MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus casei LC2W chromosome

Total Repeats: 40792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017473	TCA	2	6	17	22	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017473	GGA	2	6	66	71	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017473	GAA	2	6	129	134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818535
4	NC_017473	CTT	2	6	220	225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385818535
5	NC_017473	GAA	2	6	369	374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818535
6	NC_017473	GCT	2	6	474	479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818535
7	NC_017473	ACA	2	6	504	509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818535
8	NC_017473	TGG	2	6	530	535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385818535
9	NC_017473	ATA	2	6	589	594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818535
10	NC_017473	CAG	2	6	598	603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818535
11	NC_017473	CTG	2	6	708	713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818535
12	NC_017473	GAT	2	6	720	725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818535
13	NC_017473	GAA	2	6	759	764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818535
14	NC_017473	TAA	2	6	875	880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818535
15	NC_017473	TGA	2	6	1121	1126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818535
16	NC_017473	CGG	2	6	1307	1312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818535
17	NC_017473	TGA	2	6	1370	1375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818535
18	NC_017473	GTT	3	9	1504	1512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017473	AGG	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017473	ATG	2	6	1644	1649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818536
21	NC_017473	AAC	2	6	1672	1677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818536
22	NC_017473	AAT	2	6	1787	1792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818536
23	NC_017473	TCA	2	6	1911	1916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818536
24	NC_017473	CAT	2	6	2197	2202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818536
25	NC_017473	CAA	2	6	2455	2460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818536
26	NC_017473	GAA	2	6	2537	2542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818536
27	NC_017473	CAA	2	6	2554	2559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818536
28	NC_017473	GCG	2	6	2565	2570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818536
29	NC_017473	AGA	2	6	2689	2694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818536
30	NC_017473	TCA	2	6	2715	2720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818536
31	NC_017473	CAA	2	6	2753	2758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017473	TGA	2	6	2789	2794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017473	ATA	3	9	2861	2869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818537
34	NC_017473	GAA	2	6	2976	2981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818537
35	NC_017473	TAG	3	9	3007	3015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818537
36	NC_017473	TCC	2	6	3027	3032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017473	ATA	3	9	3077	3085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017473	ATA	2	6	3112	3117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017473	AGT	2	6	3498	3503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017473	GAC	2	6	3532	3537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017473	ACA	2	6	3596	3601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818538
42	NC_017473	GAG	2	6	3725	3730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385818538
43	NC_017473	GAT	2	6	3755	3760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818538
44	NC_017473	TGC	2	6	3843	3848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818539
45	NC_017473	ACA	2	6	3856	3861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818539
46	NC_017473	TCA	2	6	4065	4070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818539
47	NC_017473	AAC	2	6	4100	4105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818539
48	NC_017473	GCG	2	6	4191	4196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818539
49	NC_017473	AGC	2	6	4274	4279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818539
50	NC_017473	AGC	2	6	4295	4300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818539
51	NC_017473	ATC	2	6	4307	4312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818539
52	NC_017473	GTT	2	6	4395	4400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818539
53	NC_017473	TGC	2	6	4419	4424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818539
54	NC_017473	AGC	2	6	4550	4555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818539
55	NC_017473	GAT	2	6	4603	4608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818539
56	NC_017473	GTT	2	6	4611	4616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818539
57	NC_017473	CAA	2	6	4660	4665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818539
58	NC_017473	CAC	2	6	4668	4673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385818539
59	NC_017473	TGT	2	6	4754	4759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818539
60	NC_017473	ACC	2	6	4828	4833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385818539
61	NC_017473	ATC	2	6	4861	4866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818539
62	NC_017473	TGA	2	6	4890	4895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818539
63	NC_017473	TGA	2	6	4959	4964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818540
64	NC_017473	AGG	2	6	5033	5038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017473	GGC	2	6	5090	5095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818541
66	NC_017473	ATG	2	6	5101	5106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818541
67	NC_017473	AGC	2	6	5178	5183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818541
68	NC_017473	CAT	2	6	5193	5198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818541
69	NC_017473	TGA	2	6	5228	5233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818541
70	NC_017473	ATA	2	6	5281	5286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818541
71	NC_017473	GGT	2	6	5385	5390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385818541
72	NC_017473	CGG	4	12	5396	5407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818541
73	NC_017473	GTG	2	6	5491	5496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385818541
74	NC_017473	TAC	2	6	5505	5510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818541
75	NC_017473	GAT	2	6	5637	5642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818541
76	NC_017473	ACC	2	6	5652	5657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385818541
77	NC_017473	GGC	2	6	5754	5759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818541
78	NC_017473	TTG	2	6	5892	5897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818541
79	NC_017473	CAA	2	6	5906	5911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818541
80	NC_017473	GGC	2	6	5928	5933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818541
81	NC_017473	GAT	2	6	6015	6020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818541
82	NC_017473	GAT	2	6	6033	6038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818541
83	NC_017473	CGG	2	6	6055	6060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818541
84	NC_017473	GGT	2	6	6137	6142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385818541
85	NC_017473	GGC	2	6	6245	6250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818541
86	NC_017473	ACA	2	6	6322	6327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818541
87	NC_017473	ATT	2	6	6353	6358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818541
88	NC_017473	TCG	2	6	6361	6366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818541
89	NC_017473	TGG	2	6	6380	6385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385818541
90	NC_017473	GAA	2	6	6489	6494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818541
91	NC_017473	TTG	2	6	6618	6623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818541
92	NC_017473	GCC	2	6	6686	6691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385818541
93	NC_017473	GAA	2	6	6741	6746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818541
94	NC_017473	GCC	2	6	6770	6775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385818541
95	NC_017473	GAC	2	6	6842	6847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818541
96	NC_017473	AAC	2	6	6990	6995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818541
97	NC_017473	GAG	2	6	7051	7056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017473	GAT	2	6	7072	7077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818542
99	NC_017473	CGG	2	6	7207	7212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818542
100	NC_017473	AAG	2	6	7261	7266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818542
101	NC_017473	TTG	2	6	7277	7282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818542
102	NC_017473	TGC	2	6	7472	7477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818542
103	NC_017473	CAA	2	6	7485	7490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818542
104	NC_017473	ATG	2	6	7517	7522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818542
105	NC_017473	GTT	2	6	7540	7545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818542
106	NC_017473	TTG	2	6	7567	7572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818542
107	NC_017473	GAC	2	6	7605	7610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818542
108	NC_017473	CCG	2	6	7618	7623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385818542
109	NC_017473	CGG	2	6	7728	7733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818542
110	NC_017473	TGG	2	6	8069	8074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385818542
111	NC_017473	ATC	2	6	8135	8140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818542
112	NC_017473	TCG	2	6	8154	8159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818542
113	NC_017473	TGA	2	6	8238	8243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818542
114	NC_017473	ATC	2	6	8245	8250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818542
115	NC_017473	AGC	2	6	8412	8417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818542
116	NC_017473	TCA	2	6	8460	8465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818542
117	NC_017473	ATC	2	6	8467	8472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818542
118	NC_017473	AGA	2	6	8495	8500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818542
119	NC_017473	AAG	2	6	8576	8581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818542
120	NC_017473	TCA	2	6	8588	8593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818542
121	NC_017473	ATG	2	6	8687	8692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818542
122	NC_017473	ATG	2	6	8729	8734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818542
123	NC_017473	CTT	2	6	8742	8747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385818542
124	NC_017473	CAA	2	6	8751	8756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818542
125	NC_017473	GCA	2	6	8771	8776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818542
126	NC_017473	ATG	2	6	8894	8899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818542
127	NC_017473	TCT	2	6	8909	8914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385818542
128	NC_017473	GTT	2	6	8932	8937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818542
129	NC_017473	GCA	2	6	8972	8977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818542
130	NC_017473	AAT	2	6	9019	9024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818542
131	NC_017473	GAC	2	6	9454	9459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818542
132	NC_017473	CGA	2	6	9501	9506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818542
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136	NC_017473	AAT	2	6	9686	9691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818542
137	NC_017473	TAA	2	6	9693	9698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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