MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei BD-II plasmid pBD-II

Total Repeats: 1084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017476	CGA	2	6	25457	25462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824869
502	NC_017476	ACT	2	6	25465	25470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824869
503	NC_017476	GCC	2	6	25597	25602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824869
504	NC_017476	ACTT	2	8	25630	25637	25 %	50 %	0 %	25 %	385824869
505	NC_017476	GAT	2	6	25648	25653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824869
506	NC_017476	GAA	2	6	25658	25663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824869
507	NC_017476	CAA	2	6	25798	25803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824869
508	NC_017476	GCA	2	6	25814	25819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824869
509	NC_017476	TAA	2	6	25866	25871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824869
510	NC_017476	GGT	2	6	25975	25980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824869
511	NC_017476	CA	3	6	26091	26096	50 %	0 %	0 %	50 %	385824869
512	NC_017476	GGC	2	6	26381	26386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824870
513	NC_017476	ATTT	2	8	26436	26443	25 %	75 %	0 %	0 %	385824870
514	NC_017476	A	7	7	26501	26507	100 %	0 %	0 %	0 %	385824870
515	NC_017476	CTG	2	6	26642	26647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824871
516	NC_017476	CGT	2	6	26770	26775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824871
517	NC_017476	CCA	2	6	26828	26833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824871
518	NC_017476	CAA	2	6	27051	27056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824871
519	NC_017476	ACG	2	6	27063	27068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_017476	T	6	6	27111	27116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017476	GTA	2	6	27237	27242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017476	ACG	2	6	27284	27289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_017476	CTC	2	6	27383	27388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385824872
524	NC_017476	CAG	2	6	27417	27422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824872
525	NC_017476	T	6	6	27471	27476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017476	TGA	2	6	27505	27510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017476	GTC	2	6	27522	27527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_017476	T	6	6	27551	27556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017476	GTT	2	6	27557	27562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017476	CTA	2	6	27566	27571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_017476	AAC	2	6	27579	27584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_017476	TAG	2	6	27585	27590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017476	A	7	7	27597	27603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017476	TA	3	6	27738	27743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017476	TAT	2	6	27821	27826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017476	A	6	6	27850	27855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017476	A	6	6	27892	27897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017476	ATT	2	6	27954	27959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017476	T	6	6	27964	27969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017476	TTG	2	6	28056	28061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017476	GGT	2	6	28106	28111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824873
542	NC_017476	GCTA	2	8	28121	28128	25 %	25 %	25 %	25 %	385824873
543	NC_017476	CTGA	2	8	28151	28158	25 %	25 %	25 %	25 %	385824873
544	NC_017476	CCG	2	6	28276	28281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824873
545	NC_017476	T	6	6	28339	28344	0 %	100 %	0 %	0 %	385824873
546	NC_017476	CGT	2	6	28417	28422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824873
547	NC_017476	AAT	2	6	28499	28504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824873
548	NC_017476	CCT	2	6	28549	28554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385824873
549	NC_017476	C	6	6	28558	28563	0 %	0 %	0 %	100 %	385824873
550	NC_017476	GGT	2	6	28662	28667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824873
551	NC_017476	GAC	2	6	28748	28753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824873
552	NC_017476	TAAG	2	8	28763	28770	50 %	25 %	25 %	0 %	385824873
553	NC_017476	GTG	2	6	28878	28883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824873
554	NC_017476	AACC	2	8	28960	28967	50 %	0 %	0 %	50 %	385824873
555	NC_017476	ATAG	2	8	28976	28983	50 %	25 %	25 %	0 %	385824873
556	NC_017476	AAT	2	6	29033	29038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824873
557	NC_017476	CTT	2	6	29075	29080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824873
558	NC_017476	TGA	2	6	29142	29147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824873
559	NC_017476	GTT	2	6	29203	29208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824873
560	NC_017476	TAC	2	6	29230	29235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824873
561	NC_017476	AGAT	2	8	29279	29286	50 %	25 %	25 %	0 %	385824873
562	NC_017476	GTG	2	6	29370	29375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824873
563	NC_017476	A	6	6	29563	29568	100 %	0 %	0 %	0 %	385824873
564	NC_017476	AATA	2	8	29577	29584	75 %	25 %	0 %	0 %	385824873
565	NC_017476	GTT	2	6	29667	29672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824873
566	NC_017476	T	6	6	29671	29676	0 %	100 %	0 %	0 %	385824873
567	NC_017476	GCC	2	6	29738	29743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824874
568	NC_017476	GCT	2	6	29824	29829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824874
569	NC_017476	ATG	2	6	29859	29864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824874
570	NC_017476	GT	3	6	29884	29889	0 %	50 %	50 %	0 %	385824874
571	NC_017476	T	7	7	29951	29957	0 %	100 %	0 %	0 %	385824874
572	NC_017476	CCA	2	6	29984	29989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824874
573	NC_017476	TTG	2	6	30054	30059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824874
574	NC_017476	GTTGCG	2	12	30098	30109	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385824874
575	NC_017476	TGGGCT	2	12	30172	30183	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385824874
576	NC_017476	TCA	2	6	30211	30216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824874
577	NC_017476	AATT	2	8	30228	30235	50 %	50 %	0 %	0 %	385824874
578	NC_017476	ATAATC	2	12	30243	30254	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385824874
579	NC_017476	GAC	2	6	30261	30266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824874
580	NC_017476	TTC	2	6	30303	30308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824874
581	NC_017476	CCG	2	6	30338	30343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824874
582	NC_017476	GCC	2	6	30523	30528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824874
583	NC_017476	CCA	2	6	30557	30562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824874
584	NC_017476	CTG	2	6	30588	30593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824874
585	NC_017476	ATG	2	6	30607	30612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824874
586	NC_017476	TA	3	6	30635	30640	50 %	50 %	0 %	0 %	385824874
587	NC_017476	CAA	2	6	30785	30790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824874
588	NC_017476	TAA	2	6	30825	30830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824874
589	NC_017476	CCG	2	6	30831	30836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824874
590	NC_017476	CAC	2	6	30837	30842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824874
591	NC_017476	AATT	2	8	30851	30858	50 %	50 %	0 %	0 %	385824874
592	NC_017476	CTG	2	6	30966	30971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824874
593	NC_017476	TGG	2	6	30989	30994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824874
594	NC_017476	AGT	2	6	31089	31094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824874
595	NC_017476	ATA	2	6	31119	31124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824874
596	NC_017476	TGG	2	6	31148	31153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824874
597	NC_017476	AT	3	6	31213	31218	50 %	50 %	0 %	0 %	385824874
598	NC_017476	AAC	2	6	31221	31226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824874
599	NC_017476	TTC	2	6	31275	31280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824874
600	NC_017476	TGAC	2	8	31289	31296	25 %	25 %	25 %	25 %	385824874
601	NC_017476	TCA	2	6	31327	31332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824874
602	NC_017476	CAG	2	6	31341	31346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824874
603	NC_017476	TTA	2	6	31406	31411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824874
604	NC_017476	TCG	2	6	31427	31432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824874
605	NC_017476	CTC	2	6	31518	31523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385824874
606	NC_017476	CGT	2	6	31524	31529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824874
607	NC_017476	GCT	2	6	31615	31620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824874
608	NC_017476	CAA	2	6	31667	31672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824874
609	NC_017476	AGA	2	6	31673	31678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824874
610	NC_017476	T	7	7	31742	31748	0 %	100 %	0 %	0 %	385824874
611	NC_017476	TTG	2	6	31800	31805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824874
612	NC_017476	ATC	2	6	31854	31859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824874
613	NC_017476	GGC	2	6	31863	31868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824874
614	NC_017476	CCG	2	6	31908	31913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824874
615	NC_017476	AAG	2	6	31921	31926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824874
616	NC_017476	CAAA	2	8	32011	32018	75 %	0 %	0 %	25 %	385824874
617	NC_017476	A	6	6	32224	32229	100 %	0 %	0 %	0 %	385824874
618	NC_017476	T	7	7	32388	32394	0 %	100 %	0 %	0 %	385824874
619	NC_017476	ACC	2	6	32523	32528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824874
620	NC_017476	AAC	2	6	32548	32553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824874
621	NC_017476	CAT	2	6	32579	32584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824874
622	NC_017476	CGG	2	6	32618	32623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824874
623	NC_017476	GCT	2	6	32635	32640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824874
624	NC_017476	GTTATT	2	12	32724	32735	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385824874
625	NC_017476	ATTG	2	8	32804	32811	25 %	50 %	25 %	0 %	385824874
626	NC_017476	AAC	2	6	32832	32837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824874
627	NC_017476	TAT	2	6	32905	32910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017476	A	6	6	32987	32992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017476	A	7	7	33073	33079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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631	NC_017476	CAA	2	6	33147	33152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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