MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 58805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017474	ATC	2	6	127210	127215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821825
2502	NC_017474	TGAC	2	8	127272	127279	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2503	NC_017474	TGT	2	6	127299	127304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_017474	AGC	2	6	127391	127396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821826
2505	NC_017474	GTT	2	6	127473	127478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821826
2506	NC_017474	TGATC	2	10	127487	127496	20 %	40 %	20 %	20 %	385821826
2507	NC_017474	TTA	2	6	127527	127532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821826
2508	NC_017474	CCA	2	6	127543	127548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385821826
2509	NC_017474	AAC	2	6	127575	127580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821826
2510	NC_017474	A	8	8	127607	127614	100 %	0 %	0 %	0 %	385821826
2511	NC_017474	ACTT	2	8	127699	127706	25 %	50 %	0 %	25 %	385821826
2512	NC_017474	AGTATT	2	12	127710	127721	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385821826
2513	NC_017474	ATT	2	6	127726	127731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821826
2514	NC_017474	ACT	2	6	127761	127766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821826
2515	NC_017474	T	6	6	127768	127773	0 %	100 %	0 %	0 %	385821826
2516	NC_017474	TTTA	2	8	127805	127812	25 %	75 %	0 %	0 %	385821826
2517	NC_017474	TAT	2	6	127832	127837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821826
2518	NC_017474	TAA	2	6	127877	127882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821826
2519	NC_017474	GCAG	2	8	127896	127903	25 %	0 %	50 %	25 %	385821826
2520	NC_017474	GC	3	6	127933	127938	0 %	0 %	50 %	50 %	385821826
2521	NC_017474	TCAA	2	8	127987	127994	50 %	25 %	0 %	25 %	385821826
2522	NC_017474	AAT	2	6	128055	128060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821826
2523	NC_017474	ATT	2	6	128166	128171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_017474	CAC	2	6	128338	128343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2525	NC_017474	TGT	2	6	128409	128414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821827
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2529	NC_017474	CATGC	2	10	128617	128626	20 %	20 %	20 %	40 %	385821827
2530	NC_017474	TCA	2	6	128631	128636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821827
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2532	NC_017474	T	6	6	128757	128762	0 %	100 %	0 %	0 %	385821827
2533	NC_017474	GTT	2	6	128773	128778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821827
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2535	NC_017474	TGC	2	6	128971	128976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821827
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2537	NC_017474	CAAC	2	8	129097	129104	50 %	0 %	0 %	50 %	385821827
2538	NC_017474	A	6	6	129169	129174	100 %	0 %	0 %	0 %	385821827
2539	NC_017474	TGA	2	6	129189	129194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821827
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2543	NC_017474	CAC	2	6	129331	129336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385821827
2544	NC_017474	GAT	2	6	129341	129346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821827
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2549	NC_017474	GAC	2	6	129622	129627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821827
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2552	NC_017474	TCA	2	6	129739	129744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821827
2553	NC_017474	TCC	2	6	129748	129753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2554	NC_017474	T	7	7	129759	129765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_017474	TGGT	2	8	129768	129775	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_017474	A	6	6	129798	129803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_017474	TCA	3	9	129808	129816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2558	NC_017474	GTC	2	6	129823	129828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2559	NC_017474	TTA	2	6	129846	129851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_017474	GCT	2	6	129855	129860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2561	NC_017474	AT	3	6	129892	129897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_017474	ATT	2	6	129900	129905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_017474	TAA	2	6	129912	129917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_017474	GCT	2	6	129932	129937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2565	NC_017474	T	6	6	129957	129962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2572	NC_017474	CAAG	2	8	130491	130498	50 %	0 %	25 %	25 %	385821828
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2583	NC_017474	TGTT	2	8	131549	131556	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2589	NC_017474	TGG	2	6	131936	131941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821829
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2598	NC_017474	A	6	6	132270	132275	100 %	0 %	0 %	0 %	385821830
2599	NC_017474	ATGACG	2	12	132289	132300	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385821830
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2601	NC_017474	ATG	2	6	132395	132400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821831
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2607	NC_017474	A	6	6	132705	132710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_017474	AAAT	2	8	132742	132749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_017474	TTC	2	6	132812	132817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821832
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2614	NC_017474	GCAG	2	8	133212	133219	25 %	0 %	50 %	25 %	385821832
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2619	NC_017474	TGC	2	6	133365	133370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821832
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2623	NC_017474	CAG	2	6	133674	133679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821832
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2625	NC_017474	TCGCAG	2	12	133791	133802	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2626	NC_017474	CAT	2	6	133917	133922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2995	NC_017474	ATT	2	6	153983	153988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821855
2996	NC_017474	ATT	2	6	154006	154011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821855
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2999	NC_017474	TTCA	2	8	154072	154079	25 %	50 %	0 %	25 %	385821855
3000	NC_017474	CAA	2	6	154146	154151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821855

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