MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 58805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017474	GGC	2	6	179492	179497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821876
3502	NC_017474	CGG	2	6	179699	179704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821877
3503	NC_017474	GAT	2	6	179708	179713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821877
3504	NC_017474	CCA	2	6	179806	179811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385821877
3505	NC_017474	CTTA	2	8	179815	179822	25 %	50 %	0 %	25 %	385821877
3506	NC_017474	AGATG	2	10	179825	179834	40 %	20 %	40 %	0 %	385821877
3507	NC_017474	ACC	2	6	179871	179876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385821877
3508	NC_017474	T	6	6	179956	179961	0 %	100 %	0 %	0 %	385821877
3509	NC_017474	ATG	2	6	180126	180131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821877
3510	NC_017474	GTT	2	6	180155	180160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821877
3511	NC_017474	TGA	2	6	180247	180252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821877
3512	NC_017474	GCA	3	9	180264	180272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821877
3513	NC_017474	CGCT	2	8	180325	180332	0 %	25 %	25 %	50 %	385821877
3514	NC_017474	CAT	2	6	180368	180373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821877
3515	NC_017474	TGC	2	6	180379	180384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821877
3516	NC_017474	CAA	2	6	180385	180390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821877
3517	NC_017474	A	6	6	180479	180484	100 %	0 %	0 %	0 %	385821878
3518	NC_017474	TGA	2	6	180499	180504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821878
3519	NC_017474	ATT	2	6	180563	180568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821878
3520	NC_017474	TGA	2	6	180684	180689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821878
3521	NC_017474	TCT	2	6	180696	180701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821878
3522	NC_017474	TATG	2	8	180773	180780	25 %	50 %	25 %	0 %	385821878
3523	NC_017474	ACG	2	6	180785	180790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821878
3524	NC_017474	CAT	2	6	180930	180935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821879
3525	NC_017474	CGA	2	6	180979	180984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821879
3526	NC_017474	GAA	2	6	180987	180992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821879
3527	NC_017474	GAT	2	6	181075	181080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821879
3528	NC_017474	AAT	2	6	181097	181102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821879
3529	NC_017474	TCC	2	6	181148	181153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3530	NC_017474	AAAC	2	8	181254	181261	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3531	NC_017474	TGT	2	6	181355	181360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_017474	ACC	2	6	181395	181400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385821880
3533	NC_017474	CCA	2	6	181420	181425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385821880
3534	NC_017474	ATG	2	6	181453	181458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821880
3535	NC_017474	AC	3	6	181586	181591	50 %	0 %	0 %	50 %	385821880
3536	NC_017474	TAA	2	6	181681	181686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821880
3537	NC_017474	CAG	3	9	181738	181746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821880
3538	NC_017474	ATGA	2	8	181813	181820	50 %	25 %	25 %	0 %	385821880
3539	NC_017474	T	6	6	181936	181941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_017474	GAT	2	6	181978	181983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_017474	TCG	2	6	181987	181992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_017474	TTG	2	6	182030	182035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_017474	AAGGT	2	10	182037	182046	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_017474	ATC	2	6	182137	182142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821881
3545	NC_017474	CAG	2	6	182161	182166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821881
3546	NC_017474	CA	3	6	182178	182183	50 %	0 %	0 %	50 %	385821881
3547	NC_017474	ACG	2	6	182214	182219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821881
3548	NC_017474	TGA	2	6	182250	182255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821881
3549	NC_017474	TCA	2	6	182265	182270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821881
3550	NC_017474	T	6	6	182281	182286	0 %	100 %	0 %	0 %	385821881
3551	NC_017474	TTCAT	2	10	182312	182321	20 %	60 %	0 %	20 %	385821881
3552	NC_017474	CGT	2	6	182377	182382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_017474	T	6	6	182419	182424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_017474	A	6	6	182438	182443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_017474	T	7	7	182463	182469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_017474	TGAGG	2	10	182513	182522	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_017474	AGC	2	6	182587	182592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821882
3558	NC_017474	CAA	2	6	182650	182655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821882
3559	NC_017474	GGC	2	6	182703	182708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821882
3560	NC_017474	GAA	2	6	182718	182723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821882
3561	NC_017474	TAT	2	6	182808	182813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821882
3562	NC_017474	GTT	2	6	182840	182845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821882
3563	NC_017474	GGC	2	6	182858	182863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821882
3564	NC_017474	CAAG	2	8	182912	182919	50 %	0 %	25 %	25 %	385821882
3565	NC_017474	GCA	2	6	182937	182942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821882
3566	NC_017474	GAA	2	6	183047	183052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821883
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3570	NC_017474	TGT	2	6	183142	183147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821883
3571	NC_017474	TAAAGA	2	12	183169	183180	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385821883
3572	NC_017474	T	6	6	183195	183200	0 %	100 %	0 %	0 %	385821883
3573	NC_017474	T	6	6	183381	183386	0 %	100 %	0 %	0 %	385821884
3574	NC_017474	AAATG	2	10	183477	183486	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_017474	TG	4	8	183524	183531	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_017474	T	8	8	183543	183550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_017474	GCT	2	6	183599	183604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821885
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3579	NC_017474	TG	3	6	183683	183688	0 %	50 %	50 %	0 %	385821885
3580	NC_017474	TCA	2	6	183808	183813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821885
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3582	NC_017474	GCCA	2	8	184101	184108	25 %	0 %	25 %	50 %	385821885
3583	NC_017474	A	6	6	184122	184127	100 %	0 %	0 %	0 %	385821885
3584	NC_017474	GGTG	2	8	184128	184135	0 %	25 %	75 %	0 %	385821885
3585	NC_017474	TGT	2	6	184298	184303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821885
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3587	NC_017474	GT	3	6	184413	184418	0 %	50 %	50 %	0 %	385821885
3588	NC_017474	GCA	2	6	184489	184494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821885
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3590	NC_017474	TTG	2	6	184561	184566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_017474	CAT	3	9	184610	184618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_017474	GTA	2	6	184673	184678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_017474	AGAA	2	8	184693	184700	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_017474	TCT	2	6	184719	184724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_017474	A	6	6	184822	184827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_017474	TCA	2	6	184831	184836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_017474	AGTA	2	8	184944	184951	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_017474	GAT	2	6	185087	185092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821886
3599	NC_017474	GGCAT	2	10	185128	185137	20 %	20 %	40 %	20 %	385821886
3600	NC_017474	AAG	2	6	185153	185158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821886
3601	NC_017474	CAT	2	6	185225	185230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821886
3602	NC_017474	CAT	2	6	185273	185278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821886
3603	NC_017474	CAG	2	6	185283	185288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821886
3604	NC_017474	TTGA	2	8	185357	185364	25 %	50 %	25 %	0 %	385821886
3605	NC_017474	AGC	2	6	185405	185410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_017474	ATG	2	6	185413	185418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_017474	TTAA	2	8	185428	185435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_017474	T	6	6	185482	185487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_017474	TCGTT	2	10	185545	185554	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3610	NC_017474	AGA	2	6	185570	185575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_017474	AAAG	2	8	185586	185593	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_017474	ATG	2	6	185604	185609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821887
3613	NC_017474	ATC	2	6	185628	185633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821887
3614	NC_017474	GGCT	2	8	185688	185695	0 %	25 %	50 %	25 %	385821887
3615	NC_017474	CGG	2	6	185708	185713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821887
3616	NC_017474	CGGCA	2	10	185732	185741	20 %	0 %	40 %	40 %	385821887
3617	NC_017474	TAT	2	6	185792	185797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821887
3618	NC_017474	CAT	2	6	185804	185809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821887
3619	NC_017474	CGT	2	6	185810	185815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821887
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3621	NC_017474	CAT	2	6	185904	185909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821888
3622	NC_017474	CAA	2	6	185989	185994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821888
3623	NC_017474	TCA	2	6	186053	186058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821888
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3994	NC_017474	A	7	7	204612	204618	100 %	0 %	0 %	0 %	385821910
3995	NC_017474	CA	3	6	204654	204659	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3996	NC_017474	AGC	2	6	204746	204751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3997	NC_017474	TTA	3	9	204782	204790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821911
3998	NC_017474	CAT	2	6	204797	204802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821911
3999	NC_017474	GCA	2	6	204815	204820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821911
4000	NC_017474	GCT	2	6	205049	205054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821911

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