MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56D

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017485	AAAT	2	8	36	43	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017485	ACTC	2	8	137	144	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017485	ACCT	2	8	1131	1138	25 %	25 %	0 %	50 %	385831961
4	NC_017485	GTTG	2	8	1467	1474	0 %	50 %	50 %	0 %	385831961
5	NC_017485	AAAG	2	8	1696	1703	75 %	0 %	25 %	0 %	385831961
6	NC_017485	AGTA	2	8	1853	1860	50 %	25 %	25 %	0 %	385831961
7	NC_017485	ATGA	2	8	1895	1902	50 %	25 %	25 %	0 %	385831961
8	NC_017485	TACC	2	8	2081	2088	25 %	25 %	0 %	50 %	385831961
9	NC_017485	TGAG	2	8	2114	2121	25 %	25 %	50 %	0 %	385831961
10	NC_017485	AAAC	2	8	2167	2174	75 %	0 %	0 %	25 %	385831962
11	NC_017485	ACAG	2	8	2210	2217	50 %	0 %	25 %	25 %	385831962
12	NC_017485	ACAG	2	8	2301	2308	50 %	0 %	25 %	25 %	385831962
13	NC_017485	ACAG	2	8	2312	2319	50 %	0 %	25 %	25 %	385831962
14	NC_017485	CAGA	2	8	2335	2342	50 %	0 %	25 %	25 %	385831962
15	NC_017485	ACAG	2	8	2454	2461	50 %	0 %	25 %	25 %	385831962
16	NC_017485	ACAG	2	8	2545	2552	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017485	ACAG	2	8	2556	2563	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017485	CAGA	2	8	2579	2586	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017485	CAAT	2	8	2797	2804	50 %	25 %	0 %	25 %	385831963
20	NC_017485	AAAG	2	8	2940	2947	75 %	0 %	25 %	0 %	385831964
21	NC_017485	TAAA	2	8	3092	3099	75 %	25 %	0 %	0 %	385831964
22	NC_017485	TGTT	2	8	3421	3428	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017485	TTTA	2	8	3558	3565	25 %	75 %	0 %	0 %	385831965
24	NC_017485	ATGG	2	8	4291	4298	25 %	25 %	50 %	0 %	385831966
25	NC_017485	GTGA	2	8	4637	4644	25 %	25 %	50 %	0 %	385831967
26	NC_017485	CAAA	2	8	4693	4700	75 %	0 %	0 %	25 %	385831967
27	NC_017485	CATG	2	8	4781	4788	25 %	25 %	25 %	25 %	385831967
28	NC_017485	AATG	2	8	5091	5098	50 %	25 %	25 %	0 %	385831967
29	NC_017485	TGAA	2	8	5189	5196	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017485	AACA	2	8	5227	5234	75 %	0 %	0 %	25 %	385831968
31	NC_017485	GTTC	2	8	5253	5260	0 %	50 %	25 %	25 %	385831968
32	NC_017485	AAAG	2	8	5338	5345	75 %	0 %	25 %	0 %	385831968

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.