MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus fermentum CECT 5716 chromosome

Total Repeats: 42813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017465	TCG	2	6	243082	243087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_017465	ATC	2	6	243132	243137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_017465	TCG	2	6	243141	243146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_017465	CAT	2	6	243167	243172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_017465	GCC	2	6	243216	243221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5006	NC_017465	GTA	2	6	243254	243259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_017465	GGC	2	6	243329	243334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_017465	ATC	2	6	243348	243353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_017465	ACAT	2	8	243474	243481	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5010	NC_017465	CGG	2	6	243487	243492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_017465	AGG	2	6	243501	243506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_017465	CGG	2	6	243529	243534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_017465	CGA	2	6	243541	243546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_017465	GGT	2	6	243590	243595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385811909
5015	NC_017465	GAAA	2	8	243614	243621	75 %	0 %	25 %	0 %	385811909
5016	NC_017465	GTT	2	6	243641	243646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385811909
5017	NC_017465	GCC	2	6	243688	243693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811909
5018	NC_017465	ACC	2	6	243705	243710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811909
5019	NC_017465	GTCAAT	2	12	243791	243802	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385811909
5020	NC_017465	TTAAT	2	10	243808	243817	40 %	60 %	0 %	0 %	385811909
5021	NC_017465	CCT	2	6	243830	243835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385811909
5022	NC_017465	ATG	3	9	243845	243853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811909
5023	NC_017465	GTT	2	6	243856	243861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385811909
5024	NC_017465	TGT	2	6	243909	243914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385811909
5025	NC_017465	AAG	2	6	243944	243949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811909
5026	NC_017465	GCC	2	6	243980	243985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811909
5027	NC_017465	AACT	2	8	244012	244019	50 %	25 %	0 %	25 %	385811909
5028	NC_017465	GGTA	2	8	244074	244081	25 %	25 %	50 %	0 %	385811909
5029	NC_017465	GTA	2	6	244117	244122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811909
5030	NC_017465	CCG	2	6	244137	244142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811909
5031	NC_017465	GGTC	2	8	244152	244159	0 %	25 %	50 %	25 %	385811909
5032	NC_017465	GTC	2	6	244252	244257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385811909
5033	NC_017465	CAT	2	6	244299	244304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385811909
5034	NC_017465	GTT	2	6	244336	244341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385811909
5035	NC_017465	GAT	2	6	244498	244503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811910
5036	NC_017465	GGTCGA	2	12	244581	244592	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385811910
5037	NC_017465	GTAG	2	8	244632	244639	25 %	25 %	50 %	0 %	385811910
5038	NC_017465	ATC	2	6	244670	244675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385811910
5039	NC_017465	ACT	2	6	244679	244684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385811910
5040	NC_017465	TGG	3	9	244770	244778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385811910
5041	NC_017465	GGC	2	6	244791	244796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385811910
5042	NC_017465	GT	3	6	244838	244843	0 %	50 %	50 %	0 %	385811910
5043	NC_017465	ATC	2	6	244906	244911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385811910
5044	NC_017465	GTG	2	6	244930	244935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385811910
5045	NC_017465	CGG	2	6	244970	244975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385811910
5046	NC_017465	CCG	2	6	245062	245067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811910
5047	NC_017465	TGA	2	6	245091	245096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811910
5048	NC_017465	CAA	2	6	245118	245123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811910
5049	NC_017465	TCT	2	6	245154	245159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385811910
5050	NC_017465	TCC	2	6	245194	245199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385811910
5051	NC_017465	AGGG	2	8	245292	245299	25 %	0 %	75 %	0 %	385811910
5052	NC_017465	ACC	2	6	245337	245342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811910
5053	NC_017465	AAG	2	6	245362	245367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811910
5054	NC_017465	GAA	2	6	245382	245387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811910
5055	NC_017465	ACC	2	6	245553	245558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811910
5056	NC_017465	CGA	2	6	245606	245611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811910
5057	NC_017465	CGG	2	6	245674	245679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385811910
5058	NC_017465	AATTG	2	10	245705	245714	40 %	40 %	20 %	0 %	385811910
5059	NC_017465	TGATA	2	10	245727	245736	40 %	40 %	20 %	0 %	385811910
5060	NC_017465	CAA	2	6	245895	245900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_017465	ATCG	2	8	246029	246036	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5062	NC_017465	CGAAGA	2	12	246059	246070	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5063	NC_017465	AAG	2	6	246081	246086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_017465	CTT	2	6	246107	246112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_017465	GAC	4	12	246123	246134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_017465	GAT	2	6	246156	246161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_017465	AGA	2	6	246164	246169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_017465	GAT	3	9	246180	246188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_017465	GAC	2	6	246204	246209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_017465	GAA	2	6	246216	246221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_017465	GAC	2	6	246222	246227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_017465	GAT	2	6	246252	246257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_017465	CGA	2	6	246302	246307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_017465	CGA	2	6	246314	246319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_017465	GAA	2	6	246321	246326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_017465	GAA	2	6	246333	246338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_017465	AGA	2	6	246344	246349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_017465	CGA	2	6	246350	246355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_017465	AAT	2	6	246358	246363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_017465	TAT	2	6	246403	246408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_017465	TTG	2	6	246493	246498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_017465	GA	3	6	246519	246524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_017465	TGG	2	6	246552	246557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_017465	GTT	2	6	246559	246564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_017465	GGC	2	6	246588	246593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_017465	ACG	2	6	246716	246721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_017465	GAC	2	6	246795	246800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_017465	GGAC	2	8	246853	246860	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5089	NC_017465	CA	3	6	246875	246880	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5090	NC_017465	GCCGG	2	10	246908	246917	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5091	NC_017465	A	6	6	247012	247017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_017465	GGCG	2	8	247020	247027	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5093	NC_017465	GCC	2	6	247075	247080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5094	NC_017465	CCAAC	2	10	247099	247108	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
5095	NC_017465	TGG	2	6	247154	247159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385811911
5096	NC_017465	GAA	2	6	247168	247173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811911
5097	NC_017465	GTC	2	6	247234	247239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385811911
5098	NC_017465	TGG	2	6	247367	247372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385811911
5099	NC_017465	TGGT	2	8	247415	247422	0 %	50 %	50 %	0 %	385811911
5100	NC_017465	ATG	2	6	247568	247573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811911
5101	NC_017465	GGT	2	6	247588	247593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385811911
5102	NC_017465	GAT	2	6	247617	247622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811911
5103	NC_017465	CGTAC	2	10	247653	247662	20 %	20 %	20 %	40 %	385811911
5104	NC_017465	CAT	2	6	247770	247775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385811911
5105	NC_017465	AAG	2	6	247793	247798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811911
5106	NC_017465	G	6	6	247812	247817	0 %	0 %	100 %	0 %	385811911
5107	NC_017465	AAC	2	6	247930	247935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811911
5108	NC_017465	TTC	2	6	248032	248037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385811911
5109	NC_017465	GCC	2	6	248041	248046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811911
5110	NC_017465	ACC	2	6	248051	248056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811911
5111	NC_017465	ATT	2	6	248091	248096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385811911
5112	NC_017465	GCC	2	6	248098	248103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811911
5113	NC_017465	TCA	2	6	248298	248303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385811911
5114	NC_017465	AATGA	2	10	248304	248313	60 %	20 %	20 %	0 %	385811911
5115	NC_017465	A	7	7	248344	248350	100 %	0 %	0 %	0 %	385811911
5116	NC_017465	AGG	2	6	248361	248366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385811911
5117	NC_017465	AACCTT	2	12	248664	248675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385811911
5118	NC_017465	AAC	2	6	248758	248763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_017465	GGC	2	6	248856	248861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_017465	CGC	2	6	248895	248900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5121	NC_017465	ACCT	2	8	249055	249062	25 %	25 %	0 %	50 %	385811912
5122	NC_017465	GCC	2	6	249073	249078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811912
5123	NC_017465	TGA	2	6	249092	249097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811912
5124	NC_017465	CGG	2	6	249212	249217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385811912
5125	NC_017465	ACA	2	6	249261	249266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811912
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5246	NC_017465	AGG	2	6	256113	256118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385811915
5247	NC_017465	GGC	2	6	256150	256155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385811915
5248	NC_017465	CGGGC	3	15	256245	256259	0 %	0 %	60 %	40 %	385811915
5249	NC_017465	GAA	3	9	256364	256372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811915
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5251	NC_017465	CGA	2	6	256431	256436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811915
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5272	NC_017465	C	6	6	257381	257386	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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