MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN2

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017480	T	7	7	1100	1106	0 %	100 %	0 %	0 %	385839805
2	NC_017480	T	6	6	1276	1281	0 %	100 %	0 %	0 %	385839805
3	NC_017480	T	7	7	1500	1506	0 %	100 %	0 %	0 %	385839805
4	NC_017480	T	6	6	1539	1544	0 %	100 %	0 %	0 %	385839805
5	NC_017480	T	6	6	1558	1563	0 %	100 %	0 %	0 %	385839805
6	NC_017480	A	6	6	2417	2422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017480	A	6	6	2516	2521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017480	A	6	6	2833	2838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017480	T	6	6	2965	2970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017480	T	6	6	3007	3012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017480	A	6	6	3376	3381	100 %	0 %	0 %	0 %	385839806
12	NC_017480	T	6	6	4640	4645	0 %	100 %	0 %	0 %	385839807
13	NC_017480	T	6	6	4760	4765	0 %	100 %	0 %	0 %	385839807
14	NC_017480	T	6	6	5393	5398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017480	T	6	6	5451	5456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017480	T	6	6	5621	5626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017480	A	6	6	5938	5943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017480	T	8	8	6009	6016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017480	A	6	6	6285	6290	100 %	0 %	0 %	0 %	385839808
20	NC_017480	T	6	6	6552	6557	0 %	100 %	0 %	0 %	385839808
21	NC_017480	T	6	6	6690	6695	0 %	100 %	0 %	0 %	385839808
22	NC_017480	T	7	7	6744	6750	0 %	100 %	0 %	0 %	385839808
23	NC_017480	A	7	7	7596	7602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017480	A	6	6	7689	7694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017480	A	6	6	7971	7976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017480	A	6	6	8469	8474	100 %	0 %	0 %	0 %	385839810
27	NC_017480	A	6	6	8805	8810	100 %	0 %	0 %	0 %	385839810
28	NC_017480	A	7	7	9346	9352	100 %	0 %	0 %	0 %	385839811
29	NC_017480	T	6	6	9383	9388	0 %	100 %	0 %	0 %	385839811
30	NC_017480	T	6	6	10661	10666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017480	T	7	7	10965	10971	0 %	100 %	0 %	0 %	385839813
32	NC_017480	T	6	6	10983	10988	0 %	100 %	0 %	0 %	385839813
33	NC_017480	A	7	7	11218	11224	100 %	0 %	0 %	0 %	385839813
34	NC_017480	A	7	7	11258	11264	100 %	0 %	0 %	0 %	385839813
35	NC_017480	A	6	6	11492	11497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017480	T	6	6	11700	11705	0 %	100 %	0 %	0 %	385839814
37	NC_017480	A	6	6	11772	11777	100 %	0 %	0 %	0 %	385839814
38	NC_017480	T	6	6	12968	12973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017480	T	6	6	12990	12995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017480	T	7	7	13568	13574	0 %	100 %	0 %	0 %	385839815
41	NC_017480	A	7	7	13747	13753	100 %	0 %	0 %	0 %	385839815
42	NC_017480	T	8	8	13999	14006	0 %	100 %	0 %	0 %	385839815
43	NC_017480	A	8	8	14232	14239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017480	T	7	7	14310	14316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017480	T	6	6	14646	14651	0 %	100 %	0 %	0 %	385839816
46	NC_017480	T	6	6	15197	15202	0 %	100 %	0 %	0 %	385839816
47	NC_017480	T	7	7	15226	15232	0 %	100 %	0 %	0 %	385839816
48	NC_017480	A	6	6	17432	17437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017480	A	6	6	18214	18219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017480	A	6	6	18728	18733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.