MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 58805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017474	GTG	2	6	258691	258696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821956
5002	NC_017474	AC	3	6	258699	258704	50 %	0 %	0 %	50 %	385821956
5003	NC_017474	GGA	2	6	258706	258711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385821956
5004	NC_017474	ATGT	2	8	258720	258727	25 %	50 %	25 %	0 %	385821956
5005	NC_017474	TC	3	6	258792	258797	0 %	50 %	0 %	50 %	385821956
5006	NC_017474	GGA	2	6	258822	258827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385821956
5007	NC_017474	AGC	2	6	259050	259055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_017474	ATA	2	6	259126	259131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_017474	TCC	2	6	259305	259310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5010	NC_017474	AGG	2	6	259413	259418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_017474	AGC	2	6	259453	259458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_017474	TAG	2	6	259522	259527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_017474	GAG	2	6	259609	259614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_017474	GAGC	2	8	259628	259635	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5015	NC_017474	GAA	2	6	259679	259684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_017474	AAC	2	6	259725	259730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_017474	GAT	2	6	259767	259772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_017474	CGG	2	6	259858	259863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_017474	GA	3	6	259956	259961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_017474	TAGG	2	8	260074	260081	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_017474	TGG	2	6	260120	260125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_017474	TAC	2	6	260128	260133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_017474	CCT	2	6	260216	260221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5024	NC_017474	GGT	2	6	260352	260357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_017474	CGT	2	6	260547	260552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_017474	GAG	2	6	260596	260601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_017474	GCC	2	6	260655	260660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5028	NC_017474	C	6	6	260723	260728	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5029	NC_017474	GAGAT	2	10	260731	260740	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017474	GA	3	6	260771	260776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_017474	TGGAAG	2	12	260794	260805	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_017474	CTGCGA	2	12	260883	260894	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_017474	GCA	2	6	260928	260933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_017474	GTG	2	6	260980	260985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_017474	AAG	2	6	260994	260999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_017474	CTT	2	6	261036	261041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_017474	AGT	2	6	261051	261056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_017474	TGG	2	6	261057	261062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_017474	CTGC	2	8	261067	261074	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5040	NC_017474	T	7	7	261125	261131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_017474	TAAG	2	8	261141	261148	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_017474	AGCA	2	8	261172	261179	50 %	0 %	25 %	25 %	385821957
5043	NC_017474	CAT	2	6	261193	261198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821957
5044	NC_017474	GTG	2	6	261274	261279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821957
5045	NC_017474	GC	3	6	261437	261442	0 %	0 %	50 %	50 %	385821957
5046	NC_017474	TGCT	3	12	261571	261582	0 %	50 %	25 %	25 %	385821958
5047	NC_017474	CGA	2	6	261637	261642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821958
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5050	NC_017474	CG	3	6	261776	261781	0 %	0 %	50 %	50 %	385821958
5051	NC_017474	CT	3	6	261790	261795	0 %	50 %	0 %	50 %	385821958
5052	NC_017474	CGTT	2	8	261796	261803	0 %	50 %	25 %	25 %	385821958
5053	NC_017474	T	6	6	261870	261875	0 %	100 %	0 %	0 %	385821958
5054	NC_017474	GGT	2	6	261891	261896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821958
5055	NC_017474	CGGT	2	8	261977	261984	0 %	25 %	50 %	25 %	385821958
5056	NC_017474	TTA	2	6	262037	262042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821958
5057	NC_017474	TAT	3	9	262122	262130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821958
5058	NC_017474	ATTCG	2	10	262172	262181	20 %	40 %	20 %	20 %	385821958
5059	NC_017474	TTC	2	6	262282	262287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821958
5060	NC_017474	GGC	2	6	262303	262308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_017474	GTG	2	6	262317	262322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821959
5062	NC_017474	TTA	2	6	262330	262335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821959
5063	NC_017474	GAT	2	6	262428	262433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821959
5064	NC_017474	GTT	2	6	262452	262457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821959
5065	NC_017474	GAT	2	6	262479	262484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821959
5066	NC_017474	TG	3	6	262517	262522	0 %	50 %	50 %	0 %	385821959
5067	NC_017474	T	6	6	262528	262533	0 %	100 %	0 %	0 %	385821959
5068	NC_017474	GC	3	6	262534	262539	0 %	0 %	50 %	50 %	385821959
5069	NC_017474	TCA	2	6	262556	262561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821959
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5071	NC_017474	T	6	6	262962	262967	0 %	100 %	0 %	0 %	385821960
5072	NC_017474	GACT	2	8	262984	262991	25 %	25 %	25 %	25 %	385821960
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5074	NC_017474	TTA	2	6	263023	263028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821960
5075	NC_017474	TCA	2	6	263091	263096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821960
5076	NC_017474	AACC	2	8	263176	263183	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5077	NC_017474	AGG	2	6	263197	263202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_017474	TTG	3	9	263271	263279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_017474	CCGA	2	8	263291	263298	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5080	NC_017474	T	6	6	263386	263391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_017474	GAA	2	6	263448	263453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821961
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5085	NC_017474	ACA	2	6	263720	263725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821961
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5089	NC_017474	GCG	2	6	263968	263973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821961
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5100	NC_017474	CAG	2	6	264351	264356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821961
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5104	NC_017474	CAGC	2	8	264488	264495	25 %	0 %	25 %	50 %	385821961
5105	NC_017474	A	7	7	264520	264526	100 %	0 %	0 %	0 %	385821961
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5108	NC_017474	GAG	2	6	264661	264666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_017474	CAA	2	6	264690	264695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821962
5110	NC_017474	ATC	2	6	264765	264770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821962
5111	NC_017474	TAT	2	6	264825	264830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821962
5112	NC_017474	ATTA	2	8	264834	264841	50 %	50 %	0 %	0 %	385821962
5113	NC_017474	TTG	2	6	264867	264872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821962
5114	NC_017474	TTGA	2	8	264906	264913	25 %	50 %	25 %	0 %	385821962
5115	NC_017474	GCG	2	6	264954	264959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821962
5116	NC_017474	TCA	2	6	265045	265050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821962
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5122	NC_017474	TGG	2	6	265213	265218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821962
5123	NC_017474	CTGG	2	8	265269	265276	0 %	25 %	50 %	25 %	385821962
5124	NC_017474	CGC	2	6	265358	265363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821962
5125	NC_017474	GTT	2	6	265365	265370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821962
5126	NC_017474	GATCG	2	10	265376	265385	20 %	20 %	40 %	20 %	385821962
5127	NC_017474	CTT	2	6	265409	265414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821962
5128	NC_017474	GCG	2	6	265470	265475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821962
5129	NC_017474	ATC	2	6	265491	265496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821962
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5239	NC_017474	AGATA	2	10	271519	271528	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5249	NC_017474	GCA	2	6	272056	272061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821969
5250	NC_017474	GGC	2	6	272062	272067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821969
5251	NC_017474	GCGG	2	8	272131	272138	0 %	0 %	75 %	25 %	385821969
5252	NC_017474	ATTG	2	8	272166	272173	25 %	50 %	25 %	0 %	385821969
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5259	NC_017474	ATG	2	6	272525	272530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821970
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