MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei LC2W chromosome

Total Repeats: 58266

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_017473	CGC	2	6	204717	204722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385818733
4003	NC_017473	ATC	2	6	204759	204764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818733
4004	NC_017473	GAA	2	6	204776	204781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818733
4005	NC_017473	AAG	2	6	204959	204964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818733
4006	NC_017473	TGA	2	6	205002	205007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818733
4007	NC_017473	CAA	2	6	205042	205047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818733
4008	NC_017473	GGCG	2	8	205079	205086	0 %	0 %	75 %	25 %	385818733
4009	NC_017473	GTT	2	6	205127	205132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818733
4010	NC_017473	ATG	2	6	205143	205148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818733
4011	NC_017473	ATG	2	6	205164	205169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818733
4012	NC_017473	GTT	2	6	205180	205185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818733
4013	NC_017473	ATC	2	6	205265	205270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818733
4014	NC_017473	GACA	2	8	205360	205367	50 %	0 %	25 %	25 %	385818733
4015	NC_017473	AAAT	2	8	205372	205379	75 %	25 %	0 %	0 %	385818733
4016	NC_017473	GAA	2	6	205407	205412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818733
4017	NC_017473	GTG	2	6	205438	205443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385818734
4018	NC_017473	TGC	2	6	205464	205469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818734
4019	NC_017473	AG	3	6	205494	205499	50 %	0 %	50 %	0 %	385818734
4020	NC_017473	GCA	2	6	205528	205533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818734
4021	NC_017473	ACT	2	6	205549	205554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818734
4022	NC_017473	CAG	2	6	205581	205586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818734
4023	NC_017473	TCAG	2	8	205706	205713	25 %	25 %	25 %	25 %	385818734
4024	NC_017473	GCG	2	6	205740	205745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818734
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4026	NC_017473	GAT	2	6	205809	205814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818734
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4028	NC_017473	GTCA	2	8	205855	205862	25 %	25 %	25 %	25 %	385818734
4029	NC_017473	GAT	2	6	205966	205971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818734
4030	NC_017473	ATC	2	6	206033	206038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818734
4031	NC_017473	CGAT	2	8	206099	206106	25 %	25 %	25 %	25 %	385818734
4032	NC_017473	ATT	2	6	206242	206247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818734
4033	NC_017473	TGCA	2	8	206258	206265	25 %	25 %	25 %	25 %	385818734
4034	NC_017473	A	6	6	206302	206307	100 %	0 %	0 %	0 %	385818734
4035	NC_017473	TGA	2	6	206309	206314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818734
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4039	NC_017473	A	6	6	206539	206544	100 %	0 %	0 %	0 %	385818734
4040	NC_017473	TTG	2	6	206597	206602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818734
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4043	NC_017473	TTC	2	6	206695	206700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385818734
4044	NC_017473	CAG	2	6	206718	206723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_017473	GTG	2	6	206751	206756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_017473	ATC	2	6	206780	206785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_017473	T	6	6	206795	206800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_017473	CAA	2	6	206802	206807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_017473	AG	3	6	206810	206815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_017473	A	6	6	206829	206834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_017473	GCT	2	6	206994	206999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818735
4052	NC_017473	GAT	2	6	207126	207131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818735
4053	NC_017473	GCA	2	6	207230	207235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818735
4054	NC_017473	A	7	7	207313	207319	100 %	0 %	0 %	0 %	385818735
4055	NC_017473	CA	3	6	207355	207360	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4056	NC_017473	AGC	2	6	207447	207452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_017473	TTA	3	9	207483	207491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818736
4058	NC_017473	CAT	2	6	207498	207503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818736
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4060	NC_017473	GCT	2	6	207750	207755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818736
4061	NC_017473	GAT	2	6	207774	207779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818736
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4063	NC_017473	T	6	6	207877	207882	0 %	100 %	0 %	0 %	385818736
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4071	NC_017473	TGC	2	6	208217	208222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818736
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4093	NC_017473	ATC	2	6	209547	209552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818737
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4102	NC_017473	T	6	6	209821	209826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_017473	AAGA	2	8	209834	209841	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_017473	GCT	2	6	209891	209896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_017473	TCAA	2	8	209904	209911	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4106	NC_017473	TACT	2	8	209913	209920	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4107	NC_017473	TAG	2	6	209934	209939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4112	NC_017473	TCT	2	6	210190	210195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385818738
4113	NC_017473	AGC	2	6	210242	210247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818738
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4118	NC_017473	CAT	2	6	210747	210752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818738
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4120	NC_017473	TA	3	6	210835	210840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_017473	TGA	2	6	210883	210888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_017473	TAAA	2	8	210894	210901	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_017473	A	6	6	210899	210904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_017473	TG	3	6	210951	210956	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4247	NC_017473	CAA	2	6	217712	217717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818744
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4368	NC_017473	ATGA	2	8	224801	224808	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4369	NC_017473	AAT	2	6	224821	224826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4370	NC_017473	TACA	2	8	224861	224868	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4371	NC_017473	T	7	7	224910	224916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4372	NC_017473	GAG	2	6	224946	224951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4491	NC_017473	CAC	2	6	231078	231083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385818755
4492	NC_017473	TTTG	2	8	231188	231195	0 %	75 %	25 %	0 %	385818755
4493	NC_017473	AGA	2	6	231217	231222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818755
4494	NC_017473	GCG	2	6	231228	231233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818755
4495	NC_017473	TGA	2	6	231275	231280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818755
4496	NC_017473	T	6	6	231311	231316	0 %	100 %	0 %	0 %	385818755
4497	NC_017473	T	8	8	231325	231332	0 %	100 %	0 %	0 %	385818755
4498	NC_017473	GT	3	6	231358	231363	0 %	50 %	50 %	0 %	385818755
4499	NC_017473	AGT	2	6	231578	231583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818755
4500	NC_017473	GGA	2	6	231585	231590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385818755

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