MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 58805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017474	GGGCAA	2	12	231682	231693	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	385821934
4502	NC_017474	TGA	2	6	231744	231749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821934
4503	NC_017474	GGT	2	6	231811	231816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821934
4504	NC_017474	GGC	2	6	231819	231824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821934
4505	NC_017474	TAT	2	6	231849	231854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821934
4506	NC_017474	TCT	2	6	232036	232041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821934
4507	NC_017474	AAC	2	6	232076	232081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821934
4508	NC_017474	GCT	2	6	232096	232101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821934
4509	NC_017474	AATC	2	8	232141	232148	50 %	25 %	0 %	25 %	385821934
4510	NC_017474	CAGTG	2	10	232212	232221	20 %	20 %	40 %	20 %	385821934
4511	NC_017474	TTA	2	6	232335	232340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821934
4512	NC_017474	AGC	2	6	232353	232358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821934
4513	NC_017474	TCT	2	6	232425	232430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821934
4514	NC_017474	GGCA	2	8	232467	232474	25 %	0 %	50 %	25 %	385821934
4515	NC_017474	TCAC	2	8	232563	232570	25 %	25 %	0 %	50 %	385821934
4516	NC_017474	TGA	2	6	232590	232595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821934
4517	NC_017474	ATG	2	6	232664	232669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821934
4518	NC_017474	CAA	2	6	232705	232710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821934
4519	NC_017474	ACG	2	6	232714	232719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821934
4520	NC_017474	AAG	2	6	232722	232727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821934
4521	NC_017474	T	6	6	232763	232768	0 %	100 %	0 %	0 %	385821934
4522	NC_017474	ATT	2	6	232832	232837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821934
4523	NC_017474	CG	3	6	232861	232866	0 %	0 %	50 %	50 %	385821934
4524	NC_017474	TATT	2	8	232872	232879	25 %	75 %	0 %	0 %	385821934
4525	NC_017474	TGG	2	6	232881	232886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821934
4526	NC_017474	AAC	2	6	232896	232901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821934
4527	NC_017474	GA	3	6	232972	232977	50 %	0 %	50 %	0 %	385821934
4528	NC_017474	ATTCA	2	10	233002	233011	40 %	40 %	0 %	20 %	385821934
4529	NC_017474	AC	3	6	233036	233041	50 %	0 %	0 %	50 %	385821934
4530	NC_017474	GAAGC	2	10	233049	233058	40 %	0 %	40 %	20 %	385821934
4531	NC_017474	TAT	2	6	233070	233075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821934
4532	NC_017474	TTC	2	6	233076	233081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821934
4533	NC_017474	ATT	2	6	233104	233109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821934
4534	NC_017474	GT	3	6	233132	233137	0 %	50 %	50 %	0 %	385821934
4535	NC_017474	TGA	2	6	233177	233182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821934
4536	NC_017474	ATG	2	6	233186	233191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821934
4537	NC_017474	CAC	2	6	233280	233285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385821934
4538	NC_017474	CGA	2	6	233495	233500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821934
4539	NC_017474	ACA	2	6	233527	233532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821934
4540	NC_017474	GGC	2	6	233562	233567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821934
4541	NC_017474	ATTA	2	8	233701	233708	50 %	50 %	0 %	0 %	385821934
4542	NC_017474	AAG	2	6	233716	233721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821934
4543	NC_017474	AAG	2	6	233750	233755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821934
4544	NC_017474	GTC	2	6	233835	233840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821934
4545	NC_017474	ATG	2	6	233876	233881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821934
4546	NC_017474	TGA	2	6	233889	233894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821934
4547	NC_017474	GCA	2	6	233944	233949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821934
4548	NC_017474	GCT	2	6	234082	234087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821934
4549	NC_017474	CTT	2	6	234200	234205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821934
4550	NC_017474	ATTA	2	8	234220	234227	50 %	50 %	0 %	0 %	385821934
4551	NC_017474	ATG	2	6	234242	234247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821934
4552	NC_017474	CAA	2	6	234250	234255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821934
4553	NC_017474	T	6	6	234442	234447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_017474	TAG	2	6	234525	234530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_017474	AAC	2	6	234544	234549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_017474	GC	3	6	234575	234580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4557	NC_017474	T	7	7	234622	234628	0 %	100 %	0 %	0 %	385821935
4558	NC_017474	GAT	2	6	234814	234819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821935
4559	NC_017474	ACC	2	6	234832	234837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385821935
4560	NC_017474	T	6	6	234932	234937	0 %	100 %	0 %	0 %	385821935
4561	NC_017474	GGT	2	6	235020	235025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821935
4562	NC_017474	GAT	2	6	235087	235092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821935
4563	NC_017474	GCA	2	6	235209	235214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821935
4564	NC_017474	ATT	2	6	235406	235411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821935
4565	NC_017474	GCG	2	6	235504	235509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821935
4566	NC_017474	TTA	2	6	235527	235532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821935
4567	NC_017474	T	7	7	235533	235539	0 %	100 %	0 %	0 %	385821935
4568	NC_017474	GTC	2	6	235588	235593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821935
4569	NC_017474	TGC	2	6	235634	235639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821935
4570	NC_017474	CCA	2	6	235904	235909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385821935
4571	NC_017474	GTT	2	6	235924	235929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821935
4572	NC_017474	TGG	2	6	235946	235951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821935
4573	NC_017474	ATG	2	6	236073	236078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821936
4574	NC_017474	CTGGA	2	10	236149	236158	20 %	20 %	40 %	20 %	385821936
4575	NC_017474	ATC	2	6	236213	236218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821936
4576	NC_017474	ATG	2	6	236227	236232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821936
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4578	NC_017474	GCTT	2	8	236522	236529	0 %	50 %	25 %	25 %	385821936
4579	NC_017474	CAT	2	6	236541	236546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821936
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4581	NC_017474	AGCA	2	8	236585	236592	50 %	0 %	25 %	25 %	385821936
4582	NC_017474	GGTT	2	8	236651	236658	0 %	50 %	50 %	0 %	385821936
4583	NC_017474	CCTT	2	8	236674	236681	0 %	50 %	0 %	50 %	385821936
4584	NC_017474	TAT	2	6	236682	236687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821936
4585	NC_017474	AGCA	2	8	236692	236699	50 %	0 %	25 %	25 %	385821936
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4587	NC_017474	TAT	2	6	236811	236816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821936
4588	NC_017474	CAA	2	6	236817	236822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821936
4589	NC_017474	CGA	2	6	236826	236831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821936
4590	NC_017474	TGCA	2	8	236851	236858	25 %	25 %	25 %	25 %	385821936
4591	NC_017474	TGGC	2	8	236911	236918	0 %	25 %	50 %	25 %	385821936
4592	NC_017474	TGCT	2	8	237091	237098	0 %	50 %	25 %	25 %	385821937
4593	NC_017474	T	6	6	237105	237110	0 %	100 %	0 %	0 %	385821937
4594	NC_017474	ATTG	2	8	237153	237160	25 %	50 %	25 %	0 %	385821937
4595	NC_017474	TGA	2	6	237170	237175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821937
4596	NC_017474	TGA	2	6	237257	237262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821937
4597	NC_017474	T	6	6	237417	237422	0 %	100 %	0 %	0 %	385821937
4598	NC_017474	CAG	3	9	237537	237545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821937
4599	NC_017474	GAGT	2	8	237587	237594	25 %	25 %	50 %	0 %	385821937
4600	NC_017474	AAGC	2	8	237662	237669	50 %	0 %	25 %	25 %	385821937
4601	NC_017474	TAA	2	6	237737	237742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821937
4602	NC_017474	CTG	2	6	237748	237753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821937
4603	NC_017474	TTG	2	6	237790	237795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821937
4604	NC_017474	CAA	2	6	237905	237910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821937
4605	NC_017474	GAT	3	9	237951	237959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821937
4606	NC_017474	ATCG	2	8	238069	238076	25 %	25 %	25 %	25 %	385821937
4607	NC_017474	GTT	2	6	238077	238082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821937
4608	NC_017474	A	6	6	238137	238142	100 %	0 %	0 %	0 %	385821938
4609	NC_017474	CGC	2	6	238143	238148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821938
4610	NC_017474	AAG	2	6	238180	238185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821938
4611	NC_017474	TGA	2	6	238216	238221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821938
4612	NC_017474	GAT	2	6	238269	238274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821938
4613	NC_017474	GAT	2	6	238281	238286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821938
4614	NC_017474	AGA	2	6	238451	238456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821938
4615	NC_017474	ATC	2	6	238565	238570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821939
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4618	NC_017474	TTCA	2	8	238813	238820	25 %	50 %	0 %	25 %	385821939
4619	NC_017474	ATC	2	6	238835	238840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821939
4620	NC_017474	GGC	2	6	238942	238947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821939
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4622	NC_017474	CAA	2	6	239140	239145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821939
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