MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 chromosome

Total Repeats: 55562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017486	ATA	2	6	218990	218995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_017486	A	6	6	219002	219007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_017486	AAT	2	6	219030	219035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_017486	TAAA	2	8	219037	219044	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_017486	ATT	2	6	219056	219061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_017486	TTG	2	6	219087	219092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829803
5007	NC_017486	A	7	7	219095	219101	100 %	0 %	0 %	0 %	385829803
5008	NC_017486	GCT	2	6	219161	219166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385829803
5009	NC_017486	TCA	2	6	219197	219202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829803
5010	NC_017486	GGT	3	9	219281	219289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385829803
5011	NC_017486	TAC	2	6	219397	219402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829803
5012	NC_017486	TGG	2	6	219415	219420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385829803
5013	NC_017486	AGC	2	6	219430	219435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829803
5014	NC_017486	CTGACC	2	12	219489	219500	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385829803
5015	NC_017486	ATG	2	6	219540	219545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829803
5016	NC_017486	GAA	3	9	219551	219559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829803
5017	NC_017486	TTG	2	6	219567	219572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829803
5018	NC_017486	GCA	2	6	219608	219613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829803
5019	NC_017486	AAG	2	6	219618	219623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829803
5020	NC_017486	CAA	2	6	219642	219647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829803
5021	NC_017486	GATGAC	2	12	219734	219745	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385829803
5022	NC_017486	A	6	6	219791	219796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_017486	T	8	8	219814	219821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_017486	ATA	2	6	219837	219842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_017486	A	6	6	219872	219877	100 %	0 %	0 %	0 %	385829804
5026	NC_017486	ATT	3	9	219888	219896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829804
5027	NC_017486	CTGC	2	8	219923	219930	0 %	25 %	25 %	50 %	385829804
5028	NC_017486	CAA	2	6	219966	219971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829804
5029	NC_017486	AAG	2	6	219984	219989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829804
5030	NC_017486	TGA	2	6	220161	220166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829804
5031	NC_017486	AAG	2	6	220211	220216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829804
5032	NC_017486	A	6	6	220229	220234	100 %	0 %	0 %	0 %	385829804
5033	NC_017486	GATTT	2	10	220236	220245	20 %	60 %	20 %	0 %	385829804
5034	NC_017486	CATT	2	8	220294	220301	25 %	50 %	0 %	25 %	385829804
5035	NC_017486	TGA	2	6	220312	220317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829804
5036	NC_017486	TCA	2	6	220390	220395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829804
5037	NC_017486	AAC	2	6	220447	220452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829804
5038	NC_017486	GA	3	6	220469	220474	50 %	0 %	50 %	0 %	385829804
5039	NC_017486	GAA	2	6	220488	220493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829804
5040	NC_017486	AGA	2	6	220530	220535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829805
5041	NC_017486	ATCA	2	8	220561	220568	50 %	25 %	0 %	25 %	385829805
5042	NC_017486	CCA	2	6	220594	220599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385829805
5043	NC_017486	ATTGA	2	10	220621	220630	40 %	40 %	20 %	0 %	385829805
5044	NC_017486	CAAA	2	8	220642	220649	75 %	0 %	0 %	25 %	385829805
5045	NC_017486	TTG	2	6	220658	220663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829805
5046	NC_017486	GGCTT	2	10	220699	220708	0 %	40 %	40 %	20 %	385829805
5047	NC_017486	GAT	2	6	220936	220941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829805
5048	NC_017486	GGT	2	6	220969	220974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385829805
5049	NC_017486	AGAA	2	8	220981	220988	75 %	0 %	25 %	0 %	385829805
5050	NC_017486	GCG	2	6	221029	221034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385829805
5051	NC_017486	T	6	6	221065	221070	0 %	100 %	0 %	0 %	385829805
5052	NC_017486	ATTG	2	8	221128	221135	25 %	50 %	25 %	0 %	385829805
5053	NC_017486	TAAA	2	8	221139	221146	75 %	25 %	0 %	0 %	385829805
5054	NC_017486	T	7	7	221165	221171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_017486	ATTT	2	8	221172	221179	25 %	75 %	0 %	0 %	385829806
5056	NC_017486	TGA	2	6	221284	221289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829806
5057	NC_017486	GAAG	2	8	221323	221330	50 %	0 %	50 %	0 %	385829806
5058	NC_017486	ATG	2	6	221380	221385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829806
5059	NC_017486	AGC	2	6	221424	221429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829806
5060	NC_017486	GCC	2	6	221461	221466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385829806
5061	NC_017486	CAC	2	6	221633	221638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385829806
5062	NC_017486	CTG	2	6	221657	221662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385829806
5063	NC_017486	GCCA	2	8	221700	221707	25 %	0 %	25 %	50 %	385829806
5064	NC_017486	TCT	2	6	221731	221736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829806
5065	NC_017486	A	6	6	221777	221782	100 %	0 %	0 %	0 %	385829806
5066	NC_017486	GTT	2	6	221786	221791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829806
5067	NC_017486	TGC	2	6	221796	221801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385829806
5068	NC_017486	TTG	2	6	221810	221815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829806
5069	NC_017486	ATT	2	6	221872	221877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829806
5070	NC_017486	ATA	2	6	221947	221952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829806
5071	NC_017486	TGAC	2	8	221980	221987	25 %	25 %	25 %	25 %	385829806
5072	NC_017486	TGGA	2	8	222012	222019	25 %	25 %	50 %	0 %	385829806
5073	NC_017486	GAA	2	6	222041	222046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829806
5074	NC_017486	TTGTA	2	10	222067	222076	20 %	60 %	20 %	0 %	385829806
5075	NC_017486	ATTT	2	8	222088	222095	25 %	75 %	0 %	0 %	385829806
5076	NC_017486	TA	3	6	222145	222150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_017486	A	7	7	222242	222248	100 %	0 %	0 %	0 %	385829807
5078	NC_017486	AGC	2	6	222271	222276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829807
5079	NC_017486	CCA	2	6	222330	222335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385829807
5080	NC_017486	T	6	6	222359	222364	0 %	100 %	0 %	0 %	385829807
5081	NC_017486	AAT	2	6	222455	222460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829807
5082	NC_017486	CTT	2	6	222502	222507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829807
5083	NC_017486	TGA	2	6	222508	222513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829807
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5085	NC_017486	GAA	2	6	222569	222574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829807
5086	NC_017486	GAA	2	6	222602	222607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829807
5087	NC_017486	AAG	2	6	222643	222648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829807
5088	NC_017486	GAA	2	6	222698	222703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829807
5089	NC_017486	ATG	2	6	222714	222719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829807
5090	NC_017486	CAT	2	6	222731	222736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829807
5091	NC_017486	TTA	2	6	222737	222742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829807
5092	NC_017486	ACT	2	6	222864	222869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_017486	CAG	2	6	222881	222886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_017486	T	7	7	222887	222893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_017486	T	6	6	222907	222912	0 %	100 %	0 %	0 %	385829808
5096	NC_017486	AAG	2	6	222949	222954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829808
5097	NC_017486	AGCA	2	8	222970	222977	50 %	0 %	25 %	25 %	385829808
5098	NC_017486	T	6	6	223034	223039	0 %	100 %	0 %	0 %	385829808
5099	NC_017486	AAG	2	6	223066	223071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829808
5100	NC_017486	TGT	3	9	223072	223080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829808
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5102	NC_017486	TAG	2	6	223171	223176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829808
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5104	NC_017486	TTTTC	2	10	223377	223386	0 %	80 %	0 %	20 %	385829808
5105	NC_017486	GAT	2	6	223404	223409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829808
5106	NC_017486	CCG	2	6	223463	223468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385829808
5107	NC_017486	AAG	2	6	223532	223537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829808
5108	NC_017486	AAAAT	2	10	223633	223642	80 %	20 %	0 %	0 %	385829808
5109	NC_017486	TAA	2	6	223669	223674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829808
5110	NC_017486	AGG	2	6	223679	223684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385829808
5111	NC_017486	CAT	2	6	223711	223716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829808
5112	NC_017486	ATT	2	6	223730	223735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829808
5113	NC_017486	AAG	2	6	223755	223760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829808
5114	NC_017486	T	6	6	223783	223788	0 %	100 %	0 %	0 %	385829808
5115	NC_017486	TGA	2	6	223857	223862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829808
5116	NC_017486	C	6	6	223900	223905	0 %	0 %	0 %	100 %	385829808
5117	NC_017486	AGC	2	6	223939	223944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829808
5118	NC_017486	CAT	2	6	223987	223992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829808
5119	NC_017486	ATC	2	6	224018	224023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829808
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5121	NC_017486	GA	3	6	224095	224100	50 %	0 %	50 %	0 %	385829808
5122	NC_017486	GAA	2	6	224180	224185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829808
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5124	NC_017486	TTAAT	2	10	224226	224235	40 %	60 %	0 %	0 %	385829808
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5132	NC_017486	A	6	6	224510	224515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_017486	A	6	6	224540	224545	100 %	0 %	0 %	0 %	385829809
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5146	NC_017486	A	6	6	225158	225163	100 %	0 %	0 %	0 %	385829810
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