MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 58805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017474	TGAT	2	8	154157	154164	25 %	50 %	25 %	0 %	385821855
3002	NC_017474	TGA	2	6	154197	154202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821855
3003	NC_017474	CTT	2	6	154221	154226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821855
3004	NC_017474	CGGT	2	8	154276	154283	0 %	25 %	50 %	25 %	385821855
3005	NC_017474	ACA	2	6	154412	154417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821855
3006	NC_017474	ATT	2	6	154420	154425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821855
3007	NC_017474	CCG	2	6	154561	154566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821855
3008	NC_017474	AGA	2	6	154572	154577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821855
3009	NC_017474	GAA	2	6	154594	154599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821855
3010	NC_017474	CTG	2	6	154600	154605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821855
3011	NC_017474	ATG	2	6	154641	154646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821855
3012	NC_017474	GAGGC	2	10	154772	154781	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3013	NC_017474	TTTC	2	8	154826	154833	0 %	75 %	0 %	25 %	385821856
3014	NC_017474	TGG	2	6	154875	154880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821856
3015	NC_017474	TTA	2	6	154899	154904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821856
3016	NC_017474	GCT	2	6	154911	154916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821856
3017	NC_017474	TC	3	6	154947	154952	0 %	50 %	0 %	50 %	385821856
3018	NC_017474	GCA	2	6	154972	154977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821856
3019	NC_017474	TCG	2	6	155054	155059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821856
3020	NC_017474	GTG	2	6	155084	155089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821856
3021	NC_017474	TAT	3	9	155099	155107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821856
3022	NC_017474	TGG	2	6	155151	155156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821856
3023	NC_017474	ACT	2	6	155162	155167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821856
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3029	NC_017474	T	6	6	155396	155401	0 %	100 %	0 %	0 %	385821856
3030	NC_017474	ATT	3	9	155427	155435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821856
3031	NC_017474	ATC	2	6	155508	155513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821856
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3033	NC_017474	ATT	2	6	155535	155540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821856
3034	NC_017474	GTTG	2	8	155577	155584	0 %	50 %	50 %	0 %	385821856
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3039	NC_017474	CCAA	2	8	155742	155749	50 %	0 %	0 %	50 %	385821856
3040	NC_017474	CAC	2	6	155773	155778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3041	NC_017474	A	7	7	155788	155794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_017474	T	6	6	155811	155816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_017474	CTA	2	6	155870	155875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821857
3044	NC_017474	AGCG	2	8	155939	155946	25 %	0 %	50 %	25 %	385821857
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3046	NC_017474	AAG	2	6	156046	156051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821857
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3049	NC_017474	TGA	2	6	156153	156158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821857
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3051	NC_017474	CAG	2	6	156228	156233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_017474	TTA	2	6	156244	156249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_017474	ATG	2	6	156261	156266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_017474	AAT	2	6	156274	156279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_017474	TGA	2	6	156422	156427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821858
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3057	NC_017474	CGAA	2	8	156564	156571	50 %	0 %	25 %	25 %	385821858
3058	NC_017474	CAG	2	6	156592	156597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821858
3059	NC_017474	TGA	2	6	156628	156633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821858
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3061	NC_017474	CAA	2	6	156701	156706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821858
3062	NC_017474	GCA	2	6	156710	156715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821858
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3067	NC_017474	GGC	2	6	157020	157025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821858
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3070	NC_017474	GAG	2	6	157098	157103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385821858
3071	NC_017474	TGGC	2	8	157170	157177	0 %	25 %	50 %	25 %	385821858
3072	NC_017474	CGG	2	6	157218	157223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821858
3073	NC_017474	GCGA	2	8	157236	157243	25 %	0 %	50 %	25 %	385821858
3074	NC_017474	CA	3	6	157340	157345	50 %	0 %	0 %	50 %	385821858
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3076	NC_017474	CACAA	2	10	157518	157527	60 %	0 %	0 %	40 %	385821858
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3080	NC_017474	A	7	7	157749	157755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_017474	GCAG	2	8	157782	157789	25 %	0 %	50 %	25 %	385821859
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3089	NC_017474	AGA	2	6	158351	158356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821859
3090	NC_017474	GAT	2	6	158363	158368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821859
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3094	NC_017474	CAA	3	9	158828	158836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821859
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3096	NC_017474	A	6	6	158969	158974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_017474	TC	3	6	158978	158983	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3098	NC_017474	GA	3	6	158992	158997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_017474	AATT	2	8	159047	159054	50 %	50 %	0 %	0 %	385821860
3100	NC_017474	AATC	2	8	159075	159082	50 %	25 %	0 %	25 %	385821860
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3103	NC_017474	TGG	2	6	159235	159240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821860
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3105	NC_017474	CAA	2	6	159466	159471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821860
3106	NC_017474	CAG	2	6	159486	159491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821860
3107	NC_017474	TGAAT	2	10	159507	159516	40 %	40 %	20 %	0 %	385821860
3108	NC_017474	TTG	2	6	159544	159549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821860
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3110	NC_017474	TGA	2	6	159621	159626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821860
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3113	NC_017474	CCCG	2	8	159735	159742	0 %	0 %	25 %	75 %	385821860
3114	NC_017474	TTGC	2	8	159801	159808	0 %	50 %	25 %	25 %	385821860
3115	NC_017474	CCT	2	6	159882	159887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3116	NC_017474	CTG	2	6	160018	160023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_017474	AGA	2	6	160048	160053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_017474	TGG	2	6	160146	160151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821861
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3120	NC_017474	CATT	2	8	160158	160165	25 %	50 %	0 %	25 %	385821861
3121	NC_017474	TGA	3	9	160177	160185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821861
3122	NC_017474	CTG	2	6	160425	160430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821861
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3124	NC_017474	A	7	7	160488	160494	100 %	0 %	0 %	0 %	385821861
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3234	NC_017474	TAAC	2	8	166342	166349	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3235	NC_017474	GCAG	2	8	166377	166384	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3236	NC_017474	AAT	2	6	166422	166427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3237	NC_017474	CAG	2	6	166430	166435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3238	NC_017474	TGACAA	2	12	166509	166520	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3239	NC_017474	AGTC	2	8	166546	166553	25 %	25 %	25 %	25 %	385821866
3240	NC_017474	TTG	2	6	166563	166568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821866
3241	NC_017474	CAT	2	6	166576	166581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821866
3242	NC_017474	ACG	2	6	166596	166601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821866
3243	NC_017474	TCA	2	6	166605	166610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821866
3244	NC_017474	GCG	3	9	166632	166640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821866
3245	NC_017474	CCT	2	6	166694	166699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3246	NC_017474	TCA	2	6	166724	166729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3247	NC_017474	AGC	2	6	166774	166779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3249	NC_017474	T	6	6	166892	166897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3372	NC_017474	TCA	2	6	172423	172428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821871
3373	NC_017474	TGAC	2	8	172447	172454	25 %	25 %	25 %	25 %	385821871
3374	NC_017474	TGGTT	2	10	172466	172475	0 %	60 %	40 %	0 %	385821871
3375	NC_017474	CAT	2	6	172593	172598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821871
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3377	NC_017474	CAT	2	6	172760	172765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3493	NC_017474	AGC	2	6	179128	179133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821876
3494	NC_017474	TTA	2	6	179135	179140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821876
3495	NC_017474	CAA	2	6	179210	179215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821876
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3497	NC_017474	CAG	2	6	179416	179421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821876
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