MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus helveticus H10 chromosome

Total Repeats: 46925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017467	GTA	2	6	226607	226612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385813043
5002	NC_017467	ATTC	2	8	226685	226692	25 %	50 %	0 %	25 %	385813043
5003	NC_017467	GTT	2	6	226723	226728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385813043
5004	NC_017467	GAA	2	6	226740	226745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385813043
5005	NC_017467	GGT	2	6	226782	226787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385813043
5006	NC_017467	AAC	2	6	226825	226830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385813043
5007	NC_017467	AGT	2	6	226961	226966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385813043
5008	NC_017467	T	6	6	226980	226985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_017467	AATA	2	8	226997	227004	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_017467	A	6	6	227008	227013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_017467	CAAA	2	8	227044	227051	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5012	NC_017467	AGT	2	6	227058	227063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_017467	A	7	7	227076	227082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_017467	TAT	2	6	227112	227117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385813044
5015	NC_017467	ATT	2	6	227134	227139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385813044
5016	NC_017467	AAT	2	6	227149	227154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385813044
5017	NC_017467	TGC	2	6	227182	227187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385813044
5018	NC_017467	TGA	2	6	227210	227215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385813044
5019	NC_017467	CAG	2	6	227216	227221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385813044
5020	NC_017467	AGA	2	6	227226	227231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385813044
5021	NC_017467	GAAAA	2	10	227281	227290	80 %	0 %	20 %	0 %	385813044
5022	NC_017467	AGA	2	6	227338	227343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385813044
5023	NC_017467	TGTC	2	8	227346	227353	0 %	50 %	25 %	25 %	385813044
5024	NC_017467	AAG	2	6	227359	227364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385813044
5025	NC_017467	CAG	3	9	227566	227574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385813044
5026	NC_017467	AAG	2	6	227662	227667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385813044
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5028	NC_017467	AG	3	6	227732	227737	50 %	0 %	50 %	0 %	385813044
5029	NC_017467	GTTT	2	8	227751	227758	0 %	75 %	25 %	0 %	385813044
5030	NC_017467	ATC	2	6	227833	227838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385813044
5031	NC_017467	AAGA	2	8	227869	227876	75 %	0 %	25 %	0 %	385813044
5032	NC_017467	TGA	2	6	227880	227885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385813044
5033	NC_017467	GCA	2	6	227904	227909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385813044
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5035	NC_017467	GCAAA	2	10	227979	227988	60 %	0 %	20 %	20 %	385813044
5036	NC_017467	TGA	2	6	228066	228071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385813044
5037	NC_017467	TCG	2	6	228126	228131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385813044
5038	NC_017467	GCT	2	6	228188	228193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385813044
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5040	NC_017467	GAA	2	6	228364	228369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385813044
5041	NC_017467	AAGA	2	8	228396	228403	75 %	0 %	25 %	0 %	385813044
5042	NC_017467	TCA	2	6	228426	228431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385813044
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5044	NC_017467	AAAT	2	8	228497	228504	75 %	25 %	0 %	0 %	385813044
5045	NC_017467	AGT	2	6	228568	228573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_017467	GTT	3	9	228623	228631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_017467	AGT	2	6	228696	228701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385813045
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5049	NC_017467	TTA	2	6	228832	228837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385813045
5050	NC_017467	TGA	3	9	228861	228869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385813045
5051	NC_017467	GAAGCT	2	12	228877	228888	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385813045
5052	NC_017467	T	8	8	228932	228939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_017467	TATT	2	8	228953	228960	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_017467	T	6	6	229069	229074	0 %	100 %	0 %	0 %	385813046
5055	NC_017467	TGC	2	6	229089	229094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385813046
5056	NC_017467	AGA	2	6	229110	229115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385813046
5057	NC_017467	AC	4	8	229131	229138	50 %	0 %	0 %	50 %	385813046
5058	NC_017467	TAA	2	6	229143	229148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385813046
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5061	NC_017467	TTAT	2	8	229233	229240	25 %	75 %	0 %	0 %	385813046
5062	NC_017467	TGG	2	6	229284	229289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385813046
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5064	NC_017467	TTG	2	6	229349	229354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385813046
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5069	NC_017467	TGGAA	2	10	229626	229635	40 %	20 %	40 %	0 %	385813046
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5073	NC_017467	GTT	2	6	229886	229891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385813047
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5081	NC_017467	ATT	2	6	230291	230296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385813047
5082	NC_017467	TTTTG	2	10	230387	230396	0 %	80 %	20 %	0 %	385813047
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5092	NC_017467	AGGT	2	8	230946	230953	25 %	25 %	50 %	0 %	385813047
5093	NC_017467	TCT	2	6	231015	231020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385813047
5094	NC_017467	ATG	2	6	231027	231032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385813047
5095	NC_017467	AAG	2	6	231038	231043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385813047
5096	NC_017467	CAAT	2	8	231102	231109	50 %	25 %	0 %	25 %	385813047
5097	NC_017467	TGC	2	6	231130	231135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385813047
5098	NC_017467	GTC	2	6	231189	231194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385813047
5099	NC_017467	ACT	2	6	231210	231215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385813047
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5101	NC_017467	A	6	6	231262	231267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_017467	T	7	7	231302	231308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_017467	TTC	2	6	231342	231347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_017467	CTTT	2	8	231376	231383	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5105	NC_017467	AT	3	6	231399	231404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_017467	ATAGAC	2	12	231443	231454	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385813048
5107	NC_017467	GA	3	6	231480	231485	50 %	0 %	50 %	0 %	385813048
5108	NC_017467	ATT	2	6	231506	231511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385813048
5109	NC_017467	AAT	2	6	231529	231534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385813048
5110	NC_017467	CTT	2	6	231561	231566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385813048
5111	NC_017467	TA	3	6	231597	231602	50 %	50 %	0 %	0 %	385813048
5112	NC_017467	GGT	2	6	231628	231633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385813048
5113	NC_017467	GAAA	2	8	231663	231670	75 %	0 %	25 %	0 %	385813048
5114	NC_017467	AAG	2	6	231809	231814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385813048
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5118	NC_017467	AGA	2	6	232008	232013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385813048
5119	NC_017467	A	6	6	232022	232027	100 %	0 %	0 %	0 %	385813048
5120	NC_017467	AT	3	6	232051	232056	50 %	50 %	0 %	0 %	385813048
5121	NC_017467	ACT	2	6	232212	232217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385813048
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5123	NC_017467	ACT	2	6	232244	232249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385813048
5124	NC_017467	ATT	2	6	232254	232259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385813048
5125	NC_017467	AT	3	6	232312	232317	50 %	50 %	0 %	0 %	385813048
5126	NC_017467	G	6	6	232413	232418	0 %	0 %	100 %	0 %	385813048
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5129	NC_017467	T	7	7	232494	232500	0 %	100 %	0 %	0 %	385813049
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5152	NC_017467	TAA	2	6	233840	233845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5377	NC_017467	AAAAG	2	10	242483	242492	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5491	NC_017467	ATG	2	6	247655	247660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385813063
5492	NC_017467	AGC	2	6	247694	247699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385813063
5493	NC_017467	CGA	2	6	247715	247720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385813063
5494	NC_017467	CGA	2	6	247778	247783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385813063
5495	NC_017467	TGA	3	9	247784	247792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385813063
5496	NC_017467	GCA	2	6	247804	247809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385813063
5497	NC_017467	GCC	2	6	247851	247856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385813063
5498	NC_017467	ACA	2	6	247921	247926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385813063
5499	NC_017467	CCAG	2	8	247956	247963	25 %	0 %	25 %	50 %	385813063
5500	NC_017467	CGA	2	6	247988	247993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385813063

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