MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 7836

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017474	CGGT	2	8	142	149	0 %	25 %	50 %	25 %	385821701
2	NC_017474	ACAG	2	8	164	171	50 %	0 %	25 %	25 %	385821701
3	NC_017474	CAGC	2	8	333	340	25 %	0 %	25 %	50 %	385821701
4	NC_017474	TTTA	2	8	522	529	25 %	75 %	0 %	0 %	385821701
5	NC_017474	GCCT	2	8	826	833	0 %	25 %	25 %	50 %	385821701
6	NC_017474	GGTT	2	8	859	866	0 %	50 %	50 %	0 %	385821701
7	NC_017474	TGTC	2	8	886	893	0 %	50 %	25 %	25 %	385821701
8	NC_017474	ACGT	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	385821701
9	NC_017474	GAAA	2	8	1207	1214	75 %	0 %	25 %	0 %	385821701
10	NC_017474	ACGT	2	8	2961	2968	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017474	TAAT	2	8	3513	3520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017474	GGCC	2	8	3772	3779	0 %	0 %	50 %	50 %	385821703
13	NC_017474	AATC	2	8	3923	3930	50 %	25 %	0 %	25 %	385821704
14	NC_017474	TGAC	2	8	4343	4350	25 %	25 %	25 %	25 %	385821704
15	NC_017474	AAGA	2	8	5055	5062	75 %	0 %	25 %	0 %	385821705
16	NC_017474	CCAG	2	8	5107	5114	25 %	0 %	25 %	50 %	385821705
17	NC_017474	GCTG	2	8	5237	5244	0 %	25 %	50 %	25 %	385821705
18	NC_017474	CCTG	2	8	6302	6309	0 %	25 %	25 %	50 %	385821705
19	NC_017474	TGTT	2	8	6976	6983	0 %	75 %	25 %	0 %	385821705
20	NC_017474	ATGA	2	8	7225	7232	50 %	25 %	25 %	0 %	385821706
21	NC_017474	GATT	2	8	7497	7504	25 %	50 %	25 %	0 %	385821706
22	NC_017474	CGGT	2	8	7595	7602	0 %	25 %	50 %	25 %	385821706
23	NC_017474	CTTG	2	8	8832	8839	0 %	50 %	25 %	25 %	385821706
24	NC_017474	ACGG	2	8	9234	9241	25 %	0 %	50 %	25 %	385821706
25	NC_017474	TTTG	2	8	9774	9781	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017474	TTTC	2	8	9962	9969	0 %	75 %	0 %	25 %	385821707
27	NC_017474	GACA	2	8	10133	10140	50 %	0 %	25 %	25 %	385821707
28	NC_017474	ATCA	2	8	10458	10465	50 %	25 %	0 %	25 %	385821707
29	NC_017474	GCAA	2	8	10590	10597	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017474	TTGG	2	8	10984	10991	0 %	50 %	50 %	0 %	385821708
31	NC_017474	CGTA	2	8	11805	11812	25 %	25 %	25 %	25 %	385821710
32	NC_017474	AACC	2	8	11973	11980	50 %	0 %	0 %	50 %	385821710
33	NC_017474	AAGA	2	8	12486	12493	75 %	0 %	25 %	0 %	385821711
34	NC_017474	ATTA	2	8	12658	12665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017474	TTGG	2	8	12999	13006	0 %	50 %	50 %	0 %	385821712
36	NC_017474	AGTT	2	8	13382	13389	25 %	50 %	25 %	0 %	385821712
37	NC_017474	AAAG	2	8	13720	13727	75 %	0 %	25 %	0 %	385821712
38	NC_017474	TTTA	2	8	14043	14050	25 %	75 %	0 %	0 %	385821712
39	NC_017474	GCAG	2	8	14070	14077	25 %	0 %	50 %	25 %	385821712
40	NC_017474	TTTC	2	8	14240	14247	0 %	75 %	0 %	25 %	385821712
41	NC_017474	GATT	2	8	14918	14925	25 %	50 %	25 %	0 %	385821713
42	NC_017474	AACG	2	8	15202	15209	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017474	GCTG	2	8	15396	15403	0 %	25 %	50 %	25 %	385821714
44	NC_017474	CAAT	2	8	15836	15843	50 %	25 %	0 %	25 %	385821714
45	NC_017474	ACTT	2	8	16276	16283	25 %	50 %	0 %	25 %	385821714
46	NC_017474	CTGG	2	8	16580	16587	0 %	25 %	50 %	25 %	385821714
47	NC_017474	TTCT	2	8	17123	17130	0 %	75 %	0 %	25 %	385821715
48	NC_017474	CAAT	2	8	17161	17168	50 %	25 %	0 %	25 %	385821715
49	NC_017474	ACAA	2	8	18416	18423	75 %	0 %	0 %	25 %	385821717
50	NC_017474	AAAG	2	8	18594	18601	75 %	0 %	25 %	0 %	385821717
51	NC_017474	TGTT	2	8	18813	18820	0 %	75 %	25 %	0 %	385821717
52	NC_017474	AAGC	2	8	18872	18879	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017474	GACT	2	8	19170	19177	25 %	25 %	25 %	25 %	385821718
54	NC_017474	AAAC	2	8	19256	19263	75 %	0 %	0 %	25 %	385821718
55	NC_017474	TAAT	2	8	19639	19646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017474	CGTT	2	8	20293	20300	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017474	ATAA	2	8	20484	20491	75 %	25 %	0 %	0 %	385821720
58	NC_017474	AGCT	2	8	21732	21739	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017474	CGAG	2	8	21942	21949	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017474	GGGT	2	8	22159	22166	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017474	GACT	2	8	22471	22478	25 %	25 %	25 %	25 %	385821723
62	NC_017474	CAAC	2	8	22752	22759	50 %	0 %	0 %	50 %	385821723
63	NC_017474	CAAA	2	8	24428	24435	75 %	0 %	0 %	25 %	385821724
64	NC_017474	AGAC	2	8	24747	24754	50 %	0 %	25 %	25 %	385821724
65	NC_017474	AAGA	2	8	25170	25177	75 %	0 %	25 %	0 %	385821724
66	NC_017474	CTGC	2	8	25937	25944	0 %	25 %	25 %	50 %	385821724
67	NC_017474	TAGT	2	8	26171	26178	25 %	50 %	25 %	0 %	385821724
68	NC_017474	AGCC	2	8	26570	26577	25 %	0 %	25 %	50 %	385821725
69	NC_017474	TTAC	2	8	27326	27333	25 %	50 %	0 %	25 %	385821726
70	NC_017474	TGGT	2	8	27432	27439	0 %	50 %	50 %	0 %	385821726
71	NC_017474	AATT	2	8	27788	27795	50 %	50 %	0 %	0 %	385821727
72	NC_017474	AATT	2	8	28004	28011	50 %	50 %	0 %	0 %	385821727
73	NC_017474	ATTT	2	8	28222	28229	25 %	75 %	0 %	0 %	385821727
74	NC_017474	ATTG	2	8	28768	28775	25 %	50 %	25 %	0 %	385821728
75	NC_017474	GGTT	2	8	28926	28933	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017474	CATA	2	8	28972	28979	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017474	AGTG	2	8	29118	29125	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017474	AACA	2	8	29925	29932	75 %	0 %	0 %	25 %	385821730
79	NC_017474	AATG	2	8	30277	30284	50 %	25 %	25 %	0 %	385821731
80	NC_017474	TACA	2	8	31131	31138	50 %	25 %	0 %	25 %	385821731
81	NC_017474	TTGC	2	8	31827	31834	0 %	50 %	25 %	25 %	385821731
82	NC_017474	CAAA	2	8	32016	32023	75 %	0 %	0 %	25 %	385821731
83	NC_017474	CTAC	2	8	32207	32214	25 %	25 %	0 %	50 %	385821731
84	NC_017474	GTGC	2	8	32974	32981	0 %	25 %	50 %	25 %	385821732
85	NC_017474	GCAA	2	8	33268	33275	50 %	0 %	25 %	25 %	385821732
86	NC_017474	ATTT	2	8	33927	33934	25 %	75 %	0 %	0 %	385821733
87	NC_017474	ATGA	2	8	34207	34214	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017474	AGCA	2	8	34816	34823	50 %	0 %	25 %	25 %	385821734
89	NC_017474	AAGC	2	8	35973	35980	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017474	TTCA	2	8	37153	37160	25 %	50 %	0 %	25 %	385821736
91	NC_017474	AGCA	2	8	37479	37486	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017474	ATTT	2	8	37527	37534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017474	AAAC	2	8	38564	38571	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017474	GTAT	2	8	38871	38878	25 %	50 %	25 %	0 %	385821739
95	NC_017474	GATT	2	8	39306	39313	25 %	50 %	25 %	0 %	385821739
96	NC_017474	AAGG	2	8	39388	39395	50 %	0 %	50 %	0 %	385821739
97	NC_017474	GCCG	2	8	39958	39965	0 %	0 %	50 %	50 %	385821739
98	NC_017474	AGAA	2	8	40297	40304	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017474	TACT	2	8	42191	42198	25 %	50 %	0 %	25 %	385821743
100	NC_017474	TATT	2	8	43437	43444	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017474	CTTT	2	8	43676	43683	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017474	TCTT	2	8	43768	43775	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017474	ATGA	2	8	44101	44108	50 %	25 %	25 %	0 %	385821745
104	NC_017474	TCAT	2	8	45648	45655	25 %	50 %	0 %	25 %	385821747
105	NC_017474	ATCC	2	8	46084	46091	25 %	25 %	0 %	50 %	385821748
106	NC_017474	GTCA	2	8	46471	46478	25 %	25 %	25 %	25 %	385821749
107	NC_017474	AATG	2	8	46702	46709	50 %	25 %	25 %	0 %	385821750
108	NC_017474	TAAT	2	8	46842	46849	50 %	50 %	0 %	0 %	385821750
109	NC_017474	GAAA	2	8	47083	47090	75 %	0 %	25 %	0 %	385821750
110	NC_017474	AAAT	2	8	47124	47131	75 %	25 %	0 %	0 %	385821750
111	NC_017474	CAAA	2	8	47322	47329	75 %	0 %	0 %	25 %	385821750
112	NC_017474	AAAG	2	8	47380	47387	75 %	0 %	25 %	0 %	385821750
113	NC_017474	CAAA	2	8	47705	47712	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017474	ATCG	2	8	49486	49493	25 %	25 %	25 %	25 %	385821752
115	NC_017474	CTTG	2	8	49514	49521	0 %	50 %	25 %	25 %	385821752
116	NC_017474	TCAT	2	8	49637	49644	25 %	50 %	0 %	25 %	385821752
117	NC_017474	AAAT	2	8	50900	50907	75 %	25 %	0 %	0 %	385821753
118	NC_017474	AATC	2	8	51386	51393	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017474	TCAA	2	8	51425	51432	50 %	25 %	0 %	25 %	385821754
120	NC_017474	CGCT	2	8	51621	51628	0 %	25 %	25 %	50 %	385821754
121	NC_017474	CTAT	2	8	51893	51900	25 %	50 %	0 %	25 %	385821755
122	NC_017474	CTAG	2	8	52115	52122	25 %	25 %	25 %	25 %	385821755
123	NC_017474	ACTA	2	8	52400	52407	50 %	25 %	0 %	25 %	385821756
124	NC_017474	AAAT	2	8	52742	52749	75 %	25 %	0 %	0 %	385821756
125	NC_017474	TAGG	2	8	52780	52787	25 %	25 %	50 %	0 %	385821756
126	NC_017474	TGAT	2	8	53516	53523	25 %	50 %	25 %	0 %	385821757
127	NC_017474	CAAA	2	8	53577	53584	75 %	0 %	0 %	25 %	385821757
128	NC_017474	AAAT	2	8	53886	53893	75 %	25 %	0 %	0 %	385821757
129	NC_017474	TATT	2	8	54496	54503	25 %	75 %	0 %	0 %	385821757
130	NC_017474	TTGA	2	8	54793	54800	25 %	50 %	25 %	0 %	385821757
131	NC_017474	AACA	2	8	54893	54900	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017474	TGAA	2	8	55072	55079	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017474	TGAA	2	8	55114	55121	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017474	CCGC	2	8	55216	55223	0 %	0 %	25 %	75 %	385821758
135	NC_017474	TGAG	2	8	55939	55946	25 %	25 %	50 %	0 %	385821758
136	NC_017474	CAAA	2	8	56266	56273	75 %	0 %	0 %	25 %	385821758
137	NC_017474	TGCG	2	8	56547	56554	0 %	25 %	50 %	25 %	385821758
138	NC_017474	GTTA	2	8	56755	56762	25 %	50 %	25 %	0 %	385821759
139	NC_017474	TTTG	2	8	57065	57072	0 %	75 %	25 %	0 %	385821759
140	NC_017474	GTGC	2	8	57245	57252	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017474	GTCA	2	8	57455	57462	25 %	25 %	25 %	25 %	385821760
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