MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN1

Total Repeats: 935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017479	CTTTT	2	10	22823	22832	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
502	NC_017479	TTC	2	6	22913	22918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_017479	AAT	2	6	22935	22940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017479	CAA	2	6	22983	22988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_017479	TGTCC	2	10	23010	23019	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
506	NC_017479	CCT	2	6	23139	23144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_017479	CATC	2	8	23229	23236	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
508	NC_017479	AAT	2	6	23251	23256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017479	TTTC	2	8	23331	23338	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
510	NC_017479	ATC	2	6	23352	23357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_017479	CTT	2	6	23360	23365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_017479	TAA	2	6	23398	23403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017479	AGT	2	6	23423	23428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017479	GTA	2	6	23450	23455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017479	AAG	2	6	23483	23488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017479	TTA	2	6	23517	23522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017479	ATG	3	9	23575	23583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017479	ATT	2	6	23654	23659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017479	CCTCA	2	10	23675	23684	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
520	NC_017479	CTT	2	6	23715	23720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_017479	AGCA	2	8	23812	23819	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
522	NC_017479	CTG	2	6	23832	23837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_017479	AAG	2	6	23918	23923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017479	CTA	2	6	23937	23942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_017479	ATG	2	6	23979	23984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017479	AGTCA	2	10	23992	24001	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
527	NC_017479	CTTA	3	12	24041	24052	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
528	NC_017479	TAA	2	6	24053	24058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017479	AAT	2	6	24063	24068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017479	ATT	3	9	24115	24123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017479	GCA	2	6	24165	24170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_017479	TGA	2	6	24171	24176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017479	AATTT	2	10	24253	24262	40 %	60 %	0 %	0 %	385839626
534	NC_017479	TAA	2	6	24300	24305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839626
535	NC_017479	GTG	2	6	24308	24313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385839626
536	NC_017479	TGG	2	6	24350	24355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385839626
537	NC_017479	TGA	2	6	24357	24362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839626
538	NC_017479	AAC	2	6	24438	24443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839626
539	NC_017479	AAG	2	6	24445	24450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839626
540	NC_017479	AAG	2	6	24545	24550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839626
541	NC_017479	GAA	2	6	24561	24566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839626
542	NC_017479	ATT	2	6	24586	24591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839626
543	NC_017479	GGC	2	6	24592	24597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385839626
544	NC_017479	CTGA	2	8	24724	24731	25 %	25 %	25 %	25 %	385839626
545	NC_017479	AACT	2	8	24761	24768	50 %	25 %	0 %	25 %	385839626
546	NC_017479	TAT	2	6	24802	24807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839626
547	NC_017479	CAA	2	6	24808	24813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839626
548	NC_017479	GTCG	2	8	24859	24866	0 %	25 %	50 %	25 %	385839626
549	NC_017479	AGT	2	6	24880	24885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839626
550	NC_017479	GAT	2	6	24940	24945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839626
551	NC_017479	TGG	2	6	24993	24998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385839626
552	NC_017479	GAT	2	6	25024	25029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839626
553	NC_017479	TAT	2	6	25035	25040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839626
554	NC_017479	GATC	2	8	25081	25088	25 %	25 %	25 %	25 %	385839626
555	NC_017479	CAA	2	6	25391	25396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839626
556	NC_017479	AAAG	2	8	25461	25468	75 %	0 %	25 %	0 %	385839626
557	NC_017479	TTC	3	9	25503	25511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839626
558	NC_017479	AGG	2	6	25514	25519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385839626
559	NC_017479	TAA	2	6	25538	25543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839626
560	NC_017479	ACT	2	6	25605	25610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_017479	CAT	2	6	25649	25654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_017479	TGA	2	6	25661	25666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017479	TAC	2	6	25733	25738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_017479	ATT	2	6	25748	25753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017479	TCT	2	6	25898	25903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839627
566	NC_017479	AGC	2	6	25917	25922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385839627
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569	NC_017479	TTG	2	6	26035	26040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839627
570	NC_017479	GTT	2	6	26090	26095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839627
571	NC_017479	TCT	2	6	26164	26169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839627
572	NC_017479	AAC	2	6	26243	26248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839627
573	NC_017479	TAA	2	6	26261	26266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839627
574	NC_017479	TTGA	2	8	26274	26281	25 %	50 %	25 %	0 %	385839627
575	NC_017479	ATC	2	6	26303	26308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839627
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580	NC_017479	TCT	2	6	26452	26457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839627
581	NC_017479	TTG	2	6	26499	26504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839627
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583	NC_017479	TTA	2	6	26592	26597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017479	GTTA	2	8	26651	26658	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017479	AGT	2	6	26675	26680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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588	NC_017479	TAA	2	6	26819	26824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839628
589	NC_017479	TTGA	2	8	26832	26839	25 %	50 %	25 %	0 %	385839628
590	NC_017479	ATC	2	6	26861	26866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839628
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592	NC_017479	GTTGCT	2	12	26925	26936	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385839628
593	NC_017479	ATC	2	6	27023	27028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839628
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598	NC_017479	TTTA	2	8	27155	27162	25 %	75 %	0 %	0 %	385839628
599	NC_017479	CTT	2	6	27242	27247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839628
600	NC_017479	CAT	2	6	27265	27270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839628
601	NC_017479	ATGG	2	8	27295	27302	25 %	25 %	50 %	0 %	385839628
602	NC_017479	AT	3	6	27340	27345	50 %	50 %	0 %	0 %	385839628
603	NC_017479	ATT	2	6	27368	27373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839628
604	NC_017479	ATGTT	2	10	27390	27399	20 %	60 %	20 %	0 %	385839628
605	NC_017479	TTTC	2	8	27447	27454	0 %	75 %	0 %	25 %	385839628
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611	NC_017479	TGA	2	6	28019	28024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839628
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613	NC_017479	TAT	2	6	28084	28089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839629
614	NC_017479	TA	3	6	28166	28171	50 %	50 %	0 %	0 %	385839629
615	NC_017479	TCC	2	6	28179	28184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385839629
616	NC_017479	ATT	2	6	28196	28201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839629
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623	NC_017479	CAT	2	6	28451	28456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839629
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626	NC_017479	CCT	2	6	28500	28505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385839629
627	NC_017479	TTTA	2	8	28547	28554	25 %	75 %	0 %	0 %	385839629
628	NC_017479	AAT	2	6	28556	28561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839629
629	NC_017479	GCA	2	6	28658	28663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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