MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 chromosome

Total Repeats: 55562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_017486	CAT	2	6	1418610	1418615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385830922
33002	NC_017486	GA	3	6	1418653	1418658	50 %	0 %	50 %	0 %	385830922
33003	NC_017486	ATT	2	6	1418725	1418730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385830922
33004	NC_017486	CTT	2	6	1418754	1418759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385830922
33005	NC_017486	GCA	2	6	1418780	1418785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385830922
33006	NC_017486	ATC	2	6	1418806	1418811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385830922
33007	NC_017486	GAT	2	6	1418817	1418822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385830922
33008	NC_017486	ATGAT	2	10	1418888	1418897	40 %	40 %	20 %	0 %	385830922
33009	NC_017486	A	6	6	1418979	1418984	100 %	0 %	0 %	0 %	385830922
33010	NC_017486	AAC	2	6	1418995	1419000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385830922
33011	NC_017486	AAT	2	6	1419017	1419022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385830922
33012	NC_017486	GTTT	2	8	1419059	1419066	0 %	75 %	25 %	0 %	385830922
33013	NC_017486	TCA	2	6	1419105	1419110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385830922
33014	NC_017486	TAA	2	6	1419295	1419300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385830922
33015	NC_017486	TCA	2	6	1419323	1419328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385830922
33016	NC_017486	CAT	2	6	1419402	1419407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33017	NC_017486	TTA	2	6	1419410	1419415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33018	NC_017486	TTA	2	6	1419470	1419475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385830923
33019	NC_017486	TTG	2	6	1419495	1419500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385830923
33020	NC_017486	GCA	2	6	1419535	1419540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385830923
33021	NC_017486	CTC	2	6	1419545	1419550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385830923
33022	NC_017486	T	8	8	1419655	1419662	0 %	100 %	0 %	0 %	385830923
33023	NC_017486	ATTTTT	2	12	1419667	1419678	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385830923
33024	NC_017486	AATAA	2	10	1419689	1419698	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33025	NC_017486	TAA	3	9	1419696	1419704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33026	NC_017486	A	7	7	1419758	1419764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33027	NC_017486	TCT	2	6	1419815	1419820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33028	NC_017486	TAATAG	2	12	1419841	1419852	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33029	NC_017486	ACT	2	6	1419864	1419869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33030	NC_017486	TCCTT	2	10	1419873	1419882	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
33031	NC_017486	T	6	6	1419885	1419890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33032	NC_017486	TCT	2	6	1419932	1419937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33033	NC_017486	ATA	2	6	1419951	1419956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33034	NC_017486	A	6	6	1419976	1419981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33035	NC_017486	TTGT	2	8	1420034	1420041	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33036	NC_017486	TTA	2	6	1420154	1420159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33037	NC_017486	CAT	2	6	1420171	1420176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33038	NC_017486	T	7	7	1420179	1420185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33039	NC_017486	CAAA	2	8	1420194	1420201	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33040	NC_017486	A	6	6	1420199	1420204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33041	NC_017486	A	6	6	1420246	1420251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33042	NC_017486	TCA	2	6	1420255	1420260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33043	NC_017486	T	7	7	1420273	1420279	0 %	100 %	0 %	0 %	385830924
33044	NC_017486	CTT	2	6	1420307	1420312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385830924
33045	NC_017486	T	6	6	1420329	1420334	0 %	100 %	0 %	0 %	385830924
33046	NC_017486	T	7	7	1420344	1420350	0 %	100 %	0 %	0 %	385830924
33047	NC_017486	TTCCTT	2	12	1420352	1420363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385830924
33048	NC_017486	TTCA	2	8	1420485	1420492	25 %	50 %	0 %	25 %	385830924
33049	NC_017486	TTGA	2	8	1420493	1420500	25 %	50 %	25 %	0 %	385830924
33050	NC_017486	T	6	6	1420506	1420511	0 %	100 %	0 %	0 %	385830924
33051	NC_017486	ATC	2	6	1420530	1420535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385830924
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33053	NC_017486	CTTT	2	8	1420675	1420682	0 %	75 %	0 %	25 %	385830924
33054	NC_017486	AAG	2	6	1420684	1420689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385830924
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33057	NC_017486	TA	3	6	1420782	1420787	50 %	50 %	0 %	0 %	385830924
33058	NC_017486	CTT	2	6	1420799	1420804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385830924
33059	NC_017486	TTA	2	6	1420805	1420810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385830924
33060	NC_017486	TCT	2	6	1420819	1420824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385830924
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33062	NC_017486	CAT	2	6	1420910	1420915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385830924
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33072	NC_017486	GTT	2	6	1421401	1421406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385830924
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33077	NC_017486	TCTT	2	8	1421592	1421599	0 %	75 %	0 %	25 %	385830924
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33080	NC_017486	GTT	2	6	1421787	1421792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385830925
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33090	NC_017486	T	6	6	1422269	1422274	0 %	100 %	0 %	0 %	385830925
33091	NC_017486	GGATT	2	10	1422280	1422289	20 %	40 %	40 %	0 %	385830925
33092	NC_017486	CAT	2	6	1422298	1422303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385830925
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33097	NC_017486	GGTT	2	8	1422692	1422699	0 %	50 %	50 %	0 %	385830925
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33103	NC_017486	AAT	2	6	1422998	1423003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385830925
33104	NC_017486	AGA	2	6	1423013	1423018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385830925
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33106	NC_017486	TGC	2	6	1423127	1423132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385830925
33107	NC_017486	ATC	2	6	1423137	1423142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385830925
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33110	NC_017486	GCT	3	9	1423317	1423325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385830925
33111	NC_017486	TTGG	2	8	1423339	1423346	0 %	50 %	50 %	0 %	385830925
33112	NC_017486	CTG	2	6	1423405	1423410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385830925
33113	NC_017486	GCAC	2	8	1423449	1423456	25 %	0 %	25 %	50 %	385830925
33114	NC_017486	GCC	2	6	1423493	1423498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385830925
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33116	NC_017486	T	6	6	1423553	1423558	0 %	100 %	0 %	0 %	385830925
33117	NC_017486	ATA	2	6	1423687	1423692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33118	NC_017486	T	6	6	1423695	1423700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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