MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus johnsonii DPC 6026 chromosome

Total Repeats: 45291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_017477	TAAAT	2	10	21916	21925	60 %	40 %	0 %	0 %	385824965
503	NC_017477	T	6	6	21941	21946	0 %	100 %	0 %	0 %	385824965
504	NC_017477	AAG	2	6	21957	21962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824965
505	NC_017477	AAG	2	6	22002	22007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824965
506	NC_017477	TGG	2	6	22079	22084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824965
507	NC_017477	TAT	2	6	22100	22105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824965
508	NC_017477	ATTT	2	8	22114	22121	25 %	75 %	0 %	0 %	385824965
509	NC_017477	ATC	2	6	22143	22148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824965
510	NC_017477	AGC	2	6	22222	22227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824965
511	NC_017477	ATT	2	6	22244	22249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824965
512	NC_017477	TTC	2	6	22258	22263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824965
513	NC_017477	AGGA	2	8	22329	22336	50 %	0 %	50 %	0 %	385824965
514	NC_017477	ATG	2	6	22361	22366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824965
515	NC_017477	AAT	2	6	22372	22377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824965
516	NC_017477	TTAA	2	8	22409	22416	50 %	50 %	0 %	0 %	385824965
517	NC_017477	TAAAAT	2	12	22423	22434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824965
518	NC_017477	TGA	3	9	22444	22452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824965
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520	NC_017477	TTA	2	6	22571	22576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824965
521	NC_017477	TTA	2	6	22614	22619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824965
522	NC_017477	CAT	2	6	22625	22630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824965
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524	NC_017477	AGAT	2	8	22689	22696	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017477	TTA	2	6	22703	22708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017477	T	6	6	22724	22729	0 %	100 %	0 %	0 %	385824966
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531	NC_017477	TAG	2	6	22876	22881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824966
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534	NC_017477	AAT	2	6	22970	22975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824966
535	NC_017477	CATT	2	8	22981	22988	25 %	50 %	0 %	25 %	385824966
536	NC_017477	ATA	3	9	22997	23005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824966
537	NC_017477	TTTA	2	8	23099	23106	25 %	75 %	0 %	0 %	385824966
538	NC_017477	ATTG	2	8	23281	23288	25 %	50 %	25 %	0 %	385824966
539	NC_017477	GAA	2	6	23313	23318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824966
540	NC_017477	TAT	2	6	23428	23433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824966
541	NC_017477	CTA	2	6	23452	23457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824966
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543	NC_017477	ATC	2	6	23489	23494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824966
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546	NC_017477	TATTT	2	10	23621	23630	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017477	T	6	6	23637	23642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017477	TTCA	2	8	23668	23675	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
549	NC_017477	GCTAA	2	10	23677	23686	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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551	NC_017477	A	7	7	23736	23742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017477	TCA	2	6	23829	23834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824967
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559	NC_017477	CGA	2	6	24273	24278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824967
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562	NC_017477	TAC	2	6	24547	24552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824967
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565	NC_017477	CAC	2	6	24658	24663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_017477	CAAT	2	8	24734	24741	50 %	25 %	0 %	25 %	385824968
567	NC_017477	TA	3	6	24788	24793	50 %	50 %	0 %	0 %	385824968
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569	NC_017477	A	6	6	24917	24922	100 %	0 %	0 %	0 %	385824968
570	NC_017477	TATT	2	8	25031	25038	25 %	75 %	0 %	0 %	385824968
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587	NC_017477	AGAAA	2	10	25490	25499	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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592	NC_017477	TGG	2	6	25563	25568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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595	NC_017477	ATT	2	6	25658	25663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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599	NC_017477	A	6	6	25859	25864	100 %	0 %	0 %	0 %	385824969
600	NC_017477	TGAT	2	8	25896	25903	25 %	50 %	25 %	0 %	385824969
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610	NC_017477	TAC	2	6	26470	26475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824969
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613	NC_017477	TGG	2	6	26623	26628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824969
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615	NC_017477	AATA	2	8	26724	26731	75 %	25 %	0 %	0 %	385824970
616	NC_017477	A	6	6	26734	26739	100 %	0 %	0 %	0 %	385824970
617	NC_017477	ATC	2	6	26823	26828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824970
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619	NC_017477	ATC	2	6	26862	26867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824970
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621	NC_017477	A	6	6	26896	26901	100 %	0 %	0 %	0 %	385824970
622	NC_017477	A	6	6	27082	27087	100 %	0 %	0 %	0 %	385824970
623	NC_017477	CTT	2	6	27144	27149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824970
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626	NC_017477	T	6	6	27335	27340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017477	CTT	2	6	27351	27356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_017477	AGC	3	9	27360	27368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_017477	CTT	2	6	27374	27379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_017477	TCC	2	6	27403	27408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385824971
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