MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus fermentum CECT 5716 chromosome

Total Repeats: 42813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017465	GTATA	2	10	169189	169198	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_017465	AAG	2	6	169288	169293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_017465	AAT	2	6	169342	169347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_017465	CGA	2	6	169352	169357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_017465	TTA	2	6	169426	169431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_017465	CTT	2	6	169448	169453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_017465	CGG	2	6	169493	169498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_017465	ATTG	2	8	169535	169542	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_017465	TGAT	2	8	169557	169564	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_017465	ACA	2	6	169628	169633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_017465	AAC	2	6	169660	169665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_017465	GTT	2	6	169666	169671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_017465	AAC	2	6	169678	169683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_017465	TGGA	2	8	169714	169721	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_017465	TTG	2	6	169738	169743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_017465	GAT	2	6	169767	169772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_017465	GA	3	6	169786	169791	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_017465	GCA	2	6	169840	169845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_017465	GTGA	2	8	169893	169900	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_017465	TGT	2	6	169926	169931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_017465	AGA	2	6	169935	169940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_017465	CAG	2	6	170008	170013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_017465	AG	3	6	170063	170068	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_017465	AGA	2	6	170149	170154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_017465	AT	3	6	170193	170198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_017465	GAA	2	6	170200	170205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_017465	GGC	2	6	170219	170224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_017465	GAA	2	6	170463	170468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_017465	GGT	2	6	170537	170542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_017465	GTC	3	9	170548	170556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_017465	TCGTG	2	10	170560	170569	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3532	NC_017465	GGA	2	6	170663	170668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_017465	GAC	2	6	170676	170681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_017465	ATC	2	6	170687	170692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_017465	AC	3	6	170714	170719	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3536	NC_017465	GCAA	2	8	170761	170768	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3537	NC_017465	AC	3	6	170883	170888	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3538	NC_017465	AGCC	2	8	170946	170953	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3539	NC_017465	GAT	2	6	170969	170974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_017465	CCT	2	6	171025	171030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3541	NC_017465	ATA	2	6	171120	171125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_017465	TAA	2	6	171134	171139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_017465	AACT	2	8	171201	171208	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3544	NC_017465	ATC	2	6	171360	171365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_017465	GAT	2	6	171372	171377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_017465	TAG	2	6	171435	171440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_017465	AGAA	2	8	171451	171458	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_017465	GCG	2	6	171477	171482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_017465	TC	3	6	171625	171630	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3550	NC_017465	CGG	2	6	171649	171654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_017465	GGGAG	2	10	171762	171771	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_017465	TC	3	6	172087	172092	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3553	NC_017465	AT	3	6	172287	172292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_017465	AGC	2	6	172346	172351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_017465	CAT	2	6	172352	172357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3558	NC_017465	ATG	2	6	172693	172698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_017465	AGG	2	6	172708	172713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_017465	GAG	2	6	172904	172909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_017465	CGG	2	6	173153	173158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_017465	GA	3	6	173251	173256	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_017465	AATTG	2	10	173265	173274	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_017465	TAC	2	6	173353	173358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_017465	TAGG	2	8	173369	173376	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_017465	TGG	2	6	173415	173420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_017465	TAC	2	6	173423	173428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_017465	TAT	2	6	173434	173439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_017465	CAC	2	6	173455	173460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3570	NC_017465	GTG	2	6	173466	173471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_017465	GACA	2	8	173604	173611	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3572	NC_017465	GGT	2	6	173647	173652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_017465	CGT	2	6	173842	173847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3575	NC_017465	TATG	2	8	173975	173982	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_017465	GAT	2	6	174068	174073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_017465	TGGAAG	2	12	174087	174098	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3580	NC_017465	ATG	2	6	174222	174227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_017465	AGT	2	6	174287	174292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3583	NC_017465	CTTTC	2	10	174350	174359	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3584	NC_017465	T	7	7	174501	174507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3588	NC_017465	CCGC	2	8	174696	174703	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3589	NC_017465	AAG	2	6	174783	174788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3592	NC_017465	GAC	2	6	175052	175057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_017465	TGA	2	6	175080	175085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_017465	GTGA	2	8	175142	175149	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_017465	GGC	2	6	175266	175271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3597	NC_017465	GGT	2	6	175326	175331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_017465	ATC	2	6	175481	175486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_017465	CGT	2	6	175581	175586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_017465	GCCA	2	8	175813	175820	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3601	NC_017465	AAG	2	6	175864	175869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_017465	CAC	2	6	176038	176043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811876
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3604	NC_017465	ATTGCG	2	12	176207	176218	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385811876
3605	NC_017465	GCC	2	6	176228	176233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811876
3606	NC_017465	GCC	2	6	176248	176253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811876
3607	NC_017465	CAG	2	6	176257	176262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811876
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3612	NC_017465	CAG	2	6	176390	176395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811876
3613	NC_017465	GCG	2	6	176396	176401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385811876
3614	NC_017465	CAA	2	6	176420	176425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811876
3615	NC_017465	GAA	2	6	176497	176502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811876
3616	NC_017465	CGG	2	6	176555	176560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385811876
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3618	NC_017465	GGT	2	6	176628	176633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_017465	ATTA	2	8	176677	176684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_017465	AAG	2	6	176685	176690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_017465	A	6	6	176699	176704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_017465	GA	3	6	176711	176716	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_017465	ACGG	2	8	176795	176802	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3624	NC_017465	CTGG	2	8	176916	176923	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3625	NC_017465	G	6	6	176922	176927	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_017465	GCG	2	6	176964	176969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_017465	CGG	2	6	177045	177050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3628	NC_017465	GGC	2	6	177109	177114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_017465	ATG	2	6	177214	177219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_017465	CGA	2	6	177279	177284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3631	NC_017465	CGG	2	6	177290	177295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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