MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG

Total Repeats: 56021

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017482	TTG	2	6	157359	157364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385826863
3002	NC_017482	GAC	2	6	157428	157433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826863
3003	NC_017482	AAT	2	6	157465	157470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385826863
3004	NC_017482	ACC	2	6	157587	157592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385826863
3005	NC_017482	A	6	6	157652	157657	100 %	0 %	0 %	0 %	385826863
3006	NC_017482	ATG	2	6	157689	157694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826863
3007	NC_017482	TTC	2	6	157718	157723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385826863
3008	NC_017482	CTT	2	6	157781	157786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385826863
3009	NC_017482	AAT	2	6	157881	157886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385826863
3010	NC_017482	AAC	2	6	157955	157960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385826863
3011	NC_017482	CCG	2	6	157995	158000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385826863
3012	NC_017482	GGC	2	6	158033	158038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826863
3013	NC_017482	CAG	2	6	158045	158050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826863
3014	NC_017482	TCA	2	6	158103	158108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385826863
3015	NC_017482	AAG	2	6	158112	158117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826863
3016	NC_017482	ATA	2	6	158144	158149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385826863
3017	NC_017482	AAGT	2	8	158184	158191	50 %	25 %	25 %	0 %	385826863
3018	NC_017482	CGG	2	6	158226	158231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826863
3019	NC_017482	ATA	2	6	158244	158249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385826863
3020	NC_017482	TGCC	2	8	158270	158277	0 %	25 %	25 %	50 %	385826863
3021	NC_017482	AACT	2	8	158279	158286	50 %	25 %	0 %	25 %	385826863
3022	NC_017482	TCA	2	6	158373	158378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385826863
3023	NC_017482	TTTC	2	8	158380	158387	0 %	75 %	0 %	25 %	385826863
3024	NC_017482	TGT	2	6	158406	158411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385826863
3025	NC_017482	TCC	2	6	158434	158439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3026	NC_017482	TTTG	2	8	158498	158505	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_017482	TTA	2	6	158626	158631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_017482	GAA	2	6	158643	158648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_017482	CG	3	6	158810	158815	0 %	0 %	50 %	50 %	385826864
3030	NC_017482	TGA	2	6	158867	158872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826864
3031	NC_017482	ATG	2	6	158913	158918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826864
3032	NC_017482	AAAG	2	8	159023	159030	75 %	0 %	25 %	0 %	385826864
3033	NC_017482	GACCA	2	10	159114	159123	40 %	0 %	20 %	40 %	385826864
3034	NC_017482	GCG	2	6	159301	159306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826864
3035	NC_017482	G	6	6	159321	159326	0 %	0 %	100 %	0 %	385826864
3036	NC_017482	CAT	2	6	159362	159367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385826864
3037	NC_017482	CA	3	6	159374	159379	50 %	0 %	0 %	50 %	385826864
3038	NC_017482	GCA	2	6	159394	159399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826864
3039	NC_017482	TTA	2	6	159454	159459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385826864
3040	NC_017482	AGGC	2	8	159472	159479	25 %	0 %	50 %	25 %	385826864
3041	NC_017482	CGC	2	6	159542	159547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385826864
3042	NC_017482	ACT	2	6	159601	159606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385826864
3043	NC_017482	ACA	2	6	159641	159646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_017482	AAG	2	6	159658	159663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_017482	CAA	2	6	159702	159707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_017482	TAGAT	2	10	159813	159822	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_017482	GA	3	6	159891	159896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_017482	AAAC	2	8	159993	160000	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3049	NC_017482	CCAC	2	8	160032	160039	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3050	NC_017482	A	6	6	160054	160059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_017482	CACC	2	8	160107	160114	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3052	NC_017482	CGGC	2	8	160139	160146	0 %	0 %	50 %	50 %	385826865
3053	NC_017482	CTT	2	6	160158	160163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385826865
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3055	NC_017482	CGC	2	6	160404	160409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385826865
3056	NC_017482	CGGA	2	8	160424	160431	25 %	0 %	50 %	25 %	385826865
3057	NC_017482	ATG	2	6	160558	160563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826865
3058	NC_017482	TAA	2	6	160593	160598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385826865
3059	NC_017482	TGC	2	6	160712	160717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826865
3060	NC_017482	TTGA	2	8	160762	160769	25 %	50 %	25 %	0 %	385826865
3061	NC_017482	GAT	2	6	160879	160884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826865
3062	NC_017482	ACAA	2	8	160899	160906	75 %	0 %	0 %	25 %	385826865
3063	NC_017482	ATA	2	6	160921	160926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385826865
3064	NC_017482	CAG	2	6	161021	161026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826865
3065	NC_017482	CAA	2	6	161034	161039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385826865
3066	NC_017482	CAA	2	6	161057	161062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385826865
3067	NC_017482	TCCC	2	8	161121	161128	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3068	NC_017482	GGC	2	6	161256	161261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826866
3069	NC_017482	CTG	2	6	161380	161385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826866
3070	NC_017482	TTG	2	6	161440	161445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385826866
3071	NC_017482	TCT	2	6	161507	161512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385826866
3072	NC_017482	GAT	2	6	161559	161564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826866
3073	NC_017482	TCG	2	6	161588	161593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826866
3074	NC_017482	GCC	2	6	161635	161640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385826866
3075	NC_017482	TGC	2	6	161690	161695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826866
3076	NC_017482	AGTC	2	8	161739	161746	25 %	25 %	25 %	25 %	385826866
3077	NC_017482	GCA	2	6	161819	161824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826866
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3080	NC_017482	TAA	2	6	161976	161981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385826866
3081	NC_017482	ATC	2	6	162022	162027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385826866
3082	NC_017482	ATG	2	6	162044	162049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826866
3083	NC_017482	AAT	2	6	162117	162122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385826866
3084	NC_017482	TCC	2	6	162170	162175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385826866
3085	NC_017482	GCA	2	6	162206	162211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826866
3086	NC_017482	T	6	6	162283	162288	0 %	100 %	0 %	0 %	385826866
3087	NC_017482	AATT	2	8	162318	162325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_017482	CTTT	2	8	162337	162344	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3089	NC_017482	T	6	6	162382	162387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_017482	TGAT	2	8	162406	162413	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_017482	TCT	2	6	162445	162450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_017482	TGAA	2	8	162484	162491	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_017482	GGA	2	6	162535	162540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_017482	CTG	2	6	162564	162569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826867
3095	NC_017482	GCCG	2	8	162578	162585	0 %	0 %	50 %	50 %	385826867
3096	NC_017482	CCG	2	6	162608	162613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385826867
3097	NC_017482	GT	3	6	162671	162676	0 %	50 %	50 %	0 %	385826867
3098	NC_017482	CAT	2	6	162701	162706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385826867
3099	NC_017482	CAT	2	6	162801	162806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_017482	CA	3	6	162854	162859	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3101	NC_017482	GTG	2	6	163066	163071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385826868
3102	NC_017482	GTT	2	6	163085	163090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385826868
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3104	NC_017482	TGA	2	6	163197	163202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826868
3105	NC_017482	TGA	2	6	163231	163236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826868
3106	NC_017482	TTC	2	6	163361	163366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385826868
3107	NC_017482	TTC	2	6	163418	163423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385826868
3108	NC_017482	TG	3	6	163429	163434	0 %	50 %	50 %	0 %	385826868
3109	NC_017482	GCC	2	6	163457	163462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385826868
3110	NC_017482	CGC	2	6	163541	163546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385826868
3111	NC_017482	CTT	2	6	163573	163578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385826868
3112	NC_017482	GTT	2	6	163640	163645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385826868
3113	NC_017482	CAC	2	6	163684	163689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385826868
3114	NC_017482	TGC	2	6	163759	163764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826868
3115	NC_017482	TTG	2	6	163779	163784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385826868
3116	NC_017482	GTCA	2	8	163793	163800	25 %	25 %	25 %	25 %	385826868
3117	NC_017482	CAT	2	6	163840	163845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385826868
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3119	NC_017482	TAT	2	6	164029	164034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_017482	CAT	2	6	164198	164203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_017482	TAA	2	6	164251	164256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_017482	ATG	2	6	164301	164306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826869
3123	NC_017482	G	6	6	164319	164324	0 %	0 %	100 %	0 %	385826869
3124	NC_017482	TTG	2	6	164326	164331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385826869
3125	NC_017482	CGA	2	6	164365	164370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826869
3126	NC_017482	GCT	2	6	164430	164435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826869
3127	NC_017482	TGC	2	6	164443	164448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826869
3128	NC_017482	GTT	2	6	164462	164467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385826869
3129	NC_017482	TTG	2	6	164491	164496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385826869
3130	NC_017482	TGT	2	6	164516	164521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385826869
3131	NC_017482	CCA	2	6	164557	164562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385826869
3132	NC_017482	AGA	2	6	164591	164596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_017482	ATA	2	6	164633	164638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_017482	GCC	2	6	164639	164644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3136	NC_017482	TAA	2	6	164707	164712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_017482	TGT	2	6	164764	164769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3138	NC_017482	A	7	7	164771	164777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3139	NC_017482	TTG	2	6	164805	164810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3141	NC_017482	AATC	2	8	164995	165002	50 %	25 %	0 %	25 %	385826870
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3161	NC_017482	TGCTG	2	10	165804	165813	0 %	40 %	40 %	20 %	385826871
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3166	NC_017482	TTGAAG	2	12	166018	166029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826871
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3168	NC_017482	CAT	2	6	166163	166168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385826871
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3182	NC_017482	CAGC	2	8	166801	166808	25 %	0 %	25 %	50 %	385826871
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3185	NC_017482	CTG	2	6	167079	167084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3186	NC_017482	GAG	2	6	167113	167118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3209	NC_017482	ATT	2	6	168611	168616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3210	NC_017482	GTA	2	6	168671	168676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826875
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3228	NC_017482	TGA	2	6	169936	169941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826876
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3230	NC_017482	CAA	2	6	169992	169997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385826876
3231	NC_017482	GCG	2	6	170019	170024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826876
3232	NC_017482	ATC	2	6	170082	170087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385826876
3233	NC_017482	ATC	2	6	170124	170129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385826876
3234	NC_017482	CAT	2	6	170211	170216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385826876
3235	NC_017482	TC	3	6	170382	170387	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3236	NC_017482	GTT	2	6	170435	170440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3237	NC_017482	ATA	2	6	170531	170536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3238	NC_017482	T	6	6	170537	170542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3239	NC_017482	T	6	6	170555	170560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3240	NC_017482	GCTT	2	8	170641	170648	0 %	50 %	25 %	25 %	385826877
3241	NC_017482	GAG	2	6	170720	170725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385826877
3242	NC_017482	GCAAT	2	10	170739	170748	40 %	20 %	20 %	20 %	385826877
3243	NC_017482	ATT	2	6	170754	170759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385826877
3244	NC_017482	TGA	2	6	170838	170843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826877
3245	NC_017482	ACAA	2	8	170871	170878	75 %	0 %	0 %	25 %	385826877
3246	NC_017482	GCA	2	6	170885	170890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826877
3247	NC_017482	ATG	2	6	170948	170953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826877
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3368	NC_017482	T	7	7	176550	176556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3369	NC_017482	T	6	6	176568	176573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3497	NC_017482	AAT	2	6	183186	183191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385826893
3498	NC_017482	CAC	2	6	183232	183237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385826893
3499	NC_017482	GCC	2	6	183246	183251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385826893
3500	NC_017482	GTG	2	6	183299	183304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385826893

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