MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL1118 plasmid2

Total Repeats: 1825

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017472	ATA	2	6	20863	20868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818476
502	NC_017472	TAG	2	6	20885	20890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818476
503	NC_017472	TTTC	2	8	20918	20925	0 %	75 %	0 %	25 %	385818476
504	NC_017472	T	6	6	21080	21085	0 %	100 %	0 %	0 %	385818476
505	NC_017472	A	6	6	21086	21091	100 %	0 %	0 %	0 %	385818476
506	NC_017472	AT	4	8	21145	21152	50 %	50 %	0 %	0 %	385818476
507	NC_017472	CT	3	6	21158	21163	0 %	50 %	0 %	50 %	385818476
508	NC_017472	CAGAT	2	10	21240	21249	40 %	20 %	20 %	20 %	385818476
509	NC_017472	ACA	2	6	21266	21271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818476
510	NC_017472	GTG	2	6	21337	21342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385818476
511	NC_017472	AT	3	6	21366	21371	50 %	50 %	0 %	0 %	385818476
512	NC_017472	TTTA	2	8	21383	21390	25 %	75 %	0 %	0 %	385818476
513	NC_017472	A	6	6	21405	21410	100 %	0 %	0 %	0 %	385818476
514	NC_017472	A	7	7	21500	21506	100 %	0 %	0 %	0 %	385818476
515	NC_017472	TGT	2	6	21614	21619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818476
516	NC_017472	A	7	7	21655	21661	100 %	0 %	0 %	0 %	385818476
517	NC_017472	A	6	6	21688	21693	100 %	0 %	0 %	0 %	385818476
518	NC_017472	AGGA	2	8	21718	21725	50 %	0 %	50 %	0 %	385818476
519	NC_017472	AAG	2	6	21729	21734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818476
520	NC_017472	AGA	2	6	21793	21798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818476
521	NC_017472	A	6	6	21818	21823	100 %	0 %	0 %	0 %	385818476
522	NC_017472	T	6	6	21884	21889	0 %	100 %	0 %	0 %	385818476
523	NC_017472	AGC	2	6	21907	21912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818476
524	NC_017472	GAA	2	6	21936	21941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818476
525	NC_017472	TGT	2	6	22036	22041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818476
526	NC_017472	ATA	2	6	22066	22071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818476
527	NC_017472	ATT	2	6	22115	22120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818476
528	NC_017472	AAG	2	6	22137	22142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818476
529	NC_017472	TGCT	2	8	22245	22252	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
530	NC_017472	ATA	2	6	22298	22303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017472	TA	3	6	22329	22334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017472	AAT	2	6	22440	22445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017472	GAT	2	6	22455	22460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017472	CACTT	2	10	22527	22536	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
535	NC_017472	ATTG	2	8	22550	22557	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017472	TAT	2	6	22609	22614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017472	TGCACA	2	12	22616	22627	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_017472	AAAT	2	8	22649	22656	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017472	TAA	2	6	22678	22683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017472	TAA	2	6	22822	22827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017472	TGG	2	6	22835	22840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017472	TGA	2	6	22851	22856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017472	A	6	6	22926	22931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017472	TAA	2	6	22962	22967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017472	TA	3	6	22971	22976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017472	ATCGCC	2	12	23028	23039	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
547	NC_017472	GCT	2	6	23072	23077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_017472	TTA	2	6	23149	23154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017472	CTA	2	6	23207	23212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818477
550	NC_017472	TCTA	2	8	23435	23442	25 %	50 %	0 %	25 %	385818477
551	NC_017472	AGAT	2	8	23534	23541	50 %	25 %	25 %	0 %	385818477
552	NC_017472	AAGA	2	8	23577	23584	75 %	0 %	25 %	0 %	385818477
553	NC_017472	AAG	2	6	23608	23613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818477
554	NC_017472	A	6	6	23616	23621	100 %	0 %	0 %	0 %	385818477
555	NC_017472	T	6	6	23654	23659	0 %	100 %	0 %	0 %	385818477
556	NC_017472	A	6	6	23661	23666	100 %	0 %	0 %	0 %	385818477
557	NC_017472	TATT	2	8	23707	23714	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017472	T	6	6	23723	23728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017472	TA	3	6	23752	23757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017472	AT	3	6	23773	23778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017472	T	7	7	23786	23792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017472	CTC	2	6	23794	23799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_017472	TTAT	2	8	23816	23823	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017472	ATTC	2	8	23836	23843	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
565	NC_017472	AGC	2	6	23867	23872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_017472	GCT	2	6	23880	23885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_017472	T	6	6	23885	23890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017472	TAA	2	6	23896	23901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017472	AATG	2	8	23902	23909	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017472	ATG	2	6	23971	23976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818478
571	NC_017472	TAA	2	6	23982	23987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818478
572	NC_017472	AAC	2	6	24002	24007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818478
573	NC_017472	TGC	2	6	24020	24025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818478
574	NC_017472	TGG	2	6	24051	24056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385818478
575	NC_017472	AAAG	2	8	24078	24085	75 %	0 %	25 %	0 %	385818478
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577	NC_017472	GAAG	2	8	24259	24266	50 %	0 %	50 %	0 %	385818478
578	NC_017472	AATAAA	2	12	24349	24360	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385818478
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581	NC_017472	AAT	2	6	24421	24426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818478
582	NC_017472	TGA	3	9	24432	24440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818478
583	NC_017472	GAT	2	6	24442	24447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818478
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585	NC_017472	TAA	2	6	24471	24476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818478
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588	NC_017472	ACT	2	6	24619	24624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818478
589	NC_017472	TAC	2	6	24735	24740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818478
590	NC_017472	A	6	6	24853	24858	100 %	0 %	0 %	0 %	385818478
591	NC_017472	GAT	2	6	24883	24888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818478
592	NC_017472	T	6	6	24888	24893	0 %	100 %	0 %	0 %	385818478
593	NC_017472	AGT	2	6	24895	24900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818478
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595	NC_017472	TAA	2	6	24911	24916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017472	A	6	6	24923	24928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_017472	ATT	2	6	25164	25169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818479
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599	NC_017472	ATC	2	6	25239	25244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818479
600	NC_017472	TAA	2	6	25285	25290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818479
601	NC_017472	AGC	2	6	25297	25302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818479
602	NC_017472	GGT	2	6	25308	25313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385818479
603	NC_017472	TATG	2	8	25339	25346	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017472	ATA	2	6	25365	25370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017472	A	6	6	25701	25706	100 %	0 %	0 %	0 %	385818480
606	NC_017472	TTG	2	6	25771	25776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017472	TAA	2	6	25862	25867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017472	CA	3	6	25905	25910	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
609	NC_017472	ATGT	2	8	25913	25920	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017472	TTAAGG	2	12	26035	26046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017472	ATT	2	6	26125	26130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017472	A	6	6	26137	26142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017472	CAA	2	6	26169	26174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_017472	CAA	2	6	26217	26222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_017472	TAA	2	6	26251	26256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017472	ATTT	2	8	26261	26268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017472	GTAAA	2	10	26275	26284	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017472	AGCAA	2	10	26293	26302	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
619	NC_017472	A	6	6	26325	26330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017472	ATA	2	6	26340	26345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017472	AGG	2	6	26372	26377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017472	TAT	2	6	26380	26385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818481
623	NC_017472	AAT	2	6	26396	26401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818481
624	NC_017472	GAA	2	6	26471	26476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818481
625	NC_017472	GAA	2	6	26492	26497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818481
626	NC_017472	TGT	3	9	26542	26550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818481
627	NC_017472	GAA	2	6	26558	26563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818481
628	NC_017472	AATTT	2	10	26595	26604	40 %	60 %	0 %	0 %	385818481
629	NC_017472	TGA	2	6	26614	26619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818481
630	NC_017472	TAT	2	6	26634	26639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818481
631	NC_017472	AAG	2	6	26663	26668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818481
632	NC_017472	GTAT	2	8	26688	26695	25 %	50 %	25 %	0 %	385818481
633	NC_017472	GAA	2	6	26696	26701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818481
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