MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL1118 chromosome

Total Repeats: 1461

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017470	AGCAA	2	10	3473	3482	60 %	0 %	20 %	20 %	385816615
2	NC_017470	ATTTT	2	10	3514	3523	20 %	80 %	0 %	0 %	385816615
3	NC_017470	AAGGC	2	10	3680	3689	40 %	0 %	40 %	20 %	385816615
4	NC_017470	GATGA	2	10	4804	4813	40 %	20 %	40 %	0 %	385816616
5	NC_017470	CAAGG	2	10	5974	5983	40 %	0 %	40 %	20 %	385816616
6	NC_017470	AGGAA	2	10	9284	9293	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017470	GATTT	2	10	10167	10176	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017470	CAAAA	2	10	12228	12237	80 %	0 %	0 %	20 %	385816621
9	NC_017470	ATAAA	2	10	14261	14270	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017470	TGGTT	2	10	14638	14647	0 %	60 %	40 %	0 %	385816624
11	NC_017470	TATGC	2	10	15829	15838	20 %	40 %	20 %	20 %	385816625
12	NC_017470	AGAAA	2	10	16503	16512	80 %	0 %	20 %	0 %	385816626
13	NC_017470	TTCTT	2	10	19775	19784	0 %	80 %	0 %	20 %	385816630
14	NC_017470	ACAAT	2	10	22309	22318	60 %	20 %	0 %	20 %	385816634
15	NC_017470	GATAG	2	10	22674	22683	40 %	20 %	40 %	0 %	385816635
16	NC_017470	TAATT	2	10	23322	23331	40 %	60 %	0 %	0 %	385816635
17	NC_017470	AATTT	2	10	28925	28934	40 %	60 %	0 %	0 %	385816641
18	NC_017470	TTTGC	2	10	29390	29399	0 %	60 %	20 %	20 %	385816642
19	NC_017470	TTGAT	2	10	29516	29525	20 %	60 %	20 %	0 %	385816642
20	NC_017470	TAAAC	2	10	31282	31291	60 %	20 %	0 %	20 %	385816642
21	NC_017470	CATTA	2	10	32163	32172	40 %	40 %	0 %	20 %	385816643
22	NC_017470	AATTA	2	10	33450	33459	60 %	40 %	0 %	0 %	385816645
23	NC_017470	CTGGT	2	10	34025	34034	0 %	40 %	40 %	20 %	385816646
24	NC_017470	TCATT	2	10	34430	34439	20 %	60 %	0 %	20 %	385816646
25	NC_017470	TAAAA	2	10	35224	35233	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017470	TAGCT	2	10	36201	36210	20 %	40 %	20 %	20 %	385816648
27	NC_017470	TTTTC	2	10	37120	37129	0 %	80 %	0 %	20 %	385816649
28	NC_017470	CTTTT	2	10	39627	39636	0 %	80 %	0 %	20 %	385816651
29	NC_017470	AAGGA	2	10	40064	40073	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017470	TTTGC	2	10	40149	40158	0 %	60 %	20 %	20 %	385816652
31	NC_017470	TGATT	2	10	40511	40520	20 %	60 %	20 %	0 %	385816652
32	NC_017470	TATCT	2	10	40809	40818	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017470	GTGCG	2	10	42330	42339	0 %	20 %	60 %	20 %	385816653
34	NC_017470	TAAAA	2	10	42771	42780	80 %	20 %	0 %	0 %	385816653
35	NC_017470	GATCA	2	10	43049	43058	40 %	20 %	20 %	20 %	385816654
36	NC_017470	GTGAA	2	10	45933	45942	40 %	20 %	40 %	0 %	385816657
37	NC_017470	TAAAA	2	10	46660	46669	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017470	CTTTT	2	10	47123	47132	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017470	CAATT	2	10	48489	48498	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017470	TCATT	2	10	48576	48585	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017470	TTTAC	2	10	49660	49669	20 %	60 %	0 %	20 %	385816659
42	NC_017470	TTGCT	2	10	50048	50057	0 %	60 %	20 %	20 %	385816659
43	NC_017470	AAAAT	2	10	51383	51392	80 %	20 %	0 %	0 %	385816659
44	NC_017470	TAATG	2	10	54034	54043	40 %	40 %	20 %	0 %	385816661
45	NC_017470	GGTAA	2	10	56178	56187	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017470	TCGTG	2	10	56995	57004	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017470	GGCAG	2	10	57394	57403	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017470	GAGAA	2	10	57649	57658	60 %	0 %	40 %	0 %	385816663
49	NC_017470	AAGGC	2	10	59051	59060	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017470	TTGAA	2	10	59561	59570	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017470	GCCAG	2	10	59893	59902	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_017470	AGCGA	2	10	60578	60587	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017470	AGGAA	2	10	60744	60753	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017470	TGAGT	2	10	61747	61756	20 %	40 %	40 %	0 %	385816664
55	NC_017470	GCTGG	2	10	62306	62315	0 %	20 %	60 %	20 %	385816666
56	NC_017470	TCGGT	2	10	65328	65337	0 %	40 %	40 %	20 %	385816669
57	NC_017470	ATTGA	2	10	65586	65595	40 %	40 %	20 %	0 %	385816669
58	NC_017470	ATTGA	2	10	66913	66922	40 %	40 %	20 %	0 %	385816670
59	NC_017470	AATTT	2	10	69299	69308	40 %	60 %	0 %	0 %	385816674
60	NC_017470	TAGAA	2	10	70513	70522	60 %	20 %	20 %	0 %	385816675
61	NC_017470	ATGTT	2	10	70710	70719	20 %	60 %	20 %	0 %	385816675
62	NC_017470	TAAAT	2	10	71276	71285	60 %	40 %	0 %	0 %	385816676
63	NC_017470	AAAGA	2	10	71399	71408	80 %	0 %	20 %	0 %	385816676
64	NC_017470	TTGGC	2	10	73894	73903	0 %	40 %	40 %	20 %	385816678
65	NC_017470	ATCAT	2	10	75654	75663	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017470	TTCAC	2	10	77231	77240	20 %	40 %	0 %	40 %	385816681
67	NC_017470	GCAAA	2	10	77881	77890	60 %	0 %	20 %	20 %	385816682
68	NC_017470	GATAT	2	10	78675	78684	40 %	40 %	20 %	0 %	385816683
69	NC_017470	TAAAT	2	10	78829	78838	60 %	40 %	0 %	0 %	385816683
70	NC_017470	TTCAC	2	10	81809	81818	20 %	40 %	0 %	40 %	385816687
71	NC_017470	GCAAA	2	10	82459	82468	60 %	0 %	20 %	20 %	385816688
72	NC_017470	ATGAA	2	10	83540	83549	60 %	20 %	20 %	0 %	385816690
73	NC_017470	CTTAT	2	10	84965	84974	20 %	60 %	0 %	20 %	385816691
74	NC_017470	ATCAA	2	10	85450	85459	60 %	20 %	0 %	20 %	385816691
75	NC_017470	TAAAT	2	10	85547	85556	60 %	40 %	0 %	0 %	385816691
76	NC_017470	TGATG	2	10	85878	85887	20 %	40 %	40 %	0 %	385816692
77	NC_017470	TACAT	2	10	86488	86497	40 %	40 %	0 %	20 %	385816692
78	NC_017470	TTCTT	2	10	88098	88107	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017470	TCGAA	2	10	89928	89937	40 %	20 %	20 %	20 %	385816696
80	NC_017470	CAAAA	2	10	90763	90772	80 %	0 %	0 %	20 %	385816696
81	NC_017470	CCTTA	2	10	90989	90998	20 %	40 %	0 %	40 %	385816696
82	NC_017470	TTGTG	2	10	91098	91107	0 %	60 %	40 %	0 %	385816697
83	NC_017470	GTAAA	2	10	95348	95357	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017470	AATAA	2	10	96478	96487	80 %	20 %	0 %	0 %	385816702
85	NC_017470	GATTA	2	10	96750	96759	40 %	40 %	20 %	0 %	385816702
86	NC_017470	AATGC	2	10	96766	96775	40 %	20 %	20 %	20 %	385816702
87	NC_017470	TTTAA	2	10	98202	98211	40 %	60 %	0 %	0 %	385816704
88	NC_017470	GGTAA	2	10	98508	98517	40 %	20 %	40 %	0 %	385816704
89	NC_017470	TTAAA	2	10	101962	101971	60 %	40 %	0 %	0 %	385816708
90	NC_017470	ATACT	2	10	105451	105460	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017470	GAAAA	2	10	105559	105568	80 %	0 %	20 %	0 %	385816712
92	NC_017470	TAAAT	2	10	107575	107584	60 %	40 %	0 %	0 %	385816713
93	NC_017470	AACCA	2	10	107763	107772	60 %	0 %	0 %	40 %	385816714
94	NC_017470	AGGTT	2	10	107962	107971	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017470	AGATG	2	10	108619	108628	40 %	20 %	40 %	0 %	385816715
96	NC_017470	ATGCC	2	10	109394	109403	20 %	20 %	20 %	40 %	385816717
97	NC_017470	AGACA	2	10	110616	110625	60 %	0 %	20 %	20 %	385816718
98	NC_017470	TGATG	2	10	110883	110892	20 %	40 %	40 %	0 %	385816718
99	NC_017470	AAGTA	2	10	112375	112384	60 %	20 %	20 %	0 %	385816719
100	NC_017470	CTAAA	2	10	112532	112541	60 %	20 %	0 %	20 %	385816719
101	NC_017470	CAATA	2	10	117988	117997	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017470	AAATT	2	10	118989	118998	60 %	40 %	0 %	0 %	385816726
103	NC_017470	CTTTT	2	10	119805	119814	0 %	80 %	0 %	20 %	385816727
104	NC_017470	AACAA	2	10	120715	120724	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017470	TTGGC	2	10	121191	121200	0 %	40 %	40 %	20 %	385816729
106	NC_017470	TGATC	2	10	122604	122613	20 %	40 %	20 %	20 %	385816731
107	NC_017470	TTTCT	2	10	124418	124427	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017470	ATTAC	2	10	128355	128364	40 %	40 %	0 %	20 %	385816737
109	NC_017470	GCTTG	2	10	129169	129178	0 %	40 %	40 %	20 %	385816738
110	NC_017470	TAATG	2	10	129274	129283	40 %	40 %	20 %	0 %	385816738
111	NC_017470	ATGGA	2	10	131246	131255	40 %	20 %	40 %	0 %	385816740
112	NC_017470	AGAAA	2	10	133596	133605	80 %	0 %	20 %	0 %	385816742
113	NC_017470	AGCAA	2	10	134704	134713	60 %	0 %	20 %	20 %	385816743
114	NC_017470	ATTTT	2	10	135206	135215	20 %	80 %	0 %	0 %	385816744
115	NC_017470	CAACT	2	10	137235	137244	40 %	20 %	0 %	40 %	385816745
116	NC_017470	ACGCA	2	10	139140	139149	40 %	0 %	20 %	40 %	385816747
117	NC_017470	AATGG	2	10	141109	141118	40 %	20 %	40 %	0 %	385816749
118	NC_017470	TTTCT	2	10	141198	141207	0 %	80 %	0 %	20 %	385816750
119	NC_017470	TTCAA	2	10	141472	141481	40 %	40 %	0 %	20 %	385816750
120	NC_017470	AACTT	2	10	143252	143261	40 %	40 %	0 %	20 %	385816750
121	NC_017470	ACAGA	2	10	144403	144412	60 %	0 %	20 %	20 %	385816751
122	NC_017470	TTTAC	2	10	149498	149507	20 %	60 %	0 %	20 %	385816756
123	NC_017470	TCATT	2	10	151601	151610	20 %	60 %	0 %	20 %	385816759
124	NC_017470	TTGGT	2	10	151976	151985	0 %	60 %	40 %	0 %	385816759
125	NC_017470	ATTTT	2	10	152823	152832	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017470	CAAGA	2	10	152949	152958	60 %	0 %	20 %	20 %	385816761
127	NC_017470	TATTT	2	10	154828	154837	20 %	80 %	0 %	0 %	385816762
128	NC_017470	TGATT	2	10	156078	156087	20 %	60 %	20 %	0 %	385816763
129	NC_017470	AAGTT	2	10	156131	156140	40 %	40 %	20 %	0 %	385816763
130	NC_017470	TATGG	2	10	156976	156985	20 %	40 %	40 %	0 %	385816764
131	NC_017470	GATAG	2	10	158638	158647	40 %	20 %	40 %	0 %	385816765
132	NC_017470	GGAAC	2	10	164368	164377	40 %	0 %	40 %	20 %	385816770
133	NC_017470	ATTCC	2	10	164763	164772	20 %	40 %	0 %	40 %	385816770
134	NC_017470	ATTAA	2	10	165250	165259	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017470	AATAA	2	10	167966	167975	80 %	20 %	0 %	0 %	385816774
136	NC_017470	CATAA	2	10	170168	170177	60 %	20 %	0 %	20 %	385816775
137	NC_017470	ATATC	2	10	172163	172172	40 %	40 %	0 %	20 %	385816779
138	NC_017470	ATTTA	2	10	172261	172270	40 %	60 %	0 %	0 %	385816779
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