MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 chromosome

Total Repeats: 55562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55501	NC_017486	CAT	2	6	2396490	2396495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55502	NC_017486	CTT	2	6	2396555	2396560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55503	NC_017486	TCC	2	6	2396675	2396680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55504	NC_017486	ATT	2	6	2396756	2396761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55505	NC_017486	AAG	2	6	2396833	2396838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55506	NC_017486	CTT	2	6	2396843	2396848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55507	NC_017486	CTT	2	6	2396857	2396862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55508	NC_017486	TCGC	2	8	2396868	2396875	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55509	NC_017486	TAG	2	6	2396982	2396987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55510	NC_017486	TACT	2	8	2397028	2397035	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55511	NC_017486	TCG	2	6	2397051	2397056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55512	NC_017486	TTA	2	6	2397108	2397113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55513	NC_017486	ATG	2	6	2397122	2397127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55514	NC_017486	ATC	2	6	2397135	2397140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55515	NC_017486	TTTA	2	8	2397189	2397196	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55516	NC_017486	TTA	2	6	2397200	2397205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55517	NC_017486	CCT	2	6	2397287	2397292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55518	NC_017486	TA	3	6	2397412	2397417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55519	NC_017486	AGG	2	6	2397428	2397433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55520	NC_017486	CCT	2	6	2397510	2397515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55521	NC_017486	GTG	2	6	2397554	2397559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55522	NC_017486	GT	3	6	2397569	2397574	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55523	NC_017486	CCAT	2	8	2397722	2397729	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55524	NC_017486	GT	3	6	2397738	2397743	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55525	NC_017486	ATG	2	6	2397763	2397768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55526	NC_017486	TCC	2	6	2397789	2397794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55527	NC_017486	ATG	2	6	2397833	2397838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55528	NC_017486	CACGA	2	10	2397888	2397897	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
55529	NC_017486	GAC	2	6	2397901	2397906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55530	NC_017486	CAC	2	6	2397914	2397919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55531	NC_017486	TTC	2	6	2397989	2397994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55532	NC_017486	AG	3	6	2398227	2398232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55533	NC_017486	TCC	2	6	2398252	2398257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55534	NC_017486	AT	3	6	2398258	2398263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55535	NC_017486	CTCTC	2	10	2398296	2398305	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
55536	NC_017486	TAA	2	6	2398371	2398376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55537	NC_017486	ACC	2	6	2398377	2398382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55538	NC_017486	GCT	2	6	2398441	2398446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55539	NC_017486	TGA	2	6	2398489	2398494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55540	NC_017486	TTC	2	6	2398515	2398520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55541	NC_017486	CTT	2	6	2398551	2398556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55542	NC_017486	CTG	2	6	2398610	2398615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55543	NC_017486	ATC	2	6	2398684	2398689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55544	NC_017486	ATC	2	6	2398735	2398740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55545	NC_017486	TGT	2	6	2398820	2398825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55546	NC_017486	GCT	2	6	2398869	2398874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55547	NC_017486	CGC	2	6	2398929	2398934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55548	NC_017486	ATT	2	6	2399009	2399014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55549	NC_017486	TAC	2	6	2399039	2399044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55550	NC_017486	TTC	2	6	2399058	2399063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55551	NC_017486	TAT	2	6	2399123	2399128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55552	NC_017486	CTAA	2	8	2399141	2399148	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55553	NC_017486	T	7	7	2399181	2399187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55554	NC_017486	CCA	2	6	2399234	2399239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55555	NC_017486	T	6	6	2399260	2399265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55556	NC_017486	T	6	6	2399270	2399275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55557	NC_017486	TCTT	2	8	2399300	2399307	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55558	NC_017486	ATG	2	6	2399347	2399352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55559	NC_017486	TAT	2	6	2399375	2399380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55560	NC_017486	TAG	2	6	2399384	2399389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55561	NC_017486	AAT	2	6	2399419	2399424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55562	NC_017486	TA	3	6	2399445	2399450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.