MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus helveticus H10 chromosome

Total Repeats: 46925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017467	GTC	2	6	182056	182061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385813005
4002	NC_017467	TCT	3	9	182066	182074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385813005
4003	NC_017467	TTCTT	2	10	182102	182111	0 %	80 %	0 %	20 %	385813005
4004	NC_017467	GTT	2	6	182123	182128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385813005
4005	NC_017467	A	8	8	182140	182147	100 %	0 %	0 %	0 %	385813005
4006	NC_017467	AAT	3	9	182165	182173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385813005
4007	NC_017467	ACT	2	6	182206	182211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_017467	ACAT	2	8	182245	182252	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4009	NC_017467	GTG	2	6	182290	182295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_017467	A	6	6	182480	182485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_017467	A	6	6	182525	182530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_017467	TTA	2	6	182608	182613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_017467	GCA	2	6	182632	182637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_017467	TTA	2	6	182643	182648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_017467	ATC	2	6	182654	182659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_017467	TGA	2	6	182675	182680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_017467	GC	3	6	182683	182688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4018	NC_017467	AGA	2	6	182693	182698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_017467	GCT	2	6	182711	182716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_017467	CTA	2	6	182727	182732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_017467	GAA	2	6	182736	182741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_017467	GATGAA	2	12	182772	182783	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_017467	TATCCT	2	12	182806	182817	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_017467	GCT	2	6	182825	182830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_017467	TCA	2	6	182877	182882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_017467	TTA	3	9	182904	182912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_017467	ACT	2	6	182927	182932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_017467	TTG	2	6	182937	182942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_017467	ATT	2	6	182954	182959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_017467	GCGCCA	2	12	182973	182984	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4031	NC_017467	TTC	2	6	183033	183038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_017467	TC	4	8	183047	183054	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4033	NC_017467	A	6	6	183125	183130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_017467	AGA	2	6	183138	183143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_017467	ACA	2	6	183234	183239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_017467	TCAAA	2	10	183242	183251	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4037	NC_017467	TTA	2	6	183252	183257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_017467	CAAT	2	8	183298	183305	50 %	25 %	0 %	25 %	385813006
4039	NC_017467	A	6	6	183397	183402	100 %	0 %	0 %	0 %	385813006
4040	NC_017467	AAG	2	6	183428	183433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385813006
4041	NC_017467	TAC	2	6	183504	183509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_017467	TAA	2	6	183512	183517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_017467	AAAT	2	8	183530	183537	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_017467	ACT	2	6	183545	183550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_017467	AGA	3	9	183585	183593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385813007
4046	NC_017467	GAA	2	6	183632	183637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385813007
4047	NC_017467	ATG	2	6	183759	183764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385813007
4048	NC_017467	CTG	2	6	183786	183791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385813007
4049	NC_017467	AAT	2	6	183833	183838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_017467	AC	3	6	183868	183873	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4051	NC_017467	T	7	7	183909	183915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_017467	A	6	6	183947	183952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_017467	TAAA	2	8	183953	183960	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_017467	A	6	6	183958	183963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_017467	AATT	2	8	184010	184017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_017467	GCG	2	6	184043	184048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_017467	T	6	6	184106	184111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_017467	GTAA	2	8	184139	184146	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_017467	ACT	2	6	184199	184204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_017467	T	6	6	184297	184302	0 %	100 %	0 %	0 %	385813008
4061	NC_017467	AGG	2	6	184311	184316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385813008
4062	NC_017467	GAA	2	6	184328	184333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385813008
4063	NC_017467	GCT	5	15	184353	184367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385813008
4064	NC_017467	TTA	2	6	184368	184373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385813008
4065	NC_017467	TGC	2	6	184388	184393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385813008
4066	NC_017467	TGC	2	6	184412	184417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385813008
4067	NC_017467	ACT	2	6	184419	184424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385813008
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4069	NC_017467	GTA	2	6	184546	184551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385813008
4070	NC_017467	CTA	2	6	184612	184617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385813008
4071	NC_017467	TAC	2	6	184769	184774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385813008
4072	NC_017467	ACT	2	6	184890	184895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385813008
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4074	NC_017467	AAC	2	6	184925	184930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385813008
4075	NC_017467	AAC	2	6	184943	184948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385813008
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4079	NC_017467	TGTTAA	2	12	185168	185179	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385813008
4080	NC_017467	GTAACT	2	12	185220	185231	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385813008
4081	NC_017467	TGT	2	6	185252	185257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385813008
4082	NC_017467	TAT	2	6	185276	185281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385813008
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4084	NC_017467	ACT	2	6	185370	185375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385813008
4085	NC_017467	TAC	2	6	185397	185402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385813008
4086	NC_017467	GGCAA	2	10	185418	185427	40 %	0 %	40 %	20 %	385813008
4087	NC_017467	ACA	2	6	185449	185454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385813008
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4089	NC_017467	GTT	2	6	185526	185531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385813008
4090	NC_017467	AAG	2	6	185535	185540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385813008
4091	NC_017467	ACT	2	6	185553	185558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385813008
4092	NC_017467	GGT	2	6	185562	185567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385813008
4093	NC_017467	AAG	2	6	185589	185594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385813008
4094	NC_017467	TAC	2	6	185595	185600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385813008
4095	NC_017467	AAG	2	6	185619	185624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385813008
4096	NC_017467	CTAA	2	8	185686	185693	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4097	NC_017467	T	6	6	185722	185727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_017467	A	6	6	185738	185743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_017467	ACT	2	6	185751	185756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_017467	AGT	2	6	185773	185778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_017467	T	6	6	185782	185787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_017467	TTAG	2	8	185808	185815	25 %	50 %	25 %	0 %	385813009
4103	NC_017467	TCAG	2	8	185832	185839	25 %	25 %	25 %	25 %	385813009
4104	NC_017467	ATC	2	6	185846	185851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385813009
4105	NC_017467	TAA	2	6	185944	185949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385813009
4106	NC_017467	TCC	2	6	185966	185971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385813009
4107	NC_017467	TAA	2	6	185974	185979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385813009
4108	NC_017467	AT	3	6	186013	186018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_017467	T	7	7	186029	186035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_017467	TAA	2	6	186064	186069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_017467	TCT	2	6	186132	186137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_017467	GTT	2	6	186217	186222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_017467	TTC	2	6	186232	186237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_017467	TGC	2	6	186267	186272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_017467	CA	4	8	186276	186283	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4116	NC_017467	CTGTT	2	10	186286	186295	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4117	NC_017467	CTT	2	6	186330	186335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_017467	TTG	2	6	186367	186372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_017467	TTC	2	6	186381	186386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_017467	CTT	2	6	186413	186418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_017467	CCA	2	6	186475	186480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4122	NC_017467	ATTAG	2	10	186574	186583	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_017467	ACG	2	6	186607	186612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_017467	A	7	7	186709	186715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_017467	T	6	6	186735	186740	0 %	100 %	0 %	0 %	385813010
4126	NC_017467	ATATAG	2	12	186833	186844	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385813010
4127	NC_017467	GAT	2	6	186856	186861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385813010
4128	NC_017467	TCA	2	6	186863	186868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385813010
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4130	NC_017467	ATC	2	6	186932	186937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385813010
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