MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56A

Total Repeats: 1099

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017483	ATTTG	2	10	19249	19258	20 %	60 %	20 %	0 %	385831904
502	NC_017483	T	7	7	19328	19334	0 %	100 %	0 %	0 %	385831904
503	NC_017483	GTT	2	6	19364	19369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831904
504	NC_017483	GTC	2	6	19404	19409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385831904
505	NC_017483	ACC	2	6	19420	19425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385831904
506	NC_017483	TGT	2	6	19478	19483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831904
507	NC_017483	T	7	7	19526	19532	0 %	100 %	0 %	0 %	385831904
508	NC_017483	TTTCT	2	10	19564	19573	0 %	80 %	0 %	20 %	385831904
509	NC_017483	ATC	2	6	19579	19584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831904
510	NC_017483	GTT	2	6	19617	19622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831904
511	NC_017483	AAT	2	6	19713	19718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831905
512	NC_017483	T	8	8	19728	19735	0 %	100 %	0 %	0 %	385831905
513	NC_017483	ATT	2	6	19739	19744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831905
514	NC_017483	T	6	6	19784	19789	0 %	100 %	0 %	0 %	385831905
515	NC_017483	TACC	2	8	19797	19804	25 %	25 %	0 %	50 %	385831905
516	NC_017483	GAAA	2	8	19843	19850	75 %	0 %	25 %	0 %	385831905
517	NC_017483	CATTT	2	10	19961	19970	20 %	60 %	0 %	20 %	385831905
518	NC_017483	TCC	2	6	20064	20069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385831906
519	NC_017483	CTT	2	6	20080	20085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385831906
520	NC_017483	CTT	2	6	20168	20173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385831906
521	NC_017483	T	7	7	20188	20194	0 %	100 %	0 %	0 %	385831906
522	NC_017483	TTC	2	6	20205	20210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385831906
523	NC_017483	TCA	2	6	20218	20223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831906
524	NC_017483	ATT	2	6	20265	20270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831906
525	NC_017483	TCA	2	6	20302	20307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831906
526	NC_017483	TAG	2	6	20351	20356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831906
527	NC_017483	T	6	6	20445	20450	0 %	100 %	0 %	0 %	385831906
528	NC_017483	CATTT	2	10	20487	20496	20 %	60 %	0 %	20 %	385831906
529	NC_017483	TAGG	2	8	20534	20541	25 %	25 %	50 %	0 %	385831906
530	NC_017483	TCA	2	6	20599	20604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831906
531	NC_017483	A	6	6	20619	20624	100 %	0 %	0 %	0 %	385831906
532	NC_017483	TTG	2	6	20625	20630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831906
533	NC_017483	ATTT	2	8	20708	20715	25 %	75 %	0 %	0 %	385831906
534	NC_017483	AGTC	2	8	20750	20757	25 %	25 %	25 %	25 %	385831906
535	NC_017483	TCCCA	2	10	20874	20883	20 %	20 %	0 %	60 %	385831906
536	NC_017483	TGA	2	6	20905	20910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831906
537	NC_017483	GCA	2	6	20924	20929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385831906
538	NC_017483	AGA	2	6	20978	20983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831906
539	NC_017483	TC	3	6	21058	21063	0 %	50 %	0 %	50 %	385831906
540	NC_017483	AT	3	6	21094	21099	50 %	50 %	0 %	0 %	385831906
541	NC_017483	AGC	2	6	21100	21105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385831906
542	NC_017483	GAG	2	6	21110	21115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385831906
543	NC_017483	AT	3	6	21157	21162	50 %	50 %	0 %	0 %	385831906
544	NC_017483	TGAC	2	8	21268	21275	25 %	25 %	25 %	25 %	385831906
545	NC_017483	AGC	2	6	21312	21317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385831906
546	NC_017483	AGT	2	6	21366	21371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831906
547	NC_017483	AGT	2	6	21461	21466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831906
548	NC_017483	TTTA	2	8	21474	21481	25 %	75 %	0 %	0 %	385831906
549	NC_017483	AGT	2	6	21508	21513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017483	TA	4	8	21613	21620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017483	TAT	2	6	21629	21634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017483	ATC	2	6	21680	21685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_017483	ATT	2	6	21706	21711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017483	TA	3	6	21714	21719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017483	CCA	2	6	21748	21753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_017483	A	6	6	21767	21772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017483	A	6	6	21803	21808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017483	CCA	2	6	21820	21825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_017483	TA	3	6	21900	21905	50 %	50 %	0 %	0 %	385831907
560	NC_017483	AGA	2	6	21913	21918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831907
561	NC_017483	TGA	2	6	21943	21948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831907
562	NC_017483	TTG	2	6	21984	21989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831907
563	NC_017483	CCTAAA	2	12	22040	22051	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385831907
564	NC_017483	TAA	2	6	22117	22122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831907
565	NC_017483	TCA	2	6	22139	22144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831907
566	NC_017483	TTA	2	6	22151	22156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831907
567	NC_017483	TA	3	6	22217	22222	50 %	50 %	0 %	0 %	385831907
568	NC_017483	AAG	2	6	22233	22238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831907
569	NC_017483	A	8	8	22245	22252	100 %	0 %	0 %	0 %	385831907
570	NC_017483	TGC	2	6	22274	22279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385831907
571	NC_017483	TAAAAG	2	12	22311	22322	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385831907
572	NC_017483	TG	3	6	22328	22333	0 %	50 %	50 %	0 %	385831907
573	NC_017483	A	7	7	22340	22346	100 %	0 %	0 %	0 %	385831907
574	NC_017483	TAAA	2	8	22369	22376	75 %	25 %	0 %	0 %	385831907
575	NC_017483	TC	3	6	22379	22384	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
576	NC_017483	GA	3	6	22393	22398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017483	TTTA	2	8	22401	22408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017483	TTAT	2	8	22438	22445	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017483	AT	3	6	22472	22477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017483	ATAA	2	8	22482	22489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017483	A	6	6	22569	22574	100 %	0 %	0 %	0 %	385831908
582	NC_017483	AGG	2	6	22654	22659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385831908
583	NC_017483	TAGATA	2	12	22675	22686	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385831908
584	NC_017483	TA	3	6	22685	22690	50 %	50 %	0 %	0 %	385831908
585	NC_017483	T	6	6	22731	22736	0 %	100 %	0 %	0 %	385831908
586	NC_017483	GAA	2	6	22754	22759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831908
587	NC_017483	T	6	6	22802	22807	0 %	100 %	0 %	0 %	385831908
588	NC_017483	TA	4	8	22824	22831	50 %	50 %	0 %	0 %	385831908
589	NC_017483	TGA	2	6	22832	22837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831908
590	NC_017483	TCA	2	6	22862	22867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831908
591	NC_017483	A	6	6	22887	22892	100 %	0 %	0 %	0 %	385831908
592	NC_017483	TCC	2	6	22910	22915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385831908
593	NC_017483	A	6	6	22923	22928	100 %	0 %	0 %	0 %	385831908
594	NC_017483	GATA	2	8	22931	22938	50 %	25 %	25 %	0 %	385831908
595	NC_017483	TAAA	2	8	22960	22967	75 %	25 %	0 %	0 %	385831908
596	NC_017483	AGA	2	6	22982	22987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831908
597	NC_017483	TAC	2	6	22990	22995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385831908
598	NC_017483	A	8	8	22996	23003	100 %	0 %	0 %	0 %	385831908
599	NC_017483	A	8	8	23009	23016	100 %	0 %	0 %	0 %	385831908
600	NC_017483	TCAA	2	8	23051	23058	50 %	25 %	0 %	25 %	385831908
601	NC_017483	AAT	2	6	23063	23068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831908
602	NC_017483	AGA	3	9	23207	23215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017483	AG	3	6	23244	23249	50 %	0 %	50 %	0 %	385831909
604	NC_017483	T	8	8	23252	23259	0 %	100 %	0 %	0 %	385831909
605	NC_017483	TGAC	2	8	23297	23304	25 %	25 %	25 %	25 %	385831909
606	NC_017483	CATT	2	8	23307	23314	25 %	50 %	0 %	25 %	385831909
607	NC_017483	ATT	2	6	23391	23396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831909
608	NC_017483	GAACA	2	10	23414	23423	60 %	0 %	20 %	20 %	385831909
609	NC_017483	A	7	7	23447	23453	100 %	0 %	0 %	0 %	385831909
610	NC_017483	TTAGAA	2	12	23455	23466	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385831909
611	NC_017483	A	7	7	23509	23515	100 %	0 %	0 %	0 %	385831909
612	NC_017483	TA	3	6	23521	23526	50 %	50 %	0 %	0 %	385831909
613	NC_017483	ATTTT	2	10	23538	23547	20 %	80 %	0 %	0 %	385831909
614	NC_017483	AAT	2	6	23644	23649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385831909
615	NC_017483	A	6	6	23653	23658	100 %	0 %	0 %	0 %	385831909
616	NC_017483	AATA	2	8	23676	23683	75 %	25 %	0 %	0 %	385831909
617	NC_017483	T	6	6	23716	23721	0 %	100 %	0 %	0 %	385831909
618	NC_017483	AG	3	6	23774	23779	50 %	0 %	50 %	0 %	385831909
619	NC_017483	TC	3	6	23799	23804	0 %	50 %	0 %	50 %	385831909
620	NC_017483	TAAAC	2	10	23823	23832	60 %	20 %	0 %	20 %	385831909
621	NC_017483	CTAT	2	8	23850	23857	25 %	50 %	0 %	25 %	385831909
622	NC_017483	GTT	2	6	23861	23866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385831909
623	NC_017483	TAT	2	6	23890	23895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831909
624	NC_017483	CATAT	2	10	23912	23921	40 %	40 %	0 %	20 %	385831909
625	NC_017483	ATG	2	6	24017	24022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385831909
626	NC_017483	TAT	2	6	24038	24043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831909
627	NC_017483	ATTA	2	8	24082	24089	50 %	50 %	0 %	0 %	385831909
628	NC_017483	A	7	7	24096	24102	100 %	0 %	0 %	0 %	385831909
629	NC_017483	TTA	2	6	24124	24129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385831909
630	NC_017483	AAG	2	6	24137	24142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385831909
631	NC_017483	T	6	6	24157	24162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017483	TA	5	10	24207	24216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017483	TA	3	6	24225	24230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017483	TAA	2	6	24232	24237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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