MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 58805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017474	TGC	2	6	24119	24124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821724
502	NC_017474	GA	3	6	24199	24204	50 %	0 %	50 %	0 %	385821724
503	NC_017474	CAAA	2	8	24428	24435	75 %	0 %	0 %	25 %	385821724
504	NC_017474	CGC	2	6	24482	24487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821724
505	NC_017474	GCTTT	2	10	24511	24520	0 %	60 %	20 %	20 %	385821724
506	NC_017474	GCC	2	6	24666	24671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821724
507	NC_017474	TCA	2	6	24689	24694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821724
508	NC_017474	AGAC	2	8	24747	24754	50 %	0 %	25 %	25 %	385821724
509	NC_017474	GCG	2	6	24764	24769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821724
510	NC_017474	GGC	3	9	24864	24872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821724
511	NC_017474	GAC	2	6	24933	24938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821724
512	NC_017474	TTG	2	6	24939	24944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821724
513	NC_017474	GAT	2	6	25014	25019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821724
514	NC_017474	TAA	2	6	25026	25031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821724
515	NC_017474	GCA	2	6	25042	25047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821724
516	NC_017474	GC	3	6	25062	25067	0 %	0 %	50 %	50 %	385821724
517	NC_017474	GC	3	6	25112	25117	0 %	0 %	50 %	50 %	385821724
518	NC_017474	CTT	2	6	25121	25126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821724
519	NC_017474	GTG	2	6	25144	25149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821724
520	NC_017474	CAGCG	2	10	25158	25167	20 %	0 %	40 %	40 %	385821724
521	NC_017474	AAGA	2	8	25170	25177	75 %	0 %	25 %	0 %	385821724
522	NC_017474	GGC	2	6	25203	25208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821724
523	NC_017474	CAG	2	6	25217	25222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821724
524	NC_017474	GCC	2	6	25224	25229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821724
525	NC_017474	GTT	2	6	25286	25291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821724
526	NC_017474	CGG	2	6	25367	25372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821724
527	NC_017474	CGC	2	6	25389	25394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821724
528	NC_017474	GCT	2	6	25447	25452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821724
529	NC_017474	TGC	2	6	25733	25738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821724
530	NC_017474	T	7	7	25778	25784	0 %	100 %	0 %	0 %	385821724
531	NC_017474	CAA	2	6	25886	25891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821724
532	NC_017474	GCC	2	6	25905	25910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821724
533	NC_017474	CTGC	2	8	25937	25944	0 %	25 %	25 %	50 %	385821724
534	NC_017474	CGC	2	6	25946	25951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821724
535	NC_017474	GAT	2	6	26021	26026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821724
536	NC_017474	GTG	2	6	26038	26043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821724
537	NC_017474	GCCCG	2	10	26062	26071	0 %	0 %	40 %	60 %	385821724
538	NC_017474	CGA	2	6	26084	26089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821724
539	NC_017474	CAG	2	6	26091	26096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821724
540	NC_017474	ATA	2	6	26110	26115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821724
541	NC_017474	TAGT	2	8	26171	26178	25 %	50 %	25 %	0 %	385821724
542	NC_017474	TCA	2	6	26236	26241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821725
543	NC_017474	CAT	2	6	26261	26266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821725
544	NC_017474	GAT	2	6	26274	26279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821725
545	NC_017474	AAC	2	6	26359	26364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821725
546	NC_017474	TCA	2	6	26410	26415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821725
547	NC_017474	AGC	3	9	26419	26427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821725
548	NC_017474	GTT	2	6	26465	26470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821725
549	NC_017474	AGCC	2	8	26570	26577	25 %	0 %	25 %	50 %	385821725
550	NC_017474	TTG	2	6	26594	26599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821725
551	NC_017474	ATG	2	6	26842	26847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821725
552	NC_017474	AT	3	6	26890	26895	50 %	50 %	0 %	0 %	385821725
553	NC_017474	CCT	2	6	26906	26911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_017474	TG	3	6	26930	26935	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017474	GTTTT	2	10	27130	27139	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017474	ATG	2	6	27160	27165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017474	GGA	2	6	27169	27174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017474	CGG	2	6	27201	27206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821726
559	NC_017474	TTG	2	6	27240	27245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821726
560	NC_017474	CGA	2	6	27256	27261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821726
561	NC_017474	TTAC	2	8	27326	27333	25 %	50 %	0 %	25 %	385821726
562	NC_017474	TGGT	2	8	27432	27439	0 %	50 %	50 %	0 %	385821726
563	NC_017474	AGC	3	9	27473	27481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821726
564	NC_017474	ATT	2	6	27483	27488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821726
565	NC_017474	AAT	2	6	27492	27497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821726
566	NC_017474	GTG	2	6	27507	27512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821726
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568	NC_017474	A	6	6	27541	27546	100 %	0 %	0 %	0 %	385821726
569	NC_017474	TAC	3	9	27600	27608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821726
570	NC_017474	TTC	2	6	27612	27617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821726
571	NC_017474	GCG	2	6	27687	27692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821726
572	NC_017474	ATA	2	6	27756	27761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017474	AATT	2	8	27788	27795	50 %	50 %	0 %	0 %	385821727
574	NC_017474	GCC	2	6	27840	27845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821727
575	NC_017474	GGC	2	6	27908	27913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821727
576	NC_017474	CGG	2	6	27978	27983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821727
577	NC_017474	AATT	2	8	28004	28011	50 %	50 %	0 %	0 %	385821727
578	NC_017474	TCCTG	2	10	28083	28092	0 %	40 %	20 %	40 %	385821727
579	NC_017474	TG	3	6	28091	28096	0 %	50 %	50 %	0 %	385821727
580	NC_017474	ATTT	2	8	28222	28229	25 %	75 %	0 %	0 %	385821727
581	NC_017474	GTC	2	6	28373	28378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821727
582	NC_017474	ATG	2	6	28402	28407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821727
583	NC_017474	ATGATA	2	12	28421	28432	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385821727
584	NC_017474	CAT	2	6	28464	28469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821727
585	NC_017474	GGCTA	2	10	28576	28585	20 %	20 %	40 %	20 %	385821727
586	NC_017474	TTA	2	6	28637	28642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821728
587	NC_017474	TGA	2	6	28719	28724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821728
588	NC_017474	ATTG	2	8	28768	28775	25 %	50 %	25 %	0 %	385821728
589	NC_017474	ATC	2	6	28842	28847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821728
590	NC_017474	CAT	2	6	28849	28854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821728
591	NC_017474	TTGTT	2	10	28872	28881	0 %	80 %	20 %	0 %	385821728
592	NC_017474	GGTT	2	8	28926	28933	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017474	T	6	6	28945	28950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017474	CATA	2	8	28972	28979	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
595	NC_017474	AGA	2	6	28986	28991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017474	T	6	6	29035	29040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_017474	GTT	2	6	29051	29056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017474	AGTG	2	8	29118	29125	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017474	TTG	2	6	29154	29159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821729
600	NC_017474	AGC	2	6	29297	29302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821729
601	NC_017474	GT	3	6	29316	29321	0 %	50 %	50 %	0 %	385821729
602	NC_017474	TTG	2	6	29438	29443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821729
603	NC_017474	TCT	2	6	29454	29459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821729
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605	NC_017474	A	6	6	29542	29547	100 %	0 %	0 %	0 %	385821729
606	NC_017474	AGA	2	6	29551	29556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821729
607	NC_017474	T	6	6	29579	29584	0 %	100 %	0 %	0 %	385821729
608	NC_017474	TGT	2	6	29769	29774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821729
609	NC_017474	TC	3	6	29825	29830	0 %	50 %	0 %	50 %	385821730
610	NC_017474	CAA	2	6	29874	29879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821730
611	NC_017474	T	6	6	29880	29885	0 %	100 %	0 %	0 %	385821730
612	NC_017474	CAT	2	6	29901	29906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821730
613	NC_017474	AACA	2	8	29925	29932	75 %	0 %	0 %	25 %	385821730
614	NC_017474	GTC	2	6	29970	29975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821730
615	NC_017474	GCC	2	6	30018	30023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821730
616	NC_017474	TGT	2	6	30051	30056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821730
617	NC_017474	CTT	2	6	30084	30089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821730
618	NC_017474	TA	3	6	30129	30134	50 %	50 %	0 %	0 %	385821730
619	NC_017474	TTG	2	6	30176	30181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821730
620	NC_017474	A	7	7	30184	30190	100 %	0 %	0 %	0 %	385821730
621	NC_017474	TAA	2	6	30198	30203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821730
622	NC_017474	AAC	2	6	30238	30243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821730
623	NC_017474	CCT	2	6	30256	30261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_017474	AGC	2	6	30271	30276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821731
625	NC_017474	AATG	2	8	30277	30284	50 %	25 %	25 %	0 %	385821731
626	NC_017474	AGC	2	6	30301	30306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821731
627	NC_017474	CAA	2	6	30312	30317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821731
628	NC_017474	ATA	2	6	30341	30346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821731
629	NC_017474	TTG	2	6	30348	30353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821731
630	NC_017474	ACA	2	6	30362	30367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821731
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