MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56C

Total Repeats: 424

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017484	TCC	2	6	8	13	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017484	TGT	2	6	63	68	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017484	TCA	2	6	69	74	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017484	TCA	2	6	87	92	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017484	ACT	2	6	97	102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017484	AAT	2	6	107	112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017484	TGA	2	6	198	203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017484	AGG	2	6	217	222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017484	TAA	2	6	873	878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017484	TCT	2	6	906	911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017484	TTG	2	6	1042	1047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829560
12	NC_017484	TCA	2	6	1060	1065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829560
13	NC_017484	ACA	2	6	1150	1155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829560
14	NC_017484	AGA	2	6	1172	1177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829560
15	NC_017484	GAC	2	6	1200	1205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829560
16	NC_017484	AAG	2	6	1228	1233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829560
17	NC_017484	ATT	2	6	1461	1466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829560
18	NC_017484	GAA	2	6	1748	1753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829560
19	NC_017484	TAT	2	6	1910	1915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829560
20	NC_017484	AGA	2	6	1942	1947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829560
21	NC_017484	GAA	2	6	2034	2039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829560
22	NC_017484	ATA	2	6	2050	2055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829560
23	NC_017484	AGT	2	6	2202	2207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829561
24	NC_017484	ACT	2	6	2223	2228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829561
25	NC_017484	ACA	2	6	2262	2267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829561
26	NC_017484	ATA	2	6	2272	2277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829561
27	NC_017484	ACC	2	6	2295	2300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385829561
28	NC_017484	CAG	2	6	2315	2320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829561
29	NC_017484	ACC	2	6	2328	2333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385829561
30	NC_017484	CAG	2	6	2348	2353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829561
31	NC_017484	ACC	2	6	2361	2366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385829561
32	NC_017484	CAG	2	6	2381	2386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829561
33	NC_017484	ACC	2	6	2394	2399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385829561
34	NC_017484	CAG	2	6	2414	2419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829561
35	NC_017484	ACC	2	6	2427	2432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385829561
36	NC_017484	CAG	2	6	2447	2452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829561
37	NC_017484	ACC	2	6	2460	2465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385829561
38	NC_017484	CAG	2	6	2480	2485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829561
39	NC_017484	ACC	2	6	2493	2498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385829561
40	NC_017484	CAG	2	6	2513	2518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829561
41	NC_017484	ACC	2	6	2526	2531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385829561
42	NC_017484	CAG	2	6	2546	2551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829561
43	NC_017484	ACC	2	6	2559	2564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385829561
44	NC_017484	CAG	2	6	2567	2572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829561
45	NC_017484	CAA	2	6	2644	2649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829561
46	NC_017484	GTT	2	6	2676	2681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829561
47	NC_017484	AGA	2	6	2682	2687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829561
48	NC_017484	AAG	2	6	2831	2836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829561
49	NC_017484	AAT	2	6	2842	2847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829561
50	NC_017484	TAT	2	6	2917	2922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017484	GTT	2	6	3049	3054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017484	ATT	2	6	3073	3078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017484	ATC	3	9	3215	3223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829562
54	NC_017484	ATC	2	6	3332	3337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829562
55	NC_017484	GTT	2	6	3630	3635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829562
56	NC_017484	CTT	2	6	3766	3771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829562
57	NC_017484	TCT	2	6	3834	3839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829562
58	NC_017484	GTC	2	6	4055	4060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385829562
59	NC_017484	AAT	2	6	4183	4188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829562
60	NC_017484	AAT	2	6	4226	4231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829562
61	NC_017484	AAT	2	6	4382	4387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829562
62	NC_017484	TCA	2	6	4464	4469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829562
63	NC_017484	TCA	2	6	4563	4568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829562
64	NC_017484	TCA	2	6	4636	4641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829562
65	NC_017484	GAA	2	6	4671	4676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829562
66	NC_017484	ATT	2	6	4819	4824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829563
67	NC_017484	ATT	2	6	4861	4866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829563
68	NC_017484	ATA	2	6	4910	4915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829563
69	NC_017484	ATC	2	6	5009	5014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829563
70	NC_017484	TCT	2	6	5030	5035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829563
71	NC_017484	ATT	2	6	5084	5089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829563
72	NC_017484	TGG	2	6	5269	5274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017484	TTC	2	6	5454	5459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829564
74	NC_017484	ACT	2	6	5502	5507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829564
75	NC_017484	TCA	2	6	5824	5829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829565
76	NC_017484	TCA	2	6	5844	5849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829565
77	NC_017484	AAT	2	6	5890	5895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829565
78	NC_017484	CTT	2	6	5986	5991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829565
79	NC_017484	CTG	2	6	6127	6132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385829565
80	NC_017484	AAT	2	6	6180	6185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829565
81	NC_017484	ATC	2	6	6194	6199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829565
82	NC_017484	CAA	2	6	6439	6444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829565
83	NC_017484	GAA	2	6	6489	6494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829565
84	NC_017484	AAG	2	6	6505	6510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829565
85	NC_017484	CAA	2	6	6511	6516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829565
86	NC_017484	TCA	2	6	6778	6783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017484	ATC	2	6	6800	6805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829566
88	NC_017484	CTT	2	6	6820	6825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829566
89	NC_017484	TTG	2	6	6836	6841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829566
90	NC_017484	TTG	2	6	6876	6881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829566
91	NC_017484	ATC	2	6	6905	6910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829566
92	NC_017484	TCA	2	6	6954	6959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829566
93	NC_017484	GTT	2	6	7003	7008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829566
94	NC_017484	GTT	2	6	7129	7134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829566
95	NC_017484	CTT	2	6	7324	7329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829566
96	NC_017484	TGT	2	6	7339	7344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829566
97	NC_017484	TTA	2	6	7693	7698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829566
98	NC_017484	TTA	2	6	7848	7853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829566
99	NC_017484	CAA	2	6	7898	7903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829566
100	NC_017484	TCT	2	6	7965	7970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829566
101	NC_017484	CTT	2	6	7976	7981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829566
102	NC_017484	CCT	2	6	8038	8043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_017484	CTT	2	6	8263	8268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829567
104	NC_017484	CTT	2	6	8329	8334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829567
105	NC_017484	ATT	2	6	8354	8359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829567
106	NC_017484	TTC	2	6	8379	8384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829568
107	NC_017484	TCT	3	9	8452	8460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829568
108	NC_017484	TTC	2	6	8490	8495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829568
109	NC_017484	TTA	3	9	8518	8526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829568
110	NC_017484	TAT	2	6	8580	8585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829568
111	NC_017484	TAA	2	6	8588	8593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829568
112	NC_017484	GAG	2	6	8603	8608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385829568
113	NC_017484	TGT	2	6	8808	8813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829569
114	NC_017484	TCA	2	6	8816	8821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829569
115	NC_017484	TCA	2	6	8927	8932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829569
116	NC_017484	AAT	2	6	8939	8944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829569
117	NC_017484	ATT	2	6	9056	9061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829570
118	NC_017484	CAA	2	6	9103	9108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829570
119	NC_017484	ACA	3	9	9192	9200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829570
120	NC_017484	TGG	2	6	9223	9228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385829570
121	NC_017484	CTT	2	6	9325	9330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829570
122	NC_017484	GTT	2	6	9358	9363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829570
123	NC_017484	TTG	2	6	9418	9423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829570
124	NC_017484	CTT	2	6	9469	9474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829570
125	NC_017484	CAG	2	6	9502	9507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829570
126	NC_017484	TTG	2	6	9562	9567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829570
127	NC_017484	ACT	2	6	9579	9584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829570
128	NC_017484	TAC	2	6	9729	9734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829571
129	NC_017484	ACT	2	6	9781	9786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829571
130	NC_017484	GTC	2	6	10026	10031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385829571
131	NC_017484	ATC	2	6	10134	10139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829571
132	NC_017484	TCA	3	9	10255	10263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829571
133	NC_017484	TAT	2	6	10289	10294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829571
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259	NC_017484	CAT	2	6	20570	20575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829576
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.