MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus casei LC2W chromosome

Total Repeats: 2761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017473	TA	3	6	1	6	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017473	CA	3	6	752	757	50 %	0 %	0 %	50 %	385818535
3	NC_017473	GC	3	6	1260	1265	0 %	0 %	50 %	50 %	385818535
4	NC_017473	AG	3	6	2783	2788	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017473	AT	3	6	3033	3038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017473	AT	3	6	3094	3099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017473	CT	3	6	4111	4116	0 %	50 %	0 %	50 %	385818539
8	NC_017473	GC	4	8	4384	4391	0 %	0 %	50 %	50 %	385818539
9	NC_017473	GC	3	6	4558	4563	0 %	0 %	50 %	50 %	385818539
10	NC_017473	GC	3	6	5714	5719	0 %	0 %	50 %	50 %	385818541
11	NC_017473	AT	3	6	6725	6730	50 %	50 %	0 %	0 %	385818541
12	NC_017473	AT	3	6	7863	7868	50 %	50 %	0 %	0 %	385818542
13	NC_017473	GC	3	6	9825	9830	0 %	0 %	50 %	50 %	385818543
14	NC_017473	TG	3	6	10452	10457	0 %	50 %	50 %	0 %	385818543
15	NC_017473	GT	3	6	10831	10836	0 %	50 %	50 %	0 %	385818544
16	NC_017473	TG	3	6	11718	11723	0 %	50 %	50 %	0 %	385818546
17	NC_017473	AT	3	6	12319	12324	50 %	50 %	0 %	0 %	385818547
18	NC_017473	TA	3	6	12819	12824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017473	GA	3	6	13136	13141	50 %	0 %	50 %	0 %	385818548
20	NC_017473	AT	3	6	13410	13415	50 %	50 %	0 %	0 %	385818548
21	NC_017473	TA	3	6	14615	14620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017473	TA	3	6	15284	15289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017473	CA	3	6	16240	16245	50 %	0 %	0 %	50 %	385818550
24	NC_017473	TC	3	6	18919	18924	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017473	TG	3	6	19023	19028	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017473	GT	3	6	19466	19471	0 %	50 %	50 %	0 %	385818554
27	NC_017473	AT	3	6	19645	19650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017473	AC	3	6	19689	19694	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017473	AC	3	6	20923	20928	50 %	0 %	0 %	50 %	385818556
30	NC_017473	TA	3	6	21786	21791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017473	GA	3	6	24199	24204	50 %	0 %	50 %	0 %	385818560
32	NC_017473	GC	3	6	25062	25067	0 %	0 %	50 %	50 %	385818560
33	NC_017473	GC	3	6	25112	25117	0 %	0 %	50 %	50 %	385818560
34	NC_017473	AT	3	6	26890	26895	50 %	50 %	0 %	0 %	385818561
35	NC_017473	TG	3	6	26930	26935	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017473	TG	3	6	28091	28096	0 %	50 %	50 %	0 %	385818563
37	NC_017473	GT	3	6	29316	29321	0 %	50 %	50 %	0 %	385818565
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40	NC_017473	AT	3	6	31150	31155	50 %	50 %	0 %	0 %	385818567
41	NC_017473	AT	3	6	31375	31380	50 %	50 %	0 %	0 %	385818567
42	NC_017473	TG	3	6	32442	32447	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017473	AC	3	6	33461	33466	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017473	CG	3	6	34003	34008	0 %	0 %	50 %	50 %	385818569
45	NC_017473	TG	3	6	34601	34606	0 %	50 %	50 %	0 %	385818570
46	NC_017473	GT	3	6	34736	34741	0 %	50 %	50 %	0 %	385818570
47	NC_017473	CT	3	6	35027	35032	0 %	50 %	0 %	50 %	385818570
48	NC_017473	CG	3	6	35139	35144	0 %	0 %	50 %	50 %	385818570
49	NC_017473	CA	3	6	36088	36093	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017473	TC	3	6	36768	36773	0 %	50 %	0 %	50 %	385818572
51	NC_017473	TA	3	6	37605	37610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017473	AG	3	6	38052	38057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017473	CT	3	6	38641	38646	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017473	CG	3	6	40108	40113	0 %	0 %	50 %	50 %	385818575
55	NC_017473	TA	3	6	41461	41466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017473	AT	3	6	42800	42805	50 %	50 %	0 %	0 %	385818580
57	NC_017473	GA	4	8	45494	45501	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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59	NC_017473	TA	3	6	48579	48584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017473	AT	3	6	50115	50120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017473	TC	3	6	50263	50268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017473	CA	3	6	52364	52369	50 %	0 %	0 %	50 %	385818584
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69	NC_017473	CT	3	6	60821	60826	0 %	50 %	0 %	50 %	385818589
70	NC_017473	AT	3	6	61202	61207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017473	TA	3	6	61873	61878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017473	TG	3	6	65094	65099	0 %	50 %	50 %	0 %	385818594
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75	NC_017473	TA	3	6	66435	66440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017473	AG	3	6	66874	66879	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017473	AT	3	6	66885	66890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017473	CG	3	6	67636	67641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017473	AG	4	8	71181	71188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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103	NC_017473	TA	3	6	89865	89870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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109	NC_017473	GC	3	6	99316	99321	0 %	0 %	50 %	50 %	385818622
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112	NC_017473	CG	3	6	99987	99992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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115	NC_017473	AT	3	6	104391	104396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017473	CT	3	6	104447	104452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017473	AT	3	6	105226	105231	50 %	50 %	0 %	0 %	385818629
118	NC_017473	TA	3	6	105516	105521	50 %	50 %	0 %	0 %	385818629
119	NC_017473	AT	3	6	105991	105996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017473	AT	3	6	106120	106125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017473	CA	3	6	108154	108159	50 %	0 %	0 %	50 %	385818632
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125	NC_017473	AT	3	6	114685	114690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017473	CG	3	6	114820	114825	0 %	0 %	50 %	50 %	385818637
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134	NC_017473	CG	3	6	120445	120450	0 %	0 %	50 %	50 %	385818641
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138	NC_017473	TA	3	6	124392	124397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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140	NC_017473	AG	3	6	128075	128080	50 %	0 %	50 %	0 %	385818648
141	NC_017473	GC	3	6	130634	130639	0 %	0 %	50 %	50 %	385818651
142	NC_017473	AT	3	6	132593	132598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017473	AG	3	6	134875	134880	50 %	0 %	50 %	0 %	385818655
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148	NC_017473	AC	3	6	140266	140271	50 %	0 %	0 %	50 %	385818662
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