	22625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831948
554	NC_017487	AATT	2	8	22628	22635	50 %	50 %	0 %	0 %	385831948
555	NC_017487	TCA	3	9	22643	22651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831948
556	NC_017487	A	6	6	22651	22656	100 %	0 %	0 %	0 %	385831948
557	NC_017487	A	7	7	22768	22774	100 %	0 %	0 %	0 %	385831948
558	NC_017487	CTAAA	2	10	22807	22816	60 %	20 %	0 %	20 %	385831948
559	NC_017487	A	6	6	22826	22831	100 %	0 %	0 %	0 %	385831948
560	NC_017487	TTA	2	6	22861	22866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831948
561	NC_017487	TTGG	2	8	22912	22919	0 %	50 %	50 %	0 %	385831948
562	NC_017487	TAG	2	6	22936	22941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831948
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564	NC_017487	CAA	2	6	22975	22980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831948
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567	NC_017487	CTTTA	2	10	23085	23094	20 %	60 %	0 %	20 %	385831948
568	NC_017487	A	6	6	23094	23099	100 %	0 %	0 %	0 %	385831948
569	NC_017487	A	6	6	23103	23108	100 %	0 %	0 %	0 %	385831948
570	NC_017487	AGG	2	6	23147	23152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385831948
571	NC_017487	ATTCT	2	10	23154	23163	20 %	60 %	0 %	20 %	385831948
572	NC_017487	ATT	2	6	23168	23173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831948
573	NC_017487	GAA	2	6	23182	23187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831948
574	NC_017487	TAT	2	6	23224	23229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831948
575	NC_017487	ACTC	2	8	23318	23325	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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577	NC_017487	AAT	2	6	23409	23414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017487	T	6	6	23421	23426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017487	GAG	2	6	23431	23436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017487	T	7	7	23537	23543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017487	T	6	6	23549	23554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017487	GAAA	2	8	23600	23607	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017487	AGC	2	6	23619	23624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_017487	ATTAT	2	10	23708	23717	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017487	TTAC	2	8	23787	23794	25 %	50 %	0 %	25 %	385831949
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588	NC_017487	TTG	2	6	23943	23948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831949
589	NC_017487	GCACTT	2	12	23998	24009	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385831949
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591	NC_017487	TAA	2	6	24083	24088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831949
592	NC_017487	TG	3	6	24109	24114	0 %	50 %	50 %	0 %	385831949
593	NC_017487	CAA	2	6	24150	24155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831949
594	NC_017487	A	7	7	24154	24160	100 %	0 %	0 %	0 %	385831949
595	NC_017487	T	6	6	24208	24213	0 %	100 %	0 %	0 %	385831949
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598	NC_017487	T	7	7	24353	24359	0 %	100 %	0 %	0 %	385831949
599	NC_017487	TA	3	6	24383	24388	50 %	50 %	0 %	0 %	385831949
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603	NC_017487	AT	3	6	24589	24594	50 %	50 %	0 %	0 %	385831949
604	NC_017487	GATA	2	8	24611	24618	50 %	25 %	25 %	0 %	385831949
605	NC_017487	T	6	6	24627	24632	0 %	100 %	0 %	0 %	385831949
606	NC_017487	GAAT	2	8	24658	24665	50 %	25 %	25 %	0 %	385831949
607	NC_017487	TTA	2	6	24754	24759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831949
608	NC_017487	ACTG	2	8	24766	24773	25 %	25 %	25 %	25 %	385831949
609	NC_017487	ATA	2	6	24902	24907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831949
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612	NC_017487	CTT	2	6	25055	25060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385831949
613	NC_017487	T	7	7	25069	25075	0 %	100 %	0 %	0 %	385831949
614	NC_017487	T	6	6	25077	25082	0 %	100 %	0 %	0 %	385831949
615	NC_017487	TTC	2	6	25137	25142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385831949
616	NC_017487	CGA	2	6	25158	25163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385831949
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619	NC_017487	GA	3	6	25359	25364	50 %	0 %	50 %	0 %	385831949
620	NC_017487	GTTT	2	8	25415	25422	0 %	75 %	25 %	0 %	385831949
621	NC_017487	TCTT	2	8	25423	25430	0 %	75 %	0 %	25 %	385831949
622	NC_017487	TAAT	2	8	25439	25446	50 %	50 %	0 %	0 %	385831949
623	NC_017487	ATTA	2	8	25455	25462	50 %	50 %	0 %	0 %	385831949
624	NC_017487	CAT	3	9	25466	25474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831949
625	NC_017487	CTA	2	6	25505	25510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831949
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628	NC_017487	TGT	2	6	25600	25605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831949
629	NC_017487	CTT	2	6	25607	25612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385831949
630	NC_017487	ATT	2	6	25671	25676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831949
631	NC_017487	AAC	2	6	25701	25706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385831949
632	NC_017487	T	7	7	25748	25754	0 %	100 %	0 %	0 %	385831949
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