MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus fermentum CECT 5716 chromosome

Total Repeats: 5814

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017465	ATTC	2	8	362	369	25 %	50 %	0 %	25 %	385811787
2	NC_017465	GACC	2	8	495	502	25 %	0 %	25 %	50 %	385811787
3	NC_017465	CGCC	2	8	1590	1597	0 %	0 %	25 %	75 %	385811787
4	NC_017465	GCCC	2	8	2033	2040	0 %	0 %	25 %	75 %	385811788
5	NC_017465	GGAA	2	8	2768	2775	50 %	0 %	50 %	0 %	385811788
6	NC_017465	GCCG	2	8	2984	2991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017465	TGGC	2	8	3577	3584	0 %	25 %	50 %	25 %	385811789
8	NC_017465	GAGC	2	8	3617	3624	25 %	0 %	50 %	25 %	385811789
9	NC_017465	TTTG	2	8	3736	3743	0 %	75 %	25 %	0 %	385811789
10	NC_017465	CTAG	2	8	4552	4559	25 %	25 %	25 %	25 %	385811790
11	NC_017465	CCAG	2	8	4571	4578	25 %	0 %	25 %	50 %	385811790
12	NC_017465	CGGG	2	8	4770	4777	0 %	0 %	75 %	25 %	385811790
13	NC_017465	CGCC	2	8	4950	4957	0 %	0 %	25 %	75 %	385811790
14	NC_017465	AGCA	2	8	5691	5698	50 %	0 %	25 %	25 %	385811790
15	NC_017465	GCTG	2	8	5778	5785	0 %	25 %	50 %	25 %	385811790
16	NC_017465	ATTC	2	8	6552	6559	25 %	50 %	0 %	25 %	385811791
17	NC_017465	GAAC	2	8	6652	6659	50 %	0 %	25 %	25 %	385811791
18	NC_017465	GCAA	2	8	7257	7264	50 %	0 %	25 %	25 %	385811791
19	NC_017465	ACCG	2	8	7379	7386	25 %	0 %	25 %	50 %	385811791
20	NC_017465	AAGC	2	8	8949	8956	50 %	0 %	25 %	25 %	385811791
21	NC_017465	TTAA	2	8	8998	9005	50 %	50 %	0 %	0 %	385811791
22	NC_017465	TTAC	2	8	9230	9237	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017465	CGGA	2	8	9818	9825	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017465	CAAC	2	8	10048	10055	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017465	GGCT	2	8	10863	10870	0 %	25 %	50 %	25 %	385811792
26	NC_017465	CTAC	2	8	11383	11390	25 %	25 %	0 %	50 %	385811792
27	NC_017465	ACCA	2	8	12138	12145	50 %	0 %	0 %	50 %	385811792
28	NC_017465	CGCT	2	8	12517	12524	0 %	25 %	25 %	50 %	385811792
29	NC_017465	CGAT	2	8	13386	13393	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017465	CCGG	2	8	13827	13834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017465	CGGC	2	8	15705	15712	0 %	0 %	50 %	50 %	385811793
32	NC_017465	GTTT	2	8	15872	15879	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017465	GCCA	2	8	15992	15999	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017465	CCAC	2	8	16581	16588	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
35	NC_017465	GATG	2	8	16638	16645	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017465	ACCG	2	8	18212	18219	25 %	0 %	25 %	50 %	385811794
37	NC_017465	GGAT	2	8	18693	18700	25 %	25 %	50 %	0 %	385811794
38	NC_017465	CCGC	2	8	18945	18952	0 %	0 %	25 %	75 %	385811794
39	NC_017465	TACC	2	8	19418	19425	25 %	25 %	0 %	50 %	385811795
40	NC_017465	GGTC	2	8	20162	20169	0 %	25 %	50 %	25 %	385811795
41	NC_017465	TACC	2	8	20177	20184	25 %	25 %	0 %	50 %	385811795
42	NC_017465	ACCA	2	8	20421	20428	50 %	0 %	0 %	50 %	385811795
43	NC_017465	GCAA	2	8	20627	20634	50 %	0 %	25 %	25 %	385811796
44	NC_017465	TACC	2	8	20682	20689	25 %	25 %	0 %	50 %	385811796
45	NC_017465	CAGT	2	8	20845	20852	25 %	25 %	25 %	25 %	385811796
46	NC_017465	TCAG	2	8	21098	21105	25 %	25 %	25 %	25 %	385811796
47	NC_017465	TTGA	2	8	21435	21442	25 %	50 %	25 %	0 %	385811797
48	NC_017465	CAGC	2	8	22013	22020	25 %	0 %	25 %	50 %	385811797
49	NC_017465	TACC	2	8	22342	22349	25 %	25 %	0 %	50 %	385811798
50	NC_017465	CGAC	2	8	22725	22732	25 %	0 %	25 %	50 %	385811798
51	NC_017465	CGGC	2	8	22803	22810	0 %	0 %	50 %	50 %	385811798
52	NC_017465	GGCC	2	8	22990	22997	0 %	0 %	50 %	50 %	385811798
53	NC_017465	GAAC	2	8	23776	23783	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017465	TCAG	2	8	24144	24151	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017465	GGAA	2	8	24527	24534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017465	AGTT	2	8	24603	24610	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017465	GGAT	2	8	24687	24694	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017465	TTAC	2	8	24749	24756	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017465	GGCC	2	8	24848	24855	0 %	0 %	50 %	50 %	385811799
60	NC_017465	AACC	2	8	24977	24984	50 %	0 %	0 %	50 %	385811799
61	NC_017465	GACC	2	8	25333	25340	25 %	0 %	25 %	50 %	385811800
62	NC_017465	AACG	2	8	25751	25758	50 %	0 %	25 %	25 %	385811800
63	NC_017465	GTGG	2	8	25777	25784	0 %	25 %	75 %	0 %	385811800
64	NC_017465	ATTT	2	8	26044	26051	25 %	75 %	0 %	0 %	385811800
65	NC_017465	TGAT	2	8	26113	26120	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017465	CTTT	2	8	26388	26395	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017465	GGGA	2	8	26397	26404	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017465	GCCT	2	8	26704	26711	0 %	25 %	25 %	50 %	385811801
69	NC_017465	TTTA	2	8	27083	27090	25 %	75 %	0 %	0 %	385811801
70	NC_017465	CAAT	2	8	27372	27379	50 %	25 %	0 %	25 %	385811801
71	NC_017465	CTGC	2	8	27638	27645	0 %	25 %	25 %	50 %	385811801
72	NC_017465	AAGC	2	8	28372	28379	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017465	GACC	2	8	28465	28472	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017465	GTCA	2	8	28682	28689	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017465	CTGC	2	8	28879	28886	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017465	CAAC	2	8	29518	29525	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017465	CAAG	2	8	29563	29570	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017465	CCGC	2	8	30251	30258	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_017465	GGAT	2	8	30347	30354	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017465	AGGC	2	8	30374	30381	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017465	CGGC	2	8	30745	30752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017465	GTTA	2	8	30964	30971	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017465	TAGG	2	8	31288	31295	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017465	TTAG	2	8	31655	31662	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017465	GGCG	2	8	32375	32382	0 %	0 %	75 %	25 %	385811802
86	NC_017465	GGTC	2	8	32903	32910	0 %	25 %	50 %	25 %	385811803
87	NC_017465	GTAG	2	8	33008	33015	25 %	25 %	50 %	0 %	385811803
88	NC_017465	CCCA	2	8	33111	33118	25 %	0 %	0 %	75 %	385811803
89	NC_017465	AGCC	2	8	33205	33212	25 %	0 %	25 %	50 %	385811803
90	NC_017465	GCTA	2	8	33591	33598	25 %	25 %	25 %	25 %	385811803
91	NC_017465	TTAT	2	8	33640	33647	25 %	75 %	0 %	0 %	385811803
92	NC_017465	GCAA	2	8	33683	33690	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017465	GCCG	2	8	34685	34692	0 %	0 %	50 %	50 %	385811804
94	NC_017465	TGGC	2	8	34938	34945	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017465	GTAG	2	8	35011	35018	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017465	CCTT	2	8	35068	35075	0 %	50 %	0 %	50 %	385811805
97	NC_017465	GGTA	2	8	35434	35441	25 %	25 %	50 %	0 %	385811805
98	NC_017465	GGTC	2	8	35510	35517	0 %	25 %	50 %	25 %	385811805
99	NC_017465	TTGA	2	8	36013	36020	25 %	50 %	25 %	0 %	385811805
100	NC_017465	ATGT	2	8	36397	36404	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017465	TATT	2	8	36676	36683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017465	GCTA	2	8	37011	37018	25 %	25 %	25 %	25 %	385811806
103	NC_017465	AAGG	2	8	37048	37055	50 %	0 %	50 %	0 %	385811806
104	NC_017465	TTGA	2	8	37714	37721	25 %	50 %	25 %	0 %	385811806
105	NC_017465	ACCG	2	8	38239	38246	25 %	0 %	25 %	50 %	385811806
106	NC_017465	GGCG	2	8	38511	38518	0 %	0 %	75 %	25 %	385811806
107	NC_017465	AAGT	2	8	38878	38885	50 %	25 %	25 %	0 %	385811806
108	NC_017465	AAGT	2	8	38999	39006	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017465	CAAA	2	8	39612	39619	75 %	0 %	0 %	25 %	385811807
110	NC_017465	GCCG	2	8	40035	40042	0 %	0 %	50 %	50 %	385811807
111	NC_017465	AGTT	2	8	40506	40513	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017465	GTCT	2	8	40929	40936	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017465	CATT	2	8	41058	41065	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017465	AGCA	2	8	41210	41217	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017465	TACC	2	8	41226	41233	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017465	TGGA	2	8	42082	42089	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017465	CGAC	2	8	42131	42138	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017465	CGGG	2	8	42714	42721	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017465	GACC	2	8	43182	43189	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017465	GCCG	2	8	43428	43435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017465	ACCA	2	8	43661	43668	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017465	TTGA	2	8	43898	43905	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017465	GCAA	2	8	44035	44042	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017465	AGCG	2	8	45025	45032	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017465	CGAC	2	8	45122	45129	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017465	CTGG	2	8	45438	45445	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017465	GGCC	2	8	45584	45591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017465	CGGC	2	8	47093	47100	0 %	0 %	50 %	50 %	385811808
129	NC_017465	AGGG	2	8	47888	47895	25 %	0 %	75 %	0 %	385811808
130	NC_017465	TACC	2	8	48091	48098	25 %	25 %	0 %	50 %	385811808
131	NC_017465	CCTA	2	8	48234	48241	25 %	25 %	0 %	50 %	385811808
132	NC_017465	GCGA	2	8	48287	48294	25 %	0 %	50 %	25 %	385811808
133	NC_017465	TTAA	2	8	48392	48399	50 %	50 %	0 %	0 %	385811808
134	NC_017465	GACC	2	8	48671	48678	25 %	0 %	25 %	50 %	385811808
135	NC_017465	TCAG	2	8	48682	48689	25 %	25 %	25 %	25 %	385811808
136	NC_017465	CCTC	2	8	49170	49177	0 %	25 %	0 %	75 %	385811808
137	NC_017465	GGCC	2	8	49221	49228	0 %	0 %	50 %	50 %	385811808
138	NC_017465	GGCG	2	8	49278	49285	0 %	0 %	75 %	25 %	385811808
139	NC_017465	CCGC	2	8	49381	49388	0 %	0 %	25 %	75 %	385811808
140	NC_017465	AGTA	2	8	49961	49968	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017465	CTGG	2	8	50029	50036	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017465	GGCT	2	8	50299	50306	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017465	GCTG	2	8	50528	50535	0 %	25 %	50 %	25 %	385811810
144	NC_017465	TTGG	2	8	50643	50650	0 %	50 %	50 %	0 %	385811810
145	NC_017465	ACTT	2	8	50817	50824	25 %	50 %	0 %	25 %	385811810
146	NC_017465	CCCA	2	8	50929	50936	25 %	0 %	0 %	75 %	385811810
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