MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN1

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017479	GC	3	6	726	731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017479	CG	3	6	1453	1458	0 %	0 %	50 %	50 %	385839614
3	NC_017479	CT	3	6	1848	1853	0 %	50 %	0 %	50 %	385839614
4	NC_017479	AT	3	6	2196	2201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017479	AT	3	6	3425	3430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017479	AT	3	6	4418	4423	50 %	50 %	0 %	0 %	385839615
7	NC_017479	TC	3	6	4446	4451	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017479	CT	3	6	4577	4582	0 %	50 %	0 %	50 %	385839616
9	NC_017479	AC	3	6	7921	7926	50 %	0 %	0 %	50 %	385839617
10	NC_017479	AT	3	6	8353	8358	50 %	50 %	0 %	0 %	385839617
11	NC_017479	AT	3	6	8363	8368	50 %	50 %	0 %	0 %	385839617
12	NC_017479	CT	3	6	9363	9368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017479	GT	3	6	9380	9385	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017479	CA	4	8	9986	9993	50 %	0 %	0 %	50 %	385839618
15	NC_017479	TA	3	6	9997	10002	50 %	50 %	0 %	0 %	385839618
16	NC_017479	AC	3	6	10808	10813	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017479	AT	3	6	10939	10944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017479	AT	3	6	11143	11148	50 %	50 %	0 %	0 %	385839619
19	NC_017479	CG	3	6	12666	12671	0 %	0 %	50 %	50 %	385839620
20	NC_017479	AC	3	6	13365	13370	50 %	0 %	0 %	50 %	385839620
21	NC_017479	AT	3	6	15444	15449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017479	TA	3	6	15703	15708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017479	TA	3	6	15781	15786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017479	TG	3	6	16534	16539	0 %	50 %	50 %	0 %	385839621
25	NC_017479	TA	3	6	17122	17127	50 %	50 %	0 %	0 %	385839622
26	NC_017479	AT	3	6	19586	19591	50 %	50 %	0 %	0 %	385839624
27	NC_017479	AC	3	6	21849	21854	50 %	0 %	0 %	50 %	385839625
28	NC_017479	TC	3	6	21964	21969	0 %	50 %	0 %	50 %	385839625
29	NC_017479	TG	3	6	22646	22651	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017479	AT	3	6	27340	27345	50 %	50 %	0 %	0 %	385839628
31	NC_017479	TA	3	6	28166	28171	50 %	50 %	0 %	0 %	385839629
32	NC_017479	TC	3	6	29619	29624	0 %	50 %	0 %	50 %	385839631
33	NC_017479	AT	3	6	32251	32256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017479	TG	3	6	32669	32674	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017479	GC	3	6	32736	32741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017479	AC	3	6	35106	35111	50 %	0 %	0 %	50 %	385839635
37	NC_017479	TG	3	6	37276	37281	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017479	TC	3	6	38152	38157	0 %	50 %	0 %	50 %	385839637
39	NC_017479	AG	3	6	38227	38232	50 %	0 %	50 %	0 %	385839637
40	NC_017479	AT	3	6	39131	39136	50 %	50 %	0 %	0 %	385839638
41	NC_017479	AT	3	6	40084	40089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017479	TA	3	6	40712	40717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017479	TA	3	6	40744	40749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017479	AT	3	6	40760	40765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017479	AT	3	6	40819	40824	50 %	50 %	0 %	0 %	385839639
46	NC_017479	TA	4	8	40985	40992	50 %	50 %	0 %	0 %	385839639
47	NC_017479	TA	3	6	42246	42251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017479	GT	3	6	42330	42335	0 %	50 %	50 %	0 %	385839640
49	NC_017479	AT	3	6	42777	42782	50 %	50 %	0 %	0 %	385839640

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.