MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus fermentum CECT 5716 chromosome

Total Repeats: 42813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017465	TGA	2	6	23473	23478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811798
502	NC_017465	A	6	6	23602	23607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017465	AG	3	6	23635	23640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017465	TGG	2	6	23693	23698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017465	TGG	2	6	23764	23769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017465	GAAC	2	8	23776	23783	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
507	NC_017465	G	6	6	23837	23842	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017465	TTG	2	6	23888	23893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017465	GGAGA	2	10	23991	24000	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017465	A	6	6	24000	24005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017465	TCAG	2	8	24144	24151	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
512	NC_017465	AGG	2	6	24177	24182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017465	CGG	2	6	24325	24330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_017465	GGAA	2	8	24527	24534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017465	AGT	2	6	24588	24593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017465	AGTT	2	8	24603	24610	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017465	ATT	2	6	24672	24677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017465	GGAT	2	8	24687	24694	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017465	GAT	3	9	24692	24700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017465	TTAC	2	8	24749	24756	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
521	NC_017465	CAG	2	6	24791	24796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_017465	GGCC	2	8	24848	24855	0 %	0 %	50 %	50 %	385811799
523	NC_017465	GAA	2	6	24906	24911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811799
524	NC_017465	CCT	2	6	24956	24961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385811799
525	NC_017465	AACC	2	8	24977	24984	50 %	0 %	0 %	50 %	385811799
526	NC_017465	GCG	2	6	25047	25052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385811799
527	NC_017465	GGC	2	6	25058	25063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385811799
528	NC_017465	TAG	2	6	25122	25127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811799
529	NC_017465	CGA	2	6	25134	25139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811799
530	NC_017465	AGCGA	2	10	25214	25223	40 %	0 %	40 %	20 %	385811800
531	NC_017465	CGG	2	6	25248	25253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385811800
532	NC_017465	GACC	2	8	25333	25340	25 %	0 %	25 %	50 %	385811800
533	NC_017465	AGC	2	6	25401	25406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811800
534	NC_017465	GAT	2	6	25417	25422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811800
535	NC_017465	ACCGAA	2	12	25433	25444	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385811800
536	NC_017465	CTT	2	6	25498	25503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385811800
537	NC_017465	GTC	2	6	25568	25573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385811800
538	NC_017465	AAG	2	6	25589	25594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811800
539	NC_017465	TCG	2	6	25605	25610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385811800
540	NC_017465	ACA	2	6	25617	25622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811800
541	NC_017465	T	6	6	25633	25638	0 %	100 %	0 %	0 %	385811800
542	NC_017465	GCT	2	6	25651	25656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385811800
543	NC_017465	GAC	2	6	25658	25663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811800
544	NC_017465	CAC	2	6	25664	25669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811800
545	NC_017465	CGC	2	6	25695	25700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811800
546	NC_017465	CCG	2	6	25723	25728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811800
547	NC_017465	GCC	2	6	25737	25742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811800
548	NC_017465	AACG	2	8	25751	25758	50 %	0 %	25 %	25 %	385811800
549	NC_017465	GTGG	2	8	25777	25784	0 %	25 %	75 %	0 %	385811800
550	NC_017465	GAA	2	6	25787	25792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811800
551	NC_017465	T	6	6	25808	25813	0 %	100 %	0 %	0 %	385811800
552	NC_017465	GAC	2	6	25850	25855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811800
553	NC_017465	CGC	2	6	26002	26007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811800
554	NC_017465	ACC	2	6	26037	26042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811800
555	NC_017465	ATTT	2	8	26044	26051	25 %	75 %	0 %	0 %	385811800
556	NC_017465	GTA	2	6	26062	26067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811800
557	NC_017465	TGAT	2	8	26113	26120	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017465	GAG	2	6	26284	26289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017465	T	7	7	26307	26313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017465	TGA	2	6	26370	26375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017465	CTTT	2	8	26388	26395	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
562	NC_017465	GGGA	2	8	26397	26404	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017465	AGG	2	6	26414	26419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017465	TGGAG	2	10	26432	26441	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017465	GAT	2	6	26501	26506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811801
566	NC_017465	T	6	6	26516	26521	0 %	100 %	0 %	0 %	385811801
567	NC_017465	TTC	2	6	26610	26615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385811801
568	NC_017465	ACC	2	6	26621	26626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811801
569	NC_017465	TCG	2	6	26653	26658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385811801
570	NC_017465	CGGAC	2	10	26668	26677	20 %	0 %	40 %	40 %	385811801
571	NC_017465	G	6	6	26693	26698	0 %	0 %	100 %	0 %	385811801
572	NC_017465	GCCT	2	8	26704	26711	0 %	25 %	25 %	50 %	385811801
573	NC_017465	CGTGAT	2	12	26738	26749	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385811801
574	NC_017465	GCC	2	6	26799	26804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811801
575	NC_017465	GAT	2	6	26873	26878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811801
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577	NC_017465	GCC	2	6	26961	26966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811801
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582	NC_017465	TTTA	2	8	27083	27090	25 %	75 %	0 %	0 %	385811801
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588	NC_017465	CAAT	2	8	27372	27379	50 %	25 %	0 %	25 %	385811801
589	NC_017465	CGC	2	6	27380	27385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811801
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591	NC_017465	CTGC	2	8	27638	27645	0 %	25 %	25 %	50 %	385811801
592	NC_017465	CCT	2	6	27667	27672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385811801
593	NC_017465	GGC	2	6	27693	27698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385811801
594	NC_017465	CAC	2	6	27758	27763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811801
595	NC_017465	GAC	2	6	27839	27844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_017465	AGA	2	6	27857	27862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_017465	T	6	6	27921	27926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017465	GAA	2	6	27927	27932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017465	TGG	2	6	28005	28010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017465	GAT	2	6	28040	28045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017465	GCG	2	6	28145	28150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_017465	GGC	2	6	28185	28190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_017465	CGG	2	6	28225	28230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_017465	TGG	2	6	28243	28248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017465	CTG	2	6	28273	28278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_017465	ACG	2	6	28339	28344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_017465	AAGC	2	8	28372	28379	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
608	NC_017465	CTG	2	6	28392	28397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_017465	GACC	2	8	28465	28472	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
610	NC_017465	ACC	2	6	28577	28582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_017465	TGG	2	6	28611	28616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017465	CGG	2	6	28617	28622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_017465	ACG	2	6	28659	28664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_017465	GCC	2	6	28673	28678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_017465	GTCA	2	8	28682	28689	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
616	NC_017465	GTG	2	6	28718	28723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017465	CTA	2	6	28786	28791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_017465	CGG	2	6	28846	28851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_017465	CTGC	2	8	28879	28886	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
620	NC_017465	TAC	2	6	28934	28939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_017465	ACC	2	6	28944	28949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_017465	GAA	2	6	29060	29065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017465	CCT	2	6	29127	29132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_017465	GC	3	6	29171	29176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
625	NC_017465	ACT	2	6	29196	29201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_017465	ACA	2	6	29256	29261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_017465	AAC	2	6	29267	29272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_017465	CGG	2	6	29381	29386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_017465	ACA	2	6	29406	29411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_017465	ACG	2	6	29454	29459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_017465	CTT	2	6	29461	29466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_017465	CAAC	2	8	29518	29525	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
633	NC_017465	CAAG	2	8	29563	29570	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
634	NC_017465	CGA	2	6	29602	29607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_017465	GCC	2	6	29702	29707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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