MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Lactobacillus casei LC2W plasmid pLC2W

Total Repeats: 704

Go To Repeat Summary Page

< Previous 12Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017475	CTG	2	6	26323	26328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821690
502	NC_017475	GCTT	2	8	26354	26361	0 %	50 %	25 %	25 %	385821690
503	NC_017475	AGCG	2	8	26431	26438	25 %	0 %	50 %	25 %	385821690
504	NC_017475	CGA	2	6	26697	26702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821690
505	NC_017475	TAA	2	6	26774	26779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821690
506	NC_017475	GT	3	6	26790	26795	0 %	50 %	50 %	0 %	385821690
507	NC_017475	T	6	6	26835	26840	0 %	100 %	0 %	0 %	385821690
508	NC_017475	CTT	2	6	26942	26947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821690
509	NC_017475	CTTT	2	8	27032	27039	0 %	75 %	0 %	25 %	385821690
510	NC_017475	TG	3	6	27079	27084	0 %	50 %	50 %	0 %	385821690
511	NC_017475	TCA	2	6	27108	27113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821690
512	NC_017475	GTC	2	6	27227	27232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821690
513	NC_017475	GCG	2	6	27245	27250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821690
514	NC_017475	AGC	2	6	27293	27298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821690
515	NC_017475	GCC	2	6	27308	27313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821690
516	NC_017475	ATG	2	6	27417	27422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821690
517	NC_017475	ATC	2	6	27446	27451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821690
518	NC_017475	CAC	2	6	27476	27481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385821691
519	NC_017475	TAAA	2	8	27556	27563	75 %	25 %	0 %	0 %	385821691
520	NC_017475	ATC	2	6	27616	27621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821691
521	NC_017475	TTC	2	6	27791	27796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821691
522	NC_017475	ATA	2	6	27845	27850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017475	CCT	2	6	27855	27860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_017475	TTA	2	6	27876	27881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017475	AC	3	6	27887	27892	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
526	NC_017475	ACA	2	6	27955	27960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_017475	A	6	6	27963	27968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017475	TGAAT	2	10	28008	28017	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017475	GAG	2	6	28026	28031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017475	GAA	2	6	28049	28054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821692
531	NC_017475	TAG	2	6	28126	28131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821692
532	NC_017475	GTCA	2	8	28199	28206	25 %	25 %	25 %	25 %	385821692
533	NC_017475	AGA	2	6	28318	28323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821692
534	NC_017475	AGCC	2	8	28358	28365	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
535	NC_017475	TTC	2	6	28367	28372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_017475	TGT	2	6	28424	28429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017475	CTG	2	6	28454	28459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_017475	GAG	2	6	28488	28493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017475	GAC	2	6	28557	28562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_017475	ATG	2	6	28768	28773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821693
541	NC_017475	AAG	2	6	28777	28782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821693
542	NC_017475	CTT	2	6	28865	28870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821693
543	NC_017475	TGG	2	6	28933	28938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821693
544	NC_017475	TGA	2	6	28990	28995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821693
545	NC_017475	TGT	2	6	29055	29060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821693
546	NC_017475	GGC	2	6	29147	29152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821693
547	NC_017475	GAC	2	6	29174	29179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821693
548	NC_017475	TTA	2	6	29242	29247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821693
549	NC_017475	A	6	6	29307	29312	100 %	0 %	0 %	0 %	385821693
550	NC_017475	CTTT	2	8	29338	29345	0 %	75 %	0 %	25 %	385821693
551	NC_017475	ATA	2	6	29379	29384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821693
552	NC_017475	GGC	3	9	29498	29506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821694
553	NC_017475	T	7	7	29507	29513	0 %	100 %	0 %	0 %	385821694
554	NC_017475	AAG	2	6	29578	29583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821694
555	NC_017475	TA	3	6	29611	29616	50 %	50 %	0 %	0 %	385821694
556	NC_017475	ATC	2	6	29852	29857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_017475	ACTTG	2	10	29863	29872	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
558	NC_017475	TAT	2	6	29897	29902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017475	T	7	7	29963	29969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017475	TGGAA	2	10	29995	30004	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017475	ATA	2	6	30036	30041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017475	TTG	2	6	30061	30066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017475	AT	4	8	30137	30144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017475	T	7	7	30146	30152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017475	A	6	6	30194	30199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017475	AAG	2	6	30239	30244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821695
567	NC_017475	AT	3	6	30260	30265	50 %	50 %	0 %	0 %	385821695
568	NC_017475	T	7	7	30279	30285	0 %	100 %	0 %	0 %	385821695
569	NC_017475	ATC	2	6	30298	30303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821695
570	NC_017475	AAG	2	6	30384	30389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821695
571	NC_017475	CTG	2	6	30390	30395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821695
572	NC_017475	AAT	2	6	30428	30433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821695
573	NC_017475	CAA	2	6	30562	30567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821695
574	NC_017475	TTAGAG	2	12	30569	30580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821695
575	NC_017475	TGT	2	6	30679	30684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821695
576	NC_017475	CTGA	2	8	30692	30699	25 %	25 %	25 %	25 %	385821695
577	NC_017475	AGC	2	6	30743	30748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821695
578	NC_017475	CA	3	6	30913	30918	50 %	0 %	0 %	50 %	385821695
579	NC_017475	TGA	2	6	31063	31068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821695
580	NC_017475	GCT	2	6	31088	31093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821695
581	NC_017475	CTA	2	6	31170	31175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821695
582	NC_017475	TAG	2	6	31177	31182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821695
583	NC_017475	TCA	2	6	31187	31192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821695
584	NC_017475	TTG	2	6	31248	31253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821695
585	NC_017475	TCCA	2	8	31254	31261	25 %	25 %	0 %	50 %	385821695
586	NC_017475	CAA	2	6	31383	31388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821695
587	NC_017475	TAC	2	6	31411	31416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821695
588	NC_017475	AAG	2	6	31509	31514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821695
589	NC_017475	TTG	2	6	31551	31556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821695
590	NC_017475	TAAC	2	8	31668	31675	50 %	25 %	0 %	25 %	385821695
591	NC_017475	TTA	2	6	31789	31794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821695
592	NC_017475	GGA	2	6	31867	31872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385821695
593	NC_017475	TGA	2	6	31891	31896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821695
594	NC_017475	TGA	2	6	31918	31923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821695
595	NC_017475	AAT	2	6	32096	32101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821695
596	NC_017475	CAG	2	6	32111	32116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821695
597	NC_017475	ACTA	2	8	32119	32126	50 %	25 %	0 %	25 %	385821695
598	NC_017475	AAAGAT	2	12	32270	32281	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385821695
599	NC_017475	ATA	2	6	32283	32288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821695
600	NC_017475	AGCA	2	8	32321	32328	50 %	0 %	25 %	25 %	385821695
601	NC_017475	A	6	6	32365	32370	100 %	0 %	0 %	0 %	385821695
602	NC_017475	ATG	2	6	32541	32546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821695
603	NC_017475	GCA	2	6	32547	32552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821695
604	NC_017475	ATT	2	6	32651	32656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821695
605	NC_017475	AT	3	6	32722	32727	50 %	50 %	0 %	0 %	385821695
606	NC_017475	TC	3	6	32842	32847	0 %	50 %	0 %	50 %	385821695
607	NC_017475	A	6	6	32903	32908	100 %	0 %	0 %	0 %	385821695
608	NC_017475	GTT	2	6	33050	33055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821695
609	NC_017475	ATT	2	6	33080	33085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821695
610	NC_017475	GCT	2	6	33122	33127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821695
611	NC_017475	AGT	2	6	33382	33387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821695
612	NC_017475	AAC	2	6	33389	33394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821695
613	NC_017475	CTT	2	6	33474	33479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821695
614	NC_017475	TGC	2	6	33541	33546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821695
615	NC_017475	AAT	2	6	33563	33568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821695
616	NC_017475	AATC	2	8	33652	33659	50 %	25 %	0 %	25 %	385821695
617	NC_017475	AAG	2	6	33669	33674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821695
618	NC_017475	ATA	2	6	33684	33689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821695
619	NC_017475	AAGGT	2	10	33717	33726	40 %	20 %	40 %	0 %	385821695
620	NC_017475	AAGA	2	8	33791	33798	75 %	0 %	25 %	0 %	385821695
621	NC_017475	TAT	2	6	33875	33880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821695
622	NC_017475	GAT	2	6	33917	33922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821695
623	NC_017475	TTC	2	6	34002	34007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821695
624	NC_017475	AAG	2	6	34067	34072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821695
625	NC_017475	ACT	3	9	34149	34157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821695
626	NC_017475	CAG	2	6	34167	34172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821695
627	NC_017475	CAA	2	6	34257	34262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821695
628	NC_017475	AAG	2	6	34349	34354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821695
629	NC_017475	ACT	3	9	34431	34439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821695
630	NC_017475	CAG	2	6	34449	34454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821695
631	NC_017475	CAA	2	6	34539	34544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821695
632	NC_017475	GTT	2	6	34565	34570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821695
633	NC_017475	AGAC	2	8	34578	34585	50 %	0 %	25 %	25 %	385821695
634	NC_017475	AAG	2	6	34631	34636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821695
635	NC_017475	GAC	2	6	34663	34668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821695
636	NC_017475	ACT	3	9	34713	34721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821695
637	NC_017475	TTG	2	6	34722	34727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821695
638	NC_017475	CAG	2	6	34731	34736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821695
639	NC_017475	A	6	6	34764	34769	100 %	0 %	0 %	0 %	385821695
640	NC_017475	AAT	2	6	34796	34801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821695
641	NC_017475	GAA	2	6	34822	34827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821695
642	NC_017475	AAG	2	6	34832	34837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821695
643	NC_017475	ACC	2	6	34843	34848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385821695
644	NC_017475	A	6	6	34878	34883	100 %	0 %	0 %	0 %	385821695
645	NC_017475	ATGA	2	8	35050	35057	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
646	NC_017475	TTA	2	6	35058	35063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
647	NC_017475	GAC	2	6	35083	35088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
648	NC_017475	T	6	6	35109	35114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
649	NC_017475	A	7	7	35155	35161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
650	NC_017475	AG	3	6	35272	35277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
651	NC_017475	TC	3	6	35296	35301	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
652	NC_017475	AGGA	2	8	35305	35312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
653	NC_017475	CAAA	2	8	35347	35354	75 %	0 %	0 %	25 %	385821696
654	NC_017475	TA	3	6	35367	35372	50 %	50 %	0 %	0 %	385821696
655	NC_017475	GGCCA	2	10	35447	35456	20 %	0 %	40 %	40 %	385821696
656	NC_017475	AATC	2	8	35459	35466	50 %	25 %	0 %	25 %	385821696
657	NC_017475	GAG	2	6	35522	35527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385821696
658	NC_017475	A	7	7	35539	35545	100 %	0 %	0 %	0 %	385821696
659	NC_017475	CAC	2	6	35608	35613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
660	NC_017475	TAT	2	6	35659	35664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
661	NC_017475	ACG	2	6	35691	35696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
662	NC_017475	AAC	2	6	35717	35722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821697
663	NC_017475	AGC	2	6	35750	35755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821697
664	NC_017475	CCA	2	6	35775	35780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385821697
665	NC_017475	TGAAT	2	10	35781	35790	40 %	40 %	20 %	0 %	385821697
666	NC_017475	ACG	2	6	35826	35831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821697
667	NC_017475	CGGCTT	2	12	35891	35902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821697
668	NC_017475	CAT	2	6	36033	36038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821697
669	NC_017475	ACG	2	6	36051	36056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821697
670	NC_017475	A	6	6	36078	36083	100 %	0 %	0 %	0 %	385821697
671	NC_017475	CTGCCG	2	12	36340	36351	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385821697
672	NC_017475	GATG	2	8	36473	36480	25 %	25 %	50 %	0 %	385821698
673	NC_017475	AGC	2	6	36484	36489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821698
674	NC_017475	GCG	2	6	36515	36520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821698
675	NC_017475	A	6	6	36816	36821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
676	NC_017475	GCCTA	2	10	36853	36862	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
677	NC_017475	AATG	2	8	36913	36920	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
678	NC_017475	CTT	2	6	36979	36984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
679	NC_017475	AGG	2	6	37049	37054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
680	NC_017475	C	6	6	37079	37084	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
681	NC_017475	A	6	6	37085	37090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
682	NC_017475	TCT	2	6	37185	37190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821699
683	NC_017475	TTTCCA	2	12	37242	37253	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385821699
684	NC_017475	AAG	2	6	37369	37374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821699
685	NC_017475	TGA	2	6	37380	37385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821699
686	NC_017475	TAT	2	6	37499	37504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821699
687	NC_017475	AACC	2	8	37541	37548	50 %	0 %	0 %	50 %	385821699
688	NC_017475	TGA	2	6	37657	37662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
689	NC_017475	A	6	6	37732	37737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
690	NC_017475	TTTA	2	8	37742	37749	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
691	NC_017475	TA	6	12	37748	37759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
692	NC_017475	TTTTA	2	10	37793	37802	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
693	NC_017475	AG	3	6	37839	37844	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
694	NC_017475	TAT	2	6	37852	37857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
695	NC_017475	ATG	2	6	37963	37968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
696	NC_017475	TAA	2	6	37976	37981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
697	NC_017475	TGA	4	12	38054	38065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
698	NC_017475	AGT	2	6	38066	38071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
699	NC_017475	TGAC	2	8	38113	38120	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
700	NC_017475	ATC	2	6	38121	38126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
701	NC_017475	ATT	2	6	38223	38228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
702	NC_017475	TA	3	6	38236	38241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
703	NC_017475	AAG	2	6	38254	38259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
704	NC_017475	CAA	3	9	38283	38291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

< Previous 12Next >