MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus helveticus H10 chromosome

Total Repeats: 6344

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017467	TCTT	2	8	361	368	0 %	75 %	0 %	25 %	385812839
2	NC_017467	AAAT	2	8	583	590	75 %	25 %	0 %	0 %	385812839
3	NC_017467	ATGC	2	8	1460	1467	25 %	25 %	25 %	25 %	385812839
4	NC_017467	AAAG	2	8	1999	2006	75 %	0 %	25 %	0 %	385812840
5	NC_017467	GGAA	2	8	2670	2677	50 %	0 %	50 %	0 %	385812840
6	NC_017467	TTTA	2	8	2972	2979	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017467	ATTT	2	8	3424	3431	25 %	75 %	0 %	0 %	385812842
8	NC_017467	AGTA	2	8	3748	3755	50 %	25 %	25 %	0 %	385812842
9	NC_017467	GTAT	2	8	4547	4554	25 %	50 %	25 %	0 %	385812843
10	NC_017467	ACTT	2	8	5085	5092	25 %	50 %	0 %	25 %	385812843
11	NC_017467	CTAT	2	8	5204	5211	25 %	50 %	0 %	25 %	385812843
12	NC_017467	CCAA	2	8	5873	5880	50 %	0 %	0 %	50 %	385812843
13	NC_017467	TTCT	2	8	6466	6473	0 %	75 %	0 %	25 %	385812844
14	NC_017467	ATTT	2	8	6662	6669	25 %	75 %	0 %	0 %	385812844
15	NC_017467	CAAC	2	8	6945	6952	50 %	0 %	0 %	50 %	385812844
16	NC_017467	TTGG	2	8	9653	9660	0 %	50 %	50 %	0 %	385812846
17	NC_017467	AAAG	2	8	9974	9981	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017467	TAAA	2	8	10407	10414	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017467	GCCT	2	8	10554	10561	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017467	GCCA	2	8	10636	10643	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017467	GCAA	2	8	10723	10730	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017467	ATCG	2	8	11134	11141	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017467	AAAC	2	8	11398	11405	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017467	CGAA	2	8	11573	11580	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017467	ATGA	2	8	12010	12017	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017467	AATT	2	8	12025	12032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017467	AGAA	2	8	12097	12104	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017467	ATGA	2	8	12115	12122	50 %	25 %	25 %	0 %	385812848
29	NC_017467	TCAA	2	8	12152	12159	50 %	25 %	0 %	25 %	385812848
30	NC_017467	ACTG	2	8	12225	12232	25 %	25 %	25 %	25 %	385812848
31	NC_017467	CTGG	2	8	12263	12270	0 %	25 %	50 %	25 %	385812848
32	NC_017467	TTGA	2	8	12472	12479	25 %	50 %	25 %	0 %	385812848
33	NC_017467	TTTA	2	8	12593	12600	25 %	75 %	0 %	0 %	385812848
34	NC_017467	CTTT	2	8	12786	12793	0 %	75 %	0 %	25 %	385812848
35	NC_017467	ATGA	2	8	12922	12929	50 %	25 %	25 %	0 %	385812848
36	NC_017467	TAAA	2	8	13291	13298	75 %	25 %	0 %	0 %	385812848
37	NC_017467	TTTG	2	8	13842	13849	0 %	75 %	25 %	0 %	385812851
38	NC_017467	TTTA	2	8	14149	14156	25 %	75 %	0 %	0 %	385812851
39	NC_017467	TAAA	2	8	14214	14221	75 %	25 %	0 %	0 %	385812851
40	NC_017467	CTTT	2	8	14647	14654	0 %	75 %	0 %	25 %	385812851
41	NC_017467	CAAG	2	8	16334	16341	50 %	0 %	25 %	25 %	385812853
42	NC_017467	TTTA	2	8	16871	16878	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017467	TAAC	2	8	16891	16898	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017467	TTTG	2	8	17736	17743	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017467	TCAT	2	8	18920	18927	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017467	AGGA	2	8	18975	18982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017467	CTTT	2	8	19072	19079	0 %	75 %	0 %	25 %	385812855
48	NC_017467	GCTG	2	8	20517	20524	0 %	25 %	50 %	25 %	385812855
49	NC_017467	TAAT	2	8	21109	21116	50 %	50 %	0 %	0 %	385812856
50	NC_017467	GTTT	2	8	21289	21296	0 %	75 %	25 %	0 %	385812856
51	NC_017467	CAAG	2	8	21307	21314	50 %	0 %	25 %	25 %	385812856
52	NC_017467	TGAT	2	8	21501	21508	25 %	50 %	25 %	0 %	385812857
53	NC_017467	TTAC	2	8	21808	21815	25 %	50 %	0 %	25 %	385812857
54	NC_017467	AGTT	2	8	22240	22247	25 %	50 %	25 %	0 %	385812857
55	NC_017467	AGCT	2	8	22543	22550	25 %	25 %	25 %	25 %	385812857
56	NC_017467	TCAT	2	8	23103	23110	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017467	GCAA	2	8	23275	23282	50 %	0 %	25 %	25 %	385812858
58	NC_017467	CAAA	2	8	23953	23960	75 %	0 %	0 %	25 %	385812858
59	NC_017467	TGAT	2	8	24276	24283	25 %	50 %	25 %	0 %	385812859
60	NC_017467	CATG	2	8	24607	24614	25 %	25 %	25 %	25 %	385812859
61	NC_017467	GTAA	2	8	25102	25109	50 %	25 %	25 %	0 %	385812859
62	NC_017467	GTGG	2	8	25896	25903	0 %	25 %	75 %	0 %	385812860
63	NC_017467	TGAA	2	8	25987	25994	50 %	25 %	25 %	0 %	385812860
64	NC_017467	AAGA	2	8	26118	26125	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017467	AAGG	2	8	26252	26259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017467	AAAC	2	8	26757	26764	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017467	AATT	2	8	26812	26819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017467	AGAA	2	8	26927	26934	75 %	0 %	25 %	0 %	385812861
69	NC_017467	CAAA	2	8	27397	27404	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017467	TGTC	2	8	27699	27706	0 %	50 %	25 %	25 %	385812862
71	NC_017467	GTTT	2	8	28104	28111	0 %	75 %	25 %	0 %	385812862
72	NC_017467	AAGA	2	8	28222	28229	75 %	0 %	25 %	0 %	385812862
73	NC_017467	AAGA	2	8	28749	28756	75 %	0 %	25 %	0 %	385812862
74	NC_017467	AAAT	2	8	28850	28857	75 %	25 %	0 %	0 %	385812862
75	NC_017467	CCTA	2	8	29007	29014	25 %	25 %	0 %	50 %	385812863
76	NC_017467	GTTT	2	8	29192	29199	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017467	GAAA	2	8	29215	29222	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017467	TGGC	2	8	29398	29405	0 %	25 %	50 %	25 %	385812864
79	NC_017467	TCAT	2	8	29457	29464	25 %	50 %	0 %	25 %	385812864
80	NC_017467	AAGT	2	8	29982	29989	50 %	25 %	25 %	0 %	385812865
81	NC_017467	TAAA	2	8	30682	30689	75 %	25 %	0 %	0 %	385812865
82	NC_017467	TTAA	2	8	30870	30877	50 %	50 %	0 %	0 %	385812866
83	NC_017467	AGAA	2	8	31185	31192	75 %	0 %	25 %	0 %	385812866
84	NC_017467	ATTT	2	8	31606	31613	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017467	ATTT	2	8	32347	32354	25 %	75 %	0 %	0 %	385812868
86	NC_017467	AGAA	2	8	32411	32418	75 %	0 %	25 %	0 %	385812868
87	NC_017467	TTAA	2	8	32487	32494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017467	TTAT	2	8	32797	32804	25 %	75 %	0 %	0 %	385812869
89	NC_017467	ATTA	2	8	32868	32875	50 %	50 %	0 %	0 %	385812869
90	NC_017467	GAAA	2	8	32961	32968	75 %	0 %	25 %	0 %	385812869
91	NC_017467	TGCT	2	8	33567	33574	0 %	50 %	25 %	25 %	385812870
92	NC_017467	GTTT	2	8	33868	33875	0 %	75 %	25 %	0 %	385812870
93	NC_017467	AATT	2	8	34423	34430	50 %	50 %	0 %	0 %	385812871
94	NC_017467	TCAA	2	8	34520	34527	50 %	25 %	0 %	25 %	385812871
95	NC_017467	AATG	2	8	34736	34743	50 %	25 %	25 %	0 %	385812871
96	NC_017467	ATTG	2	8	35257	35264	25 %	50 %	25 %	0 %	385812872
97	NC_017467	AAGG	2	8	35280	35287	50 %	0 %	50 %	0 %	385812872
98	NC_017467	GAAA	2	8	35432	35439	75 %	0 %	25 %	0 %	385812873
99	NC_017467	AGTA	2	8	35456	35463	50 %	25 %	25 %	0 %	385812873
100	NC_017467	AATT	2	8	35703	35710	50 %	50 %	0 %	0 %	385812874
101	NC_017467	CTAA	2	8	36064	36071	50 %	25 %	0 %	25 %	385812874
102	NC_017467	AAAT	2	8	36269	36276	75 %	25 %	0 %	0 %	385812874
103	NC_017467	AATT	2	8	36848	36855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017467	AAAT	2	8	37445	37452	75 %	25 %	0 %	0 %	385812875
105	NC_017467	TAAA	2	8	37589	37596	75 %	25 %	0 %	0 %	385812875
106	NC_017467	ATTA	2	8	38139	38146	50 %	50 %	0 %	0 %	385812876
107	NC_017467	ATGC	2	8	38332	38339	25 %	25 %	25 %	25 %	385812876
108	NC_017467	TTAG	2	8	38371	38378	25 %	50 %	25 %	0 %	385812876
109	NC_017467	GAAA	2	8	38606	38613	75 %	0 %	25 %	0 %	385812876
110	NC_017467	TTAG	2	8	38658	38665	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017467	TTTA	2	8	39901	39908	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017467	GTTC	2	8	40233	40240	0 %	50 %	25 %	25 %	385812879
113	NC_017467	CGAT	2	8	40692	40699	25 %	25 %	25 %	25 %	385812879
114	NC_017467	GATC	2	8	41040	41047	25 %	25 %	25 %	25 %	385812879
115	NC_017467	TTTA	2	8	41418	41425	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017467	TTAA	2	8	41564	41571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017467	AAAC	2	8	41677	41684	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017467	CTTT	2	8	41827	41834	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017467	ATTA	2	8	41859	41866	50 %	50 %	0 %	0 %	385812880
120	NC_017467	ATTT	2	8	44000	44007	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017467	TTGG	2	8	44226	44233	0 %	50 %	50 %	0 %	385812883
122	NC_017467	GTTT	2	8	44386	44393	0 %	75 %	25 %	0 %	385812883
123	NC_017467	AAGC	2	8	44439	44446	50 %	0 %	25 %	25 %	385812883
124	NC_017467	GTTA	2	8	45340	45347	25 %	50 %	25 %	0 %	385812884
125	NC_017467	TTCT	2	8	45661	45668	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017467	TTTG	2	8	45796	45803	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017467	TTCA	2	8	46026	46033	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017467	AAAG	2	8	46345	46352	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017467	ACTA	2	8	46540	46547	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017467	AATT	2	8	47136	47143	50 %	50 %	0 %	0 %	385812885
131	NC_017467	TCAA	2	8	47926	47933	50 %	25 %	0 %	25 %	385812885
132	NC_017467	AAAG	2	8	48157	48164	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017467	GAAA	2	8	49030	49037	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017467	AATA	2	8	49224	49231	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017467	TCAA	2	8	49711	49718	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017467	TTTC	2	8	49977	49984	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017467	CCAA	2	8	50143	50150	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017467	CTGC	2	8	50282	50289	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017467	CAGA	2	8	50294	50301	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017467	ACGC	2	8	51139	51146	25 %	0 %	25 %	50 %	385812887
141	NC_017467	TGCG	2	8	51162	51169	0 %	25 %	50 %	25 %	385812888
142	NC_017467	TCTT	2	8	51793	51800	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017467	AAGA	2	8	51971	51978	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017467	ATTA	2	8	52048	52055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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146	NC_017467	TGGA	2	8	52252	52259	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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