MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 chromosome

Total Repeats: 55562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017486	CAAA	2	8	21360	21367	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
502	NC_017486	CGT	2	6	21433	21438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385829605
503	NC_017486	AAG	2	6	21449	21454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829605
504	NC_017486	TTG	2	6	21554	21559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829605
505	NC_017486	AGA	2	6	21597	21602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829605
506	NC_017486	AGA	2	6	21645	21650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829605
507	NC_017486	ATC	2	6	21663	21668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_017486	ATA	2	6	21714	21719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829606
509	NC_017486	A	7	7	21737	21743	100 %	0 %	0 %	0 %	385829606
510	NC_017486	TTTAG	2	10	21809	21818	20 %	60 %	20 %	0 %	385829606
511	NC_017486	AAG	2	6	21909	21914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829606
512	NC_017486	A	6	6	21923	21928	100 %	0 %	0 %	0 %	385829606
513	NC_017486	GAA	2	6	21929	21934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829606
514	NC_017486	TGA	2	6	22006	22011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829606
515	NC_017486	TAC	2	6	22021	22026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829606
516	NC_017486	AAT	2	6	22059	22064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829606
517	NC_017486	A	6	6	22295	22300	100 %	0 %	0 %	0 %	385829607
518	NC_017486	A	7	7	22364	22370	100 %	0 %	0 %	0 %	385829607
519	NC_017486	AAT	2	6	22386	22391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829607
520	NC_017486	A	6	6	22399	22404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017486	TAT	2	6	22405	22410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017486	T	6	6	22415	22420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017486	CTATT	2	10	22427	22436	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
524	NC_017486	ACA	2	6	22493	22498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_017486	ATT	2	6	22502	22507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017486	ATGGA	2	10	22510	22519	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017486	T	6	6	22614	22619	0 %	100 %	0 %	0 %	385829608
528	NC_017486	A	6	6	22667	22672	100 %	0 %	0 %	0 %	385829608
529	NC_017486	TTG	2	6	22675	22680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829608
530	NC_017486	AAAGAA	2	12	22701	22712	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385829608
531	NC_017486	AAC	2	6	22763	22768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829608
532	NC_017486	A	6	6	22890	22895	100 %	0 %	0 %	0 %	385829608
533	NC_017486	AG	3	6	22923	22928	50 %	0 %	50 %	0 %	385829608
534	NC_017486	CAA	2	6	22930	22935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829608
535	NC_017486	ACA	2	6	22938	22943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829608
536	NC_017486	AT	3	6	22944	22949	50 %	50 %	0 %	0 %	385829608
537	NC_017486	AAT	2	6	23003	23008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829608
538	NC_017486	CTG	2	6	23038	23043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385829608
539	NC_017486	TAC	2	6	23073	23078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829608
540	NC_017486	GGGTT	2	10	23105	23114	0 %	40 %	60 %	0 %	385829608
541	NC_017486	ATT	2	6	23165	23170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829608
542	NC_017486	TGA	2	6	23336	23341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829608
543	NC_017486	CAG	2	6	23419	23424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829608
544	NC_017486	ATA	2	6	23425	23430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829608
545	NC_017486	TAT	2	6	23505	23510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829608
546	NC_017486	AAAT	2	8	23545	23552	75 %	25 %	0 %	0 %	385829608
547	NC_017486	GGTA	2	8	23606	23613	25 %	25 %	50 %	0 %	385829608
548	NC_017486	AGG	2	6	23639	23644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385829608
549	NC_017486	TGA	2	6	23678	23683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829608
550	NC_017486	AT	3	6	23713	23718	50 %	50 %	0 %	0 %	385829608
551	NC_017486	TGG	2	6	23735	23740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385829608
552	NC_017486	CAGATA	2	12	23743	23754	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385829608
553	NC_017486	ATG	2	6	23758	23763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829608
554	NC_017486	GAT	2	6	23823	23828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829608
555	NC_017486	ATT	2	6	23941	23946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829609
556	NC_017486	GGT	2	6	23957	23962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385829609
557	NC_017486	AAG	2	6	24003	24008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829609
558	NC_017486	GAA	2	6	24071	24076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829609
559	NC_017486	CAA	2	6	24096	24101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829609
560	NC_017486	A	7	7	24150	24156	100 %	0 %	0 %	0 %	385829609
561	NC_017486	T	6	6	24179	24184	0 %	100 %	0 %	0 %	385829609
562	NC_017486	TCA	3	9	24229	24237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829609
563	NC_017486	TTG	2	6	24246	24251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829609
564	NC_017486	ATT	2	6	24349	24354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829609
565	NC_017486	AGA	2	6	24367	24372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829609
566	NC_017486	TAT	2	6	24389	24394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829609
567	NC_017486	CAA	2	6	24402	24407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829609
568	NC_017486	ATT	2	6	24420	24425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829609
569	NC_017486	CAAT	2	8	24488	24495	50 %	25 %	0 %	25 %	385829609
570	NC_017486	TAAT	2	8	24534	24541	50 %	50 %	0 %	0 %	385829609
571	NC_017486	A	6	6	24543	24548	100 %	0 %	0 %	0 %	385829609
572	NC_017486	TTG	2	6	24564	24569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829609
573	NC_017486	A	6	6	24573	24578	100 %	0 %	0 %	0 %	385829609
574	NC_017486	ATC	2	6	24580	24585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829609
575	NC_017486	A	6	6	24587	24592	100 %	0 %	0 %	0 %	385829609
576	NC_017486	CAAA	2	8	24602	24609	75 %	0 %	0 %	25 %	385829609
577	NC_017486	ACA	2	6	24616	24621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829609
578	NC_017486	T	6	6	24638	24643	0 %	100 %	0 %	0 %	385829609
579	NC_017486	AAGT	2	8	24663	24670	50 %	25 %	25 %	0 %	385829609
580	NC_017486	A	6	6	24674	24679	100 %	0 %	0 %	0 %	385829609
581	NC_017486	CAA	2	6	24713	24718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829609
582	NC_017486	ATTTT	2	10	24742	24751	20 %	80 %	0 %	0 %	385829609
583	NC_017486	A	6	6	24780	24785	100 %	0 %	0 %	0 %	385829609
584	NC_017486	GAAATT	2	12	24875	24886	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385829609
585	NC_017486	TCA	2	6	24925	24930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829609
586	NC_017486	A	6	6	24932	24937	100 %	0 %	0 %	0 %	385829609
587	NC_017486	T	6	6	24947	24952	0 %	100 %	0 %	0 %	385829609
588	NC_017486	GA	3	6	24981	24986	50 %	0 %	50 %	0 %	385829609
589	NC_017486	A	6	6	25007	25012	100 %	0 %	0 %	0 %	385829609
590	NC_017486	AGA	2	6	25076	25081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829609
591	NC_017486	A	7	7	25129	25135	100 %	0 %	0 %	0 %	385829609
592	NC_017486	AGA	3	9	25169	25177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829610
593	NC_017486	A	6	6	25232	25237	100 %	0 %	0 %	0 %	385829610
594	NC_017486	TTC	2	6	25255	25260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829610
595	NC_017486	ATTG	2	8	25299	25306	25 %	50 %	25 %	0 %	385829610
596	NC_017486	CGG	2	6	25346	25351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385829610
597	NC_017486	TCT	2	6	25359	25364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829610
598	NC_017486	CAG	2	6	25396	25401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829610
599	NC_017486	TTG	2	6	25423	25428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829610
600	NC_017486	CTT	2	6	25512	25517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829610
601	NC_017486	TTG	2	6	25537	25542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829610
602	NC_017486	ATT	2	6	25555	25560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829610
603	NC_017486	TGT	2	6	25586	25591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829610
604	NC_017486	TTTGG	2	10	25596	25605	0 %	60 %	40 %	0 %	385829610
605	NC_017486	GAA	2	6	25611	25616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829610
606	NC_017486	AAT	2	6	25669	25674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829610
607	NC_017486	A	6	6	25719	25724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017486	TACT	2	8	25736	25743	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
609	NC_017486	TTA	2	6	25808	25813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017486	AAG	2	6	25825	25830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017486	TAA	3	9	25848	25856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017486	AAC	2	6	25885	25890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829611
613	NC_017486	AAC	2	6	25892	25897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829611
614	NC_017486	A	6	6	25917	25922	100 %	0 %	0 %	0 %	385829611
615	NC_017486	TTG	4	12	25949	25960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829611
616	NC_017486	TCT	2	6	25973	25978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829611
617	NC_017486	AGT	2	6	25981	25986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829611
618	NC_017486	AATC	2	8	25987	25994	50 %	25 %	0 %	25 %	385829611
619	NC_017486	TGA	2	6	26024	26029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829611
620	NC_017486	GTAAAA	2	12	26116	26127	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385829611
621	NC_017486	AAT	2	6	26134	26139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829611
622	NC_017486	TAG	2	6	26160	26165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829611
623	NC_017486	TAT	2	6	26190	26195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829611
624	NC_017486	ATG	2	6	26243	26248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829611
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626	NC_017486	TCA	2	6	26272	26277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829611
627	NC_017486	TC	3	6	26298	26303	0 %	50 %	0 %	50 %	385829611
628	NC_017486	CAT	2	6	26307	26312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829611
629	NC_017486	TTG	2	6	26327	26332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829611
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631	NC_017486	ATG	2	6	26347	26352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829611
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