MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL1118 plasmid2

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017472	AT	3	6	683	688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017472	CA	3	6	3279	3284	50 %	0 %	0 %	50 %	385818464
3	NC_017472	TA	3	6	3690	3695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017472	AT	4	8	3726	3733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017472	TA	3	6	4173	4178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017472	TC	3	6	4498	4503	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017472	TC	3	6	4974	4979	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017472	GA	4	8	5061	5068	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017472	AT	3	6	10363	10368	50 %	50 %	0 %	0 %	385818469
10	NC_017472	CT	3	6	10583	10588	0 %	50 %	0 %	50 %	385818469
11	NC_017472	AT	3	6	12686	12691	50 %	50 %	0 %	0 %	385818470
12	NC_017472	AT	3	6	13131	13136	50 %	50 %	0 %	0 %	385818470
13	NC_017472	AC	3	6	13265	13270	50 %	0 %	0 %	50 %	385818470
14	NC_017472	AT	3	6	14469	14474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017472	AT	4	8	14488	14495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017472	AC	3	6	14500	14505	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017472	TA	3	6	14578	14583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017472	TC	3	6	14670	14675	0 %	50 %	0 %	50 %	385818471
19	NC_017472	TC	3	6	14915	14920	0 %	50 %	0 %	50 %	385818471
20	NC_017472	AG	3	6	15812	15817	50 %	0 %	50 %	0 %	385818472
21	NC_017472	AT	3	6	16414	16419	50 %	50 %	0 %	0 %	385818473
22	NC_017472	GT	3	6	16806	16811	0 %	50 %	50 %	0 %	385818474
23	NC_017472	TA	3	6	19791	19796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017472	TA	3	6	20158	20163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017472	TA	3	6	20169	20174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017472	AT	4	8	21145	21152	50 %	50 %	0 %	0 %	385818476
27	NC_017472	CT	3	6	21158	21163	0 %	50 %	0 %	50 %	385818476
28	NC_017472	AT	3	6	21366	21371	50 %	50 %	0 %	0 %	385818476
29	NC_017472	TA	3	6	22329	22334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017472	TA	3	6	22971	22976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017472	TA	3	6	23752	23757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017472	AT	3	6	23773	23778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017472	AG	3	6	24233	24238	50 %	0 %	50 %	0 %	385818478
34	NC_017472	CA	3	6	25905	25910	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017472	CA	3	6	27638	27643	50 %	0 %	0 %	50 %	385818482
36	NC_017472	AG	3	6	28756	28761	50 %	0 %	50 %	0 %	385818483
37	NC_017472	AT	3	6	29569	29574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017472	AT	3	6	29813	29818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017472	AT	3	6	30429	30434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017472	AT	4	8	30780	30787	50 %	50 %	0 %	0 %	385818484
41	NC_017472	TA	3	6	30987	30992	50 %	50 %	0 %	0 %	385818484
42	NC_017472	AT	3	6	31275	31280	50 %	50 %	0 %	0 %	385818484
43	NC_017472	AT	3	6	31817	31822	50 %	50 %	0 %	0 %	385818484
44	NC_017472	TG	3	6	33074	33079	0 %	50 %	50 %	0 %	385818487
45	NC_017472	AC	3	6	33129	33134	50 %	0 %	0 %	50 %	385818487
46	NC_017472	AT	3	6	36228	36233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017472	GA	3	6	39043	39048	50 %	0 %	50 %	0 %	385818495
48	NC_017472	AT	3	6	40468	40473	50 %	50 %	0 %	0 %	385818496
49	NC_017472	TA	3	6	41527	41532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017472	AT	3	6	41585	41590	50 %	50 %	0 %	0 %	385818497
51	NC_017472	AT	3	6	41796	41801	50 %	50 %	0 %	0 %	385818497
52	NC_017472	TA	4	8	41821	41828	50 %	50 %	0 %	0 %	385818497
53	NC_017472	TA	3	6	42959	42964	50 %	50 %	0 %	0 %	385818499
54	NC_017472	TG	3	6	43376	43381	0 %	50 %	50 %	0 %	385818500
55	NC_017472	TA	3	6	43650	43655	50 %	50 %	0 %	0 %	385818500
56	NC_017472	AT	3	6	43954	43959	50 %	50 %	0 %	0 %	385818500
57	NC_017472	CA	3	6	44223	44228	50 %	0 %	0 %	50 %	385818500
58	NC_017472	AG	3	6	45467	45472	50 %	0 %	50 %	0 %	385818500
59	NC_017472	AT	3	6	45901	45906	50 %	50 %	0 %	0 %	385818500
60	NC_017472	GC	3	6	46358	46363	0 %	0 %	50 %	50 %	385818501
61	NC_017472	AT	3	6	46377	46382	50 %	50 %	0 %	0 %	385818501
62	NC_017472	GT	3	6	47154	47159	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017472	CA	3	6	47297	47302	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017472	AT	3	6	48019	48024	50 %	50 %	0 %	0 %	385818503
65	NC_017472	AT	4	8	48571	48578	50 %	50 %	0 %	0 %	385818503
66	NC_017472	GT	4	8	49005	49012	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017472	TC	3	6	51188	51193	0 %	50 %	0 %	50 %	385818506
68	NC_017472	AT	3	6	52403	52408	50 %	50 %	0 %	0 %	385818508
69	NC_017472	GA	3	6	52591	52596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017472	AG	3	6	54785	54790	50 %	0 %	50 %	0 %	385818511
71	NC_017472	AG	3	6	56238	56243	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017472	CT	3	6	56270	56275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017472	TA	3	6	56654	56659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017472	GA	3	6	58010	58015	50 %	0 %	50 %	0 %	385818513
75	NC_017472	TC	3	6	58772	58777	0 %	50 %	0 %	50 %	385818513
76	NC_017472	TA	3	6	60337	60342	50 %	50 %	0 %	0 %	385818515
77	NC_017472	AT	3	6	60964	60969	50 %	50 %	0 %	0 %	385818515
78	NC_017472	AT	3	6	61809	61814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017472	GT	3	6	61941	61946	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017472	AC	3	6	63079	63084	50 %	0 %	0 %	50 %	385818518
81	NC_017472	TG	3	6	63824	63829	0 %	50 %	50 %	0 %	385818519
82	NC_017472	CA	3	6	64046	64051	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017472	GT	3	6	66147	66152	0 %	50 %	50 %	0 %	385818520
84	NC_017472	TA	3	6	67755	67760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017472	TG	3	6	69882	69887	0 %	50 %	50 %	0 %	385818526
86	NC_017472	AT	3	6	69976	69981	50 %	50 %	0 %	0 %	385818526
87	NC_017472	AT	3	6	70026	70031	50 %	50 %	0 %	0 %	385818526
88	NC_017472	CT	3	6	70179	70184	0 %	50 %	0 %	50 %	385818527
89	NC_017472	GC	3	6	71665	71670	0 %	0 %	50 %	50 %	385818529
90	NC_017472	AT	3	6	72489	72494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017472	AT	3	6	73935	73940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017472	TG	3	6	73992	73997	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017472	GA	3	6	74083	74088	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017472	AT	3	6	74927	74932	50 %	50 %	0 %	0 %	385818531
95	NC_017472	CA	3	6	76423	76428	50 %	0 %	0 %	50 %	385818532
96	NC_017472	TA	3	6	77443	77448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.