MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei LC2W chromosome

Total Repeats: 58266

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017473	T	6	6	51291	51296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_017473	AGA	2	6	51334	51339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017473	AATC	2	8	51386	51393	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1004	NC_017473	TCAA	2	8	51425	51432	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1005	NC_017473	GTG	2	6	51532	51537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017473	CTT	2	6	51542	51547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_017473	TCA	2	6	51598	51603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_017473	CGCT	2	8	51621	51628	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_017473	G	6	6	51667	51672	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017473	T	6	6	51711	51716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017473	AGC	2	6	51721	51726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_017473	GCT	2	6	51738	51743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_017473	CTAT	2	8	51893	51900	25 %	50 %	0 %	25 %	385818583
1014	NC_017473	CCG	2	6	51970	51975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385818583
1015	NC_017473	CGG	3	9	51989	51997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818583
1016	NC_017473	ATC	2	6	52057	52062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818583
1017	NC_017473	GTT	2	6	52065	52070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818583
1018	NC_017473	GAA	2	6	52073	52078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818583
1019	NC_017473	CTAG	2	8	52115	52122	25 %	25 %	25 %	25 %	385818583
1020	NC_017473	ACAAA	2	10	52156	52165	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1021	NC_017473	TTCTTT	2	12	52201	52212	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1022	NC_017473	T	7	7	52221	52227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017473	GCT	2	6	52266	52271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_017473	ATT	2	6	52272	52277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017473	T	7	7	52340	52346	0 %	100 %	0 %	0 %	385818584
1026	NC_017473	CA	3	6	52364	52369	50 %	0 %	0 %	50 %	385818584
1027	NC_017473	AGC	2	6	52394	52399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818584
1028	NC_017473	ACTA	2	8	52400	52407	50 %	25 %	0 %	25 %	385818584
1029	NC_017473	CTT	2	6	52423	52428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385818584
1030	NC_017473	CAG	2	6	52562	52567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818584
1031	NC_017473	AAAT	2	8	52742	52749	75 %	25 %	0 %	0 %	385818584
1032	NC_017473	TAGG	2	8	52780	52787	25 %	25 %	50 %	0 %	385818584
1033	NC_017473	TTTCT	2	10	52790	52799	0 %	80 %	0 %	20 %	385818584
1034	NC_017473	ATT	2	6	52910	52915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818584
1035	NC_017473	ACA	2	6	53094	53099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818584
1036	NC_017473	CT	3	6	53135	53140	0 %	50 %	0 %	50 %	385818584
1037	NC_017473	GAT	2	6	53171	53176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818584
1038	NC_017473	TCGTT	2	10	53187	53196	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1039	NC_017473	GGA	2	6	53258	53263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017473	ATT	2	6	53329	53334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818585
1041	NC_017473	T	6	6	53393	53398	0 %	100 %	0 %	0 %	385818585
1042	NC_017473	T	6	6	53457	53462	0 %	100 %	0 %	0 %	385818585
1043	NC_017473	ATT	2	6	53471	53476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818585
1044	NC_017473	TGAT	2	8	53516	53523	25 %	50 %	25 %	0 %	385818585
1045	NC_017473	CAAA	2	8	53577	53584	75 %	0 %	0 %	25 %	385818585
1046	NC_017473	ATG	2	6	53615	53620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818585
1047	NC_017473	TGC	2	6	53706	53711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818585
1048	NC_017473	TTCTT	2	10	53738	53747	0 %	80 %	0 %	20 %	385818585
1049	NC_017473	CGA	2	6	53801	53806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818585
1050	NC_017473	GCG	2	6	53827	53832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818585
1051	NC_017473	TTA	2	6	53875	53880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818585
1052	NC_017473	AAAT	2	8	53886	53893	75 %	25 %	0 %	0 %	385818585
1053	NC_017473	AGC	2	6	53991	53996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818585
1054	NC_017473	TCT	2	6	54005	54010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385818585
1055	NC_017473	TGC	2	6	54096	54101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818585
1056	NC_017473	ATT	2	6	54165	54170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818585
1057	NC_017473	TCT	2	6	54190	54195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385818585
1058	NC_017473	GGT	2	6	54252	54257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385818585
1059	NC_017473	GAG	2	6	54320	54325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385818585
1060	NC_017473	TGA	2	6	54423	54428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818585
1061	NC_017473	TATT	2	8	54496	54503	25 %	75 %	0 %	0 %	385818585
1062	NC_017473	AAC	2	6	54520	54525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818585
1063	NC_017473	GGC	2	6	54649	54654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818585
1064	NC_017473	TTAGCA	2	12	54667	54678	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385818585
1065	NC_017473	TTG	2	6	54710	54715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818585
1066	NC_017473	TTGA	2	8	54793	54800	25 %	50 %	25 %	0 %	385818585
1067	NC_017473	TCA	2	6	54807	54812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818585
1068	NC_017473	AACA	2	8	54893	54900	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_017473	A	6	6	54905	54910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017473	A	7	7	54957	54963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_017473	ATT	2	6	55033	55038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_017473	TGAA	2	8	55072	55079	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_017473	TGAA	2	8	55114	55121	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017473	CAT	2	6	55161	55166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1078	NC_017473	CAA	2	6	55237	55242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818586
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1080	NC_017473	TGA	2	6	55333	55338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818586
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1087	NC_017473	CAG	2	6	55897	55902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818586
1088	NC_017473	TGAG	2	8	55939	55946	25 %	25 %	50 %	0 %	385818586
1089	NC_017473	AGC	3	9	55962	55970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818586
1090	NC_017473	GTC	3	9	55995	56003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818586
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1092	NC_017473	ATA	2	6	56093	56098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818586
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1095	NC_017473	TCG	2	6	56360	56365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818586
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1097	NC_017473	CTG	2	6	56527	56532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818586
1098	NC_017473	TGCG	2	8	56547	56554	0 %	25 %	50 %	25 %	385818586
1099	NC_017473	CTG	2	6	56639	56644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_017473	A	7	7	56659	56665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_017473	GCT	2	6	56716	56721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_017473	TAA	2	6	56722	56727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_017473	GTTA	2	8	56755	56762	25 %	50 %	25 %	0 %	385818587
1104	NC_017473	CCA	2	6	56770	56775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385818587
1105	NC_017473	ATT	2	6	56834	56839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818587
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1108	NC_017473	TGTTT	2	10	56892	56901	0 %	80 %	20 %	0 %	385818587
1109	NC_017473	AAG	2	6	56922	56927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818587
1110	NC_017473	CA	3	6	57000	57005	50 %	0 %	0 %	50 %	385818587
1111	NC_017473	A	6	6	57017	57022	100 %	0 %	0 %	0 %	385818587
1112	NC_017473	TAG	2	6	57050	57055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818587
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1114	NC_017473	TTA	2	6	57104	57109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017473	CAA	2	6	57157	57162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_017473	GA	3	6	57237	57242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017473	GTGC	2	8	57245	57252	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1118	NC_017473	T	7	7	57263	57269	0 %	100 %	0 %	0 %	385818588
1119	NC_017473	G	6	6	57276	57281	0 %	0 %	100 %	0 %	385818588
1120	NC_017473	CCG	2	6	57325	57330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385818588
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1124	NC_017473	TGA	2	6	57466	57471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818588
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1380	NC_017473	CGG	2	6	70301	70306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1381	NC_017473	GCC	2	6	70345	70350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1382	NC_017473	GCC	2	6	70414	70419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1383	NC_017473	TGG	2	6	70427	70432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1385	NC_017473	CTA	2	6	70486	70491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1386	NC_017473	CGG	2	6	70574	70579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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