MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL1118 plasmid2

Total Repeats: 1138

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017472	AGA	2	6	26	31	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017472	ATG	2	6	42	47	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017472	AAT	2	6	87	92	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017472	ATT	2	6	152	157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017472	AGA	2	6	158	163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017472	GAA	2	6	303	308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017472	AGT	2	6	323	328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017472	GAA	3	9	342	350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017472	AAG	2	6	397	402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017472	AGA	2	6	487	492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017472	GAA	2	6	540	545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017472	ATG	2	6	592	597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017472	AGA	2	6	617	622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017472	ACT	2	6	672	677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017472	ATT	2	6	844	849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017472	GAA	3	9	948	956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017472	TGA	2	6	1061	1066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017472	GAA	2	6	1080	1085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017472	GAA	2	6	1188	1193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017472	CAA	2	6	1355	1360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017472	AAT	2	6	1418	1423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017472	CTT	2	6	1475	1480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017472	TTA	2	6	1494	1499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017472	TAT	2	6	1815	1820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818463
25	NC_017472	AAT	2	6	1830	1835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818463
26	NC_017472	TTA	2	6	1844	1849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818463
27	NC_017472	TAT	2	6	1986	1991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818463
28	NC_017472	TAT	2	6	2028	2033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818463
29	NC_017472	TTA	2	6	2048	2053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818463
30	NC_017472	TAT	2	6	2064	2069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818463
31	NC_017472	TAT	2	6	2118	2123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818463
32	NC_017472	ATT	2	6	2137	2142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818463
33	NC_017472	AGT	2	6	2149	2154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818463
34	NC_017472	ACT	2	6	2161	2166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818463
35	NC_017472	TTA	2	6	2168	2173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818463
36	NC_017472	TAT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818463
37	NC_017472	TAT	2	6	2199	2204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818463
38	NC_017472	TAG	2	6	2312	2317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818463
39	NC_017472	CAT	2	6	2412	2417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818463
40	NC_017472	AAT	2	6	2470	2475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818463
41	NC_017472	GCG	2	6	2615	2620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818463
42	NC_017472	GCA	2	6	2654	2659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818463
43	NC_017472	GCA	2	6	2669	2674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818463
44	NC_017472	AGT	2	6	2796	2801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017472	TAA	2	6	2854	2859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818464
46	NC_017472	TTA	2	6	2941	2946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818464
47	NC_017472	CAT	2	6	3008	3013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818464
48	NC_017472	ATT	2	6	3022	3027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818464
49	NC_017472	AAT	2	6	3031	3036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818464
50	NC_017472	TTC	3	9	3057	3065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385818464
51	NC_017472	TTC	2	6	3190	3195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385818464
52	NC_017472	TTG	2	6	3200	3205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818464
53	NC_017472	GTA	2	6	3435	3440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818464
54	NC_017472	AAT	2	6	3515	3520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818464
55	NC_017472	TCT	2	6	3589	3594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385818464
56	NC_017472	CCT	2	6	3670	3675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_017472	AGC	2	6	3759	3764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017472	TAT	2	6	3799	3804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818465
59	NC_017472	CTT	2	6	3881	3886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385818465
60	NC_017472	ATC	2	6	3900	3905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818465
61	NC_017472	TGT	2	6	4030	4035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017472	AAT	2	6	4081	4086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017472	TAT	2	6	4120	4125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017472	TTA	2	6	4136	4141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017472	TAA	2	6	4290	4295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017472	GAA	2	6	4381	4386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017472	TTA	2	6	4391	4396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017472	GCT	2	6	4418	4423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017472	GCT	2	6	4451	4456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017472	GAA	2	6	4596	4601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017472	TTA	2	6	4610	4615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017472	CGT	2	6	4733	4738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017472	TAC	2	6	4805	4810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017472	TGA	2	6	4811	4816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017472	CTT	2	6	4891	4896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017472	CAA	2	6	4980	4985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017472	AGC	2	6	5087	5092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017472	TAT	2	6	5107	5112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017472	AAT	2	6	5164	5169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017472	TGC	2	6	5230	5235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017472	TCA	2	6	5318	5323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017472	TAT	2	6	5335	5340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017472	TAA	2	6	5408	5413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017472	AGT	2	6	5424	5429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017472	TAA	2	6	5451	5456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017472	TGA	2	6	5471	5476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818466
87	NC_017472	GAT	2	6	5502	5507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818466
88	NC_017472	CAG	2	6	5587	5592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818466
89	NC_017472	TTA	2	6	5629	5634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818466
90	NC_017472	TAG	2	6	5689	5694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818466
91	NC_017472	TAA	2	6	5722	5727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818466
92	NC_017472	ATT	2	6	5737	5742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818466
93	NC_017472	TAC	2	6	5931	5936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818466
94	NC_017472	TTA	2	6	6020	6025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017472	ATT	2	6	6029	6034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017472	TAG	2	6	6074	6079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017472	ATA	2	6	6082	6087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017472	ATC	2	6	6204	6209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818467
99	NC_017472	ATA	2	6	6217	6222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818467
100	NC_017472	AAG	2	6	6243	6248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818467
101	NC_017472	AAT	2	6	6297	6302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818467
102	NC_017472	CTA	2	6	6369	6374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818467
103	NC_017472	ATT	2	6	6379	6384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818467
104	NC_017472	AAG	2	6	6391	6396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818467
105	NC_017472	ATG	2	6	6457	6462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818467
106	NC_017472	AAC	2	6	6488	6493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818467
107	NC_017472	TCA	2	6	6537	6542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818467
108	NC_017472	AAT	2	6	6576	6581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818467
109	NC_017472	ATT	2	6	6731	6736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818467
110	NC_017472	CCA	2	6	6756	6761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385818467
111	NC_017472	TCA	2	6	6856	6861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818467
112	NC_017472	AGG	2	6	6932	6937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385818467
113	NC_017472	CAG	2	6	7004	7009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818467
114	NC_017472	ATT	2	6	7026	7031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818467
115	NC_017472	TAA	2	6	7052	7057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818467
116	NC_017472	TCA	2	6	7090	7095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818467
117	NC_017472	AGA	2	6	7389	7394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818467
118	NC_017472	CAT	2	6	7452	7457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818467
119	NC_017472	AAC	2	6	7521	7526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818467
120	NC_017472	ATA	2	6	7576	7581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818467
121	NC_017472	CAA	2	6	7707	7712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818467
122	NC_017472	AGC	2	6	7850	7855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818467
123	NC_017472	AGA	2	6	7864	7869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818467
124	NC_017472	AAG	2	6	7882	7887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818467
125	NC_017472	TTC	2	6	7895	7900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385818467
126	NC_017472	CAA	2	6	7952	7957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818468
127	NC_017472	TAC	2	6	7962	7967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818468
128	NC_017472	GAA	2	6	7972	7977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818468
129	NC_017472	AAG	2	6	7997	8002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818468
130	NC_017472	TAA	2	6	8025	8030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818468
131	NC_017472	ATC	2	6	8071	8076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818468
132	NC_017472	CAT	2	6	8085	8090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818468
133	NC_017472	TCG	2	6	8091	8096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818468
134	NC_017472	ACA	2	6	8204	8209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818468
135	NC_017472	CAA	2	6	8355	8360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818468
136	NC_017472	GTT	2	6	8374	8379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818468
137	NC_017472	CAT	2	6	8508	8513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818468
138	NC_017472	ACT	2	6	8529	8534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818468
139	NC_017472	CTG	2	6	8657	8662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818468
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142	NC_017472	CCA	2	6	8821	8826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385818468
143	NC_017472	GGC	2	6	8842	8847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818468
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145	NC_017472	AGA	2	6	8883	8888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818468
146	NC_017472	GAA	2	6	8901	8906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818468
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153	NC_017472	AAT	2	6	9343	9348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818468
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159	NC_017472	TTA	2	6	9643	9648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818468
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170	NC_017472	TAT	2	6	10348	10353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818469
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243	NC_017472	AAT	2	6	15048	15053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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255	NC_017472	ATA	2	6	15884	15889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818472
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258	NC_017472	TGA	2	6	16080	16085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818472
259	NC_017472	AAT	2	6	16225	16230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_017472	ATT	2	6	16286	16291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818473
261	NC_017472	TCC	2	6	16594	16599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
262	NC_017472	TAT	2	6	16617	16622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_017472	AAT	2	6	16743	16748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818474
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