MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus fermentum CECT 5716 chromosome

Total Repeats: 42813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017465	GCC	2	6	268552	268557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811920
5502	NC_017465	GTC	2	6	268581	268586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385811920
5503	NC_017465	ATCA	2	8	268718	268725	50 %	25 %	0 %	25 %	385811920
5504	NC_017465	CGG	2	6	268742	268747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385811920
5505	NC_017465	AAG	2	6	268760	268765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811920
5506	NC_017465	CAT	2	6	268806	268811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385811920
5507	NC_017465	CTG	2	6	268852	268857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385811920
5508	NC_017465	AGA	3	9	268917	268925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811920
5509	NC_017465	TGG	2	6	268928	268933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385811920
5510	NC_017465	AAC	2	6	268946	268951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811920
5511	NC_017465	GAA	2	6	269020	269025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811920
5512	NC_017465	ACC	2	6	269038	269043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811920
5513	NC_017465	TGA	2	6	269058	269063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811920
5514	NC_017465	CAAG	2	8	269100	269107	50 %	0 %	25 %	25 %	385811920
5515	NC_017465	GAA	2	6	269127	269132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811920
5516	NC_017465	GAT	2	6	269155	269160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811920
5517	NC_017465	GTT	2	6	269220	269225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385811920
5518	NC_017465	GGA	2	6	269243	269248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385811920
5519	NC_017465	AAAAT	2	10	269249	269258	80 %	20 %	0 %	0 %	385811920
5520	NC_017465	ACT	2	6	269267	269272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385811920
5521	NC_017465	GAA	2	6	269338	269343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811920
5522	NC_017465	CCA	2	6	269346	269351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811920
5523	NC_017465	TCG	2	6	269489	269494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385811920
5524	NC_017465	TGA	2	6	269688	269693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811920
5525	NC_017465	TTA	2	6	269700	269705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385811920
5526	NC_017465	CGA	2	6	269820	269825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_017465	ACG	2	6	269845	269850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811921
5528	NC_017465	GGGAA	2	10	269885	269894	40 %	0 %	60 %	0 %	385811921
5529	NC_017465	GAC	2	6	270025	270030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811921
5530	NC_017465	GAA	3	9	270106	270114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811921
5531	NC_017465	CGA	2	6	270160	270165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811921
5532	NC_017465	AGG	2	6	270217	270222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385811921
5533	NC_017465	GAATG	2	10	270228	270237	40 %	20 %	40 %	0 %	385811921
5534	NC_017465	AAG	2	6	270323	270328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811921
5535	NC_017465	CAA	2	6	270385	270390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811921
5536	NC_017465	ATG	2	6	270404	270409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811921
5537	NC_017465	TGG	2	6	270451	270456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385811921
5538	NC_017465	TGG	2	6	270471	270476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385811921
5539	NC_017465	CGA	2	6	270493	270498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811921
5540	NC_017465	CCGATG	2	12	270504	270515	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385811921
5541	NC_017465	TAA	2	6	270544	270549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385811921
5542	NC_017465	CAA	2	6	270592	270597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811921
5543	NC_017465	A	6	6	270634	270639	100 %	0 %	0 %	0 %	385811921
5544	NC_017465	GAC	2	6	270672	270677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811921
5545	NC_017465	GGGCAG	2	12	270718	270729	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	385811921
5546	NC_017465	GAAG	2	8	270797	270804	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_017465	GCCA	2	8	270807	270814	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5548	NC_017465	CTG	2	6	270853	270858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_017465	AAG	2	6	270859	270864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_017465	GTAT	2	8	270869	270876	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_017465	GGGC	2	8	270909	270916	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5552	NC_017465	ACT	2	6	270955	270960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_017465	ACT	2	6	270974	270979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_017465	GAA	2	6	270996	271001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_017465	A	6	6	271000	271005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_017465	ACG	2	6	271008	271013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_017465	TGG	2	6	271036	271041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_017465	AGC	2	6	271085	271090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5559	NC_017465	TAC	2	6	271092	271097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_017465	GCC	2	6	271116	271121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5561	NC_017465	GAA	2	6	271200	271205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_017465	ACA	2	6	271214	271219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_017465	AGG	2	6	271231	271236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_017465	TGG	2	6	271279	271284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_017465	AAG	2	6	271380	271385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_017465	ACT	2	6	271406	271411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5568	NC_017465	GAT	2	6	271448	271453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_017465	TGG	2	6	271537	271542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385811922
5570	NC_017465	GAA	2	6	271545	271550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811922
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5580	NC_017465	TACC	2	8	272159	272166	25 %	25 %	0 %	50 %	385811923
5581	NC_017465	GGAAC	2	10	272169	272178	40 %	0 %	40 %	20 %	385811923
5582	NC_017465	CCT	2	6	272191	272196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385811923
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5584	NC_017465	GCTG	2	8	272282	272289	0 %	25 %	50 %	25 %	385811923
5585	NC_017465	TGG	2	6	272316	272321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385811923
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5593	NC_017465	TTA	2	6	272709	272714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385811923
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5595	NC_017465	ATAAGA	2	12	272758	272769	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385811923
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5597	NC_017465	A	6	6	272838	272843	100 %	0 %	0 %	0 %	385811923
5598	NC_017465	TC	3	6	272912	272917	0 %	50 %	0 %	50 %	385811923
5599	NC_017465	AAAT	2	8	272940	272947	75 %	25 %	0 %	0 %	385811923
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5602	NC_017465	A	7	7	273080	273086	100 %	0 %	0 %	0 %	385811923
5603	NC_017465	TAC	2	6	273116	273121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385811923
5604	NC_017465	A	6	6	273169	273174	100 %	0 %	0 %	0 %	385811923
5605	NC_017465	GAT	2	6	273197	273202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811923
5606	NC_017465	ATA	2	6	273203	273208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385811923
5607	NC_017465	TGG	2	6	273239	273244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385811923
5608	NC_017465	AAT	2	6	273262	273267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385811923
5609	NC_017465	CGA	2	6	273272	273277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811923
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5611	NC_017465	CTT	2	6	273368	273373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_017465	CGG	2	6	273413	273418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5613	NC_017465	ATTG	2	8	273455	273462	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_017465	TGAT	2	8	273477	273484	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_017465	ACA	2	6	273548	273553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_017465	AAC	2	6	273580	273585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_017465	GTT	2	6	273586	273591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_017465	AAC	2	6	273598	273603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_017465	TGGA	2	8	273634	273641	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_017465	TTG	2	6	273658	273663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_017465	GAT	2	6	273687	273692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_017465	GA	3	6	273706	273711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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